汪 敏,趙 靜,李洪連,谷素靜,馬宗斌,焦 睿
(1.河南農(nóng)業(yè)大學(xué)植物保護(hù)學(xué)院,河南鄭州450002;2.河南農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院,河南鄭州450002;3.河南農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,河南鄭州450002)
棉花黃萎病(Verticillium wilt of cotton)是一種土傳性的維管束真菌病害。該病害不僅造成棉花嚴(yán)重減產(chǎn),而且影響纖維長(zhǎng)度和強(qiáng)度,是制約棉花優(yōu)質(zhì)高產(chǎn)的關(guān)鍵因素[1,2]。中國(guó)引起棉花黃萎病的病原菌主要為大麗輪枝菌(Verticillium dahliae)[3-5],該病菌寄主范圍極為廣泛,可侵染 200 多種植物,而且具有傳播途徑多、防治難度大的特點(diǎn),常常造成嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失[5]。微菌核是大麗輪枝菌的主要存活結(jié)構(gòu)和初侵染源,其形成數(shù)量與存活情況直接影響棉花黃萎病的發(fā)生程度[6,7]。微菌核是由大麗輪枝菌單根或多根菌絲經(jīng)分隔膨大、細(xì)胞壁增厚和多向芽殖形成的多細(xì)胞結(jié)構(gòu),內(nèi)外層細(xì)胞的細(xì)胞壁均較厚,積累有大量的黑色素,能抵抗不良環(huán)境條件,在土壤中可存活10~15 a。在適宜條件下,微菌核受寄主根系分泌物的刺激萌發(fā)后,從植株根部侵入,并在根內(nèi)定殖和擴(kuò)展[7]。有研究表明,大麗輪枝菌的VDH1和VMK1基因與微菌核的形成密切相關(guān)[8-10]。但目前有關(guān)其微菌核形成相關(guān)基因的研究報(bào)道不多,微菌核形的分子機(jī)理尚不清楚。本研究利用農(nóng)桿菌介導(dǎo)轉(zhuǎn)化(Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation,ATMT)獲得大麗輪枝菌T-DNA插入突變體,從中篩選TDNA插入微菌核形成能力喪失(或減弱)的突變體,并利用高效 TAIL-PCR方法擴(kuò)增其側(cè)端序列,以期為大麗輪枝菌微菌核形成的相關(guān)基因克隆與分子機(jī)理研究等奠定基礎(chǔ)。
1.1.1 菌株及棉花品種 用于農(nóng)桿菌介導(dǎo)轉(zhuǎn)化的大麗輪枝菌菌株為落葉型強(qiáng)致病力菌株FGH2,由河南農(nóng)業(yè)大學(xué)植物病理實(shí)驗(yàn)室分離并保存[11]。大腸桿菌DH5α、農(nóng)桿菌介導(dǎo)轉(zhuǎn)化載體pATMT1(由pCAMBIA 1300改造而成)、農(nóng)桿菌菌株 AGL-1均由河南農(nóng)業(yè)大學(xué)植物病理實(shí)驗(yàn)室保存。大麗輪枝菌致病力測(cè)定所用的棉花品種為感黃萎病品種銀山1號(hào)。
1.1.2 主要試劑和儀器 Ex Taq酶、dNTP和限制性內(nèi)切酶、pMD19-T Vector、DNA Marker購(gòu)自寶生物工程(大連)有限公司,乙酰丁香酮、卡那霉素(Kan)購(gòu)自美國(guó)Sigma公司,潮霉素B購(gòu)自德國(guó)Roche公司。
