呂艷陽(yáng),相 潔
(太原理工大學(xué) 計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,山西 太原030024)
我國(guó)老齡化形勢(shì)十分嚴(yán)峻,癡呆及癡呆前期之輕度認(rèn)知障 礙 (mild cognitive impairment,MCI)患 病 率 極高,MCI轉(zhuǎn)化為阿爾茨海默病 (Alzheimer’s disease,AD)的年轉(zhuǎn)化率為10%~15%,故防治MCI以降低其轉(zhuǎn)化率是防治阿爾茨海默病的關(guān)鍵。
隨著數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)的發(fā)展,特別是數(shù)據(jù)分類(lèi)方法的提高和改善[1-4],可以對(duì)fMRI數(shù)據(jù)進(jìn)行有效分析及應(yīng)用,為研究MCI、正常被試的分類(lèi)提供了有效途徑。怎樣分析fMRI數(shù)據(jù),選取合適的分類(lèi)特征,構(gòu)建分類(lèi)器,成為了fMRI數(shù)據(jù)分類(lèi)的關(guān)鍵問(wèn)題。
輕度認(rèn)知功能障礙 (MCI)是指介于正常老化與老年性癡呆 (AD)之間的臨床狀態(tài),這為診斷區(qū)分正常老化、MCI的差異變化帶來(lái)了困難。
傳統(tǒng)的MCI診斷方法主要包括:量表檢查、認(rèn)知測(cè)驗(yàn)、生物學(xué)標(biāo)記物檢查、神經(jīng)影像學(xué)檢查。這些檢查方法在實(shí)施過(guò)程中存在較多不足。
問(wèn)卷形式的量表檢查,包括總體衰退量表 (GDS)等,依賴于被試所得分值的界定,由于測(cè)試者對(duì)問(wèn)卷問(wèn)題的主觀理解不同,存在一定程度的誤差?;瘜W(xué)指標(biāo)的檢測(cè),雖然能表示一定的特征變化,但由于測(cè)試者體質(zhì)不同、身體素質(zhì)不同,并不能準(zhǔn)確反映測(cè)試者狀態(tài)。同時(shí),生物學(xué)標(biāo)記物檢查,神經(jīng)影像學(xué)檢查,測(cè)試項(xiàng)目繁多,檢驗(yàn)周期長(zhǎng),伴隨著實(shí)驗(yàn)檢測(cè)過(guò)程對(duì)測(cè)試者帶來(lái)的痛苦。
由此可見(jiàn),以上的各種MCI診斷方法,測(cè)試項(xiàng)目多,檢查周期長(zhǎng),全面性和準(zhǔn)確性較低,具有一定的主觀判斷引起的誤差,并且缺乏對(duì)其它區(qū)域的有效分析,難以實(shí)現(xiàn)泛化推廣。
在fMRI檢測(cè)領(lǐng)域,李傳明、王?。?]等人,通過(guò)對(duì)某些腦區(qū)的結(jié)構(gòu)項(xiàng)改變做了統(tǒng)計(jì)分析,分析了AD、MCI、正常組,在做Stroop任務(wù)的相關(guān)腦區(qū) (額葉、頂葉)激活情況,發(fā)現(xiàn)AD、MCI具有不同的病理學(xué)特征。
在SVM 應(yīng)用方面,蔣蕓、李戰(zhàn)懷[6],通過(guò)改進(jìn)的SVM分類(lèi)器對(duì)乳腺X光圖像作分類(lèi),分類(lèi)精確度達(dá)到了96%。
呂卓、謝松云[7]等人,通過(guò)SVM及其改進(jìn)方法,對(duì)測(cè)試者左右手動(dòng)的fMRI圖像做分類(lèi),發(fā)現(xiàn)原始SVM算法的分類(lèi)精確度在60%左右,然后對(duì)比分析了多種改進(jìn)算法的分類(lèi)計(jì)算時(shí)間、分類(lèi)精確度。
