李寧,馬駿
(天津醫(yī)科大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)學(xué)系,天津300070)
論著
長(zhǎng)鏈非編碼RNA HOTAIR在膀胱癌中的表達(dá)及臨床意義
李寧,馬駿
(天津醫(yī)科大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)學(xué)系,天津300070)
目的:探討長(zhǎng)鏈非編碼RNA HOTAIR在膀胱癌組織與癌旁正常組織的表達(dá)差異,了解HOTAIR與膀胱癌惡性程度、進(jìn)展及預(yù)后的相關(guān)性。方法:采用qRT-PCR方法檢測(cè)88例膀胱癌組織與癌旁正常組織中HOTAIR RNA的差異表達(dá),分析HOTAIR表達(dá)水平與患者臨床病理特征的關(guān)系,采用Kapaln-Meier生存分析及COX比例風(fēng)險(xiǎn)回歸模型分析HOTAIR表達(dá)水平與膀胱患者預(yù)后的相關(guān)性。結(jié)果:膀胱癌組織中HOTAIR RNA表達(dá)明顯高于癌旁正常組織,HOTAIR RNA高表達(dá)與腫瘤高分級(jí)及臨床高分期有關(guān)(P<0.05),HOTAIR高表達(dá)組膀胱癌患者5年生存率明顯低于HOTAIR低表達(dá)組(P<0.05),COX回歸分析提示HOTAIR RNA高表達(dá)可能為膀胱癌不良預(yù)后的獨(dú)立危險(xiǎn)因子之一。結(jié)論:長(zhǎng)鏈非編碼RNA HOTAIR與膀胱癌發(fā)生發(fā)展及其惡性程度相關(guān),HOTAIR可以作為預(yù)測(cè)膀胱癌患者生存率的分子標(biāo)志物。
長(zhǎng)鏈非編碼RNA;HOTAIR;膀胱癌
膀胱癌是泌尿生殖系統(tǒng)最常見(jiàn)的惡性腫瘤之一,據(jù)美國(guó)國(guó)家癌癥研究所統(tǒng)計(jì),2014年美國(guó)有74 690例新發(fā)膀胱癌病例,其中男性56 390例,女性18 300例,并有15 580例患者死于膀胱癌[1]。我國(guó)膀胱癌發(fā)病率低于歐美國(guó)家,但近10年來(lái)其發(fā)病率逐年增加[2]。75%的新發(fā)膀胱癌為非肌層浸潤(rùn)性膀胱癌,非肌層浸潤(rùn)性膀胱癌具有較高的復(fù)發(fā)率,并有一部分發(fā)展為肌層浸潤(rùn)性膀胱癌[3-4],這使得膀胱癌成為治療花費(fèi)最多的惡性腫瘤之一[5]。肌層浸潤(rùn)性膀胱癌患者的預(yù)后較差,約有50%的肌層浸潤(rùn)性膀胱癌患者在診斷后3年發(fā)生轉(zhuǎn)移和死亡[6]。目前膀胱癌的治療選擇和預(yù)后判斷主要依賴臨床分期和病理分級(jí),然而具有同樣臨床和病理特點(diǎn)的病人,預(yù)后卻存在著極大的不同,因此迫切需要尋找到有助于膀胱癌早期診斷和預(yù)后判斷的新的生物指標(biāo)[7]。近年來(lái)研究發(fā)現(xiàn)長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long noncoding RNA,lncRNA)在正常細(xì)胞與腫瘤細(xì)胞的基因表達(dá)調(diào)控中起著重要作用,并且lncRNA的異常表達(dá)與腫瘤發(fā)生、進(jìn)展密切相關(guān);lncRNA可以作為腫瘤預(yù)后的判斷指標(biāo)及新的治療靶點(diǎn)[8]。HOTAIR是第一個(gè)被發(fā)現(xiàn)的具備反式調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄作用的lncRNA,近年來(lái)的研究證明HOTAIR在多種惡性腫瘤中高表達(dá),在腫瘤的發(fā)生發(fā)展中具有重要作用,其表達(dá)量與腫瘤的轉(zhuǎn)移、進(jìn)展及預(yù)后有著重要聯(lián)系[9]。而目前膀胱癌中HOTAIR的研究相對(duì)較少,我們擬通過(guò)檢測(cè)膀胱癌組織HOTAIR的表達(dá)情況,分析其與膀胱癌臨床病理參數(shù)的相關(guān)性,明確其對(duì)膀胱癌預(yù)后的指示作用。
1.1 組織標(biāo)本 本研究88例組織標(biāo)本來(lái)源于天津某醫(yī)院2006-2008年經(jīng)全膀胱手術(shù)切除的膀胱癌組織及癌旁正常組織,其中男性患者77例,女性患者11例,患者術(shù)前未行放療、化療,所有標(biāo)本在手術(shù)切除離體后立即置入液氮冷凍,后轉(zhuǎn)入-80℃條件下低溫保存,取距離腫瘤邊緣3cm以上的正常膀胱黏膜作為對(duì)照組,所有組織標(biāo)本均經(jīng)病理學(xué)檢查確認(rèn)?;颊呔押炇鹬橥鈺?shū),并經(jīng)倫理委員會(huì)批準(zhǔn)。