1.2.1 大麗輪枝菌T-DNA插入突變體庫(kù)的構(gòu)建利用農(nóng)桿菌介導(dǎo)轉(zhuǎn)化構(gòu)建大麗輪枝菌T-DNA插入突變體庫(kù),參照 MULLINS等[12]的方法,并略有改進(jìn)[11,13]。采用凍融法將構(gòu)建的載體 pATMT1轉(zhuǎn)化到農(nóng)桿菌AGL-1中,將誘導(dǎo)的農(nóng)桿菌菌液與大麗輪枝菌分生孢子懸浮液涂在濾膜上共培養(yǎng),5~7 d后挑取陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子轉(zhuǎn)接至含有潮霉素的PDA平板上,進(jìn)行2次篩選,對(duì)陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子單孢分離并保存,獲得大麗輪枝菌T-DNA插入突變體庫(kù)。
1.2.2 大麗輪枝菌微菌核形成缺陷的T-DNA突變體篩選 將待測(cè)的T-DNA插入突變體和野生菌FGH2分別接種于PDA培養(yǎng)基平板上,暗培養(yǎng)10 d后,用直徑0.7 cm的打孔器在菌落的邊緣處選取菌餅,置于PDA平板中心,每皿1塊,暗培養(yǎng)15 d后對(duì)其進(jìn)行菌落形態(tài)的觀察和分類。
根據(jù)突變體的菌落形態(tài)和黑色微菌核的有無(wú)將其分為菌核型、菌絲型和中間型3種類型[14]。分類標(biāo)準(zhǔn)如下:菌落表面為白色氣生菌絲團(tuán)、基質(zhì)內(nèi)布滿黑色微菌核的為菌核型;菌落上氣生菌絲少、產(chǎn)生少量黑色微菌核的為中間型;菌落上氣生菌絲發(fā)達(dá)、白色、絨毛狀,培養(yǎng)15 d后仍未產(chǎn)生黑色微菌核的為菌絲型。
1.2.3 大麗輪枝菌T-DNA插入突變體的致病力測(cè)定 大麗輪枝菌T-DNA插入突變體的致病力測(cè)定采用分生孢子浸根移栽法[11]。將供試的銀山1號(hào)棉種脫絨催芽,在溫室中進(jìn)行育苗。收集待測(cè)的大麗輪枝菌T-DNA插入突變體和大麗輪枝菌FGH2分生孢子懸浮液,調(diào)節(jié)其體積分?jǐn)?shù)為1.0×107個(gè)·mL-1。待棉苗長(zhǎng)至 2片真葉時(shí),挑選根系生長(zhǎng)良好的植株進(jìn)行浸根接種后,移栽至裝有無(wú)菌土的紙杯中,25℃下生長(zhǎng)。每個(gè)菌株接種15棵棉苗,3次重復(fù)。30 d左右時(shí)接種30 d后,按照石磊巖等棉花苗期分級(jí)標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行病情調(diào)查[15]。
1.2.4 大麗輪枝菌微菌核形成缺陷的T-DNA插入突變體側(cè)端序列擴(kuò)增 挑選大麗輪枝菌T-DNA插入菌絲型突變體和大麗輪枝菌FGH2于Czapek液體培養(yǎng)基中,150 r·min-1培養(yǎng) 6 d,收集菌絲用于DNA提取。采用CTAB法提取菌株的基因組DNA。采用TAIL-PCR法擴(kuò)增突變體T-DNA插入位點(diǎn)側(cè)端序列,試驗(yàn)參照 LIU等[16]的方法進(jìn)行。所用隨機(jī)引物序列和特異性引物序列見(jiàn)表1。將初始PCR產(chǎn)物稀釋20倍作為第2輪PCR的模板,第2輪PCR產(chǎn)物稀釋10倍作為第3輪PCR的模板。
表1 hiTAIL-PCR擴(kuò)增引物Table 1 Primers list used for hiTAIL-PCR
1.2.5 PCR產(chǎn)物連接、測(cè)序和序列分析 將第3輪PCR產(chǎn)物膠回收后與pMD19-T載體連接,轉(zhuǎn)化到大腸桿菌DH5α感受態(tài)中,挑選陽(yáng)性克隆進(jìn)行測(cè)序。獲得的突變體T-DNA插入位點(diǎn)右側(cè)序列與美國(guó) BROAD 研 究 網(wǎng) 址 (http://www.broad.mit.edu/)公布的大麗輪枝菌VDLs.17和黑白輪枝菌(V.albo-atrum)VaMs.102的基因組序列進(jìn)行比對(duì)分析。
