申浩 張秀 張蕾 張延
摘 要:蛋白質(zhì)的o-糖基化(O-glycosylation)是一種重要的翻譯后修飾,參與諸多生理和病理過程。目前,對(duì)于蛋白質(zhì)的O-糖基化的研究進(jìn)展仍非常緩慢,一個(gè)重要的原因就是缺乏高效的對(duì)O-糖基化蛋白進(jìn)行分離和鑒定的技術(shù)。創(chuàng)新性地將點(diǎn)擊化學(xué)反應(yīng)、二維電泳和質(zhì)譜技術(shù)結(jié)合,對(duì)尋找細(xì)胞內(nèi)0-糖基化蛋白進(jìn)行了技術(shù)探索性研究。首先利用代謝性標(biāo)記手段,在人肝癌細(xì)胞HCCLM6培養(yǎng)基中加入四乙?;B氮半乳糖胺(Ac4GaINAZ)對(duì)細(xì)胞內(nèi)O-GalNAc糖基化蛋白進(jìn)行標(biāo)記:其次通過點(diǎn)擊化學(xué)將炔基熒光基團(tuán)連接至標(biāo)記的O-糖基化蛋白的疊氮基團(tuán);應(yīng)用二維電泳技術(shù)對(duì)標(biāo)記蛋白進(jìn)行分離,并找到13個(gè)具有熒光信號(hào)的蛋白點(diǎn);最后對(duì)具有熒光信號(hào)的蛋白進(jìn)行質(zhì)譜鑒定,成功鑒定到7種蛋白,經(jīng)軟件預(yù)測(cè)后,GRP78蛋白和ANXA1蛋白均具有潛在的0-糖基化位點(diǎn)。這為尋找細(xì)胞或生物體中的O-糖基化蛋白奠定了基礎(chǔ),并為高通量篩選O-糖基化蛋白提供技術(shù)平臺(tái)。
關(guān)鍵詞:O-糖基化蛋白;點(diǎn)擊化學(xué);二維電泳;質(zhì)譜技術(shù)
中圖分類號(hào):Q599
文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A
文章編號(hào):1007-7847(2014)05-0377-05
糖基化是一種常見的蛋白質(zhì)翻譯后修飾,存在于生物體內(nèi)超過一半的蛋白質(zhì)中。糖基化修飾對(duì)于蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能具有顯著影響,參與調(diào)節(jié)信號(hào)傳導(dǎo)、分子轉(zhuǎn)運(yùn)、細(xì)胞粘附、免疫應(yīng)答等牛物學(xué)過程.除此之外,異常的糖基化修飾與諸多疾病有密切關(guān)系,粘蛋白型O-糖基化是一類廣泛仔在的蛋白質(zhì)糖基化修飾,其合成的第一步為:UDP-乙酰氨基半乳糖(UDP-GalNAc:,供體)通過多肽N-乙酰氨基半乳糖基轉(zhuǎn)移酶(pp-GalNAc-Ts)的催化連接在蛋白質(zhì)的絲氨酸或蘇氨酸殘基(受體)的羥基氧上。由于缺少保守的O-糖基化氨基酸特征序列,缺乏通用的糖苷酶以及O-糖鏈結(jié)構(gòu)的復(fù)雜性等原因,目前對(duì)于蛋白質(zhì)O-糖基化的分析仍處于方法開發(fā)階段。生物正交點(diǎn)擊化學(xué)(bioorthogonalClick chemistry)可經(jīng)簡(jiǎn)單的疊氮一炔基環(huán)化加成反應(yīng)將含炔基檢測(cè)標(biāo)簽共價(jià)連接到生物兼容的疊氮標(biāo)記的待測(cè)分子上。憑借其生物相容性、生物正交性、高效性和高特異性等優(yōu)點(diǎn).此類新興技術(shù)在化學(xué)糖生物學(xué)領(lǐng)域發(fā)展迅速[10,11]。基于疊氮的生物正交點(diǎn)擊化學(xué)在糖生物學(xué)研究中的應(yīng)用,主要分為以下幾個(gè)方面:1)在糖代謝過程中的應(yīng)用。