国产日韩欧美一区二区三区三州_亚洲少妇熟女av_久久久久亚洲av国产精品_波多野结衣网站一区二区_亚洲欧美色片在线91_国产亚洲精品精品国产优播av_日本一区二区三区波多野结衣 _久久国产av不卡

?

單純皰疹病毒性角膜炎的病原學檢測技術(shù)進展

2010-02-10 02:11穎綜述吳欣怡審校
中國實驗診斷學 2010年2期
關(guān)鍵詞:皰疹病毒探針靈敏度

張 穎綜述,吳欣怡審校

(山東大學齊魯醫(yī)院眼科,山東濟南250012)

單純皰疹病毒性角膜炎(herpes simplex keratitis,HSK)主要由 I型單純皰疹病毒(herpes simplex virus,HSV-1)引起,發(fā)病率及致盲率均占角膜病的首位。目前HSK的診斷主要依據(jù)病史、典型癥狀和角膜病變形態(tài),但該病臨床表現(xiàn)復雜多樣,常不典型,與腺病毒、棘阿米巴原蟲等引起的角膜炎不易鑒別[1-2],造成誤診或漏診,報道誤診率高達79.3%[3]。因此,HSK病原學診斷成為臨床確診的重要依據(jù)。病毒培養(yǎng)是HSV-1感染診斷的金標準,但費時費力、技術(shù)要求高,難以推廣。本文對目前各種檢測HSV-1的病原學診斷技術(shù)的最新進展綜述如下。

1 環(huán)媒恒溫擴增法(Loop-Mediated Isothermal Amplification,LAMP)

是一種新式的恒溫核酸擴增方法,由Notomi T[4]于2000年研發(fā)。原理為設(shè)計4種引物,特異性識別靶基因上6個不同的序列區(qū)域,利用鏈置換DNA聚合酶(Bst DNA polymerase)擴增靶基因(恒溫條件下一小時內(nèi)可擴增靶基因的109倍),凝膠電泳檢測擴增產(chǎn)物。

1.1 LAMP技術(shù)的改進和完善 2001年,Mori Y[5]建立了濁度法-LAMP,改進了檢測擴增產(chǎn)物的方法。該法利用擴增副產(chǎn)物-焦磷酸鎂白色沉淀的濁度判斷靶基因擴增與否,縮短了檢測時間,保證擴增與檢測同步進行,實現(xiàn)了實時檢測監(jiān)控。2004年,Mori Y[6]依據(jù)濁度法-LAMP設(shè)計了相應(yīng)的檢測儀器,可在恒溫下實時檢測多個樣品的濁度變化,實現(xiàn)了對多個LAMP擴增產(chǎn)物的定量分析。2002年Nagamine K[7]發(fā)現(xiàn),在LAMP反應(yīng)體系中加入一種環(huán)狀引物(loop primer)可加速反應(yīng),使實驗總時間縮短至30 min內(nèi)。2007年,Kaneko H[8]評價了LAMP對臨床樣品中雜質(zhì)的耐受性,認為可直接檢測樣品,無需先提取樣品中DNA。

1.2 LAMP的優(yōu)點 ①條件簡易,對空間及環(huán)境要求較小,無需大型精密儀器和特殊試劑,可適用于各級醫(yī)院及小型診所。②過程簡單:該法不必進行模板熱變性、多個熱溫循環(huán)、繁瑣易污染的電泳、紫外觀察等PCR反應(yīng)過程。③反應(yīng)迅速:四個區(qū)域同時環(huán)狀擴增,形成莖-環(huán)結(jié)構(gòu),可在30 min內(nèi)擴增至靶基因的109倍。④操作簡便:雖然原理較復雜,但僅需將檢測樣品和試劑一起放入恒溫環(huán)境中30-60 min,即可肉眼判斷擴增與否,無需專業(yè)人員。⑤特異性高:4個引物特異性識別靶基因上6個不同的區(qū)域,且六個區(qū)域的順序也有規(guī)定,因而特異性高。⑥靈敏度高:模板1-10拷貝即可實現(xiàn)擴增。

1.3 LAMP對HSV-1的檢測效果 Sugiyama H[9]利用 LAMP和“金標準”病毒培養(yǎng)法檢測38例疑似HSV-1感染的生殖器皮損樣品。結(jié)果顯示:與病毒培養(yǎng)相比,LAMP擴增30分鐘、60分鐘的靈敏度分別為90%(9/10)、100%(10/10),陽性預(yù)測值分別為100%(9/9)、100%(10/10)。提示:①LAMP靈敏度較高,可有效的篩檢病人;②陽性預(yù)測值高,LAMP結(jié)果陽性時患病的可能性較高。該研究樣本含量較小,不能顯示不同擴增時間下LAMP靈敏度之間的統(tǒng)計學差異,尚需進一步研究確證。

