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以同源異形盒家族HOXC6基因為靶標(biāo)熒光PCR鑒定地溝油的方法研究

2013-04-29 11:57:06楊冬燕楊永存李浩耿藝介張倩吳雙鄧平建
中國保健營養(yǎng)·中旬刊 2013年7期
關(guān)鍵詞:植物油靶標(biāo)核酸

楊冬燕 楊永存 李浩 耿藝介 張倩 吳雙 鄧平建

【摘 要】目的:以動物源性的同源異形盒家族HOXC6基因為靶標(biāo)建立地溝油鑒定方法。方法:通過基因數(shù)據(jù)庫的篩查、比對及特異性驗證,篩選確定以動物源性的同源異形盒家族HOXC6基因為靶標(biāo),采用實時熒光PCR方法對正常植物油和地溝油進行鑒定。 結(jié)果:6個已知來源的地溝油樣品全部被鑒定為地溝油,而8個正常食用植物油全部被鑒定為非地溝油。 結(jié)論:與課題組前期建立的采用針對多個動物物種特異性基因的PCR鑒定方法相比,該研究建立的方法在有效提高檢測靈敏度的同時,不但避免了先后擴增多個基因片段的繁瑣,同時降低了PCR污染的風(fēng)險,提高了檢測結(jié)果的準(zhǔn)確性。

【關(guān)鍵詞】地溝油;同源異形盒家族;HOXC6基因;熒光PCR

地溝油也稱泔水油或潲水油,是不法商販將收集來的潲水,經(jīng)過水油分離、過濾、去味等程序處理后,重新得到的油脂。由于潲水中常常會混有污水、洗滌劑和其他各種雜質(zhì),運輸和儲存過程也不會考慮任何衛(wèi)生要求,極易發(fā)酵變餿。加之地下作坊提煉過程純粹是以

“賣相”為目標(biāo),根本無法除去細菌和有害化學(xué)成分,人食用后易引發(fā)頭昏、頭痛、惡心、嘔吐、腹部疼痛以及腸胃道疾病[1-2]。公眾強烈呼吁嚴(yán)厲打擊地溝油制售,有效遏制地溝油回流餐桌。

自2011年10月起,經(jīng)過全國范圍的征集、專家論證及盲樣考核, 初步確定7個地溝油檢測方法進行驗證完善,但到目前為止尚未明確這些地溝油檢測方法的最終驗證結(jié)果。課題組前期采用PCR技術(shù),研究建立以雞、牛、豬、羊等各動物物種特異性基因為靶標(biāo)的地溝油鑒定方法,經(jīng)大量試驗驗證及專家評估表明,該方法與其他以差異性指標(biāo)為靶標(biāo)的檢測方法相比,其檢測指標(biāo)的高度特異性具有顯著優(yōu)勢,由于動物源性基因是只存在于地溝油,不存在于正常食用植物油的特異性標(biāo)志物,只要從植物油樣中檢出動物源性基因,不論其含量多寡,都可以判定該油樣為地溝油[3]。但前期方法的主要不足在于方法的靈敏度不足,且采用PCR技術(shù)擴增多個基因片段,實驗步驟繁瑣,容易污染從而出現(xiàn)假陽性。

本研究在前期研究基礎(chǔ)上,采用靈敏度更高的熒光PCR技術(shù),以動物源性的同源異形盒家族HOXC6基因為靶標(biāo)建立地溝油鑒定方法。該方法在有效提高檢測靈敏度的同時,不但避免了先后擴增多個基因片段的繁瑣,同時降低了PCR污染的風(fēng)險,提高檢測結(jié)果的準(zhǔn)確性。

1 材料與方法

1.1主要試劑及儀器

熒光PCR擴增采用TAKARA熒光PCR擴增試劑盒(貨號DRR390);引物、探針由大連寶生物技術(shù)公司合成。核酸蛋白分析儀(Eppendorf 6131)購自德國,ABI7500 熒光PCR儀購自美國ABI公司。

1.2 樣品

1.2.1 地溝油樣品 DG01, DG02號地溝油樣來自食品監(jiān)督部門沒收,DG03~DG04地溝油樣由深圳市滕浪再生資源發(fā)展有限公司提供,DG05~DG06號是按照油脂精煉工藝精煉的地溝油樣品。

1.2.2 食用植物油樣品 樣品編號ZC01-ZC08, 分別為金龍魚第二代食用調(diào)和油、鴻禧牌壓榨一級花生油、刀嘜橄欖芥花籽油、金浩茶籽花生食用調(diào)和油、刀嘜玉米亞麻籽油、潤之家一級大豆油、福臨門一級大豆油、刀嘜葵花籽油,均購自深圳市萬佳超市。

1.2.3 動物與植物樣品 選取7種動物和11種植物組織樣品驗證選取的靶標(biāo)基因的物種特異性,動物物種包括牛、羊、豬、馬、雞、鴨、魚;植物樣品包括芝麻、葵花籽、油菜籽、花生、油棕、棉籽、玉米、大豆、小麥、大米、辣椒。

