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丹參病程相關(guān)蛋白基因PR10的克隆與表達(dá)分析

2015-06-28 13:58馬利剛王志霜鄭曉珂
西北植物學(xué)報(bào) 2015年6期
關(guān)鍵詞:原核丹參克隆

趙 樂,馬利剛,王志霜,申 業(yè),鄭曉珂

(1河南中醫(yī)學(xué)院藥學(xué)院,鄭州450046;2中國中醫(yī)科學(xué)院中藥資源中心,北京100700)

丹參病程相關(guān)蛋白基因PR10的克隆與表達(dá)分析

趙 樂1,馬利剛1,王志霜2,申 業(yè)2,鄭曉珂1

(1河南中醫(yī)學(xué)院藥學(xué)院,鄭州450046;2中國中醫(yī)科學(xué)院中藥資源中心,北京100700)

病程相關(guān)蛋白(PR)的產(chǎn)生與積累是植物體應(yīng)對(duì)生物或非生物脅迫的主要特征之一。該研究以人工培養(yǎng)的丹參幼苗為材料,通過分析丹參轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),根據(jù)丹參病程相關(guān)蛋白基因PR10的序列設(shè)計(jì)特異性引物,采用逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(RT-PCR)從丹參中獲得PR10基因的開放閱讀框(ORF),命名為SmPR10-1(GenBank注冊號(hào)KF877034),并進(jìn)行原核表達(dá)和純化。結(jié)果表明:(1)SmPR10-1基因ORF為477bp,編碼158個(gè)氨基酸,其蛋白質(zhì)分子質(zhì)量為17.38kD。(2)通過蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測、序列多重比對(duì)和構(gòu)建進(jìn)化樹等生物信息學(xué)分析,發(fā)現(xiàn)SmPR10-1基因具有保守序列(G-X-G-G-X-G)和(K-A-X-E-X-Y),其編碼蛋白與葡萄等雙子葉植物中的PR10蛋白同源性較高。(3)經(jīng)異丙基β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)誘導(dǎo),含有表達(dá)載體pET32a-SmPR10-1的大腸桿菌(Escherichia coli BL21)可誘導(dǎo)表達(dá)融合蛋白;對(duì)影響蛋白表達(dá)的4個(gè)因素優(yōu)化結(jié)果表明,SmPR10-1蛋白的最佳表達(dá)條件為:IPTG終濃度0.4mmol/L、起始宿主菌密度A600為0.8、誘導(dǎo)溫度30℃、誘導(dǎo)時(shí)間8h,并得到純化的SmPR10-1蛋白。該結(jié)果為進(jìn)一步研究SmPR10-1基因在丹參抗病方面的生物學(xué)功能和培育丹參抗病品種奠定了基礎(chǔ)。

丹參;病程相關(guān)蛋白;生物信息學(xué)分析;原核表達(dá);條件優(yōu)化

植物在受到真菌、細(xì)菌和病毒等病原微生物侵染或受到非生物脅迫時(shí)會(huì)誘導(dǎo)表達(dá)并積累病程相關(guān)(pathogenesis-related,PR)蛋白,這類蛋白是植物防御體系的重要組成部分[1]。PR蛋白為多基因編碼,根據(jù)氨基酸序列的相似程度、血清學(xué)關(guān)系和生物學(xué)活性,目前分為17類[2]。它們在不同的植物中表現(xiàn)為幾丁質(zhì)酶、葡聚糖苷酶、蛋白酶抑制劑、內(nèi)肽酶和過氧化物酶等,在植物自我防御機(jī)制中作為可被誘導(dǎo)的組分發(fā)揮作用。

