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P53 基因密碼子72 多態(tài)性與大腸癌易感性的Meta 分析

2015-12-31 09:39:24王明珠譚詩云
關(guān)鍵詞:密碼子大腸癌多態(tài)性

王明珠,譚詩云,王 軍

武漢大學(xué)人民醫(yī)院消化內(nèi)科,湖北 武漢430060

大腸癌是癌癥的第三大最常見的類型,近幾年,大腸癌在中國(guó)的發(fā)病率逐年上升,城市地區(qū)占總癌癥比例約為6. 5%,農(nóng)村地區(qū)占總癌癥的比例約為4.6%[1]。男性和女性大腸癌的發(fā)病率分別居所有惡性腫瘤的第3 位、第2 位;而其死亡率分別居所有男性和女性惡性腫瘤的第4 位、第3 位[2]。與大腸癌發(fā)生相關(guān)的因素目前尚未完全明確,但流行病學(xué)研究揭示,微量元素缺乏、吸煙、飲酒及遺傳等與大腸癌的發(fā)展相關(guān),而遺傳因素又是諸多因素中與大腸癌的發(fā)生、發(fā)展最為密切的一個(gè)[3]。

P53 是一種腫瘤抑制基因,在調(diào)節(jié)細(xì)胞生長(zhǎng)、分裂及細(xì)胞凋亡中起著不可替代的作用[4]。它位于染色體17p13 上,在人類所有類型的癌癥中,是一種最常見的突變基因[5]。除了突變外,野生型P53 基因多態(tài)性也可以改變其功能,在一般人群中,與癌癥發(fā)展相關(guān)的常見多態(tài)性是P53 基因密碼子72 所編碼的的精氨酸(CGC)被脯氨酸(CCC)替代[6]。氨基酸序列的改變,可以改變P53 蛋白結(jié)合靶基因中反應(yīng)元件的能力,并改變翻譯后修飾的識(shí)別基序,或改變P53 的穩(wěn)定性及與其他蛋白的相互作用[7]。這種變化可能有助于腫瘤的發(fā)展,且預(yù)后不良[8]。

在過去的20 年中,大量的病例對(duì)照研究探討了人P53 基因密碼子72 多態(tài)性與人類大腸癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)之間的關(guān)聯(lián)。然而,這些研究的結(jié)論不盡相同。2010 年-2011 年有兩個(gè)薈萃分析曾發(fā)表評(píng)價(jià)P53 基因密碼子72 多態(tài)性與大腸癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)之間的關(guān)聯(lián)。這兩項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn),這種多態(tài)性與大腸癌風(fēng)險(xiǎn)無相關(guān)性,并建議進(jìn)一步研究來證實(shí)這些結(jié)果。然而,這兩項(xiàng)研究有一定的局限性,如樣本量相對(duì)較小,而且很少有研究是基于亞洲人群。此后,也有一些研究相繼發(fā)表。為了更全面的估計(jì)P53 基因密碼子72 多態(tài)性與大腸癌之間的關(guān)聯(lián)風(fēng)險(xiǎn),我們收集了25 個(gè)病例對(duì)照進(jìn)行了一項(xiàng)薈萃分析研究,來評(píng)估它們之間的聯(lián)系。

1 材料與方法

1.1 材料 計(jì)算機(jī)檢索PubMed、Medline、EMbase、CBM、CNKI、萬方和維普等數(shù)據(jù)庫。中文檢索以P53、TP53、密碼子72、大腸癌、基因多態(tài)性為檢索詞,英文檢索以P53、TP53、codon 72、mutation、variation、polymorphism、colorectal cancer 等為檢索詞,無語言限制,搜索由兩位研究人員獨(dú)立進(jìn)行,檢索時(shí)間從建庫至2014 年2 月,同時(shí)輔以手工檢索。

1.2 方法

1.2.1 納入和排除標(biāo)準(zhǔn):納入標(biāo)準(zhǔn):(1)研究是基于無相關(guān)的個(gè)人;(2)必須是病例對(duì)照研究;(3)必須提供大腸癌的病例數(shù)和對(duì)照數(shù);(4)必須提供病例組及對(duì)照組Arg/Arg、Arg/Pro 和Pro/Pro 各基因型頻數(shù),以計(jì)算OR 值及95%CI,若文獻(xiàn)中無基因型頻率,聯(lián)系作者后獲取的方可納入研究。排除標(biāo)準(zhǔn):(1)研究重復(fù)發(fā)表或者無可用數(shù)據(jù)報(bào)道;(2)未提供基因型頻率且向作者索取無果;(3)研究對(duì)象非人類;(4)控制組的基因分布不符合Hardy-Weinberg 平衡(HWE)。

