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實(shí)時(shí)反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)對(duì)豬水泡診斷樣本中賽尼卡谷病毒的檢測(cè)
Senecavirus A(SV-A)原名賽尼卡谷病毒(SVV),被認(rèn)為與豬原發(fā)性皰疹病(SIVD)相關(guān),SIVD是一種缺乏特定病原體的皰疹疾病綜合癥。SIVD的臨床表現(xiàn)類似于更具傳染性和經(jīng)濟(jì)破壞性的水泡性疾病,如口蹄疫(FMD)、豬水皰病(SVD)和水泡性口炎(VS),通常需要立即做出診斷,以解除對(duì)動(dòng)物的檢疫、運(yùn)動(dòng)和貿(mào)易的限制。該研究提出了一個(gè)適用于診斷豬樣本中SV-A的檢測(cè)方法:SYBR Green RT-qPCR(實(shí)時(shí)反轉(zhuǎn)錄定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))。用RT-qPCR對(duì)出現(xiàn)水泡疾病臨床癥狀的50頭豬只樣品進(jìn)行檢測(cè),引物序列設(shè)計(jì)根據(jù)Genbank中SV-A高度保守的VP1編碼區(qū):SV-A-qF(5'-GGGTAACACTGACACCGATTT)和SV-A-qR(5'-TCGAGATCGATCAAACAGGAAC),擴(kuò)增產(chǎn)物長(zhǎng)度為87 bp,以β-Actin為內(nèi)參,目的基因擴(kuò)增條件為:48 ℃5 min;95 ℃ 10 min;接下來(lái)40個(gè)循環(huán)的95 ℃ 5 s,60 ℃ 1 min。結(jié)果顯示:以35頭未患水泡病的豬為對(duì)照組,在50頭豬中,44頭豬(88%)被檢測(cè)到患有SV-A。
SV-A RT-qPCR是一種快速、特異、靈敏度高的定量分析方法,可檢測(cè)來(lái)自于病變蹄中的拭子和組織、口腔和鼻黏膜上皮、口腔拭子、痂和內(nèi)部器官如肝臟和淋巴結(jié)組織中的SV-A RNA。
(編譯自:http://journals.plos.org/plosone/ article?id=10.1371/journal.pone.0146211)