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山羊生長軸各類激素及其受體基因的研究

2010-02-10 23:18北京農(nóng)業(yè)職業(yè)學(xué)院
中國畜牧業(yè) 2010年7期
關(guān)鍵詞:內(nèi)含子多態(tài)外顯子

○北京農(nóng)業(yè)職業(yè)學(xué)院 田 璐

山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 張春香 岳文斌

動物生長發(fā)育調(diào)控是一個高度復(fù)雜而精細(xì)的生理過程,受多個生長調(diào)控系統(tǒng)的影響,其中,神經(jīng)內(nèi)分泌生長軸各因子(激素、受體、結(jié)合蛋白等)及其基因?qū)游锏纳L發(fā)育起著關(guān)鍵作用。正常情況下,下丘腦接受體內(nèi)外的信息,釋放促生長激素釋放激素(GHRH)和生長激素(SRIF),調(diào)節(jié)垂體生長激素(GH)的分泌,GH通過與生長激素結(jié)合蛋白(GHBP)結(jié)合而運輸,與靶器官上生長激素受體(GHR)結(jié)合,促使胰島素樣生長因素(IGFS)的產(chǎn)生并進(jìn)入血液循環(huán),IGFs再通過與胰島素樣生長因子結(jié)合蛋白(IGFBP)結(jié)合轉(zhuǎn)運到全身組織細(xì)胞,促使組織細(xì)胞的生長與分化。鑒于GHRH、GH、GHR、IGF-I和胰島素樣生長因子蛋白(IGFBPs)在動物生長中的重要作用,許多研究者把它們的基因作為候選基因用來尋找與畜禽生產(chǎn)性能相關(guān)的多態(tài)位點,以便在育種中進(jìn)行標(biāo)記輔助選擇,提高選種的準(zhǔn)確性,加快遺傳進(jìn)展。截至目前,人們已經(jīng)完成人和鼠生長軸上主要基因的克隆測序,并對這些基因及其蛋白功能進(jìn)行了詳盡研究。下文綜述山羊生長軸主要基因結(jié)構(gòu)、多態(tài)性及與生產(chǎn)性能的關(guān)聯(lián)結(jié)果等方面的研究情況。

1.山羊GH基因克隆、定位及多態(tài)性的研究。Yamano等和Yato等先后克隆了山羊GH基因cDNA序列。Kioka等(1989)以牛GH基因cDNA作為探針,得到了Tokara山羊GH基因全序列,它由2 544 bp組成,包含5個外顯子和4個內(nèi)含子,在啟動子中含有順式調(diào)控序列,在轉(zhuǎn)錄起始位點上游83 bp有TATA盒。山羊GH基因5個外顯子長度分別為13 bp、161 bp、117 bp、162 bp和201 bp;4個內(nèi)含子長度分別為247 bp、227 bp、229 bp和276 bp,外顯子和內(nèi)含子的交界處均符合GT-AG規(guī)則,該研究為山羊GH基因多態(tài)的研究奠定了基礎(chǔ)。

山羊GH基因則是通過比較基因組學(xué)技術(shù)定位于19號染色體的長臂上(19q22)。在山羊基因組中,山羊GH基因有3個等位基因。Yamano等(1991)發(fā)現(xiàn)山羊GH基因有2個克?。?個克?。–gGH)包含gGH1基因;另1個克隆 (EgGH) 包含 gGH2和 gGH3基因。CgGH克隆包含491 bp的插入序列,正好位于gGH3基因的上游。從測序結(jié)果看gGH基因的兩側(cè)序列有短散布的重復(fù)序列(SINEs),CgGH 克隆中有 4個SINEs,EgGH克隆中有8個SINEs,并指出山羊 gGH1、gGH2和gGH3基因因個體不同而數(shù)目不一。目前研究報道較多的是gGH1基因,對于gGH2和gGH3基因沒有見到更多有關(guān)報道。

