耿雪冉,柳萬石,王賀祥**
(1.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)生物學(xué)院農(nóng)業(yè)生物技術(shù)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京 100193;2.金亨稷師范大學(xué),朝鮮 平壤 999093)
污白干酪菌核糖核酸酶的分離純化和理化性質(zhì)*
耿雪冉1,柳萬石2,王賀祥1**
(1.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)生物學(xué)院農(nóng)業(yè)生物技術(shù)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京 100193;2.金亨稷師范大學(xué),朝鮮 平壤 999093)
采用DEAE-cellulose陰離子交換層析、CM-cellulose陽(yáng)離子交換層析和FPLC-Superdex-75凝膠過濾層析,從污白干酪菌(Tyromyces amygdalinus)干子實(shí)體純化得到一種核糖核酸酶,SDS-PAGE電泳檢測(cè)其為單一蛋白,分子量為25 kDa。最適反應(yīng)條件為60℃,pH4.4。該酶對(duì)幾種寡聚核糖核苷酸的水解活性低于對(duì)t-RNA的水解活性。
污白干酪菌;核糖核酸酶;分離純化;理化性質(zhì)
核糖核酸酶(ribonuclease,RNase),是一類廣泛存在于動(dòng)物、植物以及微生物體內(nèi)的核酸水解酶,其全名為聚核苷-α-寡核苷轉(zhuǎn)移酶。核糖核酸酶的主要生理功能是降解生物體內(nèi)的RNA,控制RNA的種類以及數(shù)量,參與核糖核酸轉(zhuǎn)錄后的剪切、修飾和降解等過程;還與某些植物的自交不親和性、器官發(fā)生、控制腫瘤血管生成[1]、殺滅腫瘤細(xì)胞以及抑制病毒(包括HIV-1)的復(fù)制等有關(guān)[2]。
迄今為止,已經(jīng)從多種大型真菌中分離純化得到的核糖核酸酶有20多種,比如香菇(Lentinus edodes)[3]、刺芹側(cè)耳 (Pleurotus eryngii)[4]、鳳尾菇(Pleurotus sajor-caju)[5]等。這些大型真菌來源的核糖核酸酶的分子量、理化性質(zhì)以及氨基酸序列都存在較大差異,生物學(xué)功能也各不相同。
污白干酪菌(Tyromyces amygdalinus)隸屬于擔(dān)子菌門(Basidiomycota) 層菌綱(Hymenomycetes)非褶菌目(Polyporales)多孔菌科(Polyporaceae)干酪菌屬(Tyromyces)。污白干酪菌分布于河北、安徽、浙江、湖南、海南、四川、貴州、云南、福建等地,夏秋季生樹木上,可導(dǎo)致木材腐朽。目前對(duì)該菌的研究較少,尤其是生理活性物質(zhì)的研究更少。本文從污白干酪菌的子實(shí)體中分離純化出一種核糖核酸酶,并對(duì)其部分性質(zhì)進(jìn)行研究,擬為污白干酪菌核糖核酸酶進(jìn)一步的研究應(yīng)用提供參考。
1.1 試驗(yàn)材料
污白干酪菌干子實(shí)體。
1.2 試驗(yàn)方法
1.2.1 核糖核酸酶活性測(cè)定方法
將5 μL酶液加到135 μL,0.1 mol·L-1pH4.4 NaAc-HAc緩沖液中,然后加入10 μL底物tRNA(10 mg·mL-1);空白對(duì)照以5 μL去離子水代替酶樣品,其他同樣品管。將其充分混勻后,37℃水浴反應(yīng)15 min,迅速加入350 μL 3.8%高氯酸終止反應(yīng),12 000 r·min-1離心5 min后取上清于260 nm處測(cè)定吸光度。
酶活性定義:以260 nm處每分鐘、每毫升反應(yīng)液產(chǎn)生1個(gè)吸光值所需要的酶量作為一個(gè)酶活力單位。
1.2.2 核糖核酸酶粗樣品的制備
稱量污白干酪菌干子實(shí)體10 g,加入200 mL的去離子水組織勻漿破碎,4℃抽提過夜。勻漿液9 000 r·min-1離心10 min,取上清液,得到粗樣品。
1.2.3 DEAE-cellulose陰離子交換層析
