12條運營線路，75年使用歷史，171個車站站臺，雖然莫斯科地鐵站是一個非常復雜的運輸系統(tǒng)，但是它維持著一個很低的事故率。2010年3月29日發(fā)生的2次自殺式炸彈襲擊是第八次事故，也是損失最為嚴重的一次。

1977年炸彈恐怖襲擊

1977年1月8日，一顆炸彈奪去了7名無辜乘客的生命，33人受傷。炸彈是在扎莫斯克沃列茨卡婭線(lzmailovskaya)和阿爾巴特斯克一波克羅夫斯卡婭線(Pervomaiskaya)間一列擁擠的列車中被引爆的。在之后的調(diào)查中，3名美國人被指控參與并實施了這次爆炸襲擊。

1981年站臺火災

1981年6月，從OktyabrSkaya站臺火場中抬出了7具尸體，同時Prospekt Mira站臺起火。

1982年扶手電梯事故

又一次致命的事故發(fā)生在1982年2月17日，卡浩夫斯卡婭線(Kalininskaya)的Aviamotomaya站臺使用的扶手電梯倒塌。在這次事故中8人喪命，30人重傷，事故發(fā)生的原因是電梯緊急剎車老化。

1983年列車相撞

1983年3月30日，環(huán)狀線(Koltsevaya)的Belorusskaya站兩列列車迎頭相撞，造成人員傷亡。當時莫斯科地鐵站的一位負責人告訴外國記者并沒有事故發(fā)生，車站關閉是因為靠近車站的山體有滾石跌落。

2004年炸彈恐怖襲擊

2004年2月6日，扎莫斯克沃列茨卡婭線(zamoskvoretskaya)的Avtozavodskaya和Pavelelskaya站發(fā)生爆炸襲擊，40人喪生超過100人受傷。

2005年莫斯科大停電

2005年5月25日，莫斯科南部、西南和東南市區(qū)發(fā)生大面積停電事故。1天之后才完全恢復正常供電。莫斯科大停電造成損失至少10億美元。停電引發(fā)的交通癱瘓是俄羅斯近年來最嚴重的一次。停電造成43條地鐵線路中斷運行，莫斯科街上236個交通信號燈熄滅，引發(fā)一系列交通事故，交通擁堵嚴重，數(shù)以千計的人涌入嚴重超載的巴士。停電使1500人困在電梯內(nèi)。至少20家醫(yī)院因停電被迫啟動備用電源。莫斯科證券交易所的交易被迫中斷。圖拉地區(qū)一家化工廠因停電發(fā)生爆炸。停電地區(qū)空調(diào)停運，居民搶購飲用水，出租車提價，社會秩序一片混亂。

2006年廣告牌事故

2006年3月19日，扎莫斯克沃列茨卡婭線(Zamoskvoretskaya)的Sokol和Voikovskaya站之間一個正在往屋頂安裝的廣告牌突然跌落，砸中行駛列車，索性并未造成傷亡。

2010年自殺式炸彈恐怖襲擊

2010年3月29日，索考勒尼切斯卡婭線(Sokolnicheskaya)盧比揚卡站和文化公園站接連發(fā)生恐怖襲擊，導致39死95傷。