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海南漢族乙型肝炎病毒基因型與BCP區(qū)和前 C區(qū)基因突變的關(guān)系

2011-05-23 03:59曾俊濤曾仕平鐘良寶
山東醫(yī)藥 2011年13期
關(guān)鍵詞:突變率核苷酸基因突變

曾俊濤,陳 靜,曾仕平,鐘良寶

(海南醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院,海口 570102)

研究發(fā)現(xiàn),不同基因型乙型肝炎病毒(HBV)與感染后臨床疾病譜有一定的相關(guān)性。迄今為止,海南漢族人群 HBV基因型與前 C區(qū)和 BCP區(qū)基因突變的關(guān)系尚未見報道。為此,本研究通過對慢性乙型肝炎(CHB)患者 HBV基因型和基因序列的檢測,探討海南漢族 HBV基因型與前 C區(qū) G1896A和BCP區(qū) A1762T/G1764A基因突變之間的相互關(guān)系。

1 資料與方法

1.1 臨床資料 2005年 2月 ~2006年 10月海南醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院門診和住院 CHB患者 83例,男 48例、女 35例,年齡 21~58(37.55±9.68)歲?;颊咴\斷均符合 2005年中華醫(yī)學(xué)會肝病學(xué)分會、中華醫(yī)學(xué)會感染病學(xué)分會聯(lián)合制定的診斷標(biāo)準(zhǔn),并排除了其他嗜肝病毒和艾滋病病毒的感染?;颊哐?HBV DNA檢測均為陽性,入組前均未接受抗病毒治療。

1.2 HBV基因型檢測 采空腹靜脈血,分離血清,凍存于 -20℃待檢。按照HBV基因分型試劑盒(廣州華銀生物有限公司)說明書的要求,RT-PCR方法檢測患者的 HBV基因型。從 50μl血清中提取 HBV DNA,取 B、C、D型反應(yīng)液各 23 μl,分別加入 1 U Taq酶和 2μl模板來配制反應(yīng)體系。PCR反應(yīng)條件:94℃ 60 s,94℃5 s,60℃ 30 s,40個循環(huán)。熒光素設(shè)定為 6-羧基熒光素。在反應(yīng)程序的第 2步 60℃末讀取熒光值,樣本在哪一型反應(yīng)液中有擴(kuò)增即為該型;如果在多型反應(yīng)液中都有擴(kuò)增,判為混合感染[1,2]。

1.3 HBV前 C區(qū)和 BCP區(qū)基因突變的檢測 HBV DNA的提取采用北京 Tiangen生物有限公司 DNA提取試劑盒,嚴(yán)格按照說明書的操作要求自200μl血清中提取 HBV DNA作為 PCR模板。PCR擴(kuò)增上游引物為 5'-CCCAAGGTCTTACATAAGAGG-3',下游引物為5'-GGTGGCCAGATTCATCAACT-3,擴(kuò)增片段的長度為470 bp,包括 C啟動區(qū)、前 C區(qū)和部分 X基因。 PCR的反應(yīng)條件:首先 94℃預(yù)變性 120 s;然后 94℃變性60 s,55 ℃退火 30 s,72℃延伸 60 s,30個循環(huán);72 ℃延伸 600 s。取 5μl PCR產(chǎn)物,經(jīng) 1%瓊脂糖凝膠電泳鑒定PCR反應(yīng)效果。PCR產(chǎn)物經(jīng)純化后,送由中國國家人類基因組南方研究中心檢測。

1.4 統(tǒng)計學(xué)方法 采用 SPSS12.0統(tǒng)計軟件,計量資料以±s表示,不同組之間計量資料比較采用t檢驗。HBV基因型、BCP區(qū)和前 C區(qū)基因突變在不同組之間分布比較采用 χ2檢驗。P≤0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 HBV C區(qū)基因 PCR產(chǎn)物電泳結(jié)果 采用 PCR擴(kuò)增 HBV C基因核苷酸(nt1643-nt2112)。預(yù)期片段長度為 470 bp,包括 C啟動子、前 C區(qū)及部分 X基因。擴(kuò)增片段陽性者可在 470 bp處見到熒光條帶。