隨著對(duì)PR蛋白研究的深入,發(fā)現(xiàn)PR蛋白不僅在被侵染組織中誘導(dǎo)表達(dá),而在整個(gè)植株中都有表達(dá),與系統(tǒng)獲得性抗性(systematic acquired resistance,SAR)有關(guān),被認(rèn)為是SAR的一個(gè)顯著標(biāo)志。PR10類蛋白屬于類核糖核酸酶,可以降解RNA,有抗細(xì)菌和抗真菌的活性[3],有關(guān)病毒[4-5]、細(xì)菌[6]、真菌[7-9]等病原菌誘導(dǎo)PR10蛋白表達(dá)的研究已有廣泛報(bào)道,作為植物防御系統(tǒng)中的可誘導(dǎo)表達(dá)組分,PR10蛋白受多種病原菌的誘導(dǎo)表達(dá),同時(shí)PR10蛋白在不同組織、器官及發(fā)育時(shí)期都有表達(dá),屬于組成型表達(dá)。植物激素和防御相關(guān)的信號(hào)分子,包括茉莉酸[10]、脫落酸[11]、水楊酸[12]、赤霉素、茉莉酸甲酯、乙烯也能夠調(diào)節(jié)PR10蛋白的表達(dá)。

丹參(Salvia miltiorrhiza Bunge)為唇形科鼠尾草屬多年生草本植物,以其干燥根及根莖入藥,在臨床上被廣泛應(yīng)用于心腦血管疾病以及各種炎癥的治療,是重要的大宗藥材,也是栽培面積較大的藥材之一。在人工栽培條件下,由于藥田生態(tài)環(huán)境中生物群落多樣性差、豐富度低,病蟲害優(yōu)勢種群突出,常常發(fā)生嚴(yán)重的病蟲害,導(dǎo)致藥材產(chǎn)量下降,品質(zhì)變劣,降低丹參藥用品質(zhì),影響臨床藥效。近年來,有關(guān)丹參的研究多集中在二萜類化合物丹參酮合成途徑關(guān)鍵基因的克隆上[13-14],而對(duì)于丹參抗病基因的研究則少有報(bào)道。

在對(duì)課題組前期得到的大量丹參轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的分析中,發(fā)現(xiàn)多個(gè)植物病程相關(guān)基因,本研究采用逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(RT-PCR)從丹參中得到了植物病程相關(guān)蛋白基因PR10的cDNA全長,將其構(gòu)建得到含有SmPR10-1的重組質(zhì)粒pET32a-SmPR10-1,導(dǎo)入大腸桿菌BL21(DE3)中,進(jìn)行體外誘導(dǎo)表達(dá),并對(duì)IPTG濃度、誘導(dǎo)時(shí)間、溫度等培養(yǎng)條件進(jìn)行優(yōu)化,篩選SmPR10-1蛋白的最適表達(dá)條件,為進(jìn)一步研究SmPR10-1基因在丹參抗病中的生物學(xué)功能奠定基礎(chǔ)。

1 材料和方法

1.1 試驗(yàn)材料

丹參(Salvia miltiorrhiza Bunge)種子采自陜西商洛,種植于人工氣候箱內(nèi),光照強(qiáng)度為3 000 lx,光周期為光照16h/黑暗8h,溫度25℃。種子萌發(fā),長出4片真葉后,移至培養(yǎng)罐中,每個(gè)培養(yǎng)罐4顆幼苗,每隔3d換1次Hoagland營養(yǎng)液,培養(yǎng)60d的丹參幼苗做為實(shí)驗(yàn)材料,取根、莖、葉,樣品采集后液氮冷凍,保存于-80℃冰箱中。表達(dá)宿主菌E.coli BL21(DE3)及原核表達(dá)載體pET-32a(+)為本實(shí)驗(yàn)室保存。

