梁愛鳳,費 櫻
(1.復(fù)旦大學附屬中山醫(yī)院青浦分院檢驗科,上海 201700;2.貴陽醫(yī)學院附屬醫(yī)院微生物免疫科,貴州 貴陽 550004)
貴州省漢族人群類風濕關(guān)節(jié)炎患者TRAF1/C5基因多態(tài)性研究*
梁愛鳳1,費 櫻2△
(1.復(fù)旦大學附屬中山醫(yī)院青浦分院檢驗科,上海 201700;2.貴陽醫(yī)學院附屬醫(yī)院微生物免疫科,貴州 貴陽 550004)
目的探討腫瘤壞死因子受體相關(guān)因子1(TRAF1)/補體5(C5)單核苷酸多態(tài)性與類風濕關(guān)節(jié)炎(RA)的相關(guān)性。方法提取300例RA患者(RA組)和300例健康者DNA(對照組),實時熒光定量PCR方法檢測TRAF1/C5基因rs3761847和rs10818488的單核苷酸多態(tài)性。結(jié)果TRAF1/C5存在基因多態(tài)性,但RA組與對照組比較基因多態(tài)性位點的單倍體基因型和等位基因頻率的差異均無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。連鎖不平衡分析發(fā)現(xiàn)rs3761847與rs10818488之間存在強連鎖不平衡。rs3761847位點A等位基因與類風濕因子(RF)陰性(P=0.001,OR=0.57,95%CI:0.41~0.79),抗CCP抗體(抗-CCP)陰性(P=0.001,OR=0.51,95%CI:0.35~0.76)及抗Sa抗體陰性均相關(guān)(P=0.02,OR=0.72,95%CI:0.55~0.94);rs10818488位點G等位基因僅與RF陽性相關(guān)(P=0.01,OR=1.40,95%CI:1.09~1.81)。結(jié)論TRAF1/C5基因多態(tài)性可能與貴州漢族人群RA的遺傳易感性無關(guān)。
腫瘤壞死因子受體相關(guān)因子; 補體; 單核苷酸多態(tài)性; 類風濕關(guān)節(jié)炎
類風濕關(guān)節(jié)炎(RA)是一種系統(tǒng)性自身免疫性疾病,其病因尚不明確,遺傳、環(huán)境和免疫因素共同發(fā)揮作用。RA作為一種多基因遺傳疾病,目前已知的RA易感基因主要有腫瘤壞死因子(TNF)、人類白細胞抗原(HLA)-DR、白細胞介素(IL)及肽?;彼崦搧啺访福?(PADI4)等。已有報道表明位于9號染色體短臂33-34位點的腫瘤壞死因子受體相關(guān)因子(TRAF1)/補體5(C5)基因是RA的易感基因,且與抗環(huán)瓜氨酸肽(CCP)抗體陽性相關(guān)[1],而后者是RA早期診斷、病情評估和療效檢測的有效指標之一。RA的遺傳異質(zhì)性使得不同人種之間的遺傳學研究結(jié)果常不一致。本研究首次以貴州漢族人群為研究對象,通過實時熒光定量PCR(Real-time PCR)方法檢測TRAF1/C5基因多態(tài)性,并探討該基因與RA患者相關(guān)血清學指標之間的關(guān)系,旨在探討該基因與貴州漢族人群RA患者遺傳易感性之間的關(guān)系。
1.1 一般資料 收集2011年10月至2013年1月貴陽醫(yī)學院附屬醫(yī)院腎內(nèi)科門診及病房的300例RA患者全血,均為漢族,其中男性72例、女性228例,平均年齡(50.3±14.6)歲,所有RA病例均符合美國風濕病學會(ACR)和歐洲抗風濕聯(lián)盟(RULAR)2010年聯(lián)合推出的類風濕性關(guān)節(jié)炎診斷標準[2];按照民族、年齡和性別匹配的原則選取健康體檢者300例作為對照組,其中男性66例,女性234例,平均年齡(50.5±14.1)歲,均排除其他自身免疫性疾病及腫瘤等。所有納入對象均為無血緣關(guān)系的個體。
1.2 方法
1.2.1 基因組DNA的提取 酚-氯仿法提取受檢者外周血DNA,檢測純度和濃度后-20℃保存。
1.2.2 Real-time PCR SNP分型 采用Taqman-MGB探針對TRAF1/C5基因rs3761847和rs10818488位點進行基因分型,所用Real-time PCR探針購自ABI公司。在羅氏LightCycler?480Real-time PCR儀上進行反應(yīng)。
1.2.3 血清學指標檢測 檢測RA組類風濕因子(RF)、抗CCP抗體(抗-CCP)和抗Sa抗體(抗-Sa)三項血清學指標,采用RF膠乳凝集法測定試劑盒(購自上海捷門生物技術(shù)合作公司)檢測RF水平,抗環(huán)瓜氨酸肽(CCP)抗體酶聯(lián)免疫檢測試劑盒(購自上海科新生物技術(shù)股份有限公司)檢測抗-CCP水平,抗Sa抗體IgG酶聯(lián)免疫吸附法檢測試劑盒(購自歐蒙醫(yī)學診斷技術(shù)有限公司)檢測抗-Sa水平。
