魏 偉,苗永旺
(云南農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科學(xué)技術(shù)學(xué)院,云南 昆明650201)
隨著人們生活水平的提高,奶制品以及加工工藝對(duì)原料奶質(zhì)量要求的提高,使得在使用抗生素治療奶牛乳腺炎時(shí)造成牛奶中抗生素殘留問(wèn)題越來(lái)越突出;另外,隨著奶牛向高產(chǎn)奶量方向選育,奶牛乳腺炎發(fā)病率也越來(lái)越高。因此,如何通過(guò)藥物預(yù)防和治療奶牛乳腺炎,如何減少牛奶中藥物殘留等方面,這些并不能從根本上解決奶牛乳腺炎發(fā)病率高的問(wèn)題。而對(duì)奶牛乳腺炎抗性候選基因的研究,選育出抗乳腺炎奶牛品種,這才是降低奶牛乳腺炎發(fā)病率的根本所在[1]。
乳腺炎(mastitis)是一種在奶牛業(yè)中多發(fā)的并且極其復(fù)雜的疾病,想通過(guò)一種單一方法去防治奶牛乳腺炎,效果并不理想。現(xiàn)在乳腺炎仍然是奶牛群中花費(fèi)最多的一種疾病,在美國(guó)將近要花費(fèi)20億美元用來(lái)預(yù)防乳腺炎和提高奶產(chǎn)品的質(zhì)量,日本將進(jìn)花費(fèi)690億日元[2]。Shook[3]報(bào)道,奶牛乳腺炎遺傳力僅為0.02~0.04??梢?jiàn)其遺傳力較低,因此,對(duì)奶牛乳腺炎性狀進(jìn)行直接選擇的標(biāo)準(zhǔn)性很小。近年來(lái),隨著是基因組學(xué)和生物信息學(xué)迅速發(fā)展,為乳腺炎抗病育種提供了新方法,尤其是現(xiàn)在基因芯片的廣泛使用及不同組織器官轉(zhuǎn)錄組深入研究,為奶牛乳腺炎抗病育種提供了新的前景。本文就奶牛乳腺炎抗性候選基因研究進(jìn)展作一綜述。
鋅指蛋白基因家族是一個(gè)巨大的超基因家族。鋅指蛋白是一類具有手指狀結(jié)構(gòu)域的轉(zhuǎn)錄因子,在基因的表達(dá)調(diào)控、細(xì)胞分化等方面起重要的作用。
Znf313基因是鋅指蛋白家族的成員,參與基因表達(dá)調(diào)控。曹隨忠等[4]利用一個(gè)患乳腺炎奶牛外周血白細(xì)胞中差異表達(dá)的EST序列,采用了電子克隆和分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)技術(shù)相結(jié)合的方法,克隆了一個(gè)與奶牛乳腺炎抗性相關(guān)的基因cDNA編碼序列,并將該基因被命名為鋅指蛋白313基因,其開(kāi)放閱讀框架1~639bp,推測(cè)其編碼230個(gè)氨基酸。他們還將克隆的Znf313基因推測(cè)的編碼氨基酸序列與人和豬的Znf313基因編碼氨基酸序列進(jìn)行比較,相似性為95%和94%,揭示牛Znf313基因與人和豬Znf313基因具有相似的生物學(xué)功能。Ma等[5]克隆了人Znf313基因并研究了其生物學(xué)功能,結(jié)果表明人Znf313基因參與細(xì)胞分化。該基因在水牛上還沒(méi)有相關(guān)的報(bào)道,有待于進(jìn)一步研究。
前腦鋅指蛋白(forebrain embryonic zinc finger-like,F(xiàn)EZL)是鋅指蛋白基因家族中的成員,作為轉(zhuǎn)錄因子在動(dòng)物的神經(jīng)發(fā)育中起重要的作用,主要調(diào)控單胺能(monoaminergic)的神經(jīng)細(xì)胞的發(fā)育和機(jī)體的先天性免疫。
Sugimoto等[2]研究證明奶牛乳腺炎能夠誘發(fā)乳腺中FEZL的表達(dá),而FEZL能促進(jìn)SEMA5A的表達(dá)。SEMA5A表達(dá)量的提高能夠誘發(fā)與宿主免疫反應(yīng)相關(guān)的至少九個(gè)基因的表達(dá),包括TNF-α和IL-8。通過(guò)測(cè)序?qū)Ρ龋赘腥橄傺仔蛡€(gè)體的FEZL序列與抗乳腺炎型個(gè)體的FEZL基因序列差異只是存在一個(gè)三個(gè)堿基的插入突變,導(dǎo)致FEZL氨基乙酸鏈長(zhǎng)由12變成13。因?yàn)镕EZL氨基乙酸鏈的長(zhǎng)度影響它的轉(zhuǎn)錄活性,從而控制細(xì)胞因子的表達(dá)。隨后Sugimoto等[6]研究發(fā)現(xiàn)通過(guò)育種值估計(jì)來(lái)評(píng)價(jià)體細(xì)胞評(píng)分(somatic cell score,SCS),攜帶雜合12G的公畜的SCS明顯要低于攜帶純合的13G公畜,因此選擇攜帶雜合12G的公畜可以減少乳腺炎的發(fā)病率。該基因在黃牛上有研究,水牛上還沒(méi)有相關(guān)報(bào)道。
