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大豆品種科豐14及其突變系的鑒定

2016-01-17 09:19張凱淅
種子 2016年6期
關(guān)鍵詞:多態(tài)性大豆性狀

張凱淅, 韓 俊, 王 程, 郭 蓓, 謝 皓

(北京農(nóng)學(xué)院植物科學(xué)技術(shù)學(xué)院, 北京102206)

北農(nóng)106、北農(nóng)107和北農(nóng)108是北京農(nóng)學(xué)院大豆研究室以大豆品種科豐14為輻照親本,利用60Co-γ射線輻照其干種子,從1株持綠型突變體中經(jīng)系譜法選育而成的姊妹系,均具有葉片、果莢失綠延遲,成熟后種子為綠種皮和綠子葉等特征[1]。其中,北農(nóng)106、北農(nóng)107和北農(nóng)108于2012年申報了品種權(quán)保護(hù),北農(nóng)106于2014年通過北京市農(nóng)作物品種審定委員會審定。由于北農(nóng)106、北農(nóng)107和北農(nóng)108來自同一親本科豐14,農(nóng)藝性狀十分相似,因此,在品種的鑒別上有一定難度。

分子標(biāo)記技術(shù)的發(fā)展,為品種鑒定提供了新的途徑。SSR標(biāo)記是目前品種鑒定上常用的技術(shù),已在很多農(nóng)作 物 上 應(yīng) 用,例 如,大 豆[2]、玉 米[3]、水 稻[4]、棉花[5]、小麥[6]、洋蔥[7]等。本試驗利用傳統(tǒng)的植物形態(tài)性狀鑒定方法與SSR標(biāo)記技術(shù)相結(jié)合,對科豐14及其突變系北農(nóng)106、北農(nóng)107和北農(nóng)108進(jìn)行鑒定,旨在為北農(nóng)106、北農(nóng)107和北農(nóng)108種子的鑒別與品種權(quán)保護(hù)供技術(shù)支撐。

1 材料與方法

1.1 試驗材料

科豐14、北農(nóng)106、北農(nóng)107和北農(nóng)108的種子由北京農(nóng)學(xué)院大豆研究室提供。

8 30對大豆SSR引物由北京鼎國昌盛生物技術(shù)有限公司合成,試驗藥品購自北京鼎國昌盛生物技術(shù)有限公司。

1.2 試驗方法

1.2.1 形態(tài)性狀鑒定

科豐14、北農(nóng)106、北農(nóng)107和北農(nóng)108的種子夏播,種植于北京農(nóng)學(xué)院試驗田。每品種1小區(qū),每小區(qū)3行,行長5m,株距0.1m。生長期間記載生育期、花色、葉形、生長習(xí)性等性狀,成熟后每品種隨機(jī)收獲20株,調(diào)查植株和籽粒性狀。

1.2.2 SSR分子標(biāo)記鑒定

大豆幼苗期,每品種隨機(jī)取10株幼嫩葉片,分別提取基因組DNA,等量DNA混合為品種SSR標(biāo)記的DNA模版。DNA的提取采用CTAB法,PCR擴(kuò)增采用10μL反應(yīng)體系,8%聚丙烯酰胺非變性膠電泳,1%硝酸銀水溶液銀染,制干膠保存,根據(jù)標(biāo)記的多態(tài)性統(tǒng)計結(jié)果。

2 結(jié)果與分析

2.1 科豐14及其突變系主要生物學(xué)性狀比較

北農(nóng)106、北農(nóng)107和北農(nóng)108為姊妹系,來自于同一個輻照親本科豐14,因此,大部分生物學(xué)性狀與科豐14相同,但是,也有部分性狀有別于科豐14(表1)。例如,科豐14成熟后葉片變黃,籽粒呈黃種皮、黃子葉特征,北農(nóng)106、北農(nóng)107和北農(nóng)108在成熟期具有持綠特點,種皮和子葉均為綠色。由于持綠,北農(nóng)106、北農(nóng)107和北農(nóng)108的生育期普遍延長,同樣的栽培條件下,植株的高度也有差異,百粒重也不盡相同。

在北農(nóng)106、北農(nóng)107和北農(nóng)108姊妹系之間,除生育期、百粒重有差異外,植株的花色和種臍顏色也有變化。北農(nóng)106和北農(nóng)107為紫花,而北農(nóng)108為白花與科豐14相同;北農(nóng)106為褐色種臍,而北農(nóng)107和北農(nóng)108為淺褐色種臍與科豐14相同。這些性狀的差別,為北農(nóng)106、北農(nóng)107和北農(nóng)108以及科豐14的鑒定與鑒別提供了依據(jù)。但是,在種子階段,北農(nóng)106、北農(nóng)107和北農(nóng)108之間因籽粒顏色、粒型相同,難以鑒別。此外,雖然科豐14為黃種皮、黃子葉,但在苗期階段與其突變系之間也存在差別不明顯、容易混淆的問題。因此,建立分子水平的鑒定方法十分必要。