1.2 方 法

1.2.1 SmPR10-1基因克隆與序列分析 采用Trizol法從丹參根中提取總RNA,用NanoDrop 2000進(jìn)行含量測定,用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測RNA完整性。以提取的RNA為模板,以oligo(dT)18primer為反轉(zhuǎn)錄引物,按照RevertAid H Minus Reverse Transcriptase試劑盒(Fermentas公司)說明合成cDNA。根據(jù)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中PR10基因的序列信息,利用Primer 5設(shè)計(jì)PR10基因編碼區(qū)的特異引物,正向引物SmPR-10-M1(5′-CGGAATTCATGGGTGTGATCA-3′,下劃線部分為EcoRⅠ酶切位點(diǎn));反向引物SmPR-10-M2(5′-CCGCTCGAGTGTAGTCGGGGTT-3′,下劃線部分為XhoⅠ酶切位點(diǎn)),以反轉(zhuǎn)錄得到的丹參cDNA為模板,擴(kuò)增SmPR10-1基因的ORF,用1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測PCR產(chǎn)物,用瓊脂糖凝膠回收試劑盒(天根公司)回收目的片段,將回收的PCR產(chǎn)物與pGEM-T Easy vector連接,轉(zhuǎn)化DH5α菌株,在含有氨芐青霉素的LB平板上進(jìn)行培養(yǎng),挑取單克隆,經(jīng)菌液PCR和電泳檢測后,挑選陽性克隆送北京華大基因公司測序,將測序結(jié)果與轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中的PR10基因序列進(jìn)行比對(duì),保存序列一致的陽性克隆,準(zhǔn)備構(gòu)建原核表達(dá)載體。

通過ExPASy在線服務(wù)器的Compute pI/Mw(http://web.expasy.org/compute_pi/)預(yù)測SmPR10-1基因編碼蛋白質(zhì)的相對(duì)分子量與理論等電點(diǎn),TargetP 1.1server(http://www.cbs.dtu.dk/services/TargetP/)預(yù)測該蛋白的亞細(xì)胞定位,SignalP 4.1server(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/)進(jìn)行信號(hào)肽分析,TMHMM server v.2.0(http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/)進(jìn)行跨膜域分析,PredictProtein server(http://www.predictprotein.org/)進(jìn)行二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測,SWISSMODEL(http://swissmodel.expasy.org/)進(jìn)行三維同源建模。用DNAMAN軟件對(duì)序列進(jìn)行多重比對(duì),用Clustal W軟件與其他植物PR10蛋白的氨基酸序列進(jìn)行比較,采用MEGA4軟件的相鄰連接法(neighbor-joining)構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,bootstrap重復(fù)次數(shù)為1 000次。

1.2.2 SmPR10-1原核表達(dá)載體的構(gòu)建與鑒定

用限制性內(nèi)切酶EcoRⅠ和XhoⅠ分別對(duì)原核表達(dá)載體pET-32a(+)和測序正確的pGEM-T Easy-SmPR10-1質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切,瓊脂糖凝膠電泳檢測并切膠回收載體片段和目的基因片段,T4DNA連接酶16℃連接過夜。連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化E.coli BL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞,在含有氨芐青霉素的LB平板上培養(yǎng)過夜,挑取單克隆,經(jīng)菌液PCR和雙酶切鑒定,挑選陽性克隆送北京華大基因公司測序。

1.2.3 SmPR10-1的誘導(dǎo)表達(dá) 挑取測序正確的陽性克隆,接種于含氨芐青霉素的LB液體培養(yǎng)基中,37℃培養(yǎng)過夜后,按照1∶100比例稀釋到含氨芐青霉素的LB液體培養(yǎng)基中,220r/min振蕩培養(yǎng)至對(duì)數(shù)生長期(A600為0.6),然后針對(duì)誘導(dǎo)溫度(15、20、25、30、37℃)、誘導(dǎo)時(shí)間(4、6、8、20h)、IPTG濃度(0.1、0.4、0.8、1.0mmol/L),及A600(即誘導(dǎo)起始宿主菌密度0.4、0.6、0.8、1.0)這4個(gè)影響原核表達(dá)產(chǎn)物積累的因素,當(dāng)研究其中1種因素時(shí),固定其他3個(gè)因素不變,分別分析了這4個(gè)因素對(duì)丹參SmPR10-1重組蛋白表達(dá)的影響。

