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1種快速高效的水稻谷粒自動(dòng)計(jì)數(shù)方法

2014-07-18 13:57:23田孟祥張時(shí)龍何友勛余本勛葉永印
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2014年2期
關(guān)鍵詞:谷粒圖像處理水稻

田孟祥+張時(shí)龍+何友勛+余本勛+葉永印

摘要:谷粒計(jì)數(shù)是水稻考種的重要組成部分。針對(duì)目前水稻谷粒人工計(jì)數(shù)和光電計(jì)數(shù)方法的不足,探索出1種基于MATLAB圖像處理技術(shù)的谷粒自動(dòng)計(jì)數(shù)方法,其所需材料易得,操作簡(jiǎn)單,利用攝像頭拍照獲取圖像,再應(yīng)用軟件分析處理,可實(shí)現(xiàn)谷粒自動(dòng)計(jì)數(shù)。試驗(yàn)表明,該方法可實(shí)現(xiàn)水稻谷??焖?、準(zhǔn)確地自動(dòng)計(jì)數(shù),不僅大大減輕了操作者勞動(dòng)強(qiáng)度,而且極大地提高了工作效率,是一種高效的水稻粒數(shù)計(jì)數(shù)方法,有很強(qiáng)的實(shí)用性和重要推廣意義。

關(guān)鍵詞:MATLAB;圖像處理;水稻;谷粒;自動(dòng)計(jì)數(shù)

中圖分類(lèi)號(hào): S126文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A文章編號(hào):1002-1302(2014)02-0064-02

收稿日期:2013-06-13

基金項(xiàng)目:貴州省科技廳重大專(zhuān)項(xiàng)(編號(hào):[2012]6005);貴州省畢節(jié)市科技計(jì)劃(編號(hào):[2012]34-3);貴州省畢節(jié)市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所項(xiàng)目(編號(hào):[2012]3)。

作者簡(jiǎn)介:田孟祥(1983—),男,貴州麻江人,碩士,助理研究員,主要從事水稻遺傳育種研究。E-mail: tmengxiang@126.com。

通信作者:余本勛,研究員,主要從事水稻遺傳育種研究。E-mail: bjriceybx@126.com。水稻是我國(guó)最重要的糧食作物之一,分布極廣,南至海南省崖縣,北至黑龍江省漠河縣,東至臺(tái)灣省,西至新疆都有種植[1]。目前已有大量從事水稻育種、栽培研究的人員,這些研究者在每年水稻收獲后都要進(jìn)行大批量的考種,其中谷粒計(jì)數(shù)是考種不可或缺的環(huán)節(jié),是進(jìn)行穗粒數(shù)、千粒重測(cè)定的組成部分。目前谷粒計(jì)數(shù)普遍采用人工計(jì)數(shù)方法或使用半自動(dòng)光電計(jì)數(shù)器,但均存在高成本、低效率等缺點(diǎn)。經(jīng)過(guò)不斷實(shí)踐,筆者探索出1種基于MATLAB圖像處理技術(shù)的快速、高效水稻谷粒自動(dòng)計(jì)數(shù)方法,其所需材料易得,操作簡(jiǎn)單,利用攝像頭拍照獲取圖像,再應(yīng)用軟件進(jìn)行分析處理,可實(shí)現(xiàn)谷粒自動(dòng)計(jì)數(shù),大大減輕了操作者勞動(dòng)強(qiáng)度,極大地提高了工作效率,現(xiàn)對(duì)該方法進(jìn)行詳細(xì)介紹,旨在為水稻谷粒考種研究提供參考。

1材料與方法

1.1材料電腦1臺(tái),可連接電腦并具有拍照功能的攝像頭(500萬(wàn)像素以上)1只,攝像頭支架,LED拷貝臺(tái),水稻谷粒。

1.2方法

1.2.1水稻谷粒自動(dòng)計(jì)數(shù)平臺(tái)搭建MATLAB即矩陣實(shí)驗(yàn)室(Matrix Laboratory),由美國(guó)新墨西哥大學(xué)創(chuàng)建,最初只能進(jìn)行簡(jiǎn)單的矩陣運(yùn)算,經(jīng)過(guò)不斷發(fā)展和完善,現(xiàn)已成為具有超強(qiáng)數(shù)值計(jì)算、圖形圖像處理、仿真處理能力的國(guó)際公認(rèn)優(yōu)秀科技應(yīng)用軟件。MATLAB 具有很強(qiáng)的開(kāi)放性和適應(yīng)性,除主包外,還擁有各種工具箱,如圖像處理工具箱、小波分析工具箱、信號(hào)處理工具箱、神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)工具箱等,極大地方便了不同學(xué)科的研究工作[2]。另外,MATLAB 使用方法較為簡(jiǎn)單,使用用戶非常熟悉的數(shù)學(xué)表達(dá)式來(lái)表達(dá)問(wèn)題和求解,使其越來(lái)越受到國(guó)內(nèi)外科技人員的青睞。本研究基于MATLAB的強(qiáng)大圖像處理功能,利用可拍照攝像頭、電腦、LED拷貝臺(tái)等搭建了水稻谷粒自動(dòng)計(jì)數(shù)平臺(tái),該平臺(tái)各硬件組裝配置如圖1所示。