粗提取物通過DEAE-cellulose陰離子交換層析,層析柱預(yù)先用10 mmol·L-1Tris-HCl(pH 8.4) 緩沖液平衡,上樣后以同一緩沖液將不吸附的組分洗脫,再分別用含150 mmol·L-1NaCl、500 mmol·L-1NaCl和1 mol·L-1NaCl的緩沖液進(jìn)行分段洗脫,得到活性組分。
1.2.4 CM-cellulose陽(yáng)離子交換層析
將DEAE-cellulose陰離子交換層析所得活性組分充分透析后,通過預(yù)先用10 mmol·L-1pH 4.4 NaAc-HAc-緩沖液平衡好的CM-cellulose陽(yáng)離子交換層析柱,上樣之后以同一緩沖液將不吸附的組分洗脫下來,再分別用含150 mmol·L-1NaCl、300 mmol·L-1NaCl和1 mol·L-1NaCl的緩沖液進(jìn)行分段洗脫,得到活性組分。
1.2.5 FPLC-Superdex-75HR 10/300凝膠過濾層析
將CM-cellulose陽(yáng)離子交換層析所得活性組分充分透析,冷凍干燥,進(jìn)行FPLC-Superdex-75凝膠過濾層析,層析柱預(yù)先用150 mmol NH4HCO3(pH 8.4)緩沖液平衡,即得到活性組分。
1.2.6 SDS-PAGE電泳檢測(cè)
純化所得的核糖核酸酶通過SDS-PAGE檢驗(yàn)純度及分子量。取20 μL核糖核酸酶樣品,加入5 μL上樣緩沖液,混合后煮沸5 min,12 000 r·min-1離心1 min,取上清,加樣,電泳檢測(cè)。電泳條件:濃縮膠(5%)和分離膠(15%)采用恒壓180 V。電泳完畢后,加入考馬斯亮藍(lán)G-250染色1 h~2 h,脫色液脫色至本底無色,對(duì)比標(biāo)準(zhǔn)蛋白分子量并且結(jié)合FPLC結(jié)果計(jì)算分離得到的核糖核酸酶分子量。
1.2.7 RNase氨基酸序列的質(zhì)譜分析
RNase氨基酸序列的質(zhì)譜分析由廣州輝駿生物科技公司完成,所用儀器為納升級(jí)高效液相色譜儀-線性離子肼-靜電場(chǎng)軌道肼質(zhì)譜聯(lián)用儀(nano-flow HPLC-LTQ-Orbitrap mass spectrometer)。
1.2.8 RNase的理化性質(zhì)
最適反應(yīng)pH:配制0.1 mol·L-1不同pH的緩沖液,將純化所得的RNase加入到上述緩沖液中,按照標(biāo)準(zhǔn)方法測(cè)定酶活力,活力最高值為100%,以相對(duì)活力為縱坐標(biāo),相應(yīng)的pH值為橫坐標(biāo)作圖。
最適反應(yīng)溫度:將純化所得的RNase在最適pH條件下,分別在4℃、15℃、20℃、30℃、40℃、50℃、60℃、70℃、80℃、90℃的溫度下反應(yīng)15 min,按照標(biāo)準(zhǔn)方法測(cè)定酶活力,活力最高值為100%,以相對(duì)活力為縱坐標(biāo),相應(yīng)的溫度值為橫坐標(biāo)作圖。
熱穩(wěn)定性:將純化所得的RNase在不同溫度條件下作用1 h后,按照標(biāo)準(zhǔn)方法測(cè)定酶活力,未孵育的初始活力值為100%,以相對(duì)活力為縱坐標(biāo),相應(yīng)的溫度值為橫坐標(biāo)作圖。
RNase對(duì)寡聚核糖核苷酸的水解作用:以10 mg·mL-1的poly(A)和poly(C)為反應(yīng)底物,將5 μL的酶樣品加入到 135 μL,0.1 mol·L-1pH4.4 NaAc-HAc緩沖液中,然后加入10 μL底物;空白對(duì)照以5 μL去離子水代替酶樣品,其余都相同。充分混勻后,置于37℃水浴反應(yīng)15 min,迅速加入350 μL 3.8%高氯酸終止反應(yīng),12 000 r·min-1離心5 min,poly(A)上清在260 nm處測(cè)定吸光值,poly(C)上清在280 nm處測(cè)定吸光值。
2.1 污白干酪菌RNase的分離純化結(jié)果
污白干酪菌RNase洗脫曲線見圖1。
圖1 RNase在DEAE-cellulose和CM-cellulose的洗脫曲線Fig.1 Elution profiles of RNase on DEAE-cellulose column and CM-celllulose column
