国产日韩欧美一区二区三区三州_亚洲少妇熟女av_久久久久亚洲av国产精品_波多野结衣网站一区二区_亚洲欧美色片在线91_国产亚洲精品精品国产优播av_日本一区二区三区波多野结衣 _久久国产av不卡

?

口腔細胞采集卡DNA分型快速檢驗模式的建立

2014-04-23 05:19魏福軍張建王天華田田賈世友伊莎莎郭玉秋
生命科學儀器 2014年4期
關(guān)鍵詞:采集卡孔徑分型

魏福軍,張建,王天華田,田賈世友,伊莎莎,郭玉秋

(1. 大慶市公安(局南刑京事航技空術(shù)航支天隊大,學黑 龍生江物大醫(yī)慶學 工16程33系11,;江2. 蘇公省安 部南物京證市鑒 21定00中16心),北京 100038)

近些年來, DNA數(shù)據(jù)庫的建設(shè)和應用,極大提升了公安機關(guān)打擊犯罪的效能。DNA數(shù)據(jù)庫建設(shè)業(yè)已成為目前法庭科學領(lǐng)域發(fā)展的重中之重,DNA數(shù)據(jù)庫的規(guī)模及內(nèi)存容量也在逐年擴大[1,2]。當前,DNA數(shù)據(jù)庫樣本的檢驗主要包括樣本采集、樣本直接擴增、DNA檢測三個主要步驟。樣本采集主要是指各地公安機關(guān)對違法犯罪人員及相關(guān)涉案人員進行身份信息和相應生物樣本采集。傳統(tǒng)數(shù)據(jù)庫樣本主要以血卡為主,針對該類樣本,各DNA實驗室均已建立的成熟的DNA檢驗流程,檢驗成功率高、檢驗速度快。與此同時,近年來口腔細胞樣本采集卡由于具備使用方法簡單、被采集者無創(chuàng)無痛等特點,能夠避免基層民警取樣帶來不必要的糾紛,因此,在有些地區(qū)口腔細胞樣本采集卡正逐漸替代傳統(tǒng)的血樣采集。然而,該類樣本的檢驗也存在一系列問題:第一,無法準確定位口腔細胞采集卡上口腔細胞的位置;第二,口腔細胞在采集卡上分布不均,存在著取樣時取不到細胞造成初檢成功率低的情況[3,4]。有鑒于此,目前口腔細胞的檢驗仍是一個比較棘手的問題,針對該類樣本的檢測主要還是以DNA自動化提取后再進行擴增檢測的方法為主,這種方式費時、費力、同時耗費大量辦案經(jīng)費。本研究通過采用小孔徑生物樣本自動打孔儀多點取樣的方式,結(jié)合DNATyperTM19試劑盒對口腔細胞樣本進行直接擴增,初檢成功率達到98%,極大提高了口腔細胞卡類樣本的批量檢驗效率,解決了困擾法庭科學DNA實驗室的口腔卡類數(shù)據(jù)庫樣本的檢驗難題。

1 材料與方法

1.1 試驗樣本

本實驗室日常積累的違法犯罪人員口腔細胞采集卡樣本(博坤公司研制)200份。

1.2 主要試劑

DNATyperTM19試劑盒(公安部物證鑒定中心,中國)。

1.3 主要儀器

BSD600型半自動打孔儀(BSD公司)、BIOMEK-NXP、BIOMEK-3000自動化工作站2臺(貝克曼公司)、9700型擴增儀(AB公司)、3130XL型基因分析儀(AB公司)。

1.3 試驗方法

1.3.1PCR反應液分裝

按照DNATyperTM19試劑盒說明書配制PCR擴增試劑,利用BIOMEK-NXP自動化工作站將按每孔10μL試劑加入到96孔擴增板中。

1.3.2口腔細胞采集卡樣本取樣

設(shè)置BSD600型半自動打孔儀運行參數(shù),使之在口腔細胞采集卡樣本上打孔取樣,選擇靠近棉簽轉(zhuǎn)印區(qū)的部位,打下2至3片1.0mm的樣本,置于已加入反應液的96孔擴增板中離心,待打取的樣本完全浸入擴增試劑后擴增。

1.3.3擴增反應

95℃11分鐘;94℃30秒,59℃2分鐘,72℃1分鐘,28個循環(huán);60℃60分鐘,25℃保存。

1.3.4電泳前加樣

使用 BIOMEK-3000自動化工作站對擴增后產(chǎn)物按照PCR擴增產(chǎn)物1μL與9μL上樣混合物比例混合后進行加樣電泳。

1.3.5電泳檢測及STR分型

通過3 1 3 0 X L型遺傳分析儀電泳分離后,采用GeneMaperID v3.2分析軟件進行數(shù)據(jù)分析。

2 結(jié)果與討論

2.1 結(jié)果

通過采用生物樣本自動打孔儀小孔徑多點取樣的方式,結(jié)合DNATyperTM19試劑盒對200份違法人員口腔細胞樣本進行批量化直接擴增檢驗,其中196份樣本得到了完整的STR分型,初檢成功率高達98%(部分樣本分型見圖1),檢驗結(jié)果準確,無pull-up峰、非特異性人工產(chǎn)物等現(xiàn)象出現(xiàn)。此外,未獲完整分型的4個樣本,再次使用相同的檢驗方式后獲得完整分型(數(shù)據(jù)未列出)。