1.2.2水稻谷粒圖像的采集將平臺(tái)調(diào)試好后,在LED拷貝臺(tái)上放置一定量水稻谷粒,谷粒間不能重疊,并保證谷粒在攝像頭視野范圍之內(nèi),啟動(dòng)攝像頭的拍照功能,對(duì)谷粒拍照獲取圖像,將采集到的圖像保存在MATLAB軟件搜索路徑中,便于圖片的后續(xù)調(diào)用。如圖像位置未在MATLAB軟件搜索路徑范圍內(nèi),可利用addpath函數(shù)將其添加,用save函數(shù)保存。

1.2.3水稻谷粒圖像處理及計(jì)數(shù)利用MATLAB軟件的imread函數(shù)讀入圖像,再根據(jù)試驗(yàn)需要,先后對(duì)圖像進(jìn)行灰度處理、圖像去噪、圖像分割等操作。在圖像處理中,須要進(jìn)行距離變換,取局部極小值,其目的是把每粒谷??s小,使得粘連谷粒分離,確保計(jì)數(shù)的準(zhǔn)確性。最后為連通域計(jì)數(shù),連通域數(shù)量即為水稻谷粒數(shù)目。谷粒圖像處理流程見(jiàn)圖2。

1.2.4MATLAB程序代碼根據(jù)設(shè)定的MATLAB圖像處理步驟,將其編寫(xiě)成MATLAB程序代碼如下。

2結(jié)果與分析

運(yùn)行上述MATLAB圖像處理程序,只需數(shù)秒即可在MATLAB命令窗口顯示水稻谷粒數(shù)。對(duì)數(shù)量約為100、200、300、400粒谷粒進(jìn)行多次測(cè)試,結(jié)果表明,MATLAB軟件能快速、高效、自動(dòng)地統(tǒng)計(jì)出谷粒數(shù),統(tǒng)計(jì)數(shù)目與實(shí)際相符,準(zhǔn)確率高達(dá)100%。本研究也發(fā)現(xiàn),圖像分割為程序最重要的部分,能否正確分割圖像,影響統(tǒng)計(jì)數(shù)量的準(zhǔn)確性,然而準(zhǔn)確的圖像分割需要有良好的圖像質(zhì)量,即背景與目標(biāo)有明顯的色調(diào)區(qū)分,將谷粒置于LED拷貝臺(tái)上可達(dá)到試驗(yàn)?zāi)康?,如沒(méi)有LED拷貝臺(tái),可用白紙?zhí)娲匾獣r(shí)須補(bǔ)充光照以確保背景與目標(biāo)區(qū)分明顯。還須注意的是,在放置谷粒時(shí)谷??烧尺B,但不能重疊,否則會(huì)影響統(tǒng)計(jì)的準(zhǔn)確性。圖3為按照本試驗(yàn)程序?qū)⒃脊攘D像在MATLAB軟件中處理后得到的一些圖像情況,該次水稻谷粒數(shù)為121粒,與實(shí)際數(shù)目相符。

從圖3可見(jiàn),該方法可使粘連谷粒分離(方框區(qū)域),圖3-a、圖3-b、圖3-c中3粒谷粒粘連,到圖3-d中這 3粒谷粒相對(duì)縮小而成功實(shí)現(xiàn)分離,確保了統(tǒng)計(jì)準(zhǔn)確性,從某種角度上說(shuō),也減輕了操作者的勞動(dòng)強(qiáng)度。

利用MATLAB圖像處理技術(shù)進(jìn)行水稻谷粒計(jì)數(shù)既快速,又準(zhǔn)確。值得一提的是,對(duì)于固定平臺(tái),該程序具有相對(duì)的穩(wěn)定性,一次調(diào)試多次使用;當(dāng)平臺(tái)變動(dòng)時(shí),只須對(duì)該程序稍調(diào)整參數(shù)即可。因此對(duì)于固定平臺(tái),可將程序保存為軟件可讀的M格式文件,置于MATLAB軟件的搜索路徑中,每次進(jìn)行谷粒計(jì)數(shù)時(shí),只須在MATLAB軟件的命令窗口中輸入原先保存的M文件名,軟件會(huì)立刻執(zhí)行M文件里的程序,很快完成水稻谷粒計(jì)數(shù),實(shí)現(xiàn)批量水稻谷??挤N。還須注意的是,須將獲取的圖像名稱(chēng)與程序中讀入圖像名稱(chēng)一致,否則程序無(wú)法讀入目標(biāo)圖像,導(dǎo)致程序運(yùn)行失敗。另外,使用連接電腦的攝像頭拍照獲取圖像,縮短了獲取圖像的時(shí)間,拍照后即可進(jìn)行處理,大大提高了考種效率。