利用農(nóng)桿菌介導(dǎo)構(gòu)建大麗輪枝菌T-DNA插入突變體庫(kù)。將誘導(dǎo)的農(nóng)桿菌菌液與大麗輪枝菌分生孢子懸浮液涂在濾膜上共培養(yǎng)48 h,將濾膜置于含50 mg·L-1潮霉素抗性的PDA培養(yǎng)基生長(zhǎng)上。將選擇培養(yǎng)基上長(zhǎng)出的陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子再轉(zhuǎn)接到含70 mg·L-1潮霉素PDA培養(yǎng)基上進(jìn)行2次篩選。對(duì)陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子進(jìn)行單孢分離和保存,共獲得了270個(gè)大麗輪枝菌T-DNA插入轉(zhuǎn)化子。
將獲得的270個(gè)T-DNA插入突變體和野生型大麗輪枝菌FGH2活化后,接于PDA培養(yǎng)基中,25℃下生長(zhǎng)15 d,測(cè)量菌落直徑并觀察微菌核形成情況。野生型大麗輪枝菌FGH2在PDA培養(yǎng)基上25℃恒溫培養(yǎng)時(shí)產(chǎn)生大量微菌核,氣生菌絲較為發(fā)達(dá)。突變體11-2、26-2、229-2-1、971-1 均為菌絲型,菌落氣生菌絲濃密,且不產(chǎn)生微菌核(圖1)。
圖1 野生型FGH2和突變體在PDA平板上培養(yǎng)15d后菌落形態(tài)(正、反面)Fig.1 The colony morphology of FGH2and mutants grown on PDA plate for 15 days(the front and the back)
對(duì)270個(gè)大麗輪枝菌T-DNA插入突變體和野生型菌株進(jìn)行孢子懸浮液浸根接種,測(cè)定突變體與野生型的致病性差異。結(jié)果表明,大麗輪枝菌FGH2接種感病品種銀山1號(hào)14 d左右葉片開(kāi)始發(fā)病,30 d左右棉苗表現(xiàn)為落葉、死亡,維管束變褐,病情指數(shù)達(dá)95.21。大多數(shù)大麗輪枝菌T-DNA插入突變體的致病力與野生型無(wú)顯著性差異(圖2)。
圖2 大麗輪枝菌突變體接種棉花銀山1號(hào)30 d后發(fā)病情況Fig.2 Pathogenicity assays of V.dahliae FGH2 and four microsclerotia defective mutants on cotton Yinshan 1 post inoculation 30 days
采用高效TAIL-PCR方法對(duì)大麗輪枝菌4個(gè)菌絲型T-DNA插入突變體的插入位點(diǎn)側(cè)端序列進(jìn)行擴(kuò)增,將第二輪和第三輪的擴(kuò)增的PCR產(chǎn)物進(jìn)行凝膠電泳圖譜分析,對(duì)第二、三輪的條帶大小做比較,理論上第三輪的條帶比第二輪小約70 bp,為本研究所需要的特異性條帶,將這4個(gè)突變體的第三輪全部產(chǎn)物進(jìn)行凝膠電泳,進(jìn)行切膠回收,得到突變體 11-2(A)、26-2(B)、229-2-1(C)和 971-1(D)含量較高的4條特異性條帶(圖3),獲得目標(biāo)片段片段大小分別約為 600、350、300、500 bp。
圖3 大麗輪枝菌突變體T-DNA側(cè)翼序列hiTAILPCR第二步和第三步產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳Fig.3 Agarose gel electrophoresis patterns of V.dahliae mutants T-DNA flanking sequence secondary and tertiary hiTAIL-PCR products.