表1 北農(nóng)106、北農(nóng)107、北農(nóng)108和科豐14主要生物學(xué)性狀的比較

2.2 科豐14及其突變系SSR標(biāo)記的多態(tài)性分析

為在分子水平鑒定科豐14及其突變系,采用SSR分子標(biāo)記技術(shù)進(jìn)行了多態(tài)性分析,試圖挖掘不同品種間特異的SSR標(biāo)記,作為鑒定依據(jù)。經(jīng)利用分布在大豆遺傳圖譜上的830對SSR引物,對科豐14和其突變系北農(nóng)106、北農(nóng)107、北農(nóng)108的基因組DNA進(jìn)行PCR反應(yīng)和產(chǎn)生的標(biāo)記位點分析。分別發(fā)現(xiàn)科豐14有7對SSR引物產(chǎn)生的標(biāo)記位點與北農(nóng)106、北農(nóng)107和北農(nóng)108表現(xiàn)多態(tài)性;北農(nóng)106有3對引物產(chǎn)生的標(biāo)記位點與北農(nóng)107、北農(nóng)108和科豐14表現(xiàn)多態(tài)性;北農(nóng)107有2對引物產(chǎn)生的標(biāo)記位點與北農(nóng)106、北農(nóng)108和科豐14表現(xiàn)多態(tài)性;北農(nóng)108有2對引物產(chǎn)生的標(biāo)記位點與北農(nóng)106、北農(nóng)107和科豐14表現(xiàn)多態(tài)性。

圖1 科豐14與北農(nóng)106、北農(nóng)107和北農(nóng)108DNA SSR擴(kuò)增產(chǎn)物多態(tài)性圖譜

2.2.1 科豐14與北農(nóng)106、北農(nóng)107和北農(nóng)108之間的多態(tài)性分析

對在科豐14與北農(nóng)106、北農(nóng)107和北農(nóng)108之間有多態(tài)性擴(kuò)增的7對SSR引物多次檢測,結(jié)果表明,Satt 228、Sat_160、Sat_227、Sat_362、Satt 514、Sat_381和Satt 213共7對引物對科豐14擴(kuò)增的產(chǎn)物分子量大小有別于對北農(nóng)106、北農(nóng)107和北農(nóng)108產(chǎn)生的分子量(圖1),其分別產(chǎn)生的特異帶型Satt228_170bp、Sat_160_90bp、Sat_227_150bp、Sat_362_120bp、Satt514_150bp、Sat_381_200bp和Satt213_80bp能夠在分子水平上從科豐14、北農(nóng)106、北農(nóng)107和北農(nóng)108這4個品種中鑒別出科豐14。因此,上述7個引物所產(chǎn)生的帶型,可作為鑒定科豐14的分子標(biāo)記。

2.2.2 北農(nóng)106與北農(nóng)107、科豐14和北農(nóng)108之間的多態(tài)性分析

對在北農(nóng)106與北農(nóng)107、北農(nóng)108和科豐14之間有多態(tài)性擴(kuò)增的 Satt 204、Sat_380和Satt 706共3對SSR引物多次檢測,結(jié)果表明,這3個引物能夠分別擴(kuò)增出不同于北農(nóng)107、北農(nóng)108和科豐14的特異帶型(圖2),其標(biāo)記Satt204_105bp、Sat_380_150bp和 Satt706_160bp,可以作為鑒定北農(nóng)106分子標(biāo)記。

2.2.3 北農(nóng)107與科豐14、北農(nóng)106和北農(nóng)108之間的多態(tài)性分析

利用BE 475343和Sat_211引物對北農(nóng)107與北農(nóng)106、北農(nóng)108和科豐14的DNA多次擴(kuò)增,結(jié)果表明,分別產(chǎn)

生的分子標(biāo)記BE475343_100bp和Sat_211_110bp具有北農(nóng)107的特異性(圖3),可分別作為北農(nóng)107的鑒定標(biāo)記。

2.2.4 北農(nóng)108與科豐14、北農(nóng)106和北農(nóng)107之間的多態(tài)性分析

同理,經(jīng)多次重復(fù)檢測,Satt 367和Satt 373引物在北農(nóng)108的DNA中產(chǎn)生的Satt367_130bp和Satt373_160bp標(biāo)記(圖4),為北農(nóng)108的特異標(biāo)記,可作為鑒別北農(nóng)108的SSR分子標(biāo)記。