TLR4(toll-like receptor 4)是 TLRs(toll-like receptors)家族的重要成員之一,屬于I型跨膜蛋白,該蛋白胞外區(qū)高度變異,以適應(yīng)不同配體分子的需要,胞內(nèi)區(qū)卻很保守,以便維持信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)活性的需要[7]。牛 TLR4基因位于牛的8號(hào)染色體上[8],全長(zhǎng)11Kb,在機(jī)體炎癥反應(yīng)啟動(dòng)和病原微生物的免疫應(yīng)答中發(fā)揮著重要的作用。
王興平等[9]采用 CRS-PCR(create restricti on site combined with restriction fragment length polymorphism)方法擴(kuò)增了奶牛TLR4基因第三外顯子243bp的目的片段,通過(guò)限制性內(nèi)切酶Hinf I酶切篩查多態(tài)位點(diǎn),發(fā)現(xiàn)擴(kuò)增產(chǎn)物27bp處C-T突變?cè)斐删幋a氨基酸由蘇氨酸變?yōu)楫惲涟彼?,結(jié)果表明AA基因型為乳腺炎抗性基因型,A等位基因?yàn)槿橄傺卓剐杂欣?。劉文嬌等?0]采用PCR-RFLP(polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism)方法對(duì)奶牛TLR4基因第三外顯子321bp的部分序列進(jìn)行多態(tài)性分析,通過(guò)限制性內(nèi)切酶Bbv12I酶切篩查多態(tài)位點(diǎn),C-T突變導(dǎo)致編碼氨基酸由蘇氨酸變?yōu)楫惲涟彼?,結(jié)果表明不同基因型奶牛的SCS表現(xiàn)出CC基因型>CT基因型>TT基因型的趨勢(shì)。該基因在水牛上有相關(guān)的研究,但只有該基因的核苷酸序列。
TLR2(toll-like receptor 2)是 TLRs家族中的第2個(gè)成員,能夠識(shí)別多種病原微生物及其產(chǎn)物,介導(dǎo)天然免疫,通過(guò)細(xì)胞內(nèi)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo),啟動(dòng)獲得性免疫。牛TLR2基因被定位在17號(hào)染色體上[8]。
Petzl等[11]對(duì)14頭未感染乳腺炎的奶牛乳腺接種大腸桿菌和金黃色葡萄球菌,通過(guò)實(shí)時(shí)定量PCR(Real-time Quantity PCR)檢測(cè),發(fā)現(xiàn)大腸桿菌侵染后可顯著增加TLR2、TLR4以及β-防御素(β-defensin)的表達(dá),而接種金黃色葡萄球菌后可顯著增加β-防御素的表達(dá)。白杰等[12]對(duì)TLR2基因編碼區(qū)進(jìn)行測(cè)序,在第二外顯子發(fā)現(xiàn)3個(gè)SNPs,然后對(duì)這3個(gè)SNPs進(jìn)行PCR-RFLP檢測(cè),結(jié)果揭示189、631位點(diǎn)的SNP對(duì)奶牛的SCS有較大影響,而2260位點(diǎn)的SNP可能會(huì)提高奶牛的SCS。
乳鐵蛋白(lactoferrin,Lf)是保護(hù)乳腺組織的防御因子之一,屬于轉(zhuǎn)鐵蛋白家族[13],具有廣譜的抗菌作用。編碼乳鐵蛋白的基因被定位在22號(hào)染色體上,而且乳鐵蛋白濃度能被遺傳(h2=0.4)[14],其含量和乳腺炎的發(fā)生存在相關(guān)性,并發(fā)現(xiàn)在復(fù)原的乳腺組織內(nèi)Lf能極大地阻止葡萄球菌和大腸桿菌生長(zhǎng)。