3結(jié)論與討論

水稻谷粒計(jì)數(shù)是水稻考種的重要部分,也是耗時(shí)較多的環(huán)節(jié)。如何加快谷粒計(jì)數(shù)進(jìn)度,提高考種效率,成為水稻科技工作者普遍關(guān)注的問(wèn)題。已報(bào)道的水稻考種谷粒計(jì)數(shù)方法,有巫伯舜的穗枝梗法[3],單春生[4]、許桂玲等[5]的稱(chēng)重法,陳銘官的大小穗平均法[6]等。但是,筆者發(fā)現(xiàn)這些方法存在工序復(fù)雜、準(zhǔn)確度不高等問(wèn)題,實(shí)用性有限。通過(guò)探索實(shí)踐,本研究探索出基于MATLAB圖像處理技術(shù)的水稻谷粒自動(dòng)計(jì)

數(shù)方法,該方法以MATLAB軟件為基礎(chǔ),利用攝像頭連接電腦搭建獲取圖像平臺(tái),快速獲取圖像,調(diào)用軟件或工具箱函數(shù)并進(jìn)行適當(dāng)修正組成圖像處理程序,程序開(kāi)發(fā)簡(jiǎn)單且具有相對(duì)的固定性,一次成型多次受益,方便、實(shí)用,只須放置稻谷,拍照并運(yùn)行程序就可完成計(jì)數(shù)工作。

利用該MATLAB圖像處理程序處理水稻谷粒圖像,不管是單?;蛘尺B谷粒,均能進(jìn)行準(zhǔn)確、自動(dòng)計(jì)數(shù),準(zhǔn)確率高達(dá)100%。該方法大大減輕了考種勞動(dòng)強(qiáng)度,也彌補(bǔ)了人的精神及視覺(jué)容易疲勞等的不足,極大地提高了考種效率。除水稻谷粒計(jì)數(shù)外,該方法還適用于小麥、玉米、大豆等粒數(shù)計(jì)數(shù),具有很高的使用價(jià)值和重要的推廣意義。

參考文獻(xiàn):

[1]段玲玲,彭望瑗. 水稻栽培技術(shù)300問(wèn)[M]. 北京:中國(guó)農(nóng)業(yè)出版社,1997.

[2]張季,楊亞平. Matlab在醫(yī)學(xué)圖像處理中的應(yīng)用[J]. 醫(yī)學(xué)信息,2008,21(7):1014-1017.

[3]巫伯舜. 快速測(cè)算水稻每穗粒數(shù)[J]. 農(nóng)業(yè)科技通訊,1983(7):12.

[4]單春生. 稱(chēng)重法快速測(cè)算水稻每穗粒數(shù)[J]. 種子世界,1986(2):12.

[5]許桂玲,紀(jì)洪亭,潘劍,等. 水稻考種方法探析[J]. 中國(guó)農(nóng)技推廣,2012,28(6):16-17.

[6]陳銘官. 在水稻考種中穗實(shí)粒數(shù)統(tǒng)計(jì)方法的研究[J]. 福建稻麥科技,2001,1(1):12-13.

摘要:谷粒計(jì)數(shù)是水稻考種的重要組成部分。針對(duì)目前水稻谷粒人工計(jì)數(shù)和光電計(jì)數(shù)方法的不足,探索出1種基于MATLAB圖像處理技術(shù)的谷粒自動(dòng)計(jì)數(shù)方法,其所需材料易得,操作簡(jiǎn)單,利用攝像頭拍照獲取圖像,再應(yīng)用軟件分析處理,可實(shí)現(xiàn)谷粒自動(dòng)計(jì)數(shù)。試驗(yàn)表明,該方法可實(shí)現(xiàn)水稻谷粒快速、準(zhǔn)確地自動(dòng)計(jì)數(shù),不僅大大減輕了操作者勞動(dòng)強(qiáng)度,而且極大地提高了工作效率,是一種高效的水稻粒數(shù)計(jì)數(shù)方法,有很強(qiáng)的實(shí)用性和重要推廣意義。

關(guān)鍵詞:MATLAB;圖像處理;水稻;谷粒;自動(dòng)計(jì)數(shù)

中圖分類(lèi)號(hào): S126文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A文章編號(hào):1002-1302(2014)02-0064-02

收稿日期:2013-06-13

基金項(xiàng)目:貴州省科技廳重大專(zhuān)項(xiàng)(編號(hào):[2012]6005);貴州省畢節(jié)市科技計(jì)劃(編號(hào):[2012]34-3);貴州省畢節(jié)市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所項(xiàng)目(編號(hào):[2012]3)。