Yoshihiko Enomoto[10]將23例皮膚、口腔粘膜皰疹和生殖器皰疹樣品配對設(shè)計為是否提取DNA兩組,評價LAMP對兩組樣品中HSV-1的檢測效果。與檢測速度較快的PCR相比,濁度法LAMP檢測效果與PCR相同,樣品是否提取DNA對其檢測效果無明顯影響。Kaneko H[11]利用60例疑似眼部及生殖器皰疹樣品,評價LAMP、PCR檢測直接樣品的效果。結(jié)果表明,與“金標準”病毒培養(yǎng)相比,LAMP、PCR檢測直接樣品的靈敏度分別為 88%(15/17)、6%(1/17),前者明顯高于后者(P<0.001)。以上研究顯示,PCR受臨床樣品中抑制物(文獻報道眼表麻醉劑、熒光素[12])的影響較大;LAMP受臨床樣品中抑制物的影響較小,可直接檢測樣品,無需提取DNA,快速且靈敏。濁度法LAMP進一步省略凝膠電泳檢測過程,速度更快,達到了快速診斷的目的。

2 PCR技術(shù)的改進

2.1 過程的簡化 常規(guī)PCR需首先提取樣品DNA為擴增提供模板,通常認為該步必不可缺,約花費整個PCR檢測時間接免疫熒光法(Indirect Immunofluorescence Assay,IIF)因參加反應(yīng)的因素較多,受干擾的可能性大等缺點,限制了其在臨床檢驗診斷中的應(yīng)用。單克隆抗體(Monoclonal antibody,m-Ab)技術(shù)的發(fā)展,產(chǎn)生了敏感性高、特異性強的抗體,減少了與其它物質(zhì)的交叉反應(yīng),使試驗結(jié)果可信度增大,更易于菌種的型及亞型、病毒變異株等的鑒別。隨著該技術(shù)的商業(yè)化,出現(xiàn)了許多單抗試劑盒,進一步加快了檢測速度。單克間的一半。Pandori MW[13]用PCR直接檢測57個HSV樣品,發(fā)現(xiàn)無需提取樣品DNA,經(jīng)濟省時一半,敏感性下降2-5倍,但相對病毒分離法仍為一種較實用的方法。需強調(diào)的是,應(yīng)用PCR直接檢測樣品,要求最大化減少樣品中的潛在抑制物。Pandori MW[13]發(fā)現(xiàn)用擦拭法收集樣品經(jīng)稀釋后置于95℃下10分鐘,通過稀釋組織碎片即可減少潛在抑制物,該條件能充分暴露核酸,提高檢測靈敏度。該研究提示,簡化后的常規(guī)PCR技術(shù)節(jié)省時間,污染小,值得在臨床中推廣。

2.2 實時熒光探針定量PCR 實時熒光探針定量PCR,即在PCR反應(yīng)體系中加入特異性熒光探針(如TaqMan)和引物。該探針能與靶序列特異性結(jié)合,探針兩端各標記一個熒光報告基團(如FAM)和一個熒光淬滅基團(如TAMRA)。探針完整時,TAMR A淬滅FAM的熒光,致無熒光信號發(fā)出;PCR擴增時,具有外切酶活性的TaqMan酶將探針上的FAM切下,F(xiàn)AM與TAMR A分離,產(chǎn)生的熒光信號可被監(jiān)測。隨擴增循環(huán)的重復,酶切下的FAM數(shù)量增加,實現(xiàn)了熒光信號積累與PCR產(chǎn)物形成的同步進行。Kowalski RP[14]利用該法檢測122個角膜或結(jié)膜樣品中的HSV-1,與病毒培養(yǎng)相比,靈敏度、特異度、陽性預(yù)測值、陰性預(yù)測值分別為98%(63/64)、100%(58/58)、100%(58/58)、91%(58/64),顯示了實時熒光探針PCR技術(shù)在減少誤診和漏診方面有優(yōu)勢。與常規(guī)PCR相比,該法優(yōu)點在于,特異度提高,假陽性率降低,更加快速準確,符合臨床需要,可成為檢測HSV-1的常規(guī)手段。