1.2 主要試劑 PCR引物(北京六合華大基因科技有限公司),TRIZOL試劑(AppliedInvitrogen,Carlsbad, CA,USA),逆轉(zhuǎn)錄試劑盒(PrimeScript RT-PCR kit; Takara Bio),F(xiàn)astStart Universal SYBR Green Master(Roche)。
1.3 實(shí)驗(yàn)方法
1.3.1 總RNA提取及逆轉(zhuǎn)錄 按照說(shuō)明書(shū)要求,使用TRIZOL提取膀胱癌組織及癌旁正常組織中的總RNA,1 μg總RNA在20 μL體系中應(yīng)用逆轉(zhuǎn)錄試劑盒按照說(shuō)明進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng),將cDNA凍存于-80℃冰箱備用。
1.3.2 實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)膀胱癌組織及癌旁組織中HOTAIR RNA的表達(dá) HOTAIR上游引物: 5′-CAGTGGGGAACTCTGACTCG-3′,下游引物:5′-GTGCCTGGTGCTCTCTTACC-3′,產(chǎn)物長(zhǎng)度94 bp。GAPDH上游引物:5′-GAAGGTGAAGGTCGGAGTC-3′,下游引物:5′-GAAGATGGTGATGGGATTTC-3′,產(chǎn)物長(zhǎng)度226 bp。按實(shí)時(shí)熒光定量PCR試劑盒說(shuō)明書(shū),以20 μL反應(yīng)體系進(jìn)行擴(kuò)增,陰性對(duì)照用1 μL DEPC處理的超純水代替cDNA模板。反應(yīng)條件:95℃10min;95℃15 s;60℃1 min;45個(gè)循環(huán)反應(yīng)。實(shí)時(shí)熒光定量PCR結(jié)果用2T-△△C法進(jìn)行分析,所有實(shí)驗(yàn)均重復(fù)3次。
1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 采用SPSS19.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)管理和統(tǒng)計(jì)分析,癌組織及癌旁組織中HOTAIR的表達(dá)量以s表示,組間表達(dá)差異分析采用t檢驗(yàn);定性資料采用χ2檢驗(yàn);應(yīng)用Kaplan-Meier生存分析和Log-Rank檢驗(yàn)分析HOTAIR表達(dá)量與膀胱癌患者預(yù)后關(guān)系;采用COX比例風(fēng)險(xiǎn)回歸模型分析膀胱癌患者預(yù)后的危險(xiǎn)因素,檢驗(yàn)水準(zhǔn)為雙側(cè)α=0.05。
2.1 膀胱癌組織與癌旁正常組織中HOTAIR RNA的表達(dá)情況 RT-PCR結(jié)果顯示,HOTAIR RNA在88例膀胱癌組織中的表達(dá)量明顯高于癌旁正常組織,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(4.026±0.290 vs 1.424±0.106,P<0.05,圖1)。
圖1 膀胱癌組織及癌旁正常組織中HOTAIR RNA的相對(duì)表達(dá)量Fig 1 RelativelevelofHOTAIRinbladdercancertissuesandadjacent non-cancer tissues
2.2 膀胱癌組織中HOTAIR RNA表達(dá)量與臨床病理關(guān)系 根據(jù)膀胱癌組織中的HOTAIR RNA的平均表達(dá)量確定膀胱癌組織中HOTAIR RNA的高低表達(dá)情況。采用χ2檢驗(yàn)分析HOTAIR RNA表達(dá)情況與膀胱癌臨床病理指標(biāo)相關(guān)性。高表達(dá)的HOTAIR RNA與病理分期(P<0.001)、分級(jí)密切相關(guān)(P=0.001),與患者年齡、性別、吸煙史、腫瘤大小沒(méi)有相關(guān)性(表1)。
表1 癌組織中HOTAIR表達(dá)量與臨床病理參數(shù)的關(guān)系Tab 1 Association between HOTAIR expression and various clinicopath ological factors of bladder cancer patients