以上作者都是對(duì)整幅fMRI圖像做特征提取,或者是某些ROI(region of interest)腦區(qū)做數(shù)據(jù)分類(lèi),在分析方法使用的是傳統(tǒng)的統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)方法。對(duì)特定腦區(qū)的檢測(cè),檢測(cè)了某些激活部位及范圍,即被試在相關(guān)測(cè)試中的ROI區(qū)域,需要一定的先驗(yàn)知識(shí)和領(lǐng)域知識(shí),需要具體領(lǐng)域內(nèi)的專家對(duì)ROI區(qū)域做準(zhǔn)確劃定,存在一定誤差。
本文以單個(gè)體素為單位,通過(guò)單個(gè)體素的數(shù)據(jù)特征對(duì)fMRI圖像作分類(lèi),分析分類(lèi)準(zhǔn)確率高的體素分布區(qū)域,并構(gòu)建集成分類(lèi)器,從而更好的輔助臨床診斷。
在數(shù)據(jù)分類(lèi)領(lǐng)域,待分類(lèi)的數(shù)據(jù)點(diǎn)稱為向量。對(duì)于多維數(shù)據(jù),則構(gòu)成向量集。支持向量,就是實(shí)現(xiàn)這種分類(lèi)的一些向量 (support vector),用來(lái)支撐分類(lèi)數(shù)據(jù)的邊界,這種算法簡(jiǎn)稱SVM。
Cortes和Vapnik于1995年首先提出了支持向量機(jī)(support vector machine,SVM),它的優(yōu)勢(shì)在于解決小樣本、非線性以及高維模式識(shí)別,并能夠在其它機(jī)器學(xué)習(xí)問(wèn)題中,推廣應(yīng)用到函數(shù)擬合等問(wèn)題。
以統(tǒng)計(jì)學(xué)習(xí)理論的VC維理論、結(jié)構(gòu)風(fēng)險(xiǎn)最小原理為基礎(chǔ),支持向量機(jī)方法根據(jù)有限的樣本信息,在數(shù)據(jù)模型的復(fù)雜性 (即對(duì)數(shù)據(jù)樣本的學(xué)習(xí)精度)、學(xué)習(xí)能力 (即識(shí)別任意樣本的能力)之間尋求最佳折衷,有效地提高分類(lèi)模型的推廣能力 (或稱泛化能力)。
對(duì)于復(fù)雜兩類(lèi)線性不可分問(wèn)題,首先通過(guò)一非線性映射將輸入空間映射到高維特征空間
原空間中的對(duì)偶優(yōu)化問(wèn)題變?yōu)?/p>
拉格朗日乘子法求得的最優(yōu)分類(lèi)判別函數(shù)為
式中,對(duì)于高維空間的運(yùn)算,靠的是內(nèi)積運(yùn)算來(lái)實(shí)現(xiàn)
式中內(nèi)積函數(shù)K(xi,x)為核函數(shù),且必須滿足 Mercer條件。
通過(guò)SVM對(duì)數(shù)據(jù)分類(lèi),并引入粗糙集、屬性約簡(jiǎn)、主要成分分析等方法以提高分類(lèi)精度,已經(jīng)有了廣泛研究。
蔣蕓、李戰(zhàn)懷[6]的研究中,使用了ISVM分類(lèi)算法。ISVM算法主要由兩部分組成,首先用約簡(jiǎn)算法對(duì)數(shù)據(jù)集進(jìn)行約簡(jiǎn);然后再將約簡(jiǎn)后的數(shù)據(jù)集作為輸入,用SVM方法作分類(lèi)。
呂卓、謝松云[7]等人的研究中,具體選擇了PSVM、SSVM、LPSVM、NSVM這4種SVM改進(jìn)算法以及基本SVM算法應(yīng)用于fMRI圖像的分類(lèi)問(wèn)題,其中PSVM算法在fMRI圖像的分類(lèi)問(wèn)題上有較好的綜合性能。
由于本文選用任務(wù)態(tài)fMRI圖像數(shù)據(jù),數(shù)據(jù)量大、維數(shù)高,適合選用SVM算法,并發(fā)揮支持向量機(jī)在處理小樣本學(xué)習(xí)問(wèn)題、高維度數(shù)據(jù)問(wèn)題上具有的優(yōu)越性[8-9]。