在糖代謝研究的早期.Reutler教授開發(fā)了代替唾液酸的非天然N-?;愃莆铮瑸橥僖核岬难芯刻峁┝诵滤悸?。近10年來.Bertozzi教授利用施陶丁格反應(yīng)進(jìn)行糖代謝的研究,進(jìn)一步推動(dòng)了生物正交點(diǎn)擊化學(xué)的發(fā)展:2)在糖鏈活體成像中的應(yīng)用。目前,AC4ManNAz,AC4GalNAz和GDP-FucAz均成功地應(yīng)用于糖鏈活體成像研究中;3)在糖鏈富集和糖組學(xué)中的應(yīng)用。 NarimatsU教授將生物正交點(diǎn)擊化學(xué)與質(zhì)譜技術(shù)結(jié)合,成功的鑒定出巖藻糖基化的N -聚糖位點(diǎn)圖譜。此外,本課題組開發(fā)的一種以二硫鍵和末端炔基修飾的二氧化硅納米顆粒,可從多肽混合體系中特異性地富集疊氮標(biāo)記的多肽:4)在病毒研究中的應(yīng)用??捎茂B氮或炔基修飾病毒表面.有利于成像和藥物傳送;5)另外,生物正交點(diǎn)擊化學(xué)在蛋白活性表達(dá)譜,糖復(fù)合物合成以及糖芯片技術(shù)中也有廣泛的應(yīng)用。
本研究利用疊氮標(biāo)記的單糖類似物——Ac4GaINAz(圖1)對(duì)人肝癌細(xì)胞系HCCLM6進(jìn)行代謝性標(biāo)記,單糖類似物進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)參與正常糖代謝過程.可使細(xì)胞內(nèi)的O-糖基化蛋白標(biāo)記上疊氮基團(tuán),再通過疊氮和炔基的點(diǎn)擊化學(xué)反應(yīng)實(shí)現(xiàn)對(duì)蛋白的熒光標(biāo)記,最后,利用二維電泳技術(shù)將蛋白進(jìn)行分離以及MALDI—T0F質(zhì)譜對(duì)蛋白進(jìn)行鑒定(實(shí)驗(yàn)流程見圖2)。本研究為尋找O一糖基化蛋白建立了良好的技術(shù)平臺(tái),為蛋白質(zhì)O-糖基化的研究奠定基礎(chǔ)。
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 細(xì)胞株
人肝癌細(xì)胞系HCCLM6南人類基因組南方研究中心張新教授惠贈(zèng)。
1.1.2 相關(guān)試劑
胎牛血清(Fetal bovine serum,F(xiàn)BS)購(gòu)白美國(guó)GIBCO公司;胰蛋白酶消化液(Try psin)和AlexaFluor 555熒光試劑(炔基熒光試劑,Alkynyl fluophor)購(gòu)自美國(guó)Life technology公司;細(xì)胞裂解液成分為:1% NP-40,50 mmoUL Tris-HCL 150 mmoI/lNaCl, 0.1% SDS,Cocktail;細(xì)胞培養(yǎng)基DMFM/HICJH GLUCOSE、BCA定量試劑盒和蛋白 Marker購(gòu)白美國(guó)Thermo公司;四乙?;B氮半乳糖胺(AC4GalNAz)由本實(shí)驗(yàn)室工勝老師合成;CuSO4、NaVc購(gòu)自國(guó)藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司;IPG膠條、兩性電解質(zhì)Bio-Lyte和礦物油購(gòu)白美國(guó)Bio-Rad公司;TBTA、DTT和IAA購(gòu)自美國(guó)Sigma公司;配制水化液所用試劑、平衡緩沖液所用試劑、12.5%丙烯酰胺凝膠所用試劑均為進(jìn)口或國(guó)產(chǎn)分析純?cè)噭?;水化上樣緩沖液成分:水化液,DTT和Bio-Lyle;平衡緩沖液I成分:平衡液,DTT和溴酚藍(lán);平衡緩沖液Ⅱ成分:平衡液,IAA和溴酚藍(lán)、