2.3 HOTAIR RNA表達(dá)量對(duì)膀胱癌患者生存時(shí)間的影響 采用Kaplan-Meier生存曲線分析膀胱癌組織中HOTAIR RNA表達(dá)情況對(duì)膀胱癌患者5年生存率的影響,HOTAIR RNA高表達(dá)組膀胱癌患者5年生存率低于HOTAIR RNA低表達(dá)組,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.001,Log-Rank檢驗(yàn),圖2)。進(jìn)一步通過(guò)COX比例風(fēng)險(xiǎn)回歸分析模型分析了與膀胱癌患者預(yù)后相關(guān)的影響因素:單因素分析顯示,病理分期,HOTAIR的表達(dá)水平為影響膀胱癌患者5年生存率的危險(xiǎn)因素;多因素分析顯示,膀胱癌組織中HOTAIR的表達(dá)水平,可以作為膀胱癌患者5年生存率的獨(dú)立預(yù)測(cè)因子(表2)。
圖2 膀胱癌不同HOTAIR表達(dá)組患者生存率Fig 2 The overall survival rate of patients estimated according to the HOTAIR expression level in bladder cancer patients
表2 COX比例風(fēng)險(xiǎn)模型分析患者生存影響因素Tab 2 Univariate and multivariate analysis of prognostic factors with respect to 5-year overall survival of patients with bladder cancer
基因表達(dá)的異常調(diào)控在腫瘤發(fā)生發(fā)展過(guò)程中起到了重要作用。一般情況下,人類常染色體中幾乎所有核苷酸都有轉(zhuǎn)錄現(xiàn)象[10]。隨著基因組測(cè)序計(jì)劃的完成以及新一代深度測(cè)序技術(shù)的應(yīng)用,人們發(fā)現(xiàn)哺乳動(dòng)物中多于95%的轉(zhuǎn)錄序列為非編碼RNA[11]。lncRNA是長(zhǎng)度大于200 bp的非編碼RNA分子,與micoRNA不同,lncRNA研究尚處于起步階段。越來(lái)越多的研究開(kāi)始將lncRNA與疾病聯(lián)系起來(lái),其表達(dá)異常能夠引起一系列疾病包括腫瘤的發(fā)生發(fā)展。HOTAIR是lncRNAs的成員之一,轉(zhuǎn)錄本長(zhǎng)度為2.2 kb,定位在人類染色體12q13.13上的HOXC家族的HOXC11基因和HOX12基因之間[12]。在乳腺癌中研究發(fā)現(xiàn),HOTAIR在乳腺癌原發(fā)病灶及轉(zhuǎn)移性病灶中高表達(dá),與乳腺癌的進(jìn)展轉(zhuǎn)移存在重要關(guān)系,為預(yù)測(cè)乳腺癌患者生存率的獨(dú)立危險(xiǎn)因素[9]。在肝癌、胃腸道間質(zhì)瘤以及胰腺癌中亦發(fā)現(xiàn)了HOTAIR的表達(dá)明顯升高,HOTAIR表達(dá)水平與患者生存期呈負(fù)相關(guān)[13-15]。
本研究通過(guò)qRT-PCR檢測(cè)HOTAIR在膀胱癌組織及癌旁正常組織中的差異表達(dá),實(shí)驗(yàn)結(jié)果證實(shí),膀胱癌組織中HOTAIR的表達(dá)量明顯高于癌旁正常組織;結(jié)合臨床病理相關(guān)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,發(fā)現(xiàn)膀胱癌組織中HOTAIR的表達(dá)量與膀胱癌高分期、分級(jí)密切相關(guān),而與患者年齡,性別,吸煙史,腫瘤大小沒(méi)有相關(guān)性。據(jù)此我們推測(cè)HOTAIR可能與膀胱癌的發(fā)生進(jìn)展存在相關(guān)性。為了證實(shí)這一推測(cè),筆者采用Kaplan-Merier生存分析方法檢驗(yàn)了不同HOTAIR表達(dá)組膀胱癌患者5年生存率的差異,HOTAIR高表達(dá)組膀胱癌患者5年生存率明顯低于HOTAIR低表達(dá)組,差異具有明顯的統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。進(jìn)一步的COX回歸分析證實(shí),高表達(dá)的HOTAIR為膀胱癌不良預(yù)后的獨(dú)立危險(xiǎn)因子之一。本研究也檢測(cè)了Ta/T1期膀胱癌患者中HOTAIR的表達(dá)情況,發(fā)現(xiàn)HOTAIR高表達(dá)為膀胱癌復(fù)發(fā)的預(yù)測(cè)因素之一[16]。筆者納入的研究標(biāo)本皆取自全膀胱切除患者組織標(biāo)本,其中Ta/T1期患者34例,T2-T4期患者54例,通過(guò)分析不同HOTAIR表達(dá)組患者5年生存率的差異,進(jìn)一步證實(shí)了HOTAIR對(duì)膀胱癌預(yù)后的提示作用。據(jù)此推測(cè)HOTAIR與膀胱癌的發(fā)生進(jìn)展密切相關(guān),但其調(diào)控膀胱癌發(fā)生進(jìn)展的具體機(jī)制尚不明確,我們將進(jìn)一步通過(guò)體外體內(nèi)試驗(yàn),分析HOTAIR調(diào)控膀