張 婷,周金燕,譚 紅
(1. 山東職業(yè)學(xué)院生物工程系,山東 濟(jì)南 250104;2. 中國(guó)科學(xué)院成都生物研究所,四川 成都 610041)
抗生素XBP-03-A 是從我國(guó)西部地區(qū)采集的土樣中分離得到的鏈霉菌XBP-03 菌株所產(chǎn)生的次級(jí)代謝物質(zhì),在篩選中發(fā)現(xiàn)其產(chǎn)生的代謝物質(zhì)對(duì)多種病原菌具有抗菌活性[1]。經(jīng)對(duì)該抗生物質(zhì)的分離純化和鑒定分析,發(fā)現(xiàn)其中活性組分XBP-03-A 為谷氏菌素。本文報(bào)道抗生素XBP-03-A 的制備、分離、純化及結(jié)構(gòu)分析等工作,以期為分析鏈霉菌XBP-03 發(fā)酵液中的其他活性成分提供研究思路。
鏈霉菌XBP-03 的發(fā)酵液由中國(guó)科學(xué)院成都生物研究所應(yīng)用與環(huán)境微生物研究中心提供。抑菌測(cè)定指示菌為蠟樣芽孢桿菌(Bacillus cereus Ym1004),由中國(guó)科學(xué)院成都生物研究所應(yīng)用與環(huán)境微生物研究中心提供。抑菌活性測(cè)定培養(yǎng)基:蛋白胨0.15%,磷酸氫二鈉0.005%,牛肉膏0.15%,瓊脂1.8%,pH 值7.8~8.0,培養(yǎng)基需經(jīng)0.1 MPa,121℃滅菌30 m in。
儀器設(shè)備及試劑:YJ-875 型醫(yī)用凈化工作臺(tái)、LRH-250A 型生化培養(yǎng)箱、BüCHI R-114 型旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)儀、GL-20G-Ⅱ型離心機(jī)、876-2 型真空干燥箱;玻璃層析柱;美國(guó)Perkin Elmer Lambda 35 型紫外可見(jiàn)分光光度計(jì);SHIMADZU(島津) 液相色譜儀系統(tǒng);LC-10AT 型輸液泵,SPD-10A 紫外檢測(cè)器,7725i 進(jìn)樣閥;N3000 色譜工作站(浙江大學(xué)智能信息研究所);HC-C18 色譜柱(4.6 mm×250 mm,安捷倫公司)、Bouns-RP 柱(4.6 mm×250 mm,安捷倫公司);GF-254層析板;培養(yǎng)皿;試管;試劑瓶等;超純水(18.2 MΩ)、甲醇、丙酮、冰乙酸、正丁醇、乙醇(均為國(guó)產(chǎn)分析純)、進(jìn)口色譜純甲醇、進(jìn)口色譜純乙腈、四環(huán)素(sigma 公司進(jìn)口分裝)、正相硅膠載體(青島海洋化工)
1.2.1 上柱樣品的制備 鏈霉菌XBP-03 通過(guò)深層發(fā)酵培養(yǎng)50 h 后,發(fā)酵培養(yǎng)液以6 000 r/m in 的條件離心15 min,取上清液,備用,記為發(fā)酵液。此發(fā)酵液采用D101 大孔樹(shù)脂進(jìn)行動(dòng)態(tài)脫色處理后[2],再利用3 倍體積無(wú)水乙醇沉淀,取上清液。此上清液經(jīng)旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)儀在45℃濃縮到少量體積,再用20 倍體積無(wú)水乙醇沉淀,收集沉淀,放在真空干燥箱里40℃干燥12 h,得到黃色粉末粗品。用少量水溶解此粗品后,按照粗品∶硅膠=1∶1.5(w/w)拌料,此物料為上柱樣品。