1.2.2 資料提取:由兩名研究者獨(dú)立對(duì)文獻(xiàn)進(jìn)行篩選并核對(duì),不一致的地方通過商討或第三方介入?yún)f(xié)調(diào)。提取的資料主要有第一作者的名字、發(fā)表年份、國(guó)家、病例組和對(duì)照組Arg/Arg、Arg/Pro 和Pro/Pro 各基因型頻數(shù)、對(duì)照組H-W 平衡檢驗(yàn)值(P 值),P <0.05 認(rèn)為不符合H-W 平衡規(guī)律)。

1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 采用Cochrane 協(xié)作網(wǎng)提供的Rev-Man 5.2 版軟件。(1)異質(zhì)性的檢驗(yàn):用Q 檢驗(yàn)和I2檢驗(yàn),當(dāng)P≥0.1、I2<50%時(shí),認(rèn)為不存在統(tǒng)計(jì)學(xué)異質(zhì)性,用固定效應(yīng)模型進(jìn)行Meta 分析;當(dāng)P <0.10,I2>50%時(shí)各研究結(jié)果不同質(zhì),可使用敏感性分析或分層分析等異質(zhì)性處理方法,使之達(dá)到同質(zhì)后,再用固定效應(yīng)模型;若經(jīng)過異質(zhì)性分析和處理后,多個(gè)同類研究的結(jié)果仍然不具有同質(zhì)性時(shí),可選擇隨機(jī)效應(yīng)模型。(2)H-W 遺傳平衡檢驗(yàn):其方法是利用在線軟件(http://ihg. gsf. de/cgi-bin/hw/hwa1. pl)進(jìn)行計(jì)算,P >0.05 說明群體是隨機(jī)婚配,符合H-W 平衡,可以用于遺傳學(xué)分析,否則剔除掉。(3)偏倚的評(píng)價(jià):以漏斗圖的對(duì)稱性及寬度范圍來評(píng)價(jià)。

2 結(jié)果

2.1 文獻(xiàn)檢索結(jié)果 初檢獲得文獻(xiàn)108 篇,無中文文獻(xiàn),全部為英文文獻(xiàn),通過閱讀題目和摘要剔除67 篇(其中包括研究非大腸癌類文獻(xiàn)44 篇,重復(fù)21 篇,Meta 分析2 篇),剩余41 篇通過閱讀全文剔除14 篇(均為機(jī)制研究),初納入文獻(xiàn)27 篇,因Sotamaa 等研究包括美國(guó)及芬蘭人口的兩個(gè)獨(dú)立研究,合并分析時(shí)將其視為兩個(gè)研究,即27 篇[9-35]文獻(xiàn)(28 個(gè)研究)。通過H-W 遺傳平衡檢驗(yàn)計(jì)算,其中有3 個(gè)研究[33-35](Sameer 等PHWE = 0. 025;Dakouras 等PHWE =0.002;Sjalander 等PHWE =0.049)的P 值<0.05,不符合H-W 平衡規(guī)律,將其剔除,最終納入24 篇[9-32]文獻(xiàn)(25 個(gè)研究),其中有6 753 例患者,8 562 例對(duì)照者。納入研究的一般情況如表1 所示。

表1 納入文獻(xiàn)的基本情況Tab 1 Characteristics of studies included in the Meta-analysis

續(xù)表1

2.2 Meta 分析結(jié)果 對(duì)納入的25 個(gè)研究合并進(jìn)行Meta 分析,結(jié)果如表2 所示,4 個(gè)模型中,由于顯性模型(I2=57%)及PP vs AA 模型(I2=58%)存在異質(zhì)性,采用隨機(jī)效應(yīng)模型進(jìn)行數(shù)據(jù)合并,其余兩個(gè)模型不存在異質(zhì)性,因此,采用固定效應(yīng)模型進(jìn)行數(shù)據(jù)合并。結(jié)果表明隱性模型PP vs AP +AA 與大腸癌發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)有明顯相關(guān)性(隱性模型:OR=1.13,95% CI:1.02 ~1.26,P=0.02),其余基因模型與大腸癌發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)無明顯相關(guān)性(顯性模型:OR =0.99,95% CI:0.88 ~1.11,P=0.84;PP vs AA:OR=1,95% CI:0.82 ~1.22,P=1.00;AP vs AA:OR=1.04,95% CI:0.96 ~1.11,P=0.33)(見表2、圖1)。

表2 P53 基因密碼子72 多態(tài)性與大腸癌易感性的Meta 分析Tab 2 Meta-analysis of the P53 codon 72 polymorphism and colorectal cancer risk

圖1 總?cè)巳篜53 基因密碼子72 多態(tài)性與大腸癌風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)性隱性遺傳模型的Meta 分析Fig 1 Forest plots for the association of the P53 gene codon 72 polymorphism and colorectal cancer risk in the recessive model