2.2 討論

圖1部分口腔細胞采集卡樣本的STR分型結(jié)果Fig.1Example of STR genotyping of buccal cell samples

張建等的研究表明,市售的口腔細胞采集卡含有熒光成分,直接擴增檢驗過程中,樣本量過大會對樣本的部分分型有熒光干擾[5]。本研究基于已有研究數(shù)據(jù)和本實驗室的建庫檢驗經(jīng)驗,采用生物樣本自動打孔儀小孔徑多點取樣的方式結(jié)合應用DNATyperTM19試劑盒對口腔細胞采集卡樣本進行直接擴增檢驗,避免了DNA提取等操作,極大簡化了檢驗流程,節(jié)約檢驗時間和成本,且具備98%以上的初檢成功率。BSD600型半自動打孔儀能夠同時打出兩片相同或不同尺寸的圓紙片,具有的光定位設(shè)備可以自動根據(jù)選擇的打子孔數(shù)量及孔徑準確定位,大幅增加通量,縮短工作時間。使用打孔儀的小孔徑取樣,避免了取樣量過大造成的擴增干擾物的影響;多點取樣的操作,增加了取準細胞的幾率,提高了初檢成功率(本研究中未獲完整分型的4個樣本,復檢后獲得完整分型,也從另一個方面證明了這一觀點)。另外,本實驗室使用的DNATyperTM19試劑盒可以同時擴增和檢測18個STR基因座以及Amelogenin性別基因座,完全滿足國家DNA數(shù)據(jù)庫對位點數(shù)的要求[6~8],本文研究建立的口腔細胞采集卡DNA分型快速檢驗模式能夠?qū)崿F(xiàn)檢驗我省普遍應用的口腔細胞采集卡的高效、快速檢驗,方法簡便易行,進而節(jié)約了建庫成本,對我省DNA數(shù)據(jù)庫建設(shè)和法治建設(shè)有重大的現(xiàn)實意義。

[1] 趙興春, 葉健. 法庭DNA技術(shù)的發(fā)展及展望. 刑事技術(shù), 1998(5):42- 46.

[2] 葛百川, 郭紅玲, 王穗保. 美國、加拿大DNA數(shù)據(jù)庫概況及我國建立DNA數(shù)據(jù)庫的思考. 刑事技術(shù), 2001(4): 7-9.

[3] Dennis Y W, Chien W C, Nicola J O,et al.Direct amplification of STRs from blood or buccal cell samples. For ensic Science International: Genetics Supplement Series. 2009, 2(1): 113- 114.

[4] Dennis Y W, Chien W C, Lori K H. Rapid STR analysis of single source DNA samples in 2h. Forensic Science International: Genetics Supplement Series. 2009, 2( 1) : 115- 116.

[5] 張建, 姜成濤, 趙興春, 等. DNATyperTM15試劑盒直接擴增檢驗紙質(zhì)樣本的研究. 刑事技術(shù), 2011(4): 33-35.

[6] 趙興春, 姜成濤, 葉健, 等. DNATyperTM15試劑盒的法醫(yī)學應用研究.中國法醫(yī)學雜志, 2008, 23(3): 169-171.

[7] 張建, 趙興春, 王樂, 等. 應用DNATyper15TMPlus試劑盒對遵義地區(qū)漢族人群18個STR基因座遺傳多態(tài)性的調(diào)查.法醫(yī)遺傳學應用與進展, 2012: 176-180.

[8] 鄭秀芬. 法醫(yī)DNA 分析. 北京: 中國人民公安大學出版, 2002:385-387.

猜你喜歡
采集卡孔徑分型
高精度AD采集卡性能測試及評價方法研究
失眠可調(diào)養(yǎng),食補需分型
便秘有多種 治療須分型
不同滲透率巖芯孔徑分布與可動流體研究
面向數(shù)控機床的多通道傳感數(shù)據(jù)采集卡設(shè)計
分布式孔徑相參合成雷達技術(shù)
并行高速采樣在地震物理模擬采集中的應用
基于子孔徑斜率離散采樣的波前重構(gòu)
PCI-e高速數(shù)據(jù)采集卡的驅(qū)動與上位機軟件設(shè)計
基于分型線驅(qū)動的分型面設(shè)計研究