1.2.4 重組SmPR10-1蛋白的純化 根據(jù)優(yōu)化的誘導(dǎo)表達(dá)條件,在大腸桿菌中大量表達(dá)重組SmPR10-1蛋白,獲得菌體,超聲破碎,破碎液在4℃,12 000r/min離心30min,取上清液經(jīng)0.45μm濾膜過濾,采用Ni2+親和層析方法,利用Ni Sepharose 6Fast Flow Purification System(GE Health-care)樹脂對(duì)濾液進(jìn)行純化,然后用不同濃度的咪唑梯度洗脫,SDS-PAGE電泳檢測洗脫樣品,收集單一目的條帶樣品進(jìn)行透析,透析后樣品經(jīng)超濾管濃縮,用Bradford方法對(duì)蛋白進(jìn)行定量,冷凍干燥,-70℃保存。

2 結(jié)果與分析

2.1 SmPR10-1的基因克隆與序列分析

通過對(duì)課題組前期得到的丹參轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,根據(jù)PR10基因ORF設(shè)計(jì)特異性引物,擴(kuò)增得到500bp左右的條帶(圖1),與轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中PR10基因開放閱讀框(ORF)大小一致,測序結(jié)果表明SmPR10-1基因的OFR為477bp,編碼158個(gè)氨基酸,分子量為17.38kD,等電點(diǎn)pI為5.23。

SignalP 4.1server預(yù)測,SmPR10-1蛋白不含信號(hào)肽,TargetP 1.1server預(yù)測,顯示SmPR10-1蛋白定位于細(xì)胞質(zhì),TMHMM server預(yù)測該蛋白不含跨膜域。用PredictProtein對(duì)SmPR10-1蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測,結(jié)果顯示在該蛋白中α-螺旋結(jié)構(gòu)占21.52%,β-折疊占34.81%,無規(guī)則卷曲占43.67%(圖2,A)。用SWISS-MODEL以櫻桃的allergen Pru av 1蛋白為模板(PDB ID:1e09),預(yù)測SmPR10-1蛋白的三維結(jié)構(gòu)(圖2,B)。結(jié)果顯示SmPR10-1蛋白包含一個(gè)C端由28個(gè)氨基酸組成的α螺旋,7個(gè)β折疊以及N端在β1和β2折疊之間的1個(gè)的短α螺旋。保守的P-loop基序(G-X-GG-X-G)位于β2和β3之間,C端有(K-A-X-E-X-Y)的保守序列(圖2,A)。三級(jí)結(jié)構(gòu)與已經(jīng)報(bào)道的PR10家族蛋白的空間結(jié)構(gòu)具有很高的相似性,β-折疊在α-螺旋間反向平行排列,構(gòu)成緊湊的α-β-α夾心結(jié)構(gòu),具有疏水作用和穩(wěn)定的多重氫鍵,這個(gè)緊湊的結(jié)構(gòu)可能決定了PR蛋白的高穩(wěn)定性。

圖1 PCR擴(kuò)增SmPR10-1基因的開放閱讀框Fig.1 PCR amplification of SmPR10-1 gene open reading frame M.DL2000;1.SmPR10-1ORF

將SmPR 1 0-1與NCBI GenBank中2 0種植物PR10蛋白進(jìn)行比對(duì),采用MEGA4軟件構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,結(jié)果(圖3)顯示,PR10聚為兩類,一類是單子葉植物PR10,另一類是雙子葉植物PR10,SmPR10-1歸屬于雙子葉植物類,與葡萄、人參親緣關(guān)系最近。

2.2 SmPR10-1基因的原核表達(dá)載體構(gòu)建與鑒定

用限制性內(nèi)切酶EcoRⅠ和XhoⅠ分別對(duì)原核表達(dá)載體pET-32a(+)和測序正確的pGEM-T Easy-SmPR10-1質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切,連接得到重組質(zhì)粒pET32a-SmPR10-1,然后轉(zhuǎn)化E.coli BL21(DE3),挑取單克隆進(jìn)行菌液PCR和雙酶切鑒定,都有500bp左右的目的條帶(圖4),陽性克隆測序結(jié)果顯示與目的基因SmPR10-1序列一致,未發(fā)生移碼突變,表明已成功將SmPR10-1基因克隆到原核表達(dá)載體pET-32a上。