污白干酪菌子實(shí)體經(jīng)過組織勻漿、抽提后得到的粗樣品通過DEAE-cellulose陰離子交換層析分段洗脫,其洗脫曲線如圖1a所示,得到了4個(gè)組分的洗脫峰D1、D2、D3和D4。經(jīng)過測(cè)定各洗脫峰的RNase酶活性,發(fā)現(xiàn)酶活性主要集中在D3組分。收集D3組分,充分透析,通過CM-cellulose陽(yáng)離子交換層析,得到了4個(gè)峰,洗脫曲線如圖1b所示。通過檢測(cè)RNase活性,發(fā)現(xiàn)RNase活性集中在C2組分。污白干酪菌RNase在Superdex 75的洗脫曲線及SDS-PAGE電泳圖見圖2。
圖2 RNase在Superdex-75洗脫曲線及SDS-PAGE電泳圖Fig.2 FPLC-gel filtration of RNase on Superdex-75 HR 10/300column and SDS-PAGE of fraction SU1
收集C2組分,透析凍干后,進(jìn)行FPLC-Su perdex-75 HR10/300凝膠過濾層析,其洗脫曲線見圖2a,得到2個(gè)洗脫峰SU1和SU2,活性主要集中在SU1。SU1峰呈現(xiàn)的是一個(gè)單一且對(duì)稱的峰,所以初步判斷得到的核糖核酸酶是單一組分。收集SU1活性峰的組分,凍干后電泳檢查純度。污白干酪菌RNase的分子量是25 kDa。
2.2SDS-PAGE電泳檢測(cè)結(jié)果
SU1組分電泳結(jié)果為一條帶(圖2b),結(jié)合在Superdex-75 HR10/300凝膠過濾的結(jié)果,該酶的分子量為25 kDa。
2.3 污白干酪菌RNase的質(zhì)譜結(jié)果分析
通過質(zhì)譜分析,得到的短肽序列用Mascot匹配NCBInr數(shù)據(jù)庫(kù),污白干酪菌RNase蛋白條帶匹配上8個(gè)肽段,分別為:LAAELALR、EVTEISEMDIK、LEINNDKK、SFSQMALLLATWKPMR、QEEVSIPK、NFRNNIDNQLNQGMR、MTYEIGDRLK、NNKDFVCVLMSEIFPSR。
2.4 污白干酪菌RNase的理化性質(zhì)
污白干酪菌RNase的最適pH、溫度,以及在不同pH緩沖液和不同溫度中測(cè)定的酶活性見圖3。
從圖3可以看出,該酶的最適pH及溫度分別為pH 4.4和60℃(圖3a)。pH大于6.0,酶的活性非常低,僅為最高活性的20%及以下,然而在pH 3.0到pH 5.0范圍內(nèi)活性比較高,由此可見該酶是一種酸性核糖核酸酶(acid RNase,ACR)。從溫度對(duì)污白干酪菌RNase活性的影響來看(圖3b),與其他大部分已純化出的核糖核酸酶差不多,在溫度50℃~60℃范圍內(nèi)活性非常高,最適溫度為60℃。溫度高于70℃酶迅速失活。污白干酪菌RNase在不同溫度條件下處理1 h后,酶活性如圖3c所示。溫度低于60℃,酶的活性比較穩(wěn)定,在60℃處理1 h后仍保持有80%的酶活性時(shí),但溫度高于60℃時(shí),酶迅速失活。
圖3 污白干酪菌RNase的理化性質(zhì)Fig.3 Characteristics of Tyromyces amygdalinus RNase
RNase對(duì)寡聚核糖核苷酸的水解活性遠(yuǎn)遠(yuǎn)低于對(duì)t-RNA的水解活性,該RNase對(duì)poly(A)、poly(C)均有一定的水解能力,其活性分別為(4.46± 0.4) U·mg-1和(5.33±0.3) U·mg-1,然而對(duì)t-RNA的活性為(40.0±1.9)U·mg-1。
通過各種層析從污白干酪菌中分離純化得到一種核糖核酸酶,其分子量為25 kDa。該酶最適作用溫度和pH分別為60℃和pH 4.4。該酶對(duì)poly(A)和poly(C)均有一定的水解作用。
[1]聶明建,王國(guó)槐.植物核糖核酸酶與轉(zhuǎn)基因工程雄性不育系研究進(jìn)展[J].中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào),2006(3):122-127.