2.2 HBV BCP區(qū) A1762T/G1764A、HBV前 C區(qū)G1896A突變基因測序結(jié)果 見圖1、圖 2。

圖1 BCP區(qū) A1762T/G1764A基因突變

圖2 前 C區(qū) 1896G→A突變基因

2.3 不同基因型與BCP區(qū)A1762T/G1764A和前C區(qū) G1896A突變的關(guān)系 34例基因型 C BCP區(qū)A1762T/G1764A突變率(58.82%)顯著高于基因型B(10.53%)(χ2=18.36,P<0.05)。基因型 C G1896A突變率為 29.41%,基因型 B G1896A突變率為 47.37%,兩者之間比較無統(tǒng)計學(xué)差異(χ2=2.43,P>0.05)。見表1。

表1 83例漢族CHB患者基因型與 BCP區(qū)A 1762T/G1764A和前 C區(qū)G 1896A突變的關(guān)系[例(%)]

3 討論

研究顯示,不同基因型 HBV在致病性方面存在一定差異[3]。有文獻(xiàn)報道[4],基因型 C與較高的HBV DNA水平有關(guān)。Lindh等[5]研究也顯示,與基因型 B比較,基因型 C更易引起嚴(yán)重的肝臟疾病,且與肝臟組織炎癥壞死、纖維化關(guān)系密切。

BCP區(qū)有 3個 AT富集區(qū),分別位于 nt1752-1755(ATTA),nt1758-1762(TTAAA),nt1789-1795(ATAAATT)。BCP區(qū)變異最常見在 1762位核苷酸A→T和 1764位核苷酸 G→A,稱為雙位點突變。本研究顯示,基因型 C BCP區(qū) A1762T/G1764A突變率顯著高于基因型 B。我們推測 BCP區(qū) A1762T/G1764A突變可能是影響基因型 C和基因型 B HBV致病力差異的原因之一。BCP區(qū) A1762T/G1764A雙突變可能通過以下機理影響 HBV致病性:①突變使 HBV的轉(zhuǎn)錄和包裝增加,加強病毒復(fù)制;②突變增強 HBV DNA與肝細(xì)胞 DNA的整合;③BCP區(qū)A1762T/G1764A雙突變可減少 HBeAg的表達(dá),引發(fā)針對 HBcAg的抗體反應(yīng),加劇細(xì)胞壞死和損傷;④BCP區(qū) A1762T/G1764A突變使 X基因編碼區(qū)密碼子發(fā)生改變,導(dǎo)致 X蛋白結(jié)構(gòu)異常,從而影響 X蛋白反式激活,導(dǎo)致肝臟組織損害加劇[6]。

HBV前 C區(qū) mRNA翻譯產(chǎn)生一個 25 kD蛋白,其被信號肽序列引導(dǎo)至內(nèi)質(zhì)網(wǎng),形成 HBeAg的前體蛋白。在目前發(fā)現(xiàn)的前 C區(qū)基因突變位點中,第1896位核苷酸突變最為常見。G1896A的變異可以導(dǎo)致第 28位密碼由色氨酸 TGG突變成終止密碼TAG,終止或減少 HBeAg合成[7,8]。本研究顯示,基因型 C前 C區(qū) G1896A突變率與基因型 B前 C區(qū)G1896A突變率比較無差異,提示前 C區(qū) G1896A可能與不同基因型 HBV致病力的差異無關(guān)。

綜上所述,不同基因型 HBV致病能力可能與病毒基因組 BCP區(qū) A1762T/G1764A突變率的不同有關(guān),而與前 C區(qū) G1896A突變無關(guān)。

[1]Hen JK,Hou JL,Zhou R,et al.Comparison of three genotyping methods for hepatitis B virus[J].Chin J Hepatol,2006,14(8):620-622.

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