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RT—PCR技術(shù)在診斷H5亞型禽流感病毒中的應(yīng)用

2015-09-10 10:11周建紅等
湖北畜牧獸醫(yī) 2015年7期
關(guān)鍵詞:禽流感檢測

周建紅等

摘要:按照中華人民共和國農(nóng)業(yè)行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)(NY/T 772-2004)設(shè)計合成了針對H5的引物,建立了一種對禽流感(AIV)一步法RT-PCR的快速診斷方法。結(jié)果表明,該方法具有高效,快速,特異性強(qiáng),敏感性高等特點(diǎn),可基本滿足當(dāng)前的檢測需要。

關(guān)鍵詞:禽流感;RT-PCR;檢測

中圖分類號:S858.3 文獻(xiàn)標(biāo)識碼:A 文章編號:1007-273X(2015)07-0011-02

禽流感是由A 型流感病毒(AIV)引起的一種禽類的疾病綜合征。因其傳播快、危害大,被世界動物衛(wèi)生組織(OIE)列為A類動物疫病,我國將其列為一類動物疫病[1]。該病對養(yǎng)殖業(yè)生產(chǎn)危害性極大,是世界各國防疫的重點(diǎn)對象。控制禽流感關(guān)鍵在于早發(fā)現(xiàn)、早隔離、早預(yù)防。因而快速、敏感、特異的診斷方法受到人們的關(guān)注。目前對AIV進(jìn)行快速檢測的方法有IFA、ELISA、RT-PCR、Real-time RT-PCR、NASBA和Microarray等。隨著PCR技術(shù)的不斷完善和發(fā)展,該技術(shù)已逐漸應(yīng)用于各類疫病的診斷。對于禽流感檢測,它可通過基因序列和結(jié)構(gòu)分析,從分子和基因水平直接對臨床病料或雞胚培養(yǎng)物進(jìn)行禽流感病毒(AIV)型、亞型及不同毒力株的檢測[2]。本文就RT-PCR技術(shù)檢測H5亞型禽流感病毒的試驗(yàn)報告如下。

1 材料與方法

1.1 材料

(1)禽流感病毒陽性對照(已滅活)。

(2)主要試劑:RNA提取試劑盒為美國OMEGA公司產(chǎn)品。RT-PCR試劑盒為寶生物工程大連有限公司產(chǎn)品。低分子量蛋白質(zhì)Marker、瓊脂糖為OXOID產(chǎn)品。

(3)引物:根據(jù)中華人民共和國農(nóng)業(yè)行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)(NY/T 772-2004)合成了1對引物,上游引物(P1):5′-ACACATGCYCARGACATACT-3′;下游引物(P2):5′-CTYTGRTTYAGTGTTGATGT-3′;引物之間跨度為545 bp。引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。

1.2 病毒總RNA的提取

采集的口腔、泄殖腔棉拭子分離后收集上清,RNA 病毒的抽提按試劑盒說明書進(jìn)行。

1.3 RT-PCR反應(yīng)

RT-PCR采用一步法,參照TaKaRa One Step RNA PCR Kit(AMV)(TaKaRa)操作說明,利用上述引物P1、P2分別對提取的RNA進(jìn)行RT-PCR 擴(kuò)增。RT-PCR 反應(yīng)體系如下:10×One step RNA PCR Buffer(TaKaRa)5 μL,dNTP(10 mmol/L)5 μL,MgCl2(25 mmol/L)10 μL,RNase Inhibitor (40 U/μL)1 μL,AMV RTase XL(5 U/μL) 1 μL,AMV-Optimized Taq(5 U/μL)1 μL,上下游引物(20 μmol/L)各1 μL,RNA 模板3 μL,補(bǔ)充ddH2O至50 μL。反應(yīng)程序:50 ℃反轉(zhuǎn)錄30 min;94 ℃預(yù)變性2 min;94 ℃變性1 min,52 ℃退火1 min,72 ℃ 延伸1 min,35個循環(huán),72 ℃延伸10 min。

1.4 特異性試驗(yàn)

取CSFV、PRRSV、NDV按照OMEGA說明書提取總RNA,按照1.3進(jìn)行RT-PCR。

1.5 RT-PCR產(chǎn)物電泳檢測

RT-PCR產(chǎn)物在1%瓊脂糖凝膠上進(jìn)行電泳,當(dāng)溴酚藍(lán)電泳至適當(dāng)位置,在長波紫外燈下/凝膠成像系統(tǒng)觀察或拍照。

2 結(jié)果與分析

2.1 禽流感RT-PCR擴(kuò)增結(jié)果

提取總RNA,RT-PCR擴(kuò)增,產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳,陽性對照獲得大小為545 bp 左右的片段,與設(shè)計長度一致(圖1)。

2.2 特異性試驗(yàn)結(jié)果

特異性試驗(yàn)結(jié)果表明,僅禽流感陽性株在545 bp處出現(xiàn)了一條帶,而CSFV、PRRSV、NDV均為陰性。

2.3 臨床樣品的檢測結(jié)果

從某雞場采集40份樣品進(jìn)行RT-PCR檢測,未見有陽性。

3 小結(jié)與討論

H5亞型禽流感由于在家禽中流行較為廣泛、危害大,特別是高致病性禽流感可引起雞群100%死亡,給養(yǎng)殖業(yè)造成了巨大損失。

為進(jìn)一步減少損失,及時對禽流感的發(fā)生做出早期診斷,并進(jìn)行預(yù)警預(yù)報,我們按照中華人民共和國農(nóng)業(yè)行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)(NY/T 772-2004)設(shè)計合成了針對H5的引物,建立了一種對AIV一步法RT-PCR的快速診斷方法,該方法具有高效,快速,特異性強(qiáng),敏感性高等特點(diǎn),可基本滿足當(dāng)前的檢測需要,為禽流感的預(yù)防和確診提供了保障。

參考文獻(xiàn):

[1] 卡爾尼克B W.禽病學(xué)[M].第九版.北京農(nóng)業(yè)大學(xué)出版社.199l.

[2] 彭曉玲,蘭 玲,馬亞珍,等. 高致病性禽流感RT-PCR快速診斷方法的建立[J].動物醫(yī)學(xué)進(jìn)展,2009,30(1): 40-42.

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