李曄 張西軒 阮海華
摘要 [目的]研究沙門氏菌效應(yīng)蛋白SopB中跨膜疏水結(jié)構(gòu)域288-309肽段對受SopB誘導(dǎo)的HeLa細(xì)胞Akt磷酸化激活中的功能。[方法]通過重疊延伸PCR的方法構(gòu)建SopB第288~309位肽段缺失突變基因,并將該基因在HeLa細(xì)胞中進(jìn)行異位表達(dá),與野生型SopB基因進(jìn)行比較,確定缺失的第288~309位間肽段在受SopB誘導(dǎo)的Akt磷酸化激活中的作用。[結(jié)果]與空載體對照相比較,在HeLa細(xì)胞中表達(dá)野生型SopB重組質(zhì)粒明顯激活了pAkt473的磷酸化,而在HeLa細(xì)胞中表達(dá)SopB缺失突變體SopBΔ288-309時,則檢測不到pAkt473的磷酸化激活。[結(jié)論]SopB表達(dá)激活HeLa細(xì)胞pAkt473的磷酸化與其第288~309位肽段的功能直接相關(guān),該跨膜疏水結(jié)構(gòu)域的缺失導(dǎo)致SopB蛋白不能亞細(xì)胞定位至細(xì)胞膜,從而導(dǎo)致SopBΔ288-309對pAkt473磷酸化激活功能的喪失。
關(guān)鍵詞 沙門氏菌屬;SopB;AKT的磷酸化
中圖分類號 S188 文獻(xiàn)標(biāo)識碼 A 文章編號 0517-6611(2014)03-00660-03
沙門氏菌效應(yīng)蛋白SopB 是由沙門氏菌SPI-1 Ⅲ型分泌系統(tǒng)分泌的一種由561個氨基酸構(gòu)成的蛋白質(zhì)分子,是一種肌醇磷脂酶,是目前沙門氏菌分泌的效應(yīng)蛋白中研究最多、功能最多樣化的一個蛋白[1-5]。沙門氏菌效應(yīng)蛋白SopB 首先作用于質(zhì)膜,激活SH3-鳥核苷酸交換因子(SGEF),間接活化交換因子RhoG,從而進(jìn)一步激活肌動蛋白,誘導(dǎo)細(xì)胞骨架重排,促使沙門氏菌侵入宿主細(xì)胞[6]。沙門氏菌效應(yīng)蛋白SopB 能夠激活原癌基因Akt473 的磷酸化,對細(xì)菌入侵介導(dǎo)的細(xì)胞凋亡具有抑制作用,促進(jìn)宿主細(xì)胞的存活,為沙門氏菌在宿主細(xì)胞中的存活提供條件[7]。同時,SopB 通過招募RAB5 和VPS34 到SCV(Salmonella-Containing Vacuole,SCV),促進(jìn)SCV在宿主細(xì)胞內(nèi)的形成和成熟,這對沙門氏菌在宿主細(xì)胞內(nèi)的存活與復(fù)制具有重要的意義[8]。研究表明,沙門氏菌效應(yīng)蛋白SopB在感染宿主細(xì)胞后能夠發(fā)生泛素化修飾,該泛素化修飾在沙門氏菌感染宿主細(xì)胞的過程中發(fā)揮重要的作用[9-10]。利用結(jié)構(gòu)預(yù)測算法(TMpred prediction algorithm)軟件分析發(fā)現(xiàn)沙門氏菌效應(yīng)蛋白SopB 第288~309位氨基酸之間的肽段擁有較強(qiáng)的跨膜螺旋結(jié)構(gòu)域。該跨膜結(jié)構(gòu)域被證實與效應(yīng)蛋白SopB的泛素化修飾直接相關(guān)[9]。為了深入研究該SopB跨膜結(jié)合結(jié)構(gòu)域在沙門氏菌感染過程中是否與受SopB誘導(dǎo)的Akt的磷酸化修飾和激活有關(guān),筆者利用重疊延伸PCR的方法構(gòu)建SopB基因第288~309位肽段缺失的突變體,即SopBΔ288-309缺失突變體,并與野生型SopB蛋白的功能進(jìn)行比較,以期確定該肽段與受SopB誘導(dǎo)的Akt的磷酸化修飾和激活之間的關(guān)系。
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 供試菌株、宿主細(xì)胞和質(zhì)粒載體。鼠傷寒沙門氏菌(Salmonella Typhimurium LT2)、大腸桿菌(Ecoli)Trans 10、pCDNA4.0質(zhì)粒載體、pCDNA4-SopB重組質(zhì)粒和HeLa細(xì)胞,均由天津市食品生物技術(shù)重點實驗室保存。