對(duì)目標(biāo)片段回收后與pMD19-T載體連接,轉(zhuǎn)入大腸桿菌克隆,挑選陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子送生物公司進(jìn)行DNA測(cè)序。將獲得的大麗輪枝菌突變體T-DNA側(cè)端序列與已在網(wǎng)上公布的大麗輪枝菌VDLs.17和黑白輪枝菌VaMs.102進(jìn)行比對(duì),獲得突變體T-DNA在大麗輪枝菌基因組插入位點(diǎn)的信息(表2)。突變體229-2-1 T-DNA插入位點(diǎn)位于基因VDAG_08333.1編碼區(qū),突變體11-2T-DNA插入位點(diǎn)位于基因VDAG_07013.1啟動(dòng)子區(qū)969 bp,26-2 T-DNA插入位點(diǎn)位于基因VDAG_02793.1啟動(dòng)子區(qū)716 bp,而突變體971-1 T-DNA插入位點(diǎn)位于 2個(gè)基因 VDAG_05438.1和 VDAG_05439.1 之間。
表2 T-DNA側(cè)翼序列與 VdLs.17基因組序列比對(duì)結(jié)果Table 2 BLAST results of T-DNAflanking sequences hit to VdLs.17 genome
隨著多種植物病原真菌全基因序列的完成,利用農(nóng)桿菌介導(dǎo)轉(zhuǎn)化技術(shù)構(gòu)建覆蓋全基因組的T-DNA插入突變體庫(kù),從全基因組水平研究植物病原真菌重要功能基因,進(jìn)而鑒定關(guān)鍵的致病基因,已成為重要研究方向和研究方法[17-20]。本研究利用ATMT技術(shù)構(gòu)建大麗輪枝菌T-DNA插入突變體庫(kù),獲得了270個(gè)突變體,通過(guò)菌落形態(tài)觀察,篩選出4個(gè)菌絲型突變體,氣生菌絲發(fā)達(dá)、白色絨毛狀,在長(zhǎng)期培養(yǎng)和多代轉(zhuǎn)接后,仍不產(chǎn)生黑色微菌核,并得到了其側(cè)端序列。其中突變體229-2-1 T-DNA插入位點(diǎn)位于基因VDAG_08333.1編碼區(qū),突變體11-2,26-2 T-DNA插入位點(diǎn)分別位于基因VDAG_07013.1和VDAG_02793.1的啟動(dòng)子區(qū),而突變體971-1 T-DNA插入位點(diǎn)位于VDAG_05438.1和VDAG_05439.1 2個(gè)基因之間。推測(cè)這4個(gè)菌絲型突變體的表型變異可能由于T-DNA插入突變引起,為進(jìn)一步研究這些微菌核形成相關(guān)基因奠定了基礎(chǔ)。
大麗輪枝菌產(chǎn)生由黑色素和菌絲細(xì)胞構(gòu)成的微菌核,在遇到不利環(huán)境時(shí)黑色素顆粒可使微菌核進(jìn)入休眠狀態(tài),以抵抗不同的環(huán)境壓力條件,有利于微菌核的長(zhǎng)期存活。已有研究表明,黑色素為稻瘟病菌(Magnaporthe grisea)致病所必需的,稻瘟病菌黑色素形成喪失的突變體不能形成有功能的附著胞,從而喪失對(duì)水稻的致病性[21]。目前尚無(wú)研究表明,黑色素與大麗輪枝菌微菌核的形成與致病性的關(guān)系。本研究獲得的4個(gè)大麗輪枝菌菌絲型突變體,黑色素形成喪失且不產(chǎn)生微菌核,但這4個(gè)菌絲型突變體的致病力與大麗輪枝菌FGH2并無(wú)顯著性差異。由于本研究獲得返微菌核缺失突變體偏少,有必要進(jìn)一步利用已建立的突變體庫(kù),大量篩選微菌核形成能力減弱和喪失的突變體,在獲得其側(cè)端序列后,采用目標(biāo)基因敲除和互補(bǔ)等手段,大規(guī)模鑒定微菌核形成相關(guān)基因。在此基礎(chǔ)上,深入研究大麗輪枝菌微菌核形成的分子機(jī)理,探討菌微菌核形成、黑色素與致病性的關(guān)系等。
[1] ERDOGAN O,SEZENER V,OZBEK N,et al.The effects ofVerticillium wilt(Verticillium dahliae Kleb.)on cotton yield and fiber quality[J].Asian Journal of Plant Sciences,2006,5(5):867 -870.
[2] FRADIN E F,THOMMA B H.Physiology and molecular aspects of Verticillium wilt diseases caused by V.dahliae and V.alboatrum[J].Molecular Plant Pathology,2006,7(2):71 -86.