經(jīng)典支持向量機(jī)的分類(lèi)精度受數(shù)據(jù)表達(dá)形式以及個(gè)體分類(lèi)器模型選擇因素影響較大,受參數(shù)選擇、樣本噪聲干擾等因素的影響,會(huì)降低其分類(lèi)準(zhǔn)確率。所以,一般情況下,采用一種新的分類(lèi)器集成算法來(lái)克服這個(gè)缺陷。
根據(jù)弱學(xué)習(xí)定理,通過(guò)多個(gè)弱分類(lèi)器的組合,可以構(gòu)建分類(lèi)精度更高的集成分類(lèi)器。廣泛使用的AdaBoost算法和Bagging算法,采取加權(quán)投票的方法組合弱分類(lèi)器,構(gòu)建集成分類(lèi)器。
在分類(lèi)器集成領(lǐng)域,付忠良研究分析了分類(lèi)器集成中的關(guān)鍵問(wèn)題:其一,已知多個(gè)基分類(lèi)器,如何組合才是最佳的,即組合系數(shù)如何選取才能最大限度提升組合分類(lèi)器的分類(lèi)精度;其二是類(lèi)似AdaBoost算法和Bagging算法,為了得到分類(lèi)精度高的組合分類(lèi)器,如何訓(xùn)練和選取各個(gè)基分類(lèi)器。
張偉松,高智英,研究了快速多分類(lèi)器集成算法,提出2種權(quán)重分配方法:Biased AdaBoost算法與基于差分演化的多分類(lèi)器集成算法。在人臉數(shù)據(jù)庫(kù)上的實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,與經(jīng)典AdaBoost算法相比,該算法能有效降低訓(xùn)練時(shí)間,提高識(shí)別準(zhǔn)確率。
李滿,李春華,提出了新的支持向量分類(lèi)器集成方法,兼顧了各子分類(lèi)器的分類(lèi)結(jié)果和各子分類(lèi)器判決對(duì)最終決策的重要程度。仿真實(shí)驗(yàn)表明,該方法的分類(lèi)準(zhǔn)確率,明顯優(yōu)于傳統(tǒng)方法的支持向量分類(lèi)器集成策略。
本文用于實(shí)驗(yàn)的數(shù)據(jù)來(lái)自于北京市宣武醫(yī)院。實(shí)驗(yàn)測(cè)試選取20位被試的fMRI任務(wù)態(tài)數(shù)據(jù)。其中,10位被試為MCI患者,另10位為正常組。
實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)使用3.0TMR掃描儀 (siemens trio+tim,genmeny)核磁設(shè)備,采用對(duì)BOLD敏感的單次發(fā)回波平面成像 (single shot echo planar imaging,SS-EPI)序 列,掃描參數(shù)如下:FOV=240mm×240mm,TR=2S,Thickness=3.2ms,F(xiàn)lip angle=90°,Disp Factor=0%,Matrix size=64×64,共30層橫斷位圖像覆蓋全腦。
測(cè)試的fMRI圖像數(shù)據(jù)格式為30層,每層包含64x64個(gè)體素。每個(gè)元素均稱為一個(gè)體素 (voxel),元素的取值是該voxel的BOLD值 (即血氧含量水平,blood oxygen level dependent,BOLD)。
實(shí)驗(yàn)流程:以某個(gè)體素的BOLD曲線變化率作為特征值,對(duì)正常組和MCI組做分類(lèi),測(cè)試該體素的分類(lèi)準(zhǔn)確率。
體素篩選:本實(shí)驗(yàn)選取了4082個(gè)BOLD值不為0的體素。
基線設(shè)定:以一次任務(wù)中,對(duì)某一體素前兩次掃描的BOLD值,取均值,作為BOLD曲線變化率的基線。
特征選?。阂砸淮稳蝿?wù)中,某一體素后6次掃描的BOLD曲線變化率,組成向量,作為本次任務(wù)的分類(lèi)特征值。
