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高原藏系綿羊EPAS1基因的克隆以及組織表達(dá)研究

2011-02-12 02:28:05烏仁塔娜白振中格日力
中國醫(yī)藥指南 2011年26期
關(guān)鍵詞:習(xí)服獲得性綿羊

烏仁塔娜 劉 芳 白振中 嘎 琴 格日力

(青海大學(xué)醫(yī)學(xué)院高原醫(yī)學(xué)研究中心,青海 西寧 810001)

EPAS1是哺乳動物機(jī)體功能在缺氧條件下的重要氧依賴轉(zhuǎn)錄激活因子。其蛋白屬于bHLH-PAS轉(zhuǎn)錄因子家族成員,由氧敏感的α亞基和核內(nèi)穩(wěn)定表達(dá)的β亞基以異源二聚體形式存在。近來越來越多的研究發(fā)現(xiàn),EPAS1參與諸多低氧有關(guān)的下游基因的表達(dá)調(diào)控,從而在低氧調(diào)控機(jī)制中發(fā)揮重要作用[1,2]。因此結(jié)合我們正在開展的有關(guān)低氧獲得性習(xí)服相關(guān)的研究,對青藏高原獲得性習(xí)服物種藏系綿羊EPAS1的基因進(jìn)行了克隆及序列分析,以便為進(jìn)一步研究高原獲得性習(xí)服以及急慢性高原病的發(fā)病機(jī)制的研究提供資料。

1 材料與方法

1.1 材料來源

2009年4月在青海省可可西里國家級自然保護(hù)區(qū)(海拔4300m)捕獲雄性藏系綿羊10只,捕捉后立即運至格爾木市(海拔2800m)解剖取藏系綿羊各組織,迅速投入液氮容器中,低溫保存并運回西寧。

1.2 方法

1.2.1 總RNA提取及鑒定

按照Trizol試劑盒說明提取藏系綿羊肺組織總RNA,溶于20μL DEPC水中,并用DU800核酸蛋白含量檢測儀測定A260/A280值及濃度,并進(jìn)行1%甲醛變性凝膠電泳檢測其質(zhì)量,置-80℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>

1.2.2 目的基因擴(kuò)增及序列測定

引物設(shè)計:利用GenBank中人、小鼠、大鼠、牛和牦牛的EPAS1 cDNA序列用ClustalW進(jìn)行同源性對比。

目的基因的擴(kuò)增:取總RNA 2.0μg,按照AMV逆轉(zhuǎn)錄酶試劑盒逆轉(zhuǎn)錄合成cDNA第一鏈。PCR反應(yīng)體系:模板cDNA 1μL,PCR Master Mix 15μL,EPAS1上下游引物各1μL,加水補足至25μL;擴(kuò)增條件為:95℃預(yù)變性5min后進(jìn)行35個循環(huán),每循環(huán)95℃ 30s,55℃ 1min,72℃ 1min,循環(huán)結(jié)束后72℃延伸10min。取PCR產(chǎn)物10μL 進(jìn)行1.2%的瓊脂糖凝膠電泳,采用紫外凝膠成像分析系統(tǒng)記錄電泳結(jié)果。

PCR產(chǎn)物的回收、純化及序列測定:用 QIAquick Gel 回收試劑盒回收純化456bp PCR擴(kuò)增片段并連接到 pGEM-T Easy載體上。通過藍(lán)白斑篩選實驗挑取白斑單克隆,接種后37℃搖床過夜,然后提取質(zhì)粒,用EcoRⅠ酶切電泳,選出含有目的片段的陽性克隆送上海英俊生物生物技術(shù)有限公司進(jìn)行序列測定。將獲得的基因序列在GenBank上進(jìn)行Blast初步比較分析和在ClustalX上進(jìn)行物種同源性比較。

1.2.3 熒光定量PCR

采用CluxtalW軟件對人、大鼠、小鼠、牛的Beta- actin,EPAS1,EPO的序列進(jìn)行同源性比對。定量PCR由iCycler 定時定量PCR儀來完成。結(jié)果顯示溶解曲線只出現(xiàn)一個主波峰,說明PCR擴(kuò)增的特異性較高,符合實時熒光定量的技術(shù)要求。

2 結(jié) 果

2.1 目的基因的PCR擴(kuò)增及測序結(jié)果分析

用DNAMAN軟件,將藏系綿羊EPAS1基因測序序列與其他物種進(jìn)行同源性比較分析,結(jié)果顯示與人、大鼠、小鼠、牛的EPAS1基因的同源性分別達(dá)到了94%、91%、92%、98%的同源性。

2.2 熒光定量PCR(ΔΔCt方法)檢測結(jié)果

以β-actin為內(nèi)參基因,計算藏系綿羊各個組織的EPAS1的ΔCt??梢钥闯鯡PAS1基因mRNA的表達(dá)量在心臟中最高,約是肺臟的1.8倍,在肝臟中表達(dá)量的2.5倍,約是在腎中表達(dá)量的7.57倍。

3 討 論

本研究應(yīng)用RT-PCR技術(shù)首次從草地藏系綿羊肝臟中獲得了EPAS1基因的部分編碼區(qū)序列,為進(jìn)一步研究藏系綿羊EPAS1的表達(dá)及其與高原地區(qū)獲得性習(xí)服機(jī)制的研究提供了基礎(chǔ)。我們進(jìn)行了EPAS1 mRNA在藏系綿羊的心、腎、肝、肺組織中的表達(dá),發(fā)現(xiàn)EPAS1基因mRNA在藏系綿羊心臟組織中表達(dá)量最高。故可認(rèn)為在藏系綿羊中EPAS1基因的在心臟中的高表達(dá)可能與其在低氧環(huán)境下藏系綿羊的心臟保護(hù)性改變有著重要的關(guān)系。

綜上所述長期適應(yīng)高海拔低氧的獲得性習(xí)服物種藏系綿羊,對低氧已經(jīng)形成了部分適應(yīng)性改變,且在分子水平,生理水平,形態(tài)水平已經(jīng)有了一定的改變,這對青藏高原移居物種在低氧習(xí)服機(jī)制的研究有著重要的價值。通過對藏系綿羊EPAS基因的研究,可以有助于對慢性高原病的發(fā)病機(jī)制的研究提供理論依據(jù)。

[1]管峰,石國慶,劉守仁,等.角蛋白家族及其對羊毛生長發(fā)育的調(diào)控[J].生命的化學(xué),2007,27(1):92-94.

[2]謝馥交,盧向陽.克隆全長cDNA的方法及其在獸藥研究中的應(yīng)用[J].中國獸藥雜志,2006,40(5):43-47.

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