2.3 多重PCR(multiplex PCR) 是在常規(guī)PCR技術(shù)基礎(chǔ)上改進和發(fā)展起來的一種新型擴增技術(shù),即在同一PCR反應(yīng)體系內(nèi)加入兩對或多對特異性引物,一次擴增多個DNA片段,從而實現(xiàn)多種病原體DNA的同時快速鑒定。多重PCR同單引物PCR相比,優(yōu)點在于多對引物同時擴增,擴增結(jié)果的陽性及陰性條帶可互為對照,進一步排除了PCR假陽性、假陰性問題,且比多次單引物PCR擴增所用試劑少、時間短、通過一次擴增反應(yīng)可得到多方面的信息[15]。皰疹類病毒引起的眼部疾病常具有相似的臨床表現(xiàn),特別是發(fā)生混合感染,或同時出現(xiàn)多個疑似眼部皰疹病毒感染的患者時,可用該法進行快速診斷,具有臨床實際意義。Zhang Y[16]分別利用多重PCR和單引物PCR檢測33例疑似眼部皰疹病毒感染的患者,兩種方法檢出率相同(57.6%,19/33),因前者可檢測出同一樣品中的多種病毒,優(yōu)于后者。 Anne J.J??skel?inen[17]將多重PCR與生物芯片技術(shù)相結(jié)合,用于同時檢測腦脊液中的八種皰疹病毒,并設(shè)計出新的HSV-PCR引物對和寡核苷酸探針,完善了兩種技術(shù)的結(jié)合,提高了檢測的敏感性和可靠性。

3 單克隆抗體引導的間接免疫熒光法

隆抗體引導的IIF法,克服了IIF的許多不足,目前得到了廣泛的應(yīng)用。劉軍連[18]采用HSV型共同性單克隆抗體為夾心的IIF方法,檢測120例生殖器皰疹樣品中的HSV,并與病毒培養(yǎng)法進行比較,結(jié)果顯示:IIF法的靈敏度為96.5%(82/85),特異性為40.0%(14/35)。IIF法較病毒培養(yǎng)法更適用于病程較長的病例,陽性檢出率為83.3%(75/90),高于病毒培養(yǎng)法的陽性檢出率64.4%(58/90,P<0.01)。作者推斷可能原因為:病程較長時,有活力的病毒明顯減少甚至消失,但HSV抗原仍存在且能被IIF法檢出,所以IIF法優(yōu)于病毒培養(yǎng)法。Pereira SR[19]分別應(yīng)用FITC-mAb法、病毒培養(yǎng)法檢測感染鼠(BALB/c小鼠)角膜中的HSV抗原,兩種方法24小時靈敏度分別為100%(20/20)、45%(9/20)。FITC-mAb法靈敏度明顯高于病毒培養(yǎng)法(P<0.001)。Pereira SR認為單克隆抗體引導的IIF法聯(lián)合角膜印跡取材法,可直接應(yīng)用于患者,作為病毒培養(yǎng)確診前的篩檢實驗。單克隆抗體引導的IIF法具有較高的診斷價值,但特異性較低,今后仍需更多臨床實驗綜合評價該法,確定該法應(yīng)用于診斷HSK的臨床實用價值。

4 IELIS法

新的HSV-1抗體的出現(xiàn)促使了IELIS技術(shù)檢測HSV-1的新進展。Idandi K[20]合成了包括全長gG蛋白的pTrc His2A-gG1質(zhì)粒,并利用該質(zhì)粒獲得了新的HSV-1抗體,聯(lián)合IELIS法研制出新的型特異性HSV-1診斷試劑盒,靈敏度為100%,特異度為89.5%。

5 小結(jié)

早期診斷治療HSK可降低復發(fā)率,診斷延誤有可能造成不可逆轉(zhuǎn)的視力損害,因而臨床醫(yī)生應(yīng)選擇快速靈敏的檢測方法。目前研究表明,LAMP法、實時熒光探針PCR法能夠較快速有效的篩檢病人且可信性相對較高,值得普及推廣;單克隆抗體引導的IIF法靈敏度較高,但特異性較低,可用作疑似病人進行病毒培養(yǎng)確診前的篩檢實驗。目前存在的問題是,尚缺少對各種方法的靈敏度、特異度、陽性和陰性預(yù)測值等綜合性評價,以便為眼科臨床工作者在HSK的診斷和治療中提供決策證據(jù)。

[1]Marangon FB,Miller D,Alfonso E.Laboratory results in ocular viral diseases:implications in clinical-laboratory correlation[J].Arq Bras Oftalmol,2007,70(2):189.

[2]Thebpatiphat N,Hammersmith KM,Rocha FN ,et al.Acanthamoeba keratitis:a parasite on the rise[J].Cornea ,2007 ,26(6):701.

[3]朱志忠,王印其,張月琴,等.單純皰疹性角膜基質(zhì)炎診療中的失誤和對策[J].美中國際眼科雜志,2002,2(3):30.

[4]Notomi T ,Okayama H ,Masubuchi H ,et al.Loop-mediated isothermal amplification of DNA[J].Nucleic Acids Res,2000,28(12):63.