1.1.3 儀器
等電聚焦儀和垂直電泳儀(美國(guó)Bio- Rad公司)。熒光化學(xué)發(fā)光及同位素影像掃描分析儀(fluorescent and radioisotope science imaging sys-tems,,F(xiàn)LA-5100,日本Fujifilm公司);平板掃描儀(臺(tái)灣UMAX公司);MALDI-TOF質(zhì)譜儀(Ultrallex
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
1.2.1 細(xì)胞標(biāo)記
HCCLM6細(xì)胞培養(yǎng)于37℃,5% C02培養(yǎng)箱,DMEM(含 10% FBS)培養(yǎng)基,待細(xì)胞生長(zhǎng)進(jìn)入指數(shù)生長(zhǎng)期;取50 μL濃度為10 mmol/L的AC4Gal-NAz加到培養(yǎng)皿底部,待溶劑乙醇揮發(fā),將Sxl06個(gè)細(xì)胞鋪于培養(yǎng)皿中,使標(biāo)記終濃度為100μmol/L;培養(yǎng)細(xì)胞48h。
1 .2.2 蛋白樣品的獲得
細(xì)胞標(biāo)記48h后,吸掉培養(yǎng)基并進(jìn)行胰蛋白酶消化,將細(xì)胞轉(zhuǎn)移至離心管中,800 r/min離心收集細(xì)胞;加入150 μL細(xì)胞裂解液震蕩裂解,12 000g離心30min,保留上清;BCA蛋門定量試劑盒進(jìn)行蛋白定量。
1.2.3 疊氮一炔基環(huán)化加成反應(yīng)
定量后取300 μg總蛋白,加入1.5 μL AlexaFluor 555熒光試劑和2μL催化劑,并用PBS(pH 7.8)補(bǔ)齊至400μL,置于恒溫震蕩儀中25℃反應(yīng)1 h;反應(yīng)結(jié)束后,甲醇氯仿法進(jìn)行蛋白沉淀:樣品中加入1.2 mL甲醇并混勻,加入300 μL氯仿并混勻,加入800 μL超純水并混勻,15 000 g離心5 min棄上清,加入900 μL甲醇后15 000 g離心5 min,棄上清,空氣中風(fēng)干蛋白沉淀。
1.2.4 等電聚焦
用水化上樣緩沖液將樣品定容至300 μL;IPG預(yù)制膠條室溫放置5 min;沿電泳槽邊緣連續(xù)加入樣品.不要產(chǎn)生氣泡;去除預(yù)制IPG膠條上的保護(hù)層,將IPG膠條置于樣品中;膠條上覆蓋1 mL礦物油:進(jìn)行等電聚焦電泳。
等電聚焦電泳儀參數(shù)沒置:溶脹上樣階段:
50 V
12 h等電聚焦階段:
200 V
1h
快速升壓
500 V
1h
快速升壓
1 000 V
2h
慢速升壓
10 000 V
2h
慢速升壓
10 000 V 80 000 Vhrs 快速升壓
500 V
Hold
快速升壓
1.2.5 SDS-PAGE電泳
等電聚焦結(jié)束后,瀝干膠條上的礦物油,置于平衡緩沖液I中平衡I5 min;平衡緩沖液Ⅱ中平衡15 min;去離子水清洗殘余的緩沖液,進(jìn)行SDS-PAGE電泳。
電泳儀參數(shù)設(shè)置:階段I:16 mA/gel 30 min階段Ⅱ:24 mA/gel 6 h
1.2.6
熒光掃描與考馬斯亮藍(lán)染色
對(duì)凝膠進(jìn)行熒光掃描,采集熒光信號(hào),獲得熒光信號(hào)二維電泳圖;對(duì)平行凝膠進(jìn)行考馬斯亮藍(lán)染色,脫色后掃描獲得二維電泳圖譜。
1.2.7 MALDI-TOF質(zhì)譜
比對(duì)熒光信號(hào)二維電泳圖譜結(jié)果與考馬斯亮藍(lán)染色結(jié)果,對(duì)具有熒光信號(hào)的蛋白進(jìn)行收集;進(jìn)行質(zhì)譜分析。