2.3 SmPR10-1蛋白的原核表達(dá)條件的優(yōu)化

2.3.1 IPTG濃度對(duì)SmPR10-1表達(dá)的影響 保持誘導(dǎo)時(shí)間8h、誘導(dǎo)溫度30℃及起始A600為0.6不變,在0.1、0.4、0.8、1.0mmol/L這4個(gè)IPTG濃度下,觀察發(fā)現(xiàn)IPTG濃度在0.1~1.0mmol/L對(duì)SmPR10-1表達(dá)量影響不明顯(圖5)。

圖2 SmPR10-1蛋白的結(jié)構(gòu)預(yù)測A.二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測;B.三維結(jié)構(gòu)預(yù)測Fig.2 Prediction of SmPR10-1protein structure A.Secondary structure prediction;B.Prediction of three-dimensional structure

圖3 SmPR10-1蛋白與其他物種PR10蛋白的系統(tǒng)進(jìn)化樹分析Fig.3 Phylogenetic tree of SmPR10-1protein and PR10proteins from other species

圖4 原核表達(dá)載體pET32a-SmPR10-1鑒定M.DL10000;1.EcoRⅠ和XhoⅠ雙酶切pET32a-SmPR10-1載體;2.陽性克隆的PCR產(chǎn)物Fig.4 The identification of prokaryotic expression vector pET32a-SmPR10-1 M.DL10000;1.pET32a-SmPR10-1digested by EcoRⅠand XhoⅠ;2.PCR product of positive clone

2.3.2 誘導(dǎo)溫度對(duì)SmPR10-1表達(dá)的影響 保持誘導(dǎo)時(shí)間8h、IPTG濃度0.4mmol/L及起始A600為0.6不變,不同誘導(dǎo)溫度(15℃、20℃、25℃、30℃、37℃)下,發(fā)現(xiàn)溫度對(duì)SmPR10-1表達(dá)影響明顯,20~30℃誘導(dǎo)均有利于可溶性蛋白的表達(dá),而15℃和37℃時(shí)蛋白表達(dá)量減少(圖6)。

2.3.3 A600對(duì)SmPR10-1表達(dá)的影響 保持誘導(dǎo)時(shí)間8h、誘導(dǎo)溫度30℃及IPTG濃度0.4mmol/L不變,觀察到在不同起始菌密度(A600為0.4、0.6、0.8、1.0)時(shí)加入誘導(dǎo)劑IPTG對(duì)SmPR10-1表達(dá)有影響,發(fā)現(xiàn)起始宿主菌密度(A600=0.8)時(shí),SmPR10-1表達(dá)量最高(圖7)。

2.3.4 誘導(dǎo)時(shí)間對(duì)SmPR10-1表達(dá)的影響 保持誘導(dǎo)溫度30℃、IPTG濃度0.4mmol/L及起始A6000.8不變,研究誘導(dǎo)時(shí)間(4、6、8、20h)對(duì)SmPR10-1表達(dá)的影響,觀察到誘導(dǎo)時(shí)間對(duì)蛋白表達(dá)量有明顯影響,隨著誘導(dǎo)時(shí)間的延長,蛋白表達(dá)量有隨之增加的趨勢(圖8)。