[5]Mori Y,Nagamine K,Tomita N,et al.Detection of loop-mediated isother

mal amplification reaction by turbidity derived from magnesium pyrophosphate formation[J].Biochem Biophys Res Commun,2001,289(1):150.

[6]Mori Y,Kitao M ,Tomita N ,et al.Real-time turbidimetry of LAMP reaction for quantifying template DNA[J].J Biochem Biophys Methods,2004,59(2):145.

[7]Nagamine K,Hase T,Notomi T.Accelerated reaction by loop-mediated isothermal amplification using loop primers[J].Mol Cell Probes,2002,16(3):223.

[8]Kaneko H,Kawana T,F(xiàn)ukushima E,et al.Tolerance of loop-mediated isothermal amplification to a culture medium and biological substances[J].J Biochem Biophys Methods,2007,70(3):499.

[9]Sugiyama H,Yoshikawa T ,Thira M,et al.Comparison of loop-mediated isothermal amplification,real-time PCR,and virus isolation for the detection of herpes simplex virus in genital lesions[J].J Med Virol,2005,75(4):583.

[10]Enomoto Y,Yoshikawa T,Ihira M,et al.Rapid diagnosis of herpes simplex virus infection by a loop-mediated isothermal amplification method[J].J Clin Microbiol,2005 ,43(2):951.

[11]Kaneko H ,Iida T ,Aoki K ,et al.Sensitive and rapid detection of herpes simplex virus and varicella-zoster virus DNA by loop-mediated isothermal amplification[J].J Clin Microbiol,2005 ,43(7):3290.

[12]Goldschmidt P ,Rostane H ,Saint-Jean C,et al.Effects of topical anaesthetics and fluorescein on the real-time PCR used for the diagnosis of Herpesviruses and Acanthamoeba keratitis[J].Br J Ophthalmol,2006,90(11):1354.

[13]Pandori MW ,Lei J,Wong EH ,et al.Real-Time PCR for detection of herpes simplex virus without nucleic acid extraction[J].BMC Infect Dis,2006,6:104.

[14]Kowalski RP,Thompson PP,Kinchington PR,et al.Evaluation of the SmartCycler II system for real-time detection of viruses and Chlamydia from ocular specimens[J].Arch Ophthalmol,2006 ,124(8):1135.

[15]劉愛英,尹躍平,孫建方,等.多重PCR檢測性傳播生殖器潰瘍性疾病病原體方法的研究[J].中國皮膚性病學雜志,2005,19(9):530.

[16]Zhang Y,Kimura T,F(xiàn)ujiki K ,et al.Multiplex polymerase chain reaction for detection of herpes simplex virus type 1,type 2,cytomegalovirus,and varicella-zoster virus in ocular viral infections[J].Jpn J Ophthalmol,2003,47(3):260.

[17]J ??skel?inen AJ,PiiparinenH ,Lappalainen M,et al.Improved multiplex-PCR and microarray forherpesvirus detection from CSF[J].J ClinVirol,2008,42(2):172.

[18]劉軍連,徐志凱,喻啟桂,等.單克隆抗體間接免疫熒光試驗檢測生殖器單純皰疹病毒感染[J].第四軍醫(yī)大學學報,2004,25(8):728.

[19]Pereira SR,C amara FP,Guimar ?es MA ,et al.An immunofluorescence test for diagnosis of ophthalmic herpes in a mouse corneal model[J].Rev Inst Med Trop Sao Paulo,2007,49(2):87.

[20]Zandi K,Roostaee MH,Sadeghizadeh M ,et al.Production of recombinant gG-1 protein of herpes simplex virus type 1 in a prokaryotic system in order to develop a type-specific enzyme-linked immunosorbent assay kit[J].FEMS Immunol Med Microbiol,2007 ,50(3):319.

猜你喜歡
皰疹病毒探針靈敏度
基于機電回路相關(guān)比靈敏度的機電振蕩模式抑制方法
基于靈敏度分析提升某重型牽引車車架剛度的研究
基于FANUC數(shù)控系統(tǒng)的馬波斯探針標定原理及應(yīng)用
導磁環(huán)對LVDT線性度和靈敏度的影響
荔枝草提取物體外抗單純皰疹病毒Ⅰ型的研究
單純皰疹病毒性腦炎治療措施的臨床證據(jù)評價
穿甲爆破彈引信對薄弱目標的靈敏度分析
Les consommateurs peuvent-ils rendre des produits sortis de leur emballage ?
解旋酶-引物酶復合物抑制劑pritelivir治療單純皰疹病毒2型感染
野雞冠花子液治療單純皰疹病毒性角膜炎70例