1.1.2 主要試劑。質(zhì)粒DNA提取試劑盒和膠回收試劑盒,購自英國Omega公司;Vent DNA polymerase、限制性內(nèi)切酶BamHⅠ和EcoRⅠ,均購自美國NEB公司;T4 DNA連接酶,購自美國Promega公司;細(xì)胞轉(zhuǎn)染試劑Vigofect,購自威格拉斯生物技術(shù)(北京)有限公司;引物,由上海生工生物技術(shù)有限公司合成;其他試劑均為國產(chǎn)分析純,市售。
1.2 方法
1.2.1 重組質(zhì)粒pcDNA4-SopBΔ288-309突變體的構(gòu)建。根據(jù)NCBI數(shù)據(jù)庫公布的Salmonella Typhimurium str.LT2的SopB基因編碼序列(GenBank號為AE006468.1),利用 Primer 5.0 軟件設(shè)計2對引物(表1)。以pCDNA4-SopB重組質(zhì)粒為模板,分別利用P1、P3引物對以及P2、P4引物對擴(kuò)增編碼SopB 0~288蛋白的基因片段以及編碼SopB 309~561蛋白的基因片段。2個片段進(jìn)行PCR反應(yīng)的擴(kuò)增條件均為:94 ℃,6 min;94 ℃,30 s,58 ℃,30 s,72 ℃,1 min,30 個循環(huán);72 ℃,10 min。瓊脂糖凝膠電泳檢測并分別回收純化 PCR 產(chǎn)物。最后利用P1、P2引物對,以等量的上述2種PCR產(chǎn)物為模板擴(kuò)增SopBΔ288-309缺失突變體編碼基因。PCR反應(yīng)條件為:94 ℃,6 min;94 ℃,30 s,58 ℃,30 s,72 ℃,2 min,30 個循環(huán);72 ℃,10 min。瓊脂糖凝膠電泳檢測并回收純化 PCR 產(chǎn)物。用限制性內(nèi)切酶BamHⅠ和EcoRⅠ進(jìn)行雙酶切并純化酶切后的片段,同時將質(zhì)粒 pCDNA4.0也經(jīng)同樣雙酶切和純化。最后,將pCDNA4與SopBΔ288-309基因片段的酶切純化產(chǎn)物用 T4 連接酶體系連接,轉(zhuǎn)化 Trans 10 大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞,涂布于含 Ampr的 LB 平板上,37 ℃培養(yǎng)12~16 h。挑取單個菌落接種于含 Ampr的 LB 液體培養(yǎng)基中,37 ℃、200 r/min 振蕩過夜,酶切鑒定,獲得pCDNA4-SopBΔ288-309重組質(zhì)粒,測序確認(rèn)插入序列正確。
1.2.2 質(zhì)粒轉(zhuǎn)染HeLa細(xì)胞。參照的方法[11-12]。
1.2.3 HeLa細(xì)胞pAKT473激活情況的檢測。參照文獻(xiàn)的方法[13],收集分別轉(zhuǎn)染pCDNA4-SopB野生型質(zhì)粒和pCDNA4-SopBΔ288-309突變體質(zhì)粒24 h后的HeLa細(xì)胞,將細(xì)胞加等體積2×SDS載樣緩沖后,沸水浴煮沸5 min,離心1 min后進(jìn)行10% SDS-PAGE電泳,轉(zhuǎn)膜,利用兔源抗pAkt473的一抗和羊抗兔二抗進(jìn)行免疫印跡雜交,洗膜,最后通過ECL化學(xué)發(fā)光試劑盒進(jìn)行X光片壓片,洗片。同時利用Akt抗體作為對照。
2 結(jié)果與分析
2.1 SopBΔ288-309突變基因的擴(kuò)增 利用pCDNA4-SopB重組質(zhì)粒作為模板,分別以P1、P3引物對和P2、P4引物對進(jìn)行PCR擴(kuò)增成功獲得編碼SopB 0~288蛋白序列的基因片段(圖1泳道1、2、3和4)以及SopB 309~561蛋白序列的基因片段(圖1泳道5、6、7和8)。