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人泛素結(jié)合酶UbcH5c活性突變體的構(gòu)建·純化以及催化活性研究

2014-04-29 00:44:03張西軒李曄阮海華
安徽農(nóng)業(yè)科學(xué) 2014年3期

張西軒 李曄 阮海華

摘要 [目的]構(gòu)建人泛素結(jié)合酶UbcH5c的活性位點突變體S22R和F62A,同時分析這2種突變體蛋白與野生型蛋白在泛素化反應(yīng)中的活性差異。[方法]通過點突變(Site-Directed Mutagenesis)的方法構(gòu)建2種突變體質(zhì)粒,利用0.5 mmol/L IPTG分別誘導(dǎo)2種突變體蛋白在大腸桿菌中進行表達;將菌體超聲破碎后,依次利用陽離子交換層析法對UbcH5c突變蛋白進行分離純化,最后利用體外泛素化酶促反應(yīng)結(jié)合蛋白免疫印跡雜交的方法分析野生型UbcH5c與其活性突變體UbcH5c S22R和UbcH5c F62A在泛素化修飾上的差異。[結(jié)果]人泛素結(jié)合酶UbcH5c的2個突變體蛋白S22R、F62A的泛素化修飾程度明顯弱于野生型蛋白。[結(jié)論]突變體S22R和F62A突變均不同程度的改變了人泛素結(jié)合酶UbcH5c與泛素分子之間的結(jié)合活性,即2個突變的位點中第62位苯丙氨酸殘基及第22位絲氨酸殘基均是UbcH5c結(jié)合泛素的關(guān)鍵位點,而且后者對于UbcH5c結(jié)合泛素活性的影響更大。

關(guān)鍵詞 UbcH5c;泛素化修飾;點突變

中圖分類號 S188 文獻標(biāo)識碼 A 文章編號 0517-6611(2014)03-00663-04

蛋白的泛素化修飾包括以下3個步驟:(1)泛素的活化:泛素甘氨酸端的羧基連接到泛素活化酶E1(Ubiquitin activating enzyme)的巰基,這個步驟需要以ATP作為能量,最終形成一個泛素和泛素活化酶E1之間的硫酯鍵;(2)E1將活化后的泛素通過交酯化過程交給泛素結(jié)合酶E2(Ubiquitin conjugating enzyme);(3)泛素連接酶E3將結(jié)合在E2上的泛素分子連接到底物蛋白上,最終,底物蛋白被泛素化修飾[1-3]。UbcH5c是泛素結(jié)合酶(ubiquitin-conjugating enzyme,E2)家族中的成員,由147個氨基酸構(gòu)成,分子量約為16 kDa[4]。在泛素介導(dǎo)的泛素化反應(yīng)途徑中泛素活化酶(E1)將活化后的泛素分子通過交酯化過程呈遞給UbcH5c,泛素分子結(jié)合于UbcH5c的第85位半胱氨酸(Cys85)形成UbcH5c-Ub復(fù)合物,其中Cys85是UbcH5c的活性催化中心的氨基酸[5]。研究發(fā)現(xiàn),在泛素化級聯(lián)反應(yīng)中,除了UbcH5c通過巰酯鍵與泛素分子之間形成復(fù)合物以外,其他的氨基酸在該復(fù)合物的形成過程中也發(fā)揮重要作用,例如第22位的絲氨酸(Ser,S)和第62位的苯丙氨酸[6]。筆者通過點突變(Site-Directed Mutagenesis)的方法分別構(gòu)建2種UbcH5c的活性突變體UbcH5c S22R、UbcH5c F62A;其中,UbcH5c S22R為野生型UbcH5c的氨基酸序列上第22位的絲氨酸(Ser,S)改變?yōu)榫彼幔ˋrg,R);UbcH5c F62A為野生型UbcH5c的氨基酸序列上第62位的苯丙氨酸(Phe,F(xiàn))改變?yōu)楸彼幔ˋla,A);并利用體外泛素化酶促反應(yīng)與蛋白免疫印跡的方法分析野生型UbcH5c及其2個突變體在泛素化反應(yīng)中活性的差異,以期為UbcH5c活性突變體的的開發(fā)利用提供依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 材料

1.1.1 供試菌株和質(zhì)粒載體。感受態(tài)大腸桿菌E.coli Trans10、E.coli BL21(DE3)、重組質(zhì)粒pET21a-UbcH5c,由實驗室保存。

1.1.2 主要試劑。Vent DNA polymeras,購自美國NEB公司;T4 DNA連接酶,購自美國 Promega公司;PVDF膜,購自德國Milipore公司;質(zhì)粒小提中量試劑盒,購自北京天根公司;鼠源UbcH5c單克隆抗體,購自Abcam公司;鼠源HRP偶聯(lián)抗體,購自Promega公司;ECL化學(xué)發(fā)光底物試劑盒,購自Thermo Scientific;其他試劑為國產(chǎn)分析純,市售。

