據(jù)科學(xué)網(wǎng)2016年6月23日報道，中科院昆明動物所張亞平課題組利用二代測序技術(shù)對滇南小耳豬進行了全基因組測序，拓展了對家豬馴化過程中毛色變異調(diào)控機制的認(rèn)識，并對滇南小耳豬的選育具有指導(dǎo)意義。相關(guān)研究成果發(fā)表于《科學(xué)報告》。

家豬毛色表型常作為易察覺的外型特征，在品種選育中起重要作用。六白(四蹄、頭和尾尖白色)是家豬常見的毛色類型。之前有研究揭示歐洲家豬出現(xiàn)的六白毛色與MC1R基因的插入突變緊密相關(guān)，但對有著不同馴化起源的中國家豬來說，這一表型的形成機制至今并不清楚。在滇南小耳豬中，六白毛色比例較高，并且大量個體出現(xiàn)了不完全六白的特征，給該家豬品種的選育帶來了困難。

課題組對17頭具有六白毛色表型和14頭全黑表型的滇南小耳豬進行了全基因組測序，利用比較基因組學(xué)分析手段并結(jié)合大規(guī)模群體基因分型驗證，從分子層面揭示了調(diào)控滇南小耳豬六白毛色的遺傳機制。結(jié)果顯示，滇南小耳豬的六白毛色并非由MC1R基因突變導(dǎo)致，而是受到多個基因共同調(diào)控的復(fù)雜性狀；CNTLN、PINK1和EDNRB三個基因的變異共同解釋了滇南小耳豬群體中約20%的毛色表型變異；在六白個體中，EDNRB基因上游一段跨物種保守的CEBPB識別motif發(fā)生突變，可能導(dǎo)致了基因表達的改變。