[3] 汪 敏,焦 睿,邢小萍,等.棉花黃萎病菌致病的分子機(jī)理[J].棉花學(xué)報(bào),2011,23(3):272 -278.
[4] 朱荷琴,馮自力,李志芳,等.分離自棉花的輪枝菌“種”的鑒定[J].中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué),2013,46(10):2032-2040.
[5] 朱荷琴,馮自力,尹志新,等.我國(guó)棉花黃萎病菌致病力分化及ISSR指紋分析[J].植物病理學(xué)報(bào),2012,42(3):225-235.
[6] WILHELM S.Longevity of Verticillium wilt fungus in the laboratory and field[J].Phytopathology,1955,45:180-181.
[7] 李雪鈴,張?zhí)煊?,王立?棉黃萎病菌微菌核研究進(jìn)展[J].植物保護(hù),1997,23(5)35 -37.
[8] RAUYAREE P,OSPINA-GIRALDO M D,KANG S,et al.Mutations in VMK1,a mitogen-activated protein kinase gene,affect microsclerotia formation and pathogenicity in Verticillium dahliae[J].Current genetics,2005,48(2):109 -116.
[9] KLIMES A,DOBINSON K F.A hydrophobin gene,VDH1,is involved in microsclerotial development and spore viability in the plant pathogen Verticillium dahliae[J].Fungal Genetics and Biology,2006,43:283-294.
[10] KLIMES A,AMYOAE S,GRANT S,et al.Microsclerotia development in Verticillium dahliae:regulation and differential expression of the hydrophobin gene VDH1[J].Fungal Genetics Biology,2008,45:1525 -1532.
[11]谷素靜,汪 敏,桑 茜,等.棉花黃萎病菌T-DNA插入突變體庫(kù)的構(gòu)建及致病缺陷突變體篩選[J].河南農(nóng)業(yè)科學(xué),2014,43(1):69 -73,83.
[12] MULLINS E D,CHEN X,ROMAINE P,et al.Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation of Fusarium oxyporum:an efficient tool for insertional mutagenesis and genetransfer[J].Phytopathology,2001,91:173-180.
[13]桑 茜,袁虹霞,王振躍,等.河南省不同地區(qū)棉花黃萎病菌分離物致病性及其毒素致萎活性測(cè)定[J].棉花學(xué)報(bào),2010,22(4):333 -338.
[14]宋曉軒,朱荷琴,郭金城.棉花黃萎病菌(Verticillium dahliae Kleb.)安陽(yáng)菌系致病力分化研究[J].中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué),1997,30(1):13 -18.
[15]石磊巖,王 波,文 學(xué).我國(guó)棉花黃萎病菌類型分化及培養(yǎng)特性研究[J].植物保護(hù)學(xué)報(bào),1993,20(3):247-252.
[16] LIU Y G,CHEN Y L.High-efficiency thermal asymmetric interlaced PCR for amplification of unknown flanking sequences[J].BioTechniques,2007,43(5):649 - 656.
[17] BETTS M F,TUCKER S L,GALADIMA N,et al.Development of a high throughput transformation system for insertional mutagenesis in Magnaporthe oryzae[J].Fungal Genetics and Biology,2007,44(10):1035 -1049.
[18] JEON J,PARK S Y,CHI M H,et al.Genome-wide functional analysis of pathogenicity genes in the rice blast fungus[J].Nature Genetics,2007,39(4):561 -565.
[19]徐榮旗,汪佳妮,陳捷胤,等.棉花黃萎病菌T-DNA插入突變體表型特征和側(cè)翼序列分析[J].中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué),2010,43(3):489 -496.
[20]高峰,彭 姍,彭曉玲,等.棉花黃萎病菌插入突變體庫(kù)的構(gòu)建及致病相關(guān)基因DVK1的克隆與鑒定[J].棉花學(xué)報(bào),2011,23(1):64 -68.
[21] HOWARD R J,VALENT B.Breaking and entering:host penetration by the fungal rice blast pathogen Magnaporthe grisea[J].Annual Review of Microbiology,1996,50:491-512.