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磁珠法提取糞便檢材DNA

2013-05-19 07:20:15王衛(wèi)華唐劍鋒張清波
法醫(yī)學雜志 2013年1期
關(guān)鍵詞:檢材磁珠煙臺

劉 莉 ,王衛(wèi)華,唐劍鋒,張清波

(1.煙臺市公安局刑偵支隊,山東 煙臺 264000;2.煙臺市公安局芝罘公安分局刑警大隊,山東 煙臺 264000)

疑難生物檢材的發(fā)現(xiàn)、提取和檢驗越來越多地應(yīng)用到了各類刑事案件的偵破中,并發(fā)揮了良好的作用?,F(xiàn)場糞便檢材因其中含有的抑制物種類繁多并且不易去除,檢驗成功率不高。本研究采用磁珠分離試劑盒(sbeadex?forensic kit)提取糞便檢材,有效去除抑制因子,并高效回收高純度DNA,提高此類檢材的檢驗成功率,現(xiàn)報道如下。

1 材料與方法

5份糞便檢材和3份糞便擦拭物(載體為衛(wèi)生紙)分別來自本公安局實驗室2010年以來受理的案件。剪取黃豆粒大小糞便檢材、約1cm×2cm大小糞便擦拭物分別放入1.5 mL離心管中。分別采用磁珠分離試劑盒(sbeadex?forensic kit,煙臺澳斯邦公司)和Chelex法,提取以上檢材的基因組DNA。采用 Identifiler試劑盒(美國AB公司)在9700型擴增儀(美國AB公司)上進行復合擴增,擴增產(chǎn)物用3130XL遺傳分析儀(美國AB公司)進行檢測,使用GeneMapper ID v3.2軟件進行基因分型。

2 結(jié)果與討論

采用Chelex法提取的8份檢材均未檢出STR基因型。采用磁珠分離試劑盒提取的檢材中有3份糞便檢材和3份糞便擦拭檢材均得到了完整的STR基因分型結(jié)果(圖1),2份糞便檢材未檢出基因型。

圖1 磁珠法提取糞便檢材的STR分型結(jié)果

糞便檢材所含成分復雜,含有大量的抑制因子,采用常規(guī)提取方法不易去除,往往導致擴增失敗。磁珠法提取核酸是通過細胞裂解液裂解細胞,從細胞中游離出來的核酸分子被特異性地吸附到磁性顆粒表面,而蛋白質(zhì)等雜質(zhì)不被吸附而留在溶液中。反應(yīng)一定時間后,在磁場作用下,使磁性顆粒與液體分開,回收顆粒(即磁珠-DNA混合物),再用洗脫液洗脫即可以得到高質(zhì)量的DNA,而高質(zhì)量的DNA避免了擴增抑制劑的存在,保證了下一步擴增環(huán)節(jié)順利進行。

本研究采用的磁珠分離試劑盒中80%以上的磁珠顆粒直徑在0.5~10μm、質(zhì)量濃度0.3~0.35g/mL、每克磁珠顆粒最多能吸附2mg DNA,使得磁珠粒子在懸浮液狀態(tài)時,沉降速度變慢,能夠最大程度與液體中的DNA相結(jié)合,并且磁珠面積較大可以結(jié)合更多的核酸,使DNA結(jié)合的量最大化。此外,在糞便檢材的選擇上首選糞便擦拭物,一方面因糞便的量減少而抑制物的含量也隨之減少,另一方面擦拭物上存在與皮膚接觸時遺留的DNA成分,更易于得到高質(zhì)量的DNA。

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