2.3 SSR標(biāo)記在大豆連鎖群位點的分析

通過對830對SSR引物的篩選,發(fā)現(xiàn)14對引物能夠在科豐14、北農(nóng)106、北農(nóng)107和北農(nóng)108的DNA中擴(kuò)增出多態(tài)性。由于北農(nóng)106、北農(nóng)107和北農(nóng)108為突變姊妹系,衍生于輻照親本科豐14,因此,通過對連鎖圖譜上SSR位點的分析,能夠進(jìn)一步推斷親子間、姊妹間發(fā)生變異位點的多寡與染色體的位置。表2是利用 NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)檢索,獲得的上述14對引物在大豆連鎖群上的位置。從表2可以看出,在大豆20個連鎖群中,科豐14與突變系之間產(chǎn)生的7個位點的SSR標(biāo)記,涉及5個連鎖群,表明60Co-γ射線輻照科豐14后,至少在5條染色體的DNA序列發(fā)生了變異,導(dǎo)致北農(nóng)106等突變系的產(chǎn)生;突變系北農(nóng)106與北農(nóng)107、北農(nóng)108之間有3個位點特異標(biāo)記,涉及1個連鎖群,表明北農(nóng)106至少有1條染色體DNA序列與北農(nóng)107、北農(nóng)108的序列有差異;同理,北農(nóng)107與北農(nóng)106、北農(nóng)108之間至少有1條染色體DNA序列不同;北農(nóng)108與北農(nóng)106、北農(nóng)107之間至少有2條染色體DNA序列有別。

表2 SSR引物標(biāo)記位點在大豆連鎖群上的位置

圖2 北農(nóng)106與北農(nóng)107、北農(nóng)108和科豐14DNA SSR擴(kuò)增產(chǎn)物多態(tài)性圖譜

圖3 北農(nóng)107與、北農(nóng)106北農(nóng)108和科豐14DNA SSR擴(kuò)增產(chǎn)物多態(tài)性圖譜

注:A和B分別表示SSR引物Satt 367和Satt 373。

3 討 論

輻照誘變是創(chuàng)制大豆新種質(zhì)的重要手段之一,本試驗供試材料中的北農(nóng)106等突變系就是利用60Co-γ射線輻照誘變獲得,與其輻照親本科豐14相比,有部分生物學(xué)性狀發(fā)生了變化,例如,種皮顏色、子葉顏色、成熟期持綠型及全生育期天數(shù)等,這些性狀可以作為鑒別科豐14和北農(nóng)106等突變系的形態(tài)標(biāo)記。同時,由于科豐14輻照后變異幅度較大,導(dǎo)致形成北農(nóng)106等突變系之間的部分性狀也不相同,可以利用品系間的性狀差異加以鑒別,例如,北農(nóng)106生育期105d,株高60cm,紫花,種臍褐色;北農(nóng)107生育期120d,株高75cm,紫花,種臍淺褐色;北農(nóng)115生育期120d,株高80cm,白花,種臍褐色。

利用分子標(biāo)記對品種進(jìn)行真實性鑒定,具有較高的準(zhǔn)確性和穩(wěn)定性。因此,本試驗嘗試應(yīng)用大豆SSR標(biāo)記對科豐14及其突變系進(jìn)行鑒定。結(jié)果發(fā)現(xiàn),科豐14有7個SSR標(biāo)記可用來區(qū)別突變系的種子;北農(nóng)106有3個SSR標(biāo)記可與北農(nóng)107、北農(nóng)108鑒別;北農(nóng)107有2個SSR標(biāo)記可以與北農(nóng)106、北農(nóng)108鑒別;北農(nóng)108有2個SSR標(biāo)記可與北農(nóng)106、北農(nóng)107鑒別。上述SSR標(biāo)記能夠用來鑒定科豐14及其突變系等品種。

據(jù)陳靜等報道,60Co-γ射線輻照誘變可使得DNA分子多個區(qū)段內(nèi)發(fā)生重復(fù)或缺失等結(jié)構(gòu)性變異,呈現(xiàn)多個位點突變[8]。本試驗發(fā)現(xiàn)的科豐14和突變系間的多個SSR標(biāo)記位點,驗證了上述結(jié)論,例如,科豐14有4個特異標(biāo)記分別來自2條染色體,北農(nóng)106的3個標(biāo)記來自于1條染色體,北農(nóng)107的2個標(biāo)記也來自于1條染色體,特別是科豐14與其突變系特異的標(biāo)記中,有2個標(biāo)記來自同一染色體,但是位點相對距離較遠(yuǎn)(E-3.72,E-64.18),說明科豐14被輻射后,導(dǎo)致多條染色體DNA的多個區(qū)段發(fā)生了變異,進(jìn)而產(chǎn)生了新的突變體。

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