1.3 統(tǒng)計學處理 采用SPSS 13.0統(tǒng)計軟件對結(jié)果進行分析。計算兩組各個基因型及等位基因頻率,并進行Hardy-Weinberg遺傳平衡檢驗,各組基因型及等位基因頻率的比較采用χ2檢驗,P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義,同時計算比值比(OR)和95%置信區(qū)間(95%CI)。用SHEsis在線分析軟件對TRAF1/C5基因rs3761847和rs10818488兩個位點進行連鎖不平衡分析。
2.1 TRAF1/C5基因與RA相關(guān)性分析 在貴州漢族RA患者中,TRAF1/C5基因的兩個單核苷酸多態(tài)性(SNPs)位點均符合Hardy-Weinberg平衡。與對照組比較,RA組兩個SNPs位點基因型頻率分布差異均無統(tǒng)計學意義(P>0.05),見表1。
2.2 連鎖不平衡和單倍體基因型分析 對rs3761847和rs10818488兩個SNPs位點的基因型信息在對照組中進行連鎖不平衡分析,發(fā)現(xiàn)這兩個位點存在高度連鎖不平衡(D′=1.000,r2=0.852),見附圖1(見《國際檢驗醫(yī)學雜志》網(wǎng)站主頁“論文附件”)。理論上這兩個位點共可組成4種單倍體基因型,筆者對其中頻率大于0.03的3種單倍體基因型進行了進一步的分析比較:在對照組和RA組中3種單倍體基因型的分布無統(tǒng)計學差異(P>0.05),見表2。
2.3 TRAF1/C5基因與RF、抗-CCP、抗-Sa水平的相關(guān)性分析 與對照組相比,rs3761847位點A等位基因與RF陰性(P=0.001,OR=0.57,95%CI:0.41~0.79),抗-CCP陰性(P=0.001,OR=0.51,95%CI:0.35~0.76)及抗-Sa陰性相關(guān)(P=0.02,OR=0.72,95%CI:0.55~0.94),rs10818488位點G等位基因僅與RF陽性組相關(guān)(P=0.01,OR=1.40,95% CI:1.09~1.81),見表3、4。
TRAF1介導(dǎo)TNF受體1、2和CD40參與的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑,而TNF是RA發(fā)病機制中的重要細胞因子[3]。TRAF1還與T細胞的活化增殖有關(guān)[4],TRAF1基因敲除的小鼠T細胞過度增殖或受到T細胞受體復(fù)合物刺激時過度增殖以應(yīng)答TNF。TRAF1在這些信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑中起到負調(diào)節(jié)作用以維持炎癥反應(yīng)的環(huán)境[5],從而在RA中發(fā)揮作用。雖然TRAF1在多種受體介導(dǎo)的信號通路中起作用,但TRAF1的分子機制還沒有完全闡明,其在RA中作用有待于進一步研究。補體途徑也參與了RA的發(fā)病,C5裂解成促炎癥反應(yīng)的C5a和C5b,進而啟動攻膜復(fù)合物的形成。RA患者關(guān)節(jié)滑液持續(xù)的炎癥反應(yīng)與高水平的C5a同時存在[6]。小鼠模型研究證實了C5基因是RA的候補基因,同時證明了C5缺陷的小鼠可抵抗炎性關(guān)節(jié)炎,表明了C5基因在炎癥反應(yīng)中的作用[7-8]。因此,C5在RA發(fā)病機制中可能通過上調(diào)RA患者關(guān)節(jié)腔內(nèi)補體活化程度來起作用。
本研究發(fā)現(xiàn)TRAF1/C5的兩個SNPs存在基因多態(tài)性,但RA組與對照組相比差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05),可能與貴州漢族人群RA易感性無關(guān),這一結(jié)果與其他人種研究結(jié)果不盡相同[1,9-10]。這一情況說明了RA的遺傳異質(zhì)性,不同人種之間遺傳學研究結(jié)果常不相同。經(jīng)連鎖不平衡分析發(fā)現(xiàn)TRAF1/C5兩個SNPs位點在對照組人群中呈現(xiàn)高度連鎖不平衡(D′=1.000,r2=0.852),與HapMap發(fā)布的數(shù)據(jù)基本一致(r2=1),但構(gòu)建的單倍體基因型則與RA發(fā)病不相關(guān)(P>0.05)。由于國內(nèi)外大量的病例-對照研究均局限于驗證基因與RA患者的關(guān)聯(lián)性,較少涉及這些多態(tài)性位點的單倍體基因型,因此單倍體基因型與RA的關(guān)系有待于不同種族、大樣本量的研究證實。另外本研究還發(fā)現(xiàn)TRAF1/C5基因rs3761847位點A等位基因與RF陰性、抗-CCP陰性及抗-Sa陰性相關(guān),這表明該位點可能增加自身抗體陰性RA者的易感性;rs10818488位點G等位基因僅與RF陽性相關(guān),表明該位點可能在RF陽性者RA的發(fā)病中起重要作用,但是受到標本量的影響,這些結(jié)果還有待于進一步加大樣本量進行分析,目前的研究結(jié)果也存在爭議[1,9]。