1.2.4質(zhì)控樣品:PCR擴增陽性對照樣品為源自豬肉的核酸提取物;以去離子滅菌水作為PCR空白對照。

1.3. 核酸提取

1.3.1 地溝油核酸提?。旱販嫌秃怂崽崛〔捎谜n題組之前建立的精煉食用植物油DNA提取方法[3-4]。

1.3.2 食用植物油核酸提取:方法同1.3.1地溝油核酸提取。

1.3.3 驗證樣品核酸提?。?/p>

1.3.3.1 動物組織基因組DNA的錯誤!鏈接無效。 采用網(wǎng)絡(luò)檢索到的方法[5],略加改動, 將樣品量及所有試劑用量減少到1/10。

1.3.3.2 植物組織基因DNA的錯誤!鏈接無效。 植物組織經(jīng)磨機磨成粉末后取100mg,利用Qiagen Mini Plant DNA extraction kit 試劑盒,按照試劑盒操作說明錯誤!鏈接無效?;蚪MDNA。

1. 4樣品核酸提取效果評估 對上述各種樣品按相應(yīng)的方法提取核酸后,采用核酸蛋白分析儀測定核酸提取液的DNA含量,從而確定核酸提取效果。

1.5靶標(biāo)基因的篩選與確定 根據(jù)課題需要查閱了大量文獻,統(tǒng)計出了人、大鼠、小鼠中共有的基因條目約500條,之后,以這500條基因序列信息為對象,在深圳華大基因公司的千種植物基因組數(shù)據(jù)庫中做比對,篩選出一批植物中沒有的基因;其后,將篩選出的基因在NCBI數(shù)據(jù)庫中做BLAST比對,最終確定在國人飲食涉及的常見動物中的普遍存在的靶標(biāo)基因——同源異形盒家族HOXC6基因,根據(jù)基因序列設(shè)計引物和探針,引物探針由大連寶生物公司合成。

1.6 熒光PCR檢測 擴增反應(yīng)體系參照試劑盒說明,在20μL熒光PCR擴增體系中,引物濃度0.4μmol/L, 模板含量為40pg擴增。熒光PCR擴增條件:95℃預(yù)變性30s、95℃變性5s、60℃退火與延伸30s,40 個循環(huán)。每個樣品進行一次平行測定。

2 結(jié)果

2.1 樣品核酸提取結(jié)果

對上述各種樣品按相應(yīng)的方法提取核酸后,采用核酸蛋白分析儀測定核酸提取液的DNA含量,結(jié)果表明動物組織核酸提取得率最高,核酸提取液的DNA濃度高達100-140?g/ml, 植物樣品核酸提取液的DNA濃度在50-65?g/ml, 食用植物油和地溝油由于在精煉加工過程中對核酸的破壞和降解,導(dǎo)致核酸提取液中DNA濃度較低,只有6-13?g/ml, 但該濃度尚能滿足熒光PCR擴增的需要。

2.2 靶標(biāo)基因及目標(biāo)擴增片段的篩選結(jié)果

按照上述篩選方法,通過與深圳華大基因公司的千種植物基因組數(shù)據(jù)庫比對,本研究確定HOXC6基因(Genbank NW 153693)639-904bp之間的片段與千種植物基因不相匹配,并根據(jù)此段基因采用Primer 5軟件 設(shè)計引物和探針,最終確定上游引物為5-CTCGACTCCCTTTTATTC-3,下游引物為5-CTGTGTGTTATGTCCTAAG -3,探針5 AATGTCGTGTTCAGTTCCAGCC 3,報告基團FAM490,淬滅基團Eclipse,擴增142bp的目標(biāo)片段,如圖1所示。

圖1 HOXC6基因639-904bp段及目標(biāo)擴增片段

2.3 目標(biāo)擴增片段特異性驗證

本研究選取牛、羊、豬、馬、雞、鴨、魚7種動物的肌肉組織和芝麻、葵花籽、油菜籽、花生、油棕、棉籽、玉米、大豆、小麥、大米、辣椒11種植物組織,提取基因組DNA,熒光PCR擴增HOXC6基因目標(biāo)片段。擴增結(jié)果顯示哺乳動物樣品Ct值小于21,雞、鴨、魚等非哺乳動物擴增陰性或Ct值較大;而11種植物組織的HOXC6基因目標(biāo)片段的擴增結(jié)果全部為陰性(見表1),實時擴增曲線見圖2和圖3。

2.4 地溝油和食用植物油鑒定結(jié)果

針對DG01-DG06號地溝油樣品和ZC01-ZC08食用植物油樣品的HOXC6基因目標(biāo)片段擴增結(jié)果顯示6個地溝油樣品全部檢出目標(biāo)核酸片段,而正常植物油樣品擴增結(jié)果全部為陰性(見表2),實時擴增曲線見圖4和圖5。