作者簡(jiǎn)介:田孟祥(1983—),男,貴州麻江人,碩士,助理研究員,主要從事水稻遺傳育種研究。E-mail: tmengxiang@126.com。

通信作者:余本勛,研究員,主要從事水稻遺傳育種研究。E-mail: bjriceybx@126.com。水稻是我國(guó)最重要的糧食作物之一,分布極廣,南至海南省崖縣,北至黑龍江省漠河縣,東至臺(tái)灣省,西至新疆都有種植[1]。目前已有大量從事水稻育種、栽培研究的人員,這些研究者在每年水稻收獲后都要進(jìn)行大批量的考種,其中谷粒計(jì)數(shù)是考種不可或缺的環(huán)節(jié),是進(jìn)行穗粒數(shù)、千粒重測(cè)定的組成部分。目前谷粒計(jì)數(shù)普遍采用人工計(jì)數(shù)方法或使用半自動(dòng)光電計(jì)數(shù)器,但均存在高成本、低效率等缺點(diǎn)。經(jīng)過(guò)不斷實(shí)踐,筆者探索出1種基于MATLAB圖像處理技術(shù)的快速、高效水稻谷粒自動(dòng)計(jì)數(shù)方法,其所需材料易得,操作簡(jiǎn)單,利用攝像頭拍照獲取圖像,再應(yīng)用軟件進(jìn)行分析處理,可實(shí)現(xiàn)谷粒自動(dòng)計(jì)數(shù),大大減輕了操作者勞動(dòng)強(qiáng)度,極大地提高了工作效率,現(xiàn)對(duì)該方法進(jìn)行詳細(xì)介紹,旨在為水稻谷粒考種研究提供參考。

1材料與方法

1.1材料電腦1臺(tái),可連接電腦并具有拍照功能的攝像頭(500萬(wàn)像素以上)1只,攝像頭支架,LED拷貝臺(tái),水稻谷粒。

1.2方法

1.2.1水稻谷粒自動(dòng)計(jì)數(shù)平臺(tái)搭建MATLAB即矩陣實(shí)驗(yàn)室(Matrix Laboratory),由美國(guó)新墨西哥大學(xué)創(chuàng)建,最初只能進(jìn)行簡(jiǎn)單的矩陣運(yùn)算,經(jīng)過(guò)不斷發(fā)展和完善,現(xiàn)已成為具有超強(qiáng)數(shù)值計(jì)算、圖形圖像處理、仿真處理能力的國(guó)際公認(rèn)優(yōu)秀科技應(yīng)用軟件。MATLAB 具有很強(qiáng)的開(kāi)放性和適應(yīng)性,除主包外,還擁有各種工具箱,如圖像處理工具箱、小波分析工具箱、信號(hào)處理工具箱、神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)工具箱等,極大地方便了不同學(xué)科的研究工作[2]。另外,MATLAB 使用方法較為簡(jiǎn)單,使用用戶非常熟悉的數(shù)學(xué)表達(dá)式來(lái)表達(dá)問(wèn)題和求解,使其越來(lái)越受到國(guó)內(nèi)外科技人員的青睞。本研究基于MATLAB的強(qiáng)大圖像處理功能,利用可拍照攝像頭、電腦、LED拷貝臺(tái)等搭建了水稻谷粒自動(dòng)計(jì)數(shù)平臺(tái),該平臺(tái)各硬件組裝配置如圖1所示。

1.2.2水稻谷粒圖像的采集將平臺(tái)調(diào)試好后,在LED拷貝臺(tái)上放置一定量水稻谷粒,谷粒間不能重疊,并保證谷粒在攝像頭視野范圍之內(nèi),啟動(dòng)攝像頭的拍照功能,對(duì)谷粒拍照獲取圖像,將采集到的圖像保存在MATLAB軟件搜索路徑中,便于圖片的后續(xù)調(diào)用。如圖像位置未在MATLAB軟件搜索路徑范圍內(nèi),可利用addpath函數(shù)將其添加,用save函數(shù)保存。

1.2.3水稻谷粒圖像處理及計(jì)數(shù)利用MATLAB軟件的imread函數(shù)讀入圖像,再根據(jù)試驗(yàn)需要,先后對(duì)圖像進(jìn)行灰度處理、圖像去噪、圖像分割等操作。在圖像處理中,須要進(jìn)行距離變換,取局部極小值,其目的是把每粒谷??s小,使得粘連谷粒分離,確保計(jì)數(shù)的準(zhǔn)確性。最后為連通域計(jì)數(shù),連通域數(shù)量即為水稻谷粒數(shù)目。谷粒圖像處理流程見(jiàn)圖2。