1.2 方法

1.2.1 人泛素結(jié)合酶UbcH5c點突變體的構(gòu)建。人泛素結(jié)合酶UbcH5c突變體的構(gòu)建采用Site-directed Mutagenesis Kit 的方法,即根據(jù)NCBI數(shù)據(jù)庫公布的人泛素結(jié)合酶UbcH5c的基因編碼序列(GenBank號為U39318.1)分別設(shè)計2對互補的引物(如表1所示)構(gòu)建突變體質(zhì)粒[5]。質(zhì)粒構(gòu)建采用PCR的方法,反應(yīng)條件為 94 ℃,6 min;94 ℃,30 s,78 ℃,30 s,72 ℃,10 min,16個循環(huán);72 ℃,15 min。取20 μl PCR產(chǎn)物利用DpnI于37 ℃下酶切1 h,酶切后的產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測擴增成功,再將酶切產(chǎn)物轉(zhuǎn)化到大腸桿菌Trans 10 感受態(tài)細胞中,涂布于含Ampr的LB平板上,37 ℃條件下培養(yǎng)12~16 h。挑取單個菌落接種于含Ampr的LB液體培養(yǎng)基中,37 ℃條件下150 r/min振蕩培養(yǎng)過夜,提取質(zhì)粒后進行測序驗證。

2.4 人泛素結(jié)合酶UbcH5c及其2種突變體UbcH5c S22R、UbcH5c F62A泛素結(jié)合活性分析 圖6表明,野生型UbcH5c具有最強的泛素結(jié)合活性,其UbcH5c-Ub復(fù)合物的生成量最多。相比之下,突變體UbcH5c S22R的泛素結(jié)合活性明顯弱于野生型UbcH5c,且生成的UbcH5c-Ub復(fù)合物也偏少。而突變體UbcH5c F62A的泛素結(jié)合活性幾乎完全喪失,不能夠與泛素分子之間形成UbcH5c-Ub復(fù)合物。結(jié)果表明,人泛素結(jié)合酶UbcH5c中第22位的絲氨酸與第62位的苯丙氨酸的單獨突變均明顯削弱了UbcH5c與泛素分子的結(jié)合活性;且與第22位的絲氨酸相比,第62位的苯丙氨酸位點對于其與泛素分子結(jié)合至關(guān)重要。

3 結(jié)論與討論

試驗利用定點突變的方法構(gòu)建了人泛素結(jié)合酶UbcH5c的2株突變體蛋白,分別為S22R和F62A。通過與野生型蛋白進行比較發(fā)現(xiàn),S22以及F62的突變直接導(dǎo)致UbcH5c與泛素分子之間非共價結(jié)合作用明顯降低,表明這2個位點與UbcH5c和泛素分子之間非共價結(jié)合直接相關(guān)。泛素結(jié)合酶是泛素化修飾途徑中的核心組件之一,且可以將活化的泛素分子從泛素活化酶上轉(zhuǎn)移到特定的泛素連接酶上[7-9]。研究表明,人泛素結(jié)合酶UbcH5c與泛素的結(jié)合包括2種方式,一種為其第85位的半胱氨酸與泛素分子的共價結(jié)合,另一種為其與泛素分子的非共價結(jié)合。人泛素結(jié)合酶UbcH5c與泛素分子的非共價結(jié)合對泛素的成鏈具有重要作用,為了研究人泛素結(jié)合酶UbcH5c與泛素分子之間的非共價結(jié)合。Brzovic等在蛋白質(zhì)的分子水平上,利用核磁共振成像等手段對人泛素結(jié)合酶UbcH5c與泛素通過非共價結(jié)合形成的復(fù)合物進行了研究[6]。結(jié)果表明,人泛素結(jié)合酶UbcH5c可以識別并非共價的結(jié)合泛素分子上第8位的亮氨酸、第44位的異亮氨酸以及第70位的纈氨酸,這種與泛素分子之間非共價的結(jié)合主要集中在人泛素結(jié)合酶UbcH5c上遠離其半胱氨酸(Cys85)殘基的β折疊鏈1-3上,其中距離最近的非共價結(jié)合位點也超過了20個氨基酸的長度,且一個泛素分子不能同UbcH5c Cys85殘基以及非共價結(jié)合位點同時結(jié)合。當(dāng)UbcH5c的非共價結(jié)合位點S22與F62被突變后,人泛素結(jié)合酶UbcH5c的泛素化修飾程度變得異常微弱與緩慢。

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