在山羊上,Malveiro等(2001)用PCR-SSCP方法分析奶山羊GH基因5個外顯子,并分析這些多態(tài)位點與奶產(chǎn)量、脂肪和蛋白含量等關(guān)系,結(jié)果表明:在外顯子1和外顯子2上存在2個等位基因;在外顯子3上存在4個等位基因;在外顯子4上存在6個等位基因;在外顯子5上存在5個等位基因;外顯子4的基因型F/F個體較其他基因型個體在奶產(chǎn)量上有顯著差異(P<0.05);外顯子5的基因型A/A個體較其他基因型個體在奶產(chǎn)量上有顯著差異(P<0.05)。結(jié)果說明,GH基因可作為候選基因用于奶山羊標(biāo)記輔助選擇。

李美玉等(2004)以多個山羊品種(系)為研究材料,采用PCR-SSCP方法對山羊生長激素基因多個不同位點(225~429、-406~-193、26~239) 進(jìn)行多態(tài)性分析,發(fā)現(xiàn)3個位點均存在多態(tài)性,并在-406~-193位點,基因型頻率在品種間存在顯著差異(P<0.05);進(jìn)一步與體重關(guān)聯(lián)分析結(jié)果顯示:26~239片段及225~429片段多態(tài)位點對體重的影響都沒有達(dá)到顯著水平,但后者DD基因型比CC、CD基因型有更高的斷奶重和周歲重,且差異接近顯著水平。閔令江等(2004)以波爾山羊與魯北白山羊的雜交一代為試驗材料,采用PCR-RFLP技術(shù)對GH基因的第一至第二內(nèi)含子進(jìn)行了研究,基因型與出生重和部分屠體性狀關(guān)聯(lián)分析結(jié)果表明:基因型僅對胴體重有顯著影響(P<0.05),并且在群體中AB基因型的效應(yīng)顯著高于AA基因型,在不同性別上卻沒有發(fā)現(xiàn)這種基因型之間的差異。但是在出生重、10月齡屠宰活重、胴體重和凈肉重4個性狀的表達(dá)上均發(fā)現(xiàn)AB基因型大于AA基因型的趨勢。

2.山羊GHR基因克隆、定位及多態(tài)性的研究。1987年,Leung等從兔肝臟中提取并純化出GHR,又根據(jù)氨基酸序列首次從兔的肝臟cDNA文庫中克隆出GHR cDNA。隨后人們相繼克隆了人(Accession No.:NM000163)、小鼠(Accession No.:J04811)、 家 鼠(Accession No.:NM010284)、綿羊(Accession No.:NM001009323)、牛(Accession No.:NM176608) 和 豬(Accession No.:X5429)等多種動物的GHR cDNA。但截至目前,GenBank中僅有零星片段報道,Maj等(2003)克隆了山羊GHR基因P1啟動子區(qū)和外顯子1a(Accession No.:AY358031),P1啟動子區(qū)位于450~938 bp,微衛(wèi)星序列位 于 828~855 bp,TATA 盒位于914~919 bp,外顯子1a位于940~1148,屬于非翻譯區(qū);后來,又克隆了GHR基因的外顯子4序列(Accession No.:AY739707),目前還沒有完整cDNA序列和GHR全序列。山羊和牛GHR基因都位于20號染色體的長臂q17上,并且也與PRLR位于同一區(qū)域。

截至目前,有關(guān)羊GHR基因多態(tài)和與生產(chǎn)性能關(guān)系的報道很少。Maj等將奶山羊GHR基因的5′調(diào)控區(qū)存在(TG)n多態(tài),其重復(fù)數(shù)為10~30,在奶山羊群體中(TG)14等位基因的頻率最高,達(dá)到0.48,而(TG)17等位基因的頻率為0.03,但沒有發(fā)現(xiàn)(TG)13等位基因,與產(chǎn)奶性狀進(jìn)行了關(guān)聯(lián)分析結(jié)果表明(TG)n多態(tài)與產(chǎn)奶性狀沒有相關(guān);而張春香等(2007)發(fā)現(xiàn)在南江黃羊和波爾山羊兩個群體中(TG)13的基因頻率較高,其次是(TG)14、(TG)17等位基因的頻率最低,且該多態(tài)對周歲體重影響顯著,基因型BB所對應(yīng)周歲體重的最小二乘均值顯著高于基因型DD所對應(yīng)的最小二乘均值(P<0.05)。