1.2.4MATLAB程序代碼根據(jù)設(shè)定的MATLAB圖像處理步驟,將其編寫(xiě)成MATLAB程序代碼如下。

2結(jié)果與分析

運(yùn)行上述MATLAB圖像處理程序,只需數(shù)秒即可在MATLAB命令窗口顯示水稻谷粒數(shù)。對(duì)數(shù)量約為100、200、300、400粒谷粒進(jìn)行多次測(cè)試,結(jié)果表明,MATLAB軟件能快速、高效、自動(dòng)地統(tǒng)計(jì)出谷粒數(shù),統(tǒng)計(jì)數(shù)目與實(shí)際相符,準(zhǔn)確率高達(dá)100%。本研究也發(fā)現(xiàn),圖像分割為程序最重要的部分,能否正確分割圖像,影響統(tǒng)計(jì)數(shù)量的準(zhǔn)確性,然而準(zhǔn)確的圖像分割需要有良好的圖像質(zhì)量,即背景與目標(biāo)有明顯的色調(diào)區(qū)分,將谷粒置于LED拷貝臺(tái)上可達(dá)到試驗(yàn)?zāi)康模鐩](méi)有LED拷貝臺(tái),可用白紙?zhí)娲匾獣r(shí)須補(bǔ)充光照以確保背景與目標(biāo)區(qū)分明顯。還須注意的是,在放置谷粒時(shí)谷??烧尺B,但不能重疊,否則會(huì)影響統(tǒng)計(jì)的準(zhǔn)確性。圖3為按照本試驗(yàn)程序?qū)⒃脊攘D像在MATLAB軟件中處理后得到的一些圖像情況,該次水稻谷粒數(shù)為121粒,與實(shí)際數(shù)目相符。

從圖3可見(jiàn),該方法可使粘連谷粒分離(方框區(qū)域),圖3-a、圖3-b、圖3-c中3粒谷粒粘連,到圖3-d中這 3粒谷粒相對(duì)縮小而成功實(shí)現(xiàn)分離,確保了統(tǒng)計(jì)準(zhǔn)確性,從某種角度上說(shuō),也減輕了操作者的勞動(dòng)強(qiáng)度。

利用MATLAB圖像處理技術(shù)進(jìn)行水稻谷粒計(jì)數(shù)既快速,又準(zhǔn)確。值得一提的是,對(duì)于固定平臺(tái),該程序具有相對(duì)的穩(wěn)定性,一次調(diào)試多次使用;當(dāng)平臺(tái)變動(dòng)時(shí),只須對(duì)該程序稍調(diào)整參數(shù)即可。因此對(duì)于固定平臺(tái),可將程序保存為軟件可讀的M格式文件,置于MATLAB軟件的搜索路徑中,每次進(jìn)行谷粒計(jì)數(shù)時(shí),只須在MATLAB軟件的命令窗口中輸入原先保存的M文件名,軟件會(huì)立刻執(zhí)行M文件里的程序,很快完成水稻谷粒計(jì)數(shù),實(shí)現(xiàn)批量水稻谷粒考種。還須注意的是,須將獲取的圖像名稱(chēng)與程序中讀入圖像名稱(chēng)一致,否則程序無(wú)法讀入目標(biāo)圖像,導(dǎo)致程序運(yùn)行失敗。另外,使用連接電腦的攝像頭拍照獲取圖像,縮短了獲取圖像的時(shí)間,拍照后即可進(jìn)行處理,大大提高了考種效率。

3結(jié)論與討論

水稻谷粒計(jì)數(shù)是水稻考種的重要部分,也是耗時(shí)較多的環(huán)節(jié)。如何加快谷粒計(jì)數(shù)進(jìn)度,提高考種效率,成為水稻科技工作者普遍關(guān)注的問(wèn)題。已報(bào)道的水稻考種谷粒計(jì)數(shù)方法,有巫伯舜的穗枝梗法[3],單春生[4]、許桂玲等[5]的稱(chēng)重法,陳銘官的大小穗平均法[6]等。但是,筆者發(fā)現(xiàn)這些方法存在工序復(fù)雜、準(zhǔn)確度不高等問(wèn)題,實(shí)用性有限。通過(guò)探索實(shí)踐,本研究探索出基于MATLAB圖像處理技術(shù)的水稻谷粒自動(dòng)計(jì)

數(shù)方法,該方法以MATLAB軟件為基礎(chǔ),利用攝像頭連接電腦搭建獲取圖像平臺(tái),快速獲取圖像,調(diào)用軟件或工具箱函數(shù)并進(jìn)行適當(dāng)修正組成圖像處理程序,程序開(kāi)發(fā)簡(jiǎn)單且具有相對(duì)的固定性,一次成型多次受益,方便、實(shí)用,只須放置稻谷,拍照并運(yùn)行程序就可完成計(jì)數(shù)工作。

