商圓圓,張恩奎,孫曉琳,霍存錄,馮 望,吳 穎,賀新生
(1.西南科技大學(xué)生命科學(xué)與工程學(xué)院,四川 綿陽 621010;2.金堂縣林業(yè)局,四川 金堂 610400)
柏樹(Cupressus funebris Endl.)為常綠喬木,屬于柏科(Cupressaceae),柏木屬(Cupressus)[1],有 22屬約150種,中國有8屬30種,是我國亞熱帶代表性針葉樹種之一[2]。由于柏科植物對(duì)氣候和土壤有很強(qiáng)的適應(yīng)能力,自然分布廣,樹干直,適應(yīng)性廣,在山地綠化、防風(fēng)固沙及水土保持等方面起著重要作用[3],此外很多古柏樹林,歷經(jīng)千年滄桑而仍完好茂盛,生機(jī)盎然,例如由近萬株森森古柏組成的翠云廊,現(xiàn)在已經(jīng)成了著名的風(fēng)景旅游區(qū)[4]。這些千年古柏同樣也面臨著越來越多的病蟲及病原真菌的威脅,現(xiàn)在非常有必要及時(shí)對(duì)這些柏樹的威脅因素進(jìn)行較為深刻的認(rèn)識(shí)和研究[7]。
近年來,筆者在四川省劍閣縣、江油市、梓潼縣、都江堰市等地的漢代古柏樹上發(fā)現(xiàn)了一種新的病原真菌,引起古柏樹樹根和樹干褐腐病,最終導(dǎo)致樹木枯死。該菌屬于菌物界(Fungi),擔(dān)子菌門(Basidiomycota),傘菌亞門 (Agaricomycotina),傘菌綱(Agaricomycetes),多孔菌目(Polyporales),擬層孔菌科(Fomitopsidaceae),薄孔菌屬(Antrodia P.Karst)。在形態(tài)學(xué)分析的基礎(chǔ)上,本文利用分子系統(tǒng)學(xué)方法對(duì)其構(gòu)建同源樹,以更加客觀準(zhǔn)確地判定其是否為一新種,也更加直觀的分析擬黃薄孔菌的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。由于擬黃薄孔菌對(duì)柏木有著很強(qiáng)的腐朽作用,所以對(duì)于古柏和木材質(zhì)量的保護(hù)也要相應(yīng)的提高,從而警惕類似病原真菌的侵入和防治。
擬黃薄孔菌子實(shí)體,2010年5月3日由賀新生教授采集于四川省劍閣縣翠云廊張飛井旁的柏樹枯木上。標(biāo)本保存在西南科技大學(xué)微生物實(shí)驗(yàn)室,編號(hào)為:164。
表1 供試菌株及其ITS序列登錄號(hào)Table 1 The ITS accession number of test strains from GenBank
1.2.1 形態(tài)學(xué)觀察
首先對(duì)采集的子實(shí)體進(jìn)行形態(tài)觀察。組織分離得到純菌種,挑取少量菌肉于PDA基礎(chǔ)培養(yǎng)基上,在25℃進(jìn)行活化培養(yǎng),然后挑取部分菌絲接種于含有PDA基礎(chǔ)培養(yǎng)基的培養(yǎng)皿上,25℃下培養(yǎng),觀察菌落形態(tài)。最后將菌絲置于光學(xué)顯微鏡下觀察其菌絲的形態(tài)結(jié)構(gòu)。
1.2.2 獲得 ITS序列
首先,提取總脫氧核糖核酸(Deoxyribonucleic acid,DNA),采用十六烷基三甲基溴化銨法(Hexadecyltrimethy Ammonium Bromide,CTAB),用 Lifefeng DNA純化試劑盒進(jìn)行純化,1.0%的瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行檢測。然后以總DNA為模板,ITS1和ITS4為引物進(jìn)行聚合酶鏈反應(yīng)(Polymerase Chain Reaction,PCR)反應(yīng)。采用 25 μL 的反應(yīng)體系:2.5 μL 10×buffer,2.0 μL 4 種 dNTP 混合物,ITS1 和 ITS4引物各 2.0 μL,0.5 μL TagDNA 聚合酶,1.5 μL Mg2+,12.5 μL ddH2O,2.0 μL DNA 模板。反應(yīng)條件:94℃預(yù)變性5 min,94℃變性40 s,55℃退火50 s,72℃延伸50 s,72℃ 延伸10 min,循環(huán)35次,4℃保存。1.0%的瓊脂糖凝膠電泳檢測產(chǎn)物。將理想的PCR產(chǎn)物寄送到生工生物工程(上海)有限公司進(jìn)行測序,獲得所需的ITS序列數(shù)據(jù)。
1.2.3 構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹
將已經(jīng)獲得的擬黃薄孔菌的ITS序列,在Gen-Bank通過NucleiBlast軟件搜索出與之高相似的相關(guān)物種的ITS序列。然后利用DNAMAN(6.0.3.99版本)對(duì)所有的序列進(jìn)行比對(duì)和構(gòu)建同源樹,確立擬黃薄孔菌的分類學(xué)地位和系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。最終確定其物種后,將擬黃薄孔菌的ITS序列上傳到NCBI數(shù)據(jù)庫,并獲得序列號(hào)。