本研究首次以貴州漢族人群為研究對象,結(jié)果顯示TRAF1/C5SNPs基因型或多態(tài)性位點可能與貴州漢族人群RA的發(fā)病無關(guān),可能是由于受到樣本量較小,TRAF1/C5 SNPs單倍體基因型及等位基因與RA患者血清學指標之間的關(guān)系沒有得到很好的證實。
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Association of the TRAF1/C5 gene polymorphism with rheumatoid arthritis in Han population of Guizhou Province*
Liang Aifeng1,F(xiàn)ei Ying2△
(1.Department of Clinical Laboratory,Qingpu Branch of Zhongshan Hospital Affiliated to Fudan University,Shanghai 201700,China;2.Department of Clinical microbiology and Immunology,the Affiliated Hospital of Guiyang Medical College,Guiyang,Guizhou550004,China)
ObjectiveTo explore the association between the tumor necrosis factor receptor-associated factor 1(TRAF1)/complement component 5(C5)single nucleotide polymorphism and rheumatoid arthritis patients.MethodsTwo groups of people were included in the study:300rheumatoid arthritis(RA)patients(RA group)and 300healthy individuals(control group).Real-time PCR was used to test the single nucleotide polymorphisms rs3761847and rs10818488of TRAF1/C5.ResultsThere was no significant difference(P>0.05)of TRAF1/C5rs3761847and rs10818488polymorphism between the two groups.The linkage disequilibrium analysis results showed that there was strong linkage disequilibrium between rs3761847and rs10818488.For the RF,anti-CCP and anti-Sa negative RA patients,the difference in the frequency of A allele of rs3761847between the RA patients and matched controls was statistically significant(P=0.001,OR=0.57,95%CI:0.41-0.79;P=0.001,OR=0.51,95%CI:0.35-0.76;P=0.02,OR=0.72,95%CI:0.55-0.94).Significant difference for the frequency of G allele of rs10818488between RF positive RA patients and control groups was observed(P=0.01,OR=1.40,95%CI:1.09-1.81).ConclusionTRAF1/C5gene polymorphism may not associate with susceptibility of RA patients in Han population in Guizhou.
tumor necrosis factor receptor-associated factor; complement component; single nucleotide polymorphisms;rheumatoid arthritis
10.3969/j.issn.1673-4130.2015.03.010
A
1673-4130(2015)03-0310-03
2014-11-10)
貴陽市科技計劃項目[(2010)筑科農(nóng)合同第1-社-17號]。 作者簡介:梁愛鳳,女,檢驗技師,主要從事分子生物學檢測方面的研究?!?/p>
,Email:645903661@qq.com。