1.2.2 硅膠柱層析分離 以乙醇-水作為流動(dòng)相,柱層析硅膠(100~200 目)為固定相[3],采用濕法裝柱,使流速控制在2 m L/m in。利用梯度洗脫的方法,即乙醇∶水=8∶1、乙醇∶水=4∶1,每250 m L 收集一瓶,每一梯度洗5個(gè)柱體積,柱層析結(jié)果利用薄層層析方法檢測(cè)分析,展層效果相近的洗脫液合并濃縮,各流份用管碟法進(jìn)行活性跟蹤檢測(cè),活性樣品繼續(xù)采用硅膠柱分離。
1.2.3 洗脫液檢測(cè) (1)生物活性跟蹤:各流份用管碟法進(jìn)行活性跟蹤檢測(cè),使用管蝶法[4]分別測(cè)定其對(duì)蠟樣芽孢桿菌的抑菌效果。(2)TLC 檢測(cè):將生物檢測(cè)得有抗細(xì)菌活性的洗脫液,于GF-254 層析板上點(diǎn)樣,以乙醇-氨水-水為展開(kāi)劑,采用紫外燈254 nm 照射和5%茚三酮丙酮溶液染色相結(jié)合的方法顯色。檢測(cè)后將斑點(diǎn)一致的收集液合并起來(lái),減壓濃縮后測(cè)抑菌活性,活性樣品繼續(xù)采用硅膠柱分離第二次,方法同1.2.2。
1.2.4 HPLC 制備XBP-03-A 經(jīng)過(guò)上述步驟的分離純化過(guò)程,能夠得到單一組分含量較高的樣品,還需使用高相液相色譜法(HPLC)法制備[5]兩次,進(jìn)一步達(dá)到核磁純度,從而可以鑒定其結(jié)構(gòu)。
HPLC 一次制備條件:Bouns-RP 柱,流動(dòng)相乙腈-水(6∶4),流速0.5 m L/m in,檢測(cè)波長(zhǎng)265 nm,柱溫40℃;HPLC 二次制備條件:HC-C18 柱,流動(dòng)相甲醇-水(5∶95,含0.05%冰乙酸),流速0.5 m L/m in,檢測(cè)波長(zhǎng)265 nm,柱溫40℃。
分別收集目標(biāo)峰,利用HPLC 進(jìn)行純度分析后,旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)濃縮至干后,得到XBP-03-A 白色粉末,用此樣品進(jìn)行結(jié)構(gòu)分析及活性檢測(cè)。
1.2.5 XBP-03-A 的抑茵活性檢測(cè) 制備時(shí)取少量在HPLC 圖譜峰尖時(shí)流出的溶液,將其濃縮干燥后,用無(wú)菌水溶解,使用濾紙片法測(cè)其抑菌活性。
利用梯度洗脫硅膠柱層析的方法,每250 m L 收集一瓶,經(jīng)薄層層析檢測(cè),將展層效果相近的洗脫液合并,相應(yīng)地將發(fā)酵液粗提物分為8個(gè)流份,并對(duì)以上8個(gè)流份進(jìn)行管碟法抑菌活性檢驗(yàn)。結(jié)果顯示,1 至6 流份無(wú)活性,7、8 流份具有抑菌活性(圖1)。
圖1 硅膠柱層析流份的活性
將有活性的7、8 流份再經(jīng)過(guò)反復(fù)正相硅膠柱層析分離純化,分別得到純度較好,薄層層析為單一斑點(diǎn)的組分,用于進(jìn)一步制備。
2.1 中有活性的7、8 流份經(jīng)過(guò)反復(fù)硅膠柱層析進(jìn)行分離純化,得到的純度較好的組份,進(jìn)一步通過(guò)高效液相色譜制備兩次,得到XBP-03-A。XBP-03-A 的液相譜圖如圖2。
圖2 XBP-03-A 的HPLC 圖
活性測(cè)定結(jié)果表明,XBP-03-A 的抑菌活性較強(qiáng)(圖3)。
圖3 XBP-03-A 的抑菌活性
采用紫外光譜、質(zhì)譜、核磁共振譜(13C-NMR 和1H-NMR)等分析方法對(duì)XBP-03-A 結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析。
XBP-03-A 化合物的紫外特征譜圖如圖4,與典型的胞嘧啶堿基核苷類化合物的紫外特性一致[6],其水溶液在265 nm 處有中等強(qiáng)度吸收峰,遠(yuǎn)紫外區(qū)存在最大吸收,其0.1 mol/L HCl 溶液吸收峰發(fā)生紅移(向長(zhǎng)波方向移動(dòng)),且伴隨摩爾吸光系數(shù)顯著增加。