從圖中可以看出,2種PCR片段的長度均在DNA marker的大小為750 bp的條帶附近,而且編碼SopB 0~288蛋白片段的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的分子量(預(yù)期片段長度 864 bp)比編碼SopB 309~561蛋白片段的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的分子量(預(yù)期片段長度 756 bp)略大一些,與預(yù)期結(jié)果相吻合。繼續(xù)以上述2種回收的PCR片段作模板,利用引物對P1、P2對其進(jìn)行PCR擴(kuò)增發(fā)現(xiàn),成功擴(kuò)增出了與預(yù)期的SopBΔ288-309片段長度(1 620 bp)接近的PCR產(chǎn)物(圖2)。試驗結(jié)果表明,通過重疊延伸PCR的方法即利用2種PCR片段作為模板,2個片段之間各有1段20 bp左右的互補的序列,可以成功的獲得去掉288~309位間氨基酸片段的SopBΔ288-309基因片段。
3 結(jié)論與討論
試驗利用重疊延伸PCR的方法構(gòu)建了沙門氏菌效應(yīng)蛋白SopB跨膜疏水片段288~309肽段缺失質(zhì)粒,并利用該質(zhì)粒與野生型SopB蛋白的功能進(jìn)行比較,研究了該疏水肽段對HeLa細(xì)胞pAkt473激活的影響。結(jié)果發(fā)現(xiàn),該疏水肽段對于SopB依賴的HeLa細(xì)胞pAkt473的激活是必需的。2009年,Patel等的研究發(fā)現(xiàn),沙門氏菌效應(yīng)蛋白SopBΔ288-309缺失菌株感染宿主細(xì)胞后,SopBΔ288-309蛋白不能夠發(fā)生與野生型SopB類似的泛素化修飾,表明SopB跨膜結(jié)構(gòu)域288~309肽段與SopB蛋白的泛素化修飾直接相關(guān),進(jìn)一步研究該跨膜結(jié)構(gòu)域與SopB亞細(xì)胞定位有關(guān)[9]。當(dāng)SopB缺失第288~309位肽段后,該SopB 缺失突變體能夠被分泌至宿主細(xì)胞中,而且該突變體的分泌量略低于野生型SopB蛋白。亞細(xì)胞定位研究表明,SopBΔ288-309突變體主要被轉(zhuǎn)運至細(xì)胞的胞漿,與野生型SopB定位于細(xì)胞膜,胞漿以及SCV完全不同[9]?;诖?/p>
推測,288~309跨膜螺旋結(jié)構(gòu)域與SopB亞細(xì)胞定位至細(xì)胞
膜有關(guān),當(dāng)突變體不能定位至細(xì)胞膜以后,SopB蛋白的泛素化也隨之消失。試驗利用穿梭質(zhì)粒在HeLa細(xì)胞中表達(dá)SopBΔ288-309突變體時發(fā)現(xiàn)該跨膜疏水片段與HeLa細(xì)胞pAkt473的激活直接相關(guān)。推測SopB對pAkt473磷酸化激活的功能依賴于其定位于宿主細(xì)胞膜,當(dāng)SopB不能夠亞細(xì)胞定位至細(xì)胞膜時會導(dǎo)致其激活功能的喪失。SopBΔ288-309的表型不像是由于該疏水跨膜結(jié)構(gòu)域的缺失導(dǎo)致的蛋白整體構(gòu)象的變化,因為純化的SopBΔ288-309突變體仍然具有與野生型SopB類似的肌醇磷脂酶活性[9],但是該實驗也不能排除另一種可能就是該段序列的去除可能影響到SopB局部構(gòu)象的變化,例如改變了SopB與其他蛋白間的相互作用,而這些想相互作用與SopB和膜的結(jié)合有關(guān)。綜上所述,試驗建立了一種利用重疊延伸PCR的方法構(gòu)建蛋白的缺失突變體,為蛋白質(zhì)功能的研究提供了一種可靠的手段。
參考文獻(xiàn)
[1]
NORRIS F A,WILSON M,WALLIS T S,et al.SopB,a protein required for virulence of Salmonella dublin,is an inositol phosphate phosphatase[J].Proc Natl Acad Sci USA,1998,95(24):14057-14059.
[2] HERNANDEZ L D,HUEFFER K,WENK M R,et al.Salmonella modulates vesicular traffic by altering phosphoinositide[J].Science,2004,304(5678):1805-1807.