圖5 不同IPTG濃度對(duì)SmPR10-1蛋白表達(dá)的影響M.蛋白分子量標(biāo)準(zhǔn);C1~C4.含pET32a空載體的E.coli菌株;1~4.分別在0.1、0.4、0.8、1.0mmol/L IPTG濃度誘導(dǎo)的含pET32a-SmPR10-1質(zhì)粒的E.coli菌株。箭頭顯示為重組SmPR10-1蛋白Fig.5 Effect of different IPTG concentrations on the expression of SmPR10-1protein M.Protein marker;C1-C4.E.coli containing pET32aused as contro;1-4.E.coli contains pET32a-SmPR10-1induced with 0.1,0.4,0.8and 1.0mmol/L IPTG,respectively.The arrows show the recombinant SmPR10-1protein

圖6 不同誘導(dǎo)溫度對(duì)SmPR10-1蛋白表達(dá)的影響M.蛋白分子量標(biāo)準(zhǔn);C.含pET32a空載體的E.coli菌株;1~5.分別在15℃,20℃,25℃,30℃,37℃誘導(dǎo)的含pET32a-SmPR10-1質(zhì)粒的E.coli菌株。箭頭顯示為重組SmPR10-1蛋白Fig.6 Effect of different temperature on the expression of SmPR10-1protein M.Protein marker;C.E.coli containing pET32aused as contro;1-4.E.coli contains pET32a-SmPR10-1induced at 15℃,20℃,25℃,30℃,37℃,respectively.The arrows show the recombinant SmPR10-1protein

圖7 不同起始宿主菌密度(A600)對(duì)SmPR10-1蛋白表達(dá)的影響M.蛋白分子量標(biāo)準(zhǔn);C1~C4:含pET32a空載體的E.coli菌株;1~4.分別在A600為0.4、0.6、0.8、1.0條件下誘導(dǎo)的含pET32a-SmPR10-1質(zhì)粒的E.coli菌株。箭頭顯示為重組SmPR10-1蛋白Fig.7 Effect of different initial density of host bacterium(A600)on the expression of SmPR10-1protein M.Protein marker;C1-C4.E.coli contains pET32aused as contro;1-4.E.coli containg pET32a-SmPR10-1induced at 0.4,0.6,0.8and 1.0A600,respectively.The arrowsshow the recombinant SmPR10-1protein

圖8 不同誘導(dǎo)時(shí)間對(duì)SmPR10-1蛋白表達(dá)的影響M.蛋白分子量標(biāo)準(zhǔn);C1~C4.含pET32a空載體的E.coli菌株;1~4.分別誘導(dǎo)4、6、8、20h的含pET32a-SmPR10-1質(zhì)粒的E.coli菌株。箭頭顯示為重組SmPR10-1蛋白Fig.8 Effect of different inducing time on the expression of SmPR10-1protein M.Protein marker;C1-C4.E.coli contains pET32aused as control;1-4.E.coli containg pET32a-SmPR10-1 induced with 4,6,8,20h,respectively.The arrows show the recombinant SmPR10-1protein

2.4 重組SmPR10-1蛋白的純化

根據(jù)優(yōu)化的條件,IPTG濃度0.4mmol/L、起始A600為0.8、誘導(dǎo)溫度30℃、誘導(dǎo)時(shí)間8h,將重組SmPR10-1蛋白在大腸桿菌中大量表達(dá),收集大腸桿菌菌體,超聲破碎,破碎液經(jīng)過離心取上清液,采用Ni2+親和層析方法,利用Ni Sepharose 6Fast Flow Purification System(GE Healthcare)樹脂進(jìn)行純化,得到目的蛋白SmPR10-1(圖9),Bradford法測得純化蛋白濃度為1.02mg·mL-1。

圖9 重組SmPR10-1蛋白的純化M.蛋白分子量標(biāo)準(zhǔn);1.含pET32a空載體的E.coli菌株作為對(duì)照;2.優(yōu)化條件下誘導(dǎo)的含pET32a-SmPR10-1質(zhì)粒的E.coli菌株;3、4.純化后的重組SmPR10-1蛋白(3∶2μg上樣;4∶5μg上樣)。箭頭顯示為重組SmPR10-1蛋白Fig.9 Purification of recombinant SmPR10-1protein M.Protein marker;1.E.coli containing pET32aused as control;2.E.coli contains pET32a-SmPR10-1induced under optimized conditions;3,4.The purified recombinant SmPR10-1protein(3∶2μg;4∶5μg).The arrows show the recombinant SmPR10-1protein