通過(guò)SVM分類(lèi)模型,判斷測(cè)試集數(shù)據(jù)的任務(wù)標(biāo)簽類(lèi)型(正常/MCI),其準(zhǔn)確率為判斷正確的任務(wù)個(gè)數(shù)與測(cè)試任務(wù)總數(shù)的百分比。實(shí)驗(yàn)流程如圖1所示。
圖1 SVM數(shù)據(jù)分類(lèi)實(shí)驗(yàn)流程
本實(shí)驗(yàn)所用平臺(tái)為 MATLAB,Lib-SVM工具包,ker-nel_type=RBF,參數(shù)c(cost)取1,g (gamma)取1。
測(cè)試方法采用 “Leave one person out”交叉驗(yàn)證方法,即保留1組數(shù)據(jù)作為測(cè)試集,其它數(shù)據(jù)作為訓(xùn)練集。
選取18個(gè)被試的任務(wù)態(tài)數(shù)據(jù)作訓(xùn)練集其中包含9個(gè)被試為正常組,9個(gè)被試為對(duì)照組。每個(gè)被試隨機(jī)選取16次任務(wù)。
測(cè)試集的數(shù)據(jù)包含5組數(shù)據(jù),每組包含2個(gè)被試的數(shù)據(jù),其中1個(gè)被試為正常組,1個(gè)被試為對(duì)照組。每個(gè)被試隨機(jī)選取16次任務(wù)。
5組測(cè)試數(shù)據(jù)的分類(lèi)準(zhǔn)確率平均值,作為該體素的平均分類(lèi)準(zhǔn)確率。
通過(guò)測(cè)試各個(gè)體素的平均分類(lèi)準(zhǔn)確率,觀察分類(lèi)準(zhǔn)確率較高的體素分布情況。
通過(guò)實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),一共有181個(gè)體素的平均分類(lèi)準(zhǔn)確率達(dá)到60%以上,其中準(zhǔn)確率大于70%的有18個(gè),大于65%的有31個(gè),大于60%的有132個(gè)。平均分類(lèi)準(zhǔn)確率較高的體素 (70%以上)見(jiàn)表1。
表1 平均分類(lèi)準(zhǔn)確率較高的體素分布 (70%以上)
實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明:分類(lèi)準(zhǔn)確率達(dá)70%以上的體素中,主要分布在13、17、21、23、25層上,他們的標(biāo)注位置如圖2所示。
圖2 體素位置標(biāo)注
如圖2所示,平均準(zhǔn)確率大于70%的體素用 “○”標(biāo)記,平均準(zhǔn)確率大于65%的用 “□”標(biāo)記,平均準(zhǔn)確率大于60%的用 “△”標(biāo)記。這些位置的體素,主要分布于枕葉區(qū)域,即與視覺(jué)相關(guān)的區(qū)域;準(zhǔn)確率較高的體素主要集中在與認(rèn)知相關(guān)的主要腦區(qū)位置上,包括顳葉、扣帶回等。
邵輝麗,杜小霞所做研究表明:功能連接分析發(fā)現(xiàn),楔前葉/后扣帶皮層是默認(rèn)腦功能網(wǎng)絡(luò)中的一個(gè)關(guān)鍵區(qū)域。靜息態(tài)默認(rèn)腦功能網(wǎng)絡(luò)是無(wú)尺度網(wǎng)絡(luò),具有小世界特性,楔前葉/后扣帶皮層可能是該默認(rèn)腦功能網(wǎng)絡(luò)中一個(gè)重要的“集散節(jié)點(diǎn)”[10-11]。
顳葉區(qū)域?qū)φJ(rèn)知活動(dòng)有重要影響,顳葉受損的表現(xiàn)包括:
(1)記憶障礙:顳葉海馬回破壞時(shí)可出現(xiàn)記憶障礙,通常雙側(cè)損害時(shí)出現(xiàn),記憶障礙可伴有定向障礙。