經(jīng)HR-ESI-MS 分析測(cè)定,XBP-03-A 的分子離子峰為m/z 444.1817 [M+H]+,二倍分子離子峰為m/z 887.3601[2M+H]+,如圖5,推測(cè)分子量為443。
13C -NMR(D2O):δC171.8,171.7,167.0,166.1,157.8,141.7,97.2,83.2,75.9,73.5,71.3,61.3,59.7,55.7,53.4,33.0;1H-NMR(D2O):δH7.74(d),6.05(d),5.67(d),4.49(s),4.12(m),4.03(m),3.87(m),3.80(m),3.78(m),2.69(s)。結(jié)合氫譜、碳譜及元素分析初步定出XBP-03-A 的分子式為C16H25N7O8。對(duì)照Dolak[7]和Murao[8]發(fā)表的數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)XBP-03-A 與兩者文章中g(shù)ougerotin 的C 和H化學(xué)位移值相近度很高,確定XBP-03-A 結(jié)構(gòu)式與gougerotin[9]的結(jié)構(gòu)式相同,結(jié)構(gòu)見(jiàn)圖6。
圖4 XBP-03-A 的紫外特征
圖5 XBP-03-A 的ESI-MS
圖6 XBP-03-A 的化學(xué)結(jié)構(gòu)
XBP-03-A 與gougerotin 的核磁波譜數(shù)據(jù)對(duì)比,結(jié)果見(jiàn)表1。
另外,在鏈霉菌XBP-03 發(fā)酵液中還分離到一種單體化合物,經(jīng)鑒定其結(jié)構(gòu)與胞嘧啶葡萄糖醛酸[10]相同,見(jiàn)圖7。由于核苷肽類抗生素的生物合成機(jī)理具有相似性[11],均先形成核苷,再經(jīng)酶催化,在核苷上連接不同的氨基酸,最終形成不同的核苷肽抗生素。因此,推測(cè)胞嘧啶葡萄糖醛酸是谷氏菌素生物合成的中間體。
谷氏菌素是一種核苷肽類抗生素,分子構(gòu)成包括3個(gè)部分,即胞嘧啶、氨基已糖和肌氨酞絲氨酸二肽,具有抗細(xì)菌、支原體及抗病毒和腫瘤等活性[12]。早期,Murao 等在一株鏈霉菌發(fā)酵液中發(fā)現(xiàn)一種植物生長(zhǎng)抑制劑,命名為谷氏菌素。胡繼蘭等[13]從采自云南土樣中分離的一株鏈霉菌發(fā)酵液中提取分離得到一個(gè)具有抗腫瘤活性的物質(zhì),命名為云谷霉素,經(jīng)鑒別該物質(zhì)與谷氏菌素相同。M igawa 等[14]采用固相合成法實(shí)現(xiàn)了谷氏菌素的全合成,進(jìn)一步推動(dòng)了谷氏菌素的應(yīng)用。
表1 抗生素XBP-03-A 與谷氏菌素的13C 和1H化學(xué)位移數(shù)據(jù)對(duì)比
圖7 胞嘧啶葡萄糖醛酸的化學(xué)結(jié)構(gòu)
本文報(bào)道的從鏈霉菌XBP-03 發(fā)酵液中發(fā)現(xiàn)的抗菌物質(zhì)XBP-03-A,結(jié)構(gòu)與谷氏菌素相同,不僅為分離純化鏈霉菌XBP-03 發(fā)酵液中的其他活性成分奠定了試驗(yàn)基礎(chǔ),而且為分離不解離的極性物質(zhì)提供了思路。同時(shí)還分離得到了構(gòu)成XBP-03-A 的結(jié)構(gòu)單元胞嘧啶葡萄糖醛酸,可為研究鏈霉菌XBP-03 次級(jí)代謝產(chǎn)物的生物合成途徑提供線索。
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