3.山羊IGFs基因克隆、定位及多態(tài)性的研究。IGF-I是一個單拷貝基因。成熟的IGF-I是一個較小的多肽,但在哺乳動物中該基因卻相當(dāng)大,基因組DNA為80~100 kb,由5個或6個外顯子組成,如有5個外顯子,則成熟的多肽是由外顯子2和3之間的區(qū)域編碼組成;如有6個外顯子組成,則成熟的多肽是由外顯子3和4之間的區(qū)域編碼組成。根據(jù)現(xiàn)在的命名,外顯子1和外顯子2是前導(dǎo)外顯子,編碼5'UTR的上游沒有啟動子的CTTAA或TATA序列,但具有不同的轉(zhuǎn)錄起始位點,含外顯子1的IGF-ImRNA稱為1類啟動子,含外顯子2的IGF-ImRNA稱為2類啟動子,選擇性地拼接到外顯子3。

山羊IGF-I基因的全序列還沒有報道,Mikawa等(1995)克隆了山羊IGF-I基因的不同的外顯子1片段,該片段長4 244 bp,包括外顯子1W、外顯子1和外顯子1A。Sakai等(2001)克隆了山羊IGF-I基因的幾個外顯子片段,包括外顯子3、外顯子4和外顯子6。用DNAstar軟件,將這3個區(qū)的編碼部分連接后,與山羊cDNA序列比較發(fā)現(xiàn),已經(jīng)包含了完整的編碼區(qū)。即山羊的IGF-I基因有6個外顯子,成熟的多肽是由外顯子3和4之間的區(qū)域編碼組成。山羊的IGF-I定位在第5號染色體上的5q31。Yilmaz等研究表明綿羊IGF-I基因5′調(diào)控區(qū)和第1外顯子都有多態(tài)。山羊IGF-I基因多態(tài)研究還未見報道。

4.羊IGFBP3基因克隆、定位及多態(tài)性的研究。IGFBP3是單拷貝基因,牛IGFBP3大約長度10 kb,由5個外顯子和4個內(nèi)含子組成,5′端4 000 bp,539 bp的外顯子1,2 954 bp內(nèi)含子1,227 bp外顯子2,474 bp內(nèi)含子2,120 bp外顯子3,1 049 bp內(nèi)含子3 141 bp的外顯子4,1 547內(nèi)含子4和1 421的外顯子5,其中,外顯子1~4是IGFBP3蛋白的編碼區(qū)。牛的轉(zhuǎn)錄起始點位于起始密碼子上游的137 bp處,該處是一個CAP位點,其上游的26 bp有TATA盒,在5′端到TATA盒之間,沒有發(fā)現(xiàn)CAAT盒,但發(fā)現(xiàn)了包含兩個重疊的假定AP2結(jié)合點的一個富含GC的序列元。目前,對山羊IGFBP3一級結(jié)構(gòu)的研究還較少,其全序列還沒有報道。

山羊的IGFBP3基因定位在第4號染色體上,閔令江等(2006)研究了山羊IGFBP3基因F4/R4位點單核苷酸多態(tài)性與體重、體高、體尺和屠體性狀的關(guān)系。分析結(jié)果顯示,山羊IGFBP3基因F4/R4位點對3月齡體長和胸圍、10月齡體長、胸圍、12月齡體長、斷奶重和眼肌面積有影響;在體尺上,均表現(xiàn)為AG型極顯著地大于GG型(P<0.01),在數(shù)值上均遵循AG>AA>GG;在斷奶重和眼肌面積上,則有AG型顯著大于GG型(P<0.05)。山羊 IGFBP3基因 F4/R4位點對體長、胸圍、斷奶重和眼肌面積發(fā)揮作用可能以超顯性為主。

雖然目前對山羊生長軸主要基因結(jié)構(gòu)、多態(tài)性及與生產(chǎn)性能的關(guān)聯(lián)分析等方面研究還很有限,但是隨著肉用山羊業(yè)的發(fā)展,這方面的研究會越來越多。

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