2.3 敏感性分析 對(duì)各項(xiàng)研究進(jìn)行依次剔除,每次僅剔除1 篇,發(fā)現(xiàn)剔除Zhu 等[19]的研究后,其研究間的異質(zhì)性也隨之消失,但是各個(gè)模型的合并效應(yīng)量OR值無明顯變化,表明我們得到的結(jié)果是穩(wěn)定的,具有可靠性。

2.4 發(fā)表偏倚分析 從漏斗圖的對(duì)稱性來看,隱性模型及PP vs AA 模型不對(duì)稱,可能存在潛在的發(fā)表偏倚。而顯性模型及AP vs AA 模型較為對(duì)稱,且分布范圍較為狹窄,集中在上部,表明其精度較高,不存在發(fā)表偏倚(見圖2)。

圖2 P53 基因密碼子72 多態(tài)性與大腸癌易感性Meta 分析發(fā)表偏倚風(fēng)險(xiǎn)結(jié)果 A:顯性模型;B:隱性模型;C:PP vs AA 模型;D:AP vs AA 模型Fig 2 Funnel plot for publication bias test between the P53 gene codon 72 polymorphism and colorectal cancer risk A:dominant model;B:recessive model;C:PP vs AA model;D:AP vs AA model

3 討論

P53 是一種重要的腫瘤抑制基因,在過去20 年里,已被廣泛研究,根據(jù)以往國(guó)內(nèi)外報(bào)道,P53 基因突變與肺癌、宮頸癌、乳腺癌及前列腺癌的發(fā)生均有有一定的關(guān)系。自從Olschwang 等[32]在1991 年第一次研究P53 基因密碼子72 多態(tài)性與大腸癌風(fēng)險(xiǎn)之間的關(guān)系,此后,關(guān)于兩者關(guān)系的文章被相繼報(bào)道,然而結(jié)果卻不盡相同。先前,Wang 及Tang 等[36-37]分別在2010年及2011 年發(fā)表了薈萃分析,研究結(jié)果表明P53 基因密碼子72 多態(tài)性與大腸癌風(fēng)險(xiǎn)無相關(guān)性。然而這兩個(gè)研究均存在一定的局限性,前者沒有剔除不符合HW 遺傳平衡檢驗(yàn)的研究(納入了34、35 兩篇文獻(xiàn)),且前者沒有研究隱性模型,后者的研究雖然避免了前者的缺點(diǎn),但是樣本含量較少(病例組3 603 個(gè),對(duì)照組5 524個(gè))。因此,更新的薈萃分析是必要的。

該項(xiàng)薈萃分析樣本含量較之前明顯增加,統(tǒng)計(jì)效能也大大提高。研究結(jié)果表明隱性模型PP vs AP +AA 中P53 基因密碼子與大腸癌發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)有明顯相關(guān)性,其余模型中均未發(fā)現(xiàn)大腸癌風(fēng)險(xiǎn)有關(guān)。該結(jié)果與前兩次研究[36-37]并不完全一致。分層分析顯示,在亞洲人群中,合并OR 值為1.07(95%CI:0.98 ~1.18),白種人中,合并OR 值為0.99 (95%CI:0.88 ~1.10),該結(jié)果表明P53 基因密碼子72 多態(tài)性和大腸癌易感性,與種族無關(guān)。薈萃分析的結(jié)果受對(duì)照組選擇的影響,不同的對(duì)照組來源可能是一個(gè)混雜因素,對(duì)我們的研究結(jié)論會(huì)產(chǎn)生影響[38]。如一些研究中使用健康人群作為對(duì)照組,而其他研究選擇無大腸癌住院患者作為對(duì)照組。為了消除對(duì)照源不同的混雜因素,我們對(duì)對(duì)照源進(jìn)行亞組分析。研究結(jié)果表明,P53 基因密碼子72 多態(tài)性與大腸癌易感性也無顯著相關(guān)性,這證實(shí)了我們整體結(jié)果的可靠性。

本文尚存在以下不足:(1)文獻(xiàn)存在發(fā)表偏倚的可能性;(2)未考慮基因與環(huán)境的相互作用;(3)我們沒有調(diào)整OR 值,可能存在年齡、性別、肥胖、吸煙、飲酒等方面的影響。因此結(jié)論的可靠性需要考究。

總之,這項(xiàng)薈萃分析表明,P53 基因密碼子72 多態(tài)性與大腸癌易感性之間存在相關(guān)性。然而受諸多混雜因素的影響,以上結(jié)論需要大樣本、多中心的病例對(duì)照研究來證實(shí),此外,期望在未來,基因與環(huán)境的相互作用能得到進(jìn)一步研究,以更全面了解P53 基因密碼子72 多態(tài)性與大腸癌風(fēng)險(xiǎn)之間的關(guān)系。

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