3 討 論

丹參為多年生草本植物,以根入藥,在人工栽培條件下,易受到各種病蟲害的危害,若長期大量使用農(nóng)藥,一方面易使病蟲害產(chǎn)生抗藥性,另一方面農(nóng)藥殘留會(huì)降低丹參的藥用品質(zhì),影響丹參臨床藥效。因此從丹參自身挖掘抗性相關(guān)基因,培育抗病品種,才是緩解丹參病蟲害的根本途徑。本研究從丹參中克隆得到病程相關(guān)蛋白10基因SmPR10-1,對(duì)其核酸及其推測的氨基酸序列分析發(fā)現(xiàn),SmPR10-1基因編碼蛋白的N端有典型的富含甘氨酸的P-loop基序(G-X-G-G-X-G),C端有(K-A-X-E-X-Y)的保守序列,說明SmPR10-1蛋白是PR10蛋白家族中的成員(Van Loon[2]、Fernandes[15])。SmPR10-1蛋白不含信號(hào)肽,作為細(xì)胞質(zhì)蛋白發(fā)揮作用,這與其他PR家族蛋白不同,其它PR家族蛋白大多是位于胞外,具有信號(hào)肽序列,先是作為蛋白前體合成,然后在分泌過程中形成成熟蛋白[16]。

大腸桿菌是常用的外源蛋白質(zhì)表達(dá)系統(tǒng)之一,影響外源蛋白可溶性表達(dá)的因素有多方面,要增加可溶性蛋白的表達(dá)量,除了合理的選擇酶切位點(diǎn)、表達(dá)載體、宿主菌、試劑外,還可以通過改變培養(yǎng)條件來提高外源蛋白的可溶性表達(dá)量,如改變IPTG濃度[17]、誘導(dǎo)溫度[18]、誘導(dǎo)時(shí)宿主菌的密度(A600)[19]和誘導(dǎo)時(shí)間[18]等。本研究將目的基因SmPR10-1構(gòu)建到表達(dá)載體pET32a上,形成重組質(zhì)粒pET32a-SmPR10-1,然后轉(zhuǎn)化E.coli BL21(DE3),進(jìn)行蛋白表達(dá)。pET32a載體是帶有N-端硫氧還蛋白(Trx·Tag)編碼序列的融合表達(dá)載體,當(dāng)外源重組蛋白在E.coli中以不溶形式存在時(shí),和Trx· Tag序列融合后,可增加重組蛋白的溶解性[20];此外,表達(dá)宿主菌BL21(DE3)可以增加存在于細(xì)胞質(zhì)中蛋白質(zhì)的二硫鍵的形成,使得蛋白的可溶性更好,同時(shí),利用pET32a載體表達(dá)的重組蛋白N端帶有6個(gè)His Tag標(biāo)簽,方便后續(xù)重組蛋白的純化[18]。

IPTG濃度、溫度、起始菌密度(A600)和誘導(dǎo)時(shí)間是影響原核表達(dá)的主要因素,本研究發(fā)現(xiàn),IPTG濃度在0.1~1.0mmol/L對(duì)SmPR10-1蛋白表達(dá)量影響不明顯,最終選擇IPTG濃度為0.4mmol/L。溫度對(duì)SmPR10-1表達(dá)量有明顯影響,從15~37℃均能得到重組蛋白,但是15℃時(shí)溫度過低,不利于蛋白表達(dá),在30℃時(shí)表達(dá)量最高,雖然在37℃時(shí)也有蛋白表達(dá),但是和30℃條件下相比,表達(dá)量卻有所降低,這可能是37℃條件下大腸桿菌細(xì)胞各種代謝旺盛,生長加快,影響外源重組蛋白的表達(dá),而且有可能使重組蛋白積累形成包涵體,而在25~30℃培養(yǎng)會(huì)形成可溶的、有活性的重組蛋白,最終選擇誘導(dǎo)溫度為30℃[21]。隨著誘導(dǎo)時(shí)間的延長,SmPR10-1的表達(dá)量也隨之增加,4h時(shí)表達(dá)量最低,8h與24h時(shí)表達(dá)量較高,但是誘導(dǎo)時(shí)間過長,重組蛋白的可溶性降低,可能形成包涵體,最終選擇8h作為最終誘導(dǎo)時(shí)間[22]。