[3] AKOPYAN K,EDGREN T,WANG-EDGREN H,et al.Translocation of surface-localized effectors in type III secretion[J].Proc Natl Acad Sci USA,2011,108(4):1639-1644.
[4] ZHOU D,CHEN L M,HERNANDEZ L,et al.A Salmonella inositol polyphosphatase acts in conjunction with other bacterial effectors to promote host cell actin cytoskeleton rearrangements and bacterial internalization[J].Mol Microbiol,2001,39(2):248-259.
[5] AGBOR T A,MCCORMICK B A.Salmonella effectors:important players modulating host cell function during infection[J].Cell Microbiol,2011,13(12):1858-1869.
[6] PATEL J,GALN J.Differential activation and function of Rho GTPases during Salmonella-host cell interactions[J].Cell Biol,2006,175(3):453-463.
[7] COOPER K G,WINFREE S,MALIK-KALE P,et al.Activation of Akt by the bacterial inositol phosphatase,SopB,is wortmannin insensitive[J].PLoS One,2011,6:22260.
[8] MALLO G V,ESPINA M,SMITH A C,et al.SopB promotes phosphatidylinositol 3-phosphate formation on Salmonella vacuoles by recruiting Rab5 and Vps34[J].J Cell Biol,2008,182(4):741-752.
[9] PATEL J C,HUEFFER K,LAM T,et al.Diversification of a Salmonella virulence protein function by ubiquitin-dependent differential localization[J].Cell,2009,137(2):283-294.
[10] KNODLER L A,WINFREE S,DRECKTRAH D,et al.Ubiquitination of the bacterial inositol phoshatase,SopB,regulates its biological activity at the plasma membrane[J].Cell Microbiol,2009,11(11):1652-1670.
[11] 陶永清,劉崇基,李健嬌,等.沙門菌效應(yīng)分子SopB 激活HeLa 細(xì)胞MAPK 蛋白激酶的磷酸化[J].中國醫(yī)藥生物技術(shù),2011,6(6):432-436.
[12] 阮海華,趙霞,張振奇.過表達(dá)沙門氏菌效應(yīng)蛋白SopB對HeLa細(xì)胞骨架的影響[J].安徽農(nóng)業(yè)科學(xué),2013,41(6):7067-7069.
[13] YANG W L,WANG J,CHAN C H,et al.The E3 ligase TRAF6 regulates Akt ubiquitination and activation[J].Science,2009,325(5944):1134-1138.