利用該MATLAB圖像處理程序處理水稻谷粒圖像,不管是單粒或粘連谷粒,均能進(jìn)行準(zhǔn)確、自動(dòng)計(jì)數(shù),準(zhǔn)確率高達(dá)100%。該方法大大減輕了考種勞動(dòng)強(qiáng)度,也彌補(bǔ)了人的精神及視覺(jué)容易疲勞等的不足,極大地提高了考種效率。除水稻谷粒計(jì)數(shù)外,該方法還適用于小麥、玉米、大豆等粒數(shù)計(jì)數(shù),具有很高的使用價(jià)值和重要的推廣意義。

參考文獻(xiàn):

[1]段玲玲,彭望瑗. 水稻栽培技術(shù)300問(wèn)[M]. 北京:中國(guó)農(nóng)業(yè)出版社,1997.

[2]張季,楊亞平. Matlab在醫(yī)學(xué)圖像處理中的應(yīng)用[J]. 醫(yī)學(xué)信息,2008,21(7):1014-1017.

[3]巫伯舜. 快速測(cè)算水稻每穗粒數(shù)[J]. 農(nóng)業(yè)科技通訊,1983(7):12.

[4]單春生. 稱(chēng)重法快速測(cè)算水稻每穗粒數(shù)[J]. 種子世界,1986(2):12.

[5]許桂玲,紀(jì)洪亭,潘劍,等. 水稻考種方法探析[J]. 中國(guó)農(nóng)技推廣,2012,28(6):16-17.

[6]陳銘官. 在水稻考種中穗實(shí)粒數(shù)統(tǒng)計(jì)方法的研究[J]. 福建稻麥科技,2001,1(1):12-13.

摘要:谷粒計(jì)數(shù)是水稻考種的重要組成部分。針對(duì)目前水稻谷粒人工計(jì)數(shù)和光電計(jì)數(shù)方法的不足,探索出1種基于MATLAB圖像處理技術(shù)的谷粒自動(dòng)計(jì)數(shù)方法,其所需材料易得,操作簡(jiǎn)單,利用攝像頭拍照獲取圖像,再應(yīng)用軟件分析處理,可實(shí)現(xiàn)谷粒自動(dòng)計(jì)數(shù)。試驗(yàn)表明,該方法可實(shí)現(xiàn)水稻谷??焖?、準(zhǔn)確地自動(dòng)計(jì)數(shù),不僅大大減輕了操作者勞動(dòng)強(qiáng)度,而且極大地提高了工作效率,是一種高效的水稻粒數(shù)計(jì)數(shù)方法,有很強(qiáng)的實(shí)用性和重要推廣意義。

關(guān)鍵詞:MATLAB;圖像處理;水稻;谷粒;自動(dòng)計(jì)數(shù)

中圖分類(lèi)號(hào): S126文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A文章編號(hào):1002-1302(2014)02-0064-02

收稿日期:2013-06-13

基金項(xiàng)目:貴州省科技廳重大專(zhuān)項(xiàng)(編號(hào):[2012]6005);貴州省畢節(jié)市科技計(jì)劃(編號(hào):[2012]34-3);貴州省畢節(jié)市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所項(xiàng)目(編號(hào):[2012]3)。

作者簡(jiǎn)介:田孟祥(1983—),男,貴州麻江人,碩士,助理研究員,主要從事水稻遺傳育種研究。E-mail: tmengxiang@126.com。

通信作者:余本勛,研究員,主要從事水稻遺傳育種研究。E-mail: bjriceybx@126.com。水稻是我國(guó)最重要的糧食作物之一,分布極廣,南至海南省崖縣,北至黑龍江省漠河縣,東至臺(tái)灣省,西至新疆都有種植[1]。目前已有大量從事水稻育種、栽培研究的人員,這些研究者在每年水稻收獲后都要進(jìn)行大批量的考種,其中谷粒計(jì)數(shù)是考種不可或缺的環(huán)節(jié),是進(jìn)行穗粒數(shù)、千粒重測(cè)定的組成部分。目前谷粒計(jì)數(shù)普遍采用人工計(jì)數(shù)方法或使用半自動(dòng)光電計(jì)數(shù)器,但均存在高成本、低效率等缺點(diǎn)。經(jīng)過(guò)不斷實(shí)踐,筆者探索出1種基于MATLAB圖像處理技術(shù)的快速、高效水稻谷粒自動(dòng)計(jì)數(shù)方法,其所需材料易得,操作簡(jiǎn)單,利用攝像頭拍照獲取圖像,再應(yīng)用軟件進(jìn)行分析處理,可實(shí)現(xiàn)谷粒自動(dòng)計(jì)數(shù),大大減輕了操作者勞動(dòng)強(qiáng)度,極大地提高了工作效率,現(xiàn)對(duì)該方法進(jìn)行詳細(xì)介紹,旨在為水稻谷??挤N研究提供參考。