[2]Dewi DL,Ishii H,Haraguchi N,et al.Dicer 1,ribonuclease type III modulates a reprogramming effect in colorectal cancer cells[J].Int J Mol Med,2012,29(6):1060-1064.
[3]Kobayashi H,Itagaki T,Inokuchi N,et al.A new type of RNase T2 ribonuclease in two Basidiomycetes fungi,Lentinus edodes and Irpex lacteus[J].Biosci Biotechnol Biochem,2003, 67(10):2307-2310.
[4]Ng TB,Wang HX.A novel ribonuclease from fruiting bodies of the common edible mushroom Pleurotus eryngii[J].Peptides,2004,25(8):1365-1368.
[5]Ngai PH,Ng TB.A ribonuclease with antimicrobial,antimitogenic and antiproliferative activities from the edible mushroom Pleurotus sajor-caju[J].Peptides,2004,25(1):11-17.
全球食用菌市場(chǎng)將迎來新發(fā)展階段
據(jù)美國(guó)最新報(bào)道稱,由于全球消費(fèi)者對(duì)有機(jī)產(chǎn)品的需求不斷增加,2018年全球食用菌市場(chǎng)將迎來新的發(fā)展階段。全世界的農(nóng)民已經(jīng)開始著手發(fā)展蘑菇種植,并把它作為更有利可圖的產(chǎn)業(yè)之一。
當(dāng)下,一些因素?cái)U(kuò)大了蘑菇市場(chǎng)高收益系統(tǒng)的發(fā)展,增加了需求飽和,提高了客戶對(duì)產(chǎn)品的增值接受度和改變了超市豐富的產(chǎn)品種類。然而,也有一些制約全球蘑菇市場(chǎng)增長(zhǎng)的因素,比如蘑菇食品的短期保質(zhì)期,添加使用不安全的成分或是防腐劑等。
蘑菇是有營(yíng)養(yǎng)的,應(yīng)對(duì)全世界人民進(jìn)行普及。同時(shí),增加蘑菇更深層次的研究、開發(fā)更多趣味活動(dòng),打造更全面的蘑菇創(chuàng)新理念,將進(jìn)一步加速全球蘑菇的市場(chǎng)發(fā)展。
中國(guó)食用菌商務(wù)網(wǎng) 2015.10.30
Purification and Characterization of Ribonuclease from Tyromyces amygdalinus
GENG Xue-ran1,Ryu Mansok2,WANG He-xiang1
(1.State Key Laboratory for Agrobiotechnology and Department of Microbiology,College of Biologial Sciences,China Agricultural University,Beijing 100193,China; 2.Pyongyang KimHyongJik University of Education,Pyongyang 999093,D.P.R.Korea)
A novel ribonuclease (RNase)was purified from dry fruit bodies of Tyromyces amygdalinus using a purification procedure which involved ion exchange chromatography on DEAE-cellulose,CM-cellulose and gel filteration chromatography by FPLC on superdex 75HR 10/300 column.Combine with the result from FPLC and SDS-PAGE,it was estimated that this ribonuclease was a monomeric protein with a molecular weight of 25 kD.The optimum temperature of this RNase is 60℃,and optimum pH of it is 4.4.The activity of this enzyme toward poly A and poly C was lower than that of t-RNA.
Tyromyces amygdalinus;ribonuclease;purification;characterization
S646.9
A
1003-8310(2015)06-0063-04
10.13629/j.cnki.53-1054.2015.06.016
現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(xiàng)基金(CARS-24)。
耿雪冉(1988-),女,在讀博士研究生,主要研究方向?yàn)樗幱门c食用真菌。E-mail:gengxueran2007@163.com
**通信作者:王賀祥(1957-),男,博士,教授,主要從事藥用與食用真菌研究。E-mail:hxwang@cau.edu.cn
2015-09-09