3 討論

同源異型盒基因(homeobox genes,Hox)是動物同源異形基因中的保守基因片段,是調(diào)控動物個體的體節(jié)、椎骨位置及其形態(tài)和數(shù)量的基因。其在胚胎發(fā)育中的表達水平對于組織和器官的形成具有重要的調(diào)控作用,該類基因的突變會在胚胎發(fā)育過程中導(dǎo)致某一器官異位生長。哺乳動物具有四個相似的HOX基因簇,分別是HOXA、HOXB、HOXC和HOXD,它們位于不同的染色體上,由9到11個基因串聯(lián)而成[6,7]。HOXC基因位于人12號染色體,HOXC6是其中一個子類基因。哺乳動物的HOXC4、HOXC5 和HOXC6共用一段非編碼外顯子,對于每一個基因來說,其轉(zhuǎn)錄子可能包括這段共用序列和它特異的外顯子序列,也可能只包括特異的外顯子序列。本研究針對哺乳動物組織的HOXC6基因擴增結(jié)果全部為強陽性,其Ct值均小于21,對雞、鴨、魚3種非哺乳動物的擴增結(jié)果顯示鴨肉組織擴增陰性,雞肉組織擴增Ct值為22.37,魚肉組織擴增Ct值為31.68,結(jié)果提示本研究選定的HOXC6基因擴增片段在哺乳動物中具有嚴(yán)格的保守性,但HOXC6基因不是哺乳動物特異性的序列,與其他非哺乳動物存在一定的交叉。而該基因片段與千種植物基因比對未檢出同源序列,且本研究針對11種植物組織的擴增結(jié)果全部為陰性,因此,HOXC6基因的動物特異性屬性完全滿足地溝油檢測的需要。

本研究通過HOXC6基因擴增方法對3個不同來源的6個已知地溝油樣品進行鑒定檢測,結(jié)果顯示6個樣品檢測結(jié)果全部為陽性,由于6個地溝油樣品精煉程度不同,其擴增Ct值也有一定差異,DG03和DG04號油樣精煉程度最低,擴增Ct值最小,提示其內(nèi)目標(biāo)核酸片段濃度最高,而隨著精煉程度的提高,地溝油中核酸殘留漸少,對擴增靈敏度要求更高。該研究所用的6個樣品,同時采用課題組前期建立的以雞、牛、豬、羊等各動物物種特異性基因為靶標(biāo)的普通PCR鑒定方法進行鑒定,結(jié)果顯示5個檢出地溝油陽性,其中DG05號樣品為陰性,而該樣品采用本研究檢測結(jié)果Ct值最大,提示采用實時熒光PCR方法以HOXC6基因為靶標(biāo)鑒定地溝油,其檢測靈敏度略高于普通PCR方法,且只需擴增一個靶標(biāo)片段,方法更簡便,結(jié)果更可靠。

致謝:

本研究在靶標(biāo)基因篩選及與植物基因數(shù)據(jù)庫比對工作中獲得深圳華大基因公司的大力支持,特此致謝。

參考文獻:

[1] 尹平河. 薄層色譜法快速鑒別潲水油和煎炸老油的研究[J]. 中國油脂, 2004, 29(4): 47-49.

[2] 黃道平, 彭進, 謝燕湘,等. 潲水油鑒別檢測方法研究[J]. 中國衛(wèi)生檢驗雜志, 2006,16 (2):151-153.

[3] 楊冬燕, 楊小柯, 楊永存,等. 潲水油聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)鑒定技術(shù)研究[J]. 中國食品衛(wèi)生雜志,2011, 23(3):255-260.

[4] 楊冬燕,鄧漢超,楊永存,等. 精煉食用植物油PCR檢測技術(shù)研究[J]. 中國衛(wèi)生檢驗雜志,2010,20(4):700-702.

[5] 從動物組織提取基因組DNA,2010.9.4. http://www.51protocol.com/AandP/dongwushiyanjishu/20071219/50794.html.

[6 ] 哈斯圖雅,賴雙英,烏達巴拉,等.同源異形盒基因的研究現(xiàn)狀[J].畜牧與飼料科學(xué),2009,30(2):141-142.

[7] 任德全,劉玉芬,許麗敏,等. 同源異型盒基因研究[J].安徽農(nóng)業(yè)科學(xué),2011,39(4): 1949-1950.

作者簡介:

楊冬燕(1972-),女,碩士,主任技師,主要從事食品衛(wèi)生檢驗和研究工作

通訊作者:

鄧平建,男,主任技師

基金項目:

1. 深圳市科技計劃重點項目 深衛(wèi)人醫(yī)政【2012】251號;2. 深圳市技術(shù)研究開發(fā)計劃技術(shù)攻 關(guān)項目(深發(fā)改【2012】866號)

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