背景導(dǎo)致急性髓細(xì)胞樣白血病(AML)的諸多基因突變尚未明確。突變模式與表觀遺傳學(xué)表型的關(guān)系尚不清楚。方法研究者對(duì)200例臨床解釋為新型AML的成人患者的基因組進(jìn)行了分析,采用全基因組測(cè)序(50例)或全外顯子測(cè)序(150例),并且采用RNA、小分子RNA測(cè)序和DNA甲基化分析。結(jié)果AML基因組突變數(shù)量較其他成人癌癥突變數(shù)量少,平均僅13個(gè)基因發(fā)生突變。在這些基因中平均有5個(gè)基因發(fā)生多次突變,有23個(gè)基因發(fā)生顯著突變,另有237個(gè)基因在≥2個(gè)標(biāo)本中發(fā)生突變。幾乎所有標(biāo)本至少有一處非同義突變發(fā)生在幾乎確認(rèn)和癌癥發(fā)生相關(guān)的九大類基因中的一類,包括轉(zhuǎn)錄因子融合(18%)、基因編碼核磷蛋白(NPM1)(27%)、腫瘤抑制基因(16%)、DNA甲基化相關(guān)基因(44%)、信號(hào)通路基因(59%)、染色體-修飾基因(30%)、髓細(xì)胞轉(zhuǎn)錄因子基因(22%)、粘連蛋白復(fù)合物基因(13%)及剪接體復(fù)合物基因(14%)。相互協(xié)同及排斥模式表明幾種基因和類別間有較強(qiáng)的生物學(xué)聯(lián)系。結(jié)論研究者在幾乎所有AML樣本中識(shí)別出至少1個(gè)具有潛在驅(qū)動(dòng)作用的突變,并且發(fā)現(xiàn)復(fù)雜的遺傳事件相互作用與個(gè)別AML患者發(fā)病有關(guān)。本研究數(shù)據(jù)可廣泛用于今后對(duì)AML發(fā)病機(jī)制、分級(jí)和危險(xiǎn)分層的進(jìn)一步調(diào)查中。
原文見(jiàn):The Cancer Genome Atlas Research Network.Genomic and Epigenomic Landscapes of Adult De Novo Acute Myeloid Leukemia.N Engl J Med,2013.Published at:http://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMoa1301689?query=featured_home