(2)聽(tīng)覺(jué)和平衡障礙:一側(cè)損害時(shí)僅有輕度雙側(cè)聽(tīng)力障礙,雙側(cè)破壞時(shí)可導(dǎo)致皮質(zhì)性全聾。顳上回也是前庭的皮質(zhì)中樞,因此顳葉病變可出現(xiàn)平衡障礙和眩暈。
(3)言語(yǔ)障礙:顳上回后部損害可出現(xiàn)感覺(jué)性失語(yǔ),患者能聽(tīng)到講話的聲音但不能理解其意義。優(yōu)勢(shì)半球顳上回后部與頂葉緣上回的移形區(qū)損害時(shí),可出現(xiàn)命名性失語(yǔ)。
(4)視野缺損:顳葉損害時(shí)可出現(xiàn)同向性上1/4象限盲。
由此可見(jiàn),通過(guò)對(duì)正常組和MCI組的fMRI圖像作分類(lèi),所發(fā)現(xiàn)的分類(lèi)準(zhǔn)確率較高的體素分布情況,與MCI患者受損腦區(qū)位置相符?;谶@些體素的分類(lèi)測(cè)試,可以為醫(yī)療應(yīng)用提供指導(dǎo),并有效地輔助臨床診斷。
SVM的函數(shù)參數(shù)設(shè)置是影響分類(lèi)準(zhǔn)確率的重要因素。本實(shí)驗(yàn)使用的是Lib-SVM工具包,在訓(xùn)練過(guò)程中,kernel_type=RBF,參數(shù)c (cost)取1,g (gamma)取1。通過(guò)實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),對(duì)于同一組訓(xùn)練集和測(cè)試集,當(dāng)c?。?,1]時(shí),其分類(lèi)準(zhǔn)確率高于c取 [-1,0],并且當(dāng)c和g取0到1之間的不同小數(shù)時(shí),分類(lèi)準(zhǔn)確率不變。選取和優(yōu)化適合于本實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)集的SVM訓(xùn)練參數(shù),還有待進(jìn)一步研究。
實(shí)驗(yàn)流程:選取分類(lèi)準(zhǔn)確率較高的8個(gè)的體素,通過(guò)SVM訓(xùn)練,得到8個(gè)弱分類(lèi)器。然后為各個(gè)弱分類(lèi)器分配并調(diào)整權(quán)重,采用加權(quán)平均的方法,構(gòu)高精度的集成分類(lèi)器。
權(quán)重訓(xùn)練、測(cè)試樣本:包含5組數(shù)據(jù),每組包含2個(gè)被試的數(shù)據(jù),其中1個(gè)被試為正常組,1個(gè)被試為對(duì)照組。每個(gè)被試隨機(jī)選取16次任務(wù)。
權(quán)重分配策略1:指定權(quán)重分配。準(zhǔn)確率較高的2個(gè)分類(lèi)器權(quán)重為0.35,其余6個(gè)分類(lèi)器權(quán)重為0.05。實(shí)驗(yàn)結(jié)果見(jiàn)表2。
表2 指定權(quán)重分配的集成分類(lèi)器
實(shí)驗(yàn)表明,集成分類(lèi)器平均準(zhǔn)確率為65.63%,其中有兩個(gè)測(cè)試組分類(lèi)精度提高25%。
權(quán)重分配策略2:對(duì)各個(gè)分類(lèi)器設(shè)置初始權(quán)重(0.125=1/8),然后訓(xùn)練調(diào)整,調(diào)整步長(zhǎng)為0.05。實(shí)驗(yàn)結(jié)果見(jiàn)表3。
表3 訓(xùn)練調(diào)整權(quán)重的集成分類(lèi)器
實(shí)驗(yàn)表明,集成分類(lèi)器平均準(zhǔn)確率為80.00%。其中,測(cè)試組1和組5的分類(lèi)精度可提高24.61%和33.6%,單組分類(lèi)精度最高達(dá)到96.88%,可有效提高其分類(lèi)準(zhǔn)確率。