2 結(jié)果與分析
2.1 熒光信號(hào)二維電泳圖譜
利用熒光化學(xué)發(fā)光及同位素影像掃描分析儀對(duì)二維電泳凝膠進(jìn)行熒光信號(hào)掃描。結(jié)果如圖3所示。結(jié)果顯示,熒光信號(hào)大部分出現(xiàn)在pH堿性端,相對(duì)分子質(zhì)量40 kD附近;少部分信號(hào)出現(xiàn)在pH酸性,相對(duì)分子質(zhì)量15 kD附近。
2.2 二維電泳圖譜
熒光信號(hào)掃描以后,對(duì)同一塊二維電泳凝膠進(jìn)行考馬斯亮藍(lán)(CBB)染色,脫色后用平板掃描儀進(jìn)行掃描。結(jié)果如圖4所示。
2.3 質(zhì)譜鑒定結(jié)果
對(duì)熒光信號(hào)二維電泳圖譜和考馬斯亮藍(lán)染色圖譜進(jìn)行比對(duì),尋找到13個(gè)具有熒光信號(hào)的蛋白點(diǎn)(如圖4所示)。對(duì)其進(jìn)行割膠和質(zhì)譜鑒定,成功鑒定到7種蛋白,如表1所示。我們用Net0-Glyc 3.1 Server軟件對(duì)7種蛋白的O-糖基化位點(diǎn)進(jìn)行預(yù)測(cè),其中GRP78蛋白和ANXA1蛋白分別具有2個(gè)和1個(gè)潛在的O-糖基化位點(diǎn)。
3 結(jié)論與討論
點(diǎn)擊化學(xué)具有生物相容性、高特異性等優(yōu)點(diǎn),已逐步發(fā)展為極有價(jià)值的化學(xué)生物學(xué)研究方法。尤其是在糖生物學(xué)領(lǐng)域,點(diǎn)擊化學(xué)技術(shù)在高通量糖蛋白質(zhì)組學(xué)和疾病相關(guān)標(biāo)志物尋找等方面發(fā)揮了重要作用,疊氮試劑因其生物學(xué)惰性,在體外實(shí)驗(yàn)和體內(nèi)實(shí)驗(yàn)(例如,小鼠和斑馬魚)中均有很大突破,應(yīng)用也最為廣泛。靈敏的選擇性和生物相容性使生物正交點(diǎn)擊化學(xué)為糖生物學(xué)研究帶來了巨大變革,基于生物正交性點(diǎn)擊化學(xué)的糖生物學(xué)研究主要包括四個(gè)方面:1)利用疊氮的反應(yīng)活性和特異性,作為捕獲底物的工具;2)用于新型生物正交性官能團(tuán)的發(fā)現(xiàn);3)在高通量蛋白質(zhì)組學(xué)中的應(yīng)用;4)對(duì)疾病發(fā)生發(fā)展機(jī)制的研究。目前,對(duì)于O-糖基化蛋白的發(fā)現(xiàn)依然基于凝集素富集技術(shù),受限于凝集素特異性和靈敏度較差等缺點(diǎn),尤其是在研究復(fù)雜糖鏈的過程中,這種技術(shù)思路存在較大的局限性。為建立高通量的尋找O-糖基化蛋白的技術(shù),本研究將二維電泳技術(shù)與點(diǎn)擊化學(xué)技術(shù)相結(jié)合,并對(duì)利用糖探針標(biāo)記所發(fā)現(xiàn)的潛在的0—糖基化蛋白進(jìn)行了質(zhì)譜鑒定,所發(fā)現(xiàn)的部分蛋白經(jīng)糖基化預(yù)測(cè)軟件分析發(fā)現(xiàn)其預(yù)測(cè)含有O-糖基化修飾位點(diǎn)。雖然目前的技術(shù)無法判定確定的糖基化修飾位點(diǎn),但是本研究仍為O-糖基化蛋白的高通量發(fā)現(xiàn)提供了有效的技術(shù)策略。今后通過改善和優(yōu)化標(biāo)記糖蛋白的富集效率、總蛋白的分級(jí)分離能力等,將能進(jìn)一步提升熒光信號(hào)的靈敏度與O-糖蛋白的展現(xiàn)特異性,從而更加完善該技術(shù)。