1材料與方法

1.1材料電腦1臺(tái),可連接電腦并具有拍照功能的攝像頭(500萬(wàn)像素以上)1只,攝像頭支架,LED拷貝臺(tái),水稻谷粒。

1.2方法

1.2.1水稻谷粒自動(dòng)計(jì)數(shù)平臺(tái)搭建MATLAB即矩陣實(shí)驗(yàn)室(Matrix Laboratory),由美國(guó)新墨西哥大學(xué)創(chuàng)建,最初只能進(jìn)行簡(jiǎn)單的矩陣運(yùn)算,經(jīng)過(guò)不斷發(fā)展和完善,現(xiàn)已成為具有超強(qiáng)數(shù)值計(jì)算、圖形圖像處理、仿真處理能力的國(guó)際公認(rèn)優(yōu)秀科技應(yīng)用軟件。MATLAB 具有很強(qiáng)的開(kāi)放性和適應(yīng)性,除主包外,還擁有各種工具箱,如圖像處理工具箱、小波分析工具箱、信號(hào)處理工具箱、神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)工具箱等,極大地方便了不同學(xué)科的研究工作[2]。另外,MATLAB 使用方法較為簡(jiǎn)單,使用用戶非常熟悉的數(shù)學(xué)表達(dá)式來(lái)表達(dá)問(wèn)題和求解,使其越來(lái)越受到國(guó)內(nèi)外科技人員的青睞。本研究基于MATLAB的強(qiáng)大圖像處理功能,利用可拍照攝像頭、電腦、LED拷貝臺(tái)等搭建了水稻谷粒自動(dòng)計(jì)數(shù)平臺(tái),該平臺(tái)各硬件組裝配置如圖1所示。

1.2.2水稻谷粒圖像的采集將平臺(tái)調(diào)試好后,在LED拷貝臺(tái)上放置一定量水稻谷粒,谷粒間不能重疊,并保證谷粒在攝像頭視野范圍之內(nèi),啟動(dòng)攝像頭的拍照功能,對(duì)谷粒拍照獲取圖像,將采集到的圖像保存在MATLAB軟件搜索路徑中,便于圖片的后續(xù)調(diào)用。如圖像位置未在MATLAB軟件搜索路徑范圍內(nèi),可利用addpath函數(shù)將其添加,用save函數(shù)保存。

1.2.3水稻谷粒圖像處理及計(jì)數(shù)利用MATLAB軟件的imread函數(shù)讀入圖像,再根據(jù)試驗(yàn)需要,先后對(duì)圖像進(jìn)行灰度處理、圖像去噪、圖像分割等操作。在圖像處理中,須要進(jìn)行距離變換,取局部極小值,其目的是把每粒谷??s小,使得粘連谷粒分離,確保計(jì)數(shù)的準(zhǔn)確性。最后為連通域計(jì)數(shù),連通域數(shù)量即為水稻谷粒數(shù)目。谷粒圖像處理流程見(jiàn)圖2。

1.2.4MATLAB程序代碼根據(jù)設(shè)定的MATLAB圖像處理步驟,將其編寫(xiě)成MATLAB程序代碼如下。

2結(jié)果與分析

運(yùn)行上述MATLAB圖像處理程序,只需數(shù)秒即可在MATLAB命令窗口顯示水稻谷粒數(shù)。對(duì)數(shù)量約為100、200、300、400粒谷粒進(jìn)行多次測(cè)試,結(jié)果表明,MATLAB軟件能快速、高效、自動(dòng)地統(tǒng)計(jì)出谷粒數(shù),統(tǒng)計(jì)數(shù)目與實(shí)際相符,準(zhǔn)確率高達(dá)100%。本研究也發(fā)現(xiàn),圖像分割為程序最重要的部分,能否正確分割圖像,影響統(tǒng)計(jì)數(shù)量的準(zhǔn)確性,然而準(zhǔn)確的圖像分割需要有良好的圖像質(zhì)量,即背景與目標(biāo)有明顯的色調(diào)區(qū)分,將谷粒置于LED拷貝臺(tái)上可達(dá)到試驗(yàn)?zāi)康?,如沒(méi)有LED拷貝臺(tái),可用白紙?zhí)娲匾獣r(shí)須補(bǔ)充光照以確保背景與目標(biāo)區(qū)分明顯。還須注意的是,在放置谷粒時(shí)谷??烧尺B,但不能重疊,否則會(huì)影響統(tǒng)計(jì)的準(zhǔn)確性。圖3為按照本試驗(yàn)程序?qū)⒃脊攘D像在MATLAB軟件中處理后得到的一些圖像情況,該次水稻谷粒數(shù)為121粒,與實(shí)際數(shù)目相符。