在實(shí)際應(yīng)用過(guò)程中,需要通過(guò)已有的分類(lèi)器模型,應(yīng)用到與訓(xùn)練集不同的測(cè)試樣本中。為此,將測(cè)試數(shù)據(jù)分作兩部分,每組選取2/3樣本作為訓(xùn)練,其余1/3樣本作為測(cè)試,以測(cè)試集成分類(lèi)器的泛化推廣能力。
權(quán)重分配策略:各個(gè)分類(lèi)器初始權(quán)重為0.125,調(diào)整步長(zhǎng)為0.05。實(shí)驗(yàn)結(jié)果見(jiàn)表4。
表4 集成分類(lèi)器的泛化推廣測(cè)試
本實(shí)驗(yàn)中有兩組數(shù)據(jù)的分類(lèi)準(zhǔn)確率達(dá)到90%以上,平均分類(lèi)準(zhǔn)確率為78%。可見(jiàn),由支持向量機(jī)得到的集成分類(lèi)器,具有一定的泛化推廣能力。
綜合以上實(shí)驗(yàn)可以發(fā)現(xiàn),通過(guò)單個(gè)體素的數(shù)據(jù)特征作分類(lèi),選取分類(lèi)準(zhǔn)確率較高的8個(gè)體素,其準(zhǔn)確率位于70%至75%。然后,以這些體素對(duì)應(yīng)的分類(lèi)器為基礎(chǔ),通過(guò)加權(quán)平均、權(quán)重調(diào)整的方法,構(gòu)建集成分類(lèi)器,集成分類(lèi)器的平均準(zhǔn)確率提高至80%,單組分類(lèi)精度最高達(dá)96.88%。
在SVM數(shù)據(jù)分類(lèi)實(shí)驗(yàn)中,平均分類(lèi)準(zhǔn)確率主要分布在70%左右。平均準(zhǔn)確率較低的原因是各組測(cè)試數(shù)據(jù)的差異性不同,并且在特征提取時(shí)以單個(gè)體素的BOLD變化為特征值,而單個(gè)體素體積較小。單個(gè)體素的BOLD變化,在不同任務(wù)、不同測(cè)試數(shù)據(jù)中,有一定的噪聲影響,對(duì)于某些區(qū)別度較低的測(cè)試數(shù)據(jù)集,分類(lèi)準(zhǔn)確率較低。
綜上所述,對(duì)于高維度、數(shù)據(jù)量大的fMRI圖像數(shù)據(jù),支持向量機(jī)與分類(lèi)器集成相結(jié)合的方法,有效彌補(bǔ)了SVM參數(shù)選擇復(fù)雜、準(zhǔn)確率偏低的缺點(diǎn),降低了體素體積較小、BOLD變化等因素引起的噪聲影響,并提高了分類(lèi)精度。
在后續(xù)的研究中,可以在提取特征過(guò)程中,采用每4個(gè)體素為1組,計(jì)算其平均BOLD變化曲線,進(jìn)一步降低噪聲影響。對(duì)于分類(lèi)模型,可使用更高精度的改進(jìn)算法、更優(yōu)的分類(lèi)器集成方法,構(gòu)建高精度的綜合分類(lèi)器。
本文從數(shù)據(jù)分類(lèi)的角度提出了一種基于支持向量機(jī)的fMRI圖像分類(lèi)方法,以單個(gè)體素的BOLD曲線變化率作為分類(lèi)特征,應(yīng)用到MCI的數(shù)據(jù)分類(lèi)中。根據(jù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果發(fā)現(xiàn),分類(lèi)準(zhǔn)確率較高的體素主要集中于MCI相關(guān)的重要腦區(qū),該分析方法所得結(jié)論和已有研究結(jié)果一致,可應(yīng)用于MCI的實(shí)際診斷。并且,以分類(lèi)準(zhǔn)確率較高的體素為基礎(chǔ),采用加權(quán)平均的方法,建立集成分類(lèi)器,提高了分類(lèi)精度。在其它相關(guān)的臨床診斷中,該方法也可作為一種研究方法進(jìn)行推廣。
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