本研究用分子克隆方法得到丹參SmPR10-1基因,通過構(gòu)建原核表達(dá)載體,在大腸桿菌中得到成功表達(dá),在優(yōu)化表達(dá)體系為IPTG濃度0.4mmol/L、起始宿主菌密度A600為0.8、誘導(dǎo)溫度30℃、誘導(dǎo)時(shí)間8h的條件下,SmPR10-1在大腸桿菌中能夠得到很好的表達(dá),采用Ni2+親和層析得到了純化的目的蛋白,為進(jìn)一步研究SmPR10-1蛋白的生物學(xué)活性,抗體制備和SmPR10-1基因在丹參抗病方面的生物學(xué)功能奠定了基礎(chǔ)。

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(編輯:宋亞珍)

Cloning and Expression Analysis of Pathogenesis-related Protein 10Gene of Salvia miltiorrhiza

ZHAO Le1,MA Ligang1,WANG Zhishuang2,SHEN Ye2,ZHENG Xiaoke1
(1School of Pharmacy,Henan University of Traditional Chinese Medicine,Zhengzhou 450046,China;2National Resource Center for Chinese Materia Medica,China Academy of Chinese Medical Sciences,Beijing 100700,China)

The synthesis of pathogenesis-related proteins(PR)is one prominent feature of plant defense responses on abiotic or non-abiotic stress situations.According to the transcriptome data of Salvia miltiorrhiza,designing specific primers and using reverse transcription-polymerase chain reaction(RT-PCR),we isolated an open reading frame of pathogenesis-related protein 10(PR10)fromS.miltiorrhizaand named as SmPR10-1(GenBank Accession No.KF877034).The results indicated that:(1)SmPR10-1has an open reading frame(ORF)of 477bp,which encoded a protein of 158amino acid residues,with a predicted molecular mass of 17.38kD.(2)Bioinformatic analysis indicated that SmPR10-1protein showed the highest homology,69%identity,with PR10protein fromVitis vinifera with the same conserved sequence(G-X-GG-X-G)and(K-A-X-E-X-Y).(3)Escherichia coli BL21cells were transformed with the expression vector pET32a-SmPR10-1and used for prokaryotic expression.Meanwhile,the four factors,inducing IPTG concentrations,initial density of host bacterium(A600),inducing temperature and inducing time,which influenced protein expression,were optimized.The optimum expression conditions of SmPR10-1were final IPTG concentration of 0.4mmol/L,A600of 0.8,and the inducing time of 8hat 30℃.Finally,the recombi-nant SmPR10-1protein was purified through Ni2+affinity chromatography.The results of this study provided not only the first and fundamental information about SmPR10-1gene,but also a candidate gene for future genetic engineering of Chinese medical herbs,S.miltiorrhiza,against pathogen attack.

Salvia miltiorrhiza;pathogenesis-related protein;bioinformatic analysis;prokaryotic expression;optimization of expression condition

Q785;Q786

A

10.7606/j.issn.1000-4025.2015.06.1078

1000-4025(2015)06-1078-07

2015-02-03;修改稿收到日期:2015-04-17

國家自然科學(xué)基金(81173490,8130070);河南中醫(yī)學(xué)院博士科研基金(BSJJ2011-07)

趙 樂(1983-),男,博士,講師,主要從事藥用植物分子生物學(xué)研究。E-mail:zhaole1983@126.com

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