該菌春夏秋季發(fā)生在柏樹樹干枯朽部位、樹干基部樹皮,樹根上,當(dāng)年連續(xù)生長。如圖1,擔(dān)子果1 a生,平伏貼生,易與基質(zhì)分離。新鮮時(shí)脆蠟質(zhì)、軟木質(zhì),干燥后變硬、脆,整體鮮黃色,易開裂成不規(guī)則的片狀。菌管表面鮮黃色,干燥后變?yōu)辄S白色、黃色,長3 mm~4 mm;菌管層黃色、黃白色,分層不明顯,粉筆質(zhì),不易與菌肉分離,非放射狀。孢子印白色。擔(dān)孢子臘腸形、彎圓柱形,略彎曲,無色,薄壁,光滑,與Melzer和棉蘭試劑均無變色反應(yīng),大小為2~3.5 ×0.8 ~1.0 μm。
圖1 擬黃薄孔菌子實(shí)體形態(tài)Fig.1 The morphology of the fruiting bodies of Antrodia subxantha
菌絲系統(tǒng)3型,生殖菌絲,具鎖狀聯(lián)合,薄壁,通常分枝,交織排列,直徑2 μm ~2.5 μm;骨架菌絲占多數(shù),厚壁,扭曲,常分枝,強(qiáng)烈交織排列,直徑5 μm~6 μm,纏繞菌絲尖細(xì),分枝發(fā)達(dá),直徑 0.5 μm ~1.5 μm。菌管菌絲與菌肉菌絲相似。
培養(yǎng)特征如圖2,在瓊脂培養(yǎng)基上菌絲先稀疏,呈白色、黃白色,后變密集、鮮黃色、黃色,菌絲具有爬壁性,可以直接形成子實(shí)體。菌絲具有明顯的鎖狀聯(lián)合。
圖2 擬黃薄孔菌菌落及菌絲體形態(tài)Fig.2 The colony morphology and mycelium form of Antrodia subxantha
將擬黃薄孔菌的ITS序列(632bp)轉(zhuǎn)化成Fast格式,并上傳至GenBank,通過Blast比對(duì),獲得最大相似序列(表1),并將已測序列上傳至NCBI數(shù)據(jù)庫,獲得的序列號(hào)JN182921。然后結(jié)合已報(bào)道的擬黃薄孔菌的物種的ITS序列,利用ClustalX進(jìn)行多重比對(duì),最后用 DNAMAN(6.0.3.99 版本)軟件對(duì)這12個(gè)供試菌株的ITS rDNA序列進(jìn)行分析,得到系統(tǒng)發(fā)育樹(圖3)可看出,擬黃薄孔菌在分子系統(tǒng)的分析中屬于薄孔菌屬(Antrodia),且較明顯的區(qū)別于其它的菌株,單獨(dú)聚類為一種。與已知的西加薄孔菌(Antrodia sitchensi)和黃薄孔菌(Antrodia xantha)的同源相似度為94%。
圖3 基于擬黃薄孔菌的ITS同源性分析Fig.3 Phylogeny and relationships of Antrodia sp.based on ITS sequences
擬黃薄孔菌Antrodia subxantha Y.C.Dai& X.S.He.屬于菌物界(Fungi),擔(dān)子菌門(Basidiomycota),擬層孔菌科(Fomitopsidaceae),薄孔菌屬(Antrodia P.Karst)。在系統(tǒng)進(jìn)化樹中將12種薄孔菌物種聚為了四大類,其中擬黃薄孔菌以94%的相似度與細(xì)加薄孔菌 Antrodia sitchensis(Baxter)Gilb.&Ryvarden聚類在一起,依據(jù)ITS序列的分類標(biāo)準(zhǔn)可判定二者為不同種。雖然在子實(shí)體形態(tài)上與黃薄孔菌Antrodia xantha(Fr.)Ryvarden和西加薄孔菌Antrodia sitchensis最相似,但該種子實(shí)體顏色更加鮮艷,為亮黃色,完全平伏貼生,沒有發(fā)現(xiàn)形成層架狀、蹄狀的子實(shí)體。且顯微觀察發(fā)現(xiàn)該種孢子(大小為2~3.5 ×0.8 ~1.0 μm)明顯小于黃色薄孔菌和西加薄孔菌,其中黃色薄孔菌孢子大小為4.2~5.0×1.2 μm,西加薄孔菌的孢子大小為4.5~5.5×1.8~ 2.2 μm[8~11]。
此外薄孔菌屬中的大部分的物種的菌絲系統(tǒng)為二體型,分為生殖菌絲和骨架菌絲,而擬黃薄孔菌的菌絲為3型菌絲系統(tǒng),具有生殖菌絲,菌管菌絲和菌肉菌絲,其中骨架菌絲與菌肉菌絲相似。擬黃薄孔菌在江油市六合鄉(xiāng)、梓潼縣七曲山大廟,成都青城山、綿陽江油市和梓潼縣的古柏樹上也均發(fā)現(xiàn)有存在,樹齡超過1500 a~2000 a,一般生長在柏樹樹枝、樹根、樹皮還有枯樹樁上,對(duì)于柏木的腐蝕能力強(qiáng),在樹根和樹干表面引起褐色腐朽,最后導(dǎo)致全株植物枯死。可見其對(duì)于柏樹生長和木材質(zhì)量的影響比較廣泛的,所以今后要加強(qiáng)對(duì)該種菌生長條件觀察和防治方法的研究,為古柏名木的保護(hù)提供必要的科學(xué)依據(jù)。
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