Diarra[15]認(rèn) 為,N-乙 酰-β-D-氨 基 葡 萄 糖 苷 酶(N-acetyl-β-D-glucosaminidase,NAGase)不僅僅可以作為乳腺炎檢測(cè)的一個(gè)指標(biāo),而且該酶還具有一定的免疫活性,通過(guò)與Lf協(xié)同作用,能夠抑制某些病原微生物的活性。因此,從生理作用、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)到表達(dá)等各個(gè)水平深人研究NAGase在乳腺炎發(fā)生中的作用,對(duì)研究奶牛乳腺炎的檢測(cè)、治療乃至乳腺炎抗性的遺傳選育等都具有重大意義。王洪梅等[16]采用 PCR-RFLP、CRS-PCR 方法研究了中國(guó)荷斯坦牛Lf基因的啟動(dòng)子區(qū),結(jié)果表明Lf基因啟動(dòng)子區(qū)72位的AB基因型和478位的CC基因型均是奶牛乳腺炎抗性的優(yōu)良基因型,可作為分子標(biāo)記應(yīng)用于奶牛乳腺炎抗性篩選。
趨化因子(chemokine)是指一類能夠趨化細(xì)胞定向移動(dòng)的小分子分泌蛋白。趨化因子受體屬于G蛋白偶聯(lián)7次跨膜受體家族[17],大小一般由350~360個(gè)氨基酸組成。趨化因子通過(guò)與受體的結(jié)合,對(duì)免疫細(xì)胞在體內(nèi)的遷移、活化和分布起重要作用,并參與免疫應(yīng)答的調(diào)控,與機(jī)體抵抗感染(如HIV感染)等密切相關(guān)。
牛CXCR1基因被定位在2號(hào)染色體距著絲粒約90.3cM 處,其 mRNA 全長(zhǎng)是1083bp[18]。陳仁金等[18]采用PCR-SSCP方法研究了CXCR1基因的5'側(cè)翼區(qū)和編碼區(qū)進(jìn)行多態(tài)性檢測(cè),研究結(jié)果發(fā)現(xiàn)1830(A/G)位點(diǎn)AA基因型、1768(T/A)位點(diǎn)TT基因型和344(T/C)位點(diǎn)TT基因型以及根據(jù)發(fā)現(xiàn)的4個(gè)SNPs預(yù)測(cè)的10種單倍型中單倍型Haplo2(ATTA)純合體對(duì)中國(guó)荷斯坦牛的SCS具有較大的遺傳效應(yīng),可作為分子標(biāo)記應(yīng)用于奶牛乳腺炎抗性的篩選。
當(dāng)牛乳房發(fā)炎時(shí),嗜中性粒細(xì)胞將從血液中遷移到病菌感染處,通過(guò)與其受體結(jié)合吞噬病原體。研究表明,CXCR2基因多態(tài)性與牛的臨床和亞臨床性乳腺炎對(duì)疾病敏感性相關(guān)[19]。Younggerman等[20]研究了CXCR2基因的777位的SNP與乳腺炎抗性之間的關(guān)系,777位SNP基因型和隱性乳腺炎的表達(dá)顯著相關(guān)。劉文嬌等[21]采用測(cè)序技術(shù)對(duì)CXCR2基因編碼區(qū)進(jìn)行了多態(tài)性篩查,結(jié)果發(fā)現(xiàn)在612位、684位、777位、855位、858位和861位有6個(gè)SNPs,其中612位和777位SNPs可作為奶牛乳腺炎抗性分子標(biāo)記位點(diǎn)。該基因在水牛上沒(méi)有相關(guān)研究報(bào)道。
熱休克蛋白70(heat shock protein 70,HSP70)作為蛋白成熟過(guò)程中的分子伴侶通過(guò)分子伴侶作用參與新生蛋白質(zhì)折疊、轉(zhuǎn)運(yùn)、損傷蛋白質(zhì)的修復(fù)和抗原呈遞等許多重要體內(nèi)過(guò)程,其表達(dá)能夠減少NO的合成釋放,減輕炎癥因子對(duì)細(xì)胞的損傷。牛的HSP70由HSP70-1和 HSP70-2這兩個(gè)基因編碼,都被定位在染色體23q13。程維杰等[22]采用PCRSSCP和PCR-RFLP方法研究了中國(guó)荷斯坦奶牛HSP70-1基因編碼區(qū)的多態(tài)性及其與中國(guó)荷斯坦牛SCS的相關(guān)性,研究發(fā)現(xiàn)1623位點(diǎn)和2409位點(diǎn)2個(gè)SNPs,1623位點(diǎn)基因型與SCS相關(guān)性顯著(P<0.05),2409位點(diǎn)基因型與SCS相關(guān)性不顯著(P>0.05),CC基因型可作為改良奶牛乳腺炎抗性性狀的分子遺傳標(biāo)記。該基因在水牛上也沒(méi)有相關(guān)研究報(bào)道。
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