從圖3可見(jiàn),該方法可使粘連谷粒分離(方框區(qū)域),圖3-a、圖3-b、圖3-c中3粒谷粒粘連,到圖3-d中這 3粒谷粒相對(duì)縮小而成功實(shí)現(xiàn)分離,確保了統(tǒng)計(jì)準(zhǔn)確性,從某種角度上說(shuō),也減輕了操作者的勞動(dòng)強(qiáng)度。

利用MATLAB圖像處理技術(shù)進(jìn)行水稻谷粒計(jì)數(shù)既快速,又準(zhǔn)確。值得一提的是,對(duì)于固定平臺(tái),該程序具有相對(duì)的穩(wěn)定性,一次調(diào)試多次使用;當(dāng)平臺(tái)變動(dòng)時(shí),只須對(duì)該程序稍調(diào)整參數(shù)即可。因此對(duì)于固定平臺(tái),可將程序保存為軟件可讀的M格式文件,置于MATLAB軟件的搜索路徑中,每次進(jìn)行谷粒計(jì)數(shù)時(shí),只須在MATLAB軟件的命令窗口中輸入原先保存的M文件名,軟件會(huì)立刻執(zhí)行M文件里的程序,很快完成水稻谷粒計(jì)數(shù),實(shí)現(xiàn)批量水稻谷粒考種。還須注意的是,須將獲取的圖像名稱(chēng)與程序中讀入圖像名稱(chēng)一致,否則程序無(wú)法讀入目標(biāo)圖像,導(dǎo)致程序運(yùn)行失敗。另外,使用連接電腦的攝像頭拍照獲取圖像,縮短了獲取圖像的時(shí)間,拍照后即可進(jìn)行處理,大大提高了考種效率。

3結(jié)論與討論

水稻谷粒計(jì)數(shù)是水稻考種的重要部分,也是耗時(shí)較多的環(huán)節(jié)。如何加快谷粒計(jì)數(shù)進(jìn)度,提高考種效率,成為水稻科技工作者普遍關(guān)注的問(wèn)題。已報(bào)道的水稻考種谷粒計(jì)數(shù)方法,有巫伯舜的穗枝梗法[3],單春生[4]、許桂玲等[5]的稱(chēng)重法,陳銘官的大小穗平均法[6]等。但是,筆者發(fā)現(xiàn)這些方法存在工序復(fù)雜、準(zhǔn)確度不高等問(wèn)題,實(shí)用性有限。通過(guò)探索實(shí)踐,本研究探索出基于MATLAB圖像處理技術(shù)的水稻谷粒自動(dòng)計(jì)

數(shù)方法,該方法以MATLAB軟件為基礎(chǔ),利用攝像頭連接電腦搭建獲取圖像平臺(tái),快速獲取圖像,調(diào)用軟件或工具箱函數(shù)并進(jìn)行適當(dāng)修正組成圖像處理程序,程序開(kāi)發(fā)簡(jiǎn)單且具有相對(duì)的固定性,一次成型多次受益,方便、實(shí)用,只須放置稻谷,拍照并運(yùn)行程序就可完成計(jì)數(shù)工作。

利用該MATLAB圖像處理程序處理水稻谷粒圖像,不管是單?;蛘尺B谷粒,均能進(jìn)行準(zhǔn)確、自動(dòng)計(jì)數(shù),準(zhǔn)確率高達(dá)100%。該方法大大減輕了考種勞動(dòng)強(qiáng)度,也彌補(bǔ)了人的精神及視覺(jué)容易疲勞等的不足,極大地提高了考種效率。除水稻谷粒計(jì)數(shù)外,該方法還適用于小麥、玉米、大豆等粒數(shù)計(jì)數(shù),具有很高的使用價(jià)值和重要的推廣意義。

參考文獻(xiàn):

[1]段玲玲,彭望瑗. 水稻栽培技術(shù)300問(wèn)[M]. 北京:中國(guó)農(nóng)業(yè)出版社,1997.

[2]張季,楊亞平. Matlab在醫(yī)學(xué)圖像處理中的應(yīng)用[J]. 醫(yī)學(xué)信息,2008,21(7):1014-1017.

[3]巫伯舜. 快速測(cè)算水稻每穗粒數(shù)[J]. 農(nóng)業(yè)科技通訊,1983(7):12.

[4]單春生. 稱(chēng)重法快速測(cè)算水稻每穗粒數(shù)[J]. 種子世界,1986(2):12.

[5]許桂玲,紀(jì)洪亭,潘劍,等. 水稻考種方法探析[J]. 中國(guó)農(nóng)技推廣,2012,28(6):16-17.

[6]陳銘官. 在水稻考種中穗實(shí)粒數(shù)統(tǒng)計(jì)方法的研究[J]. 福建稻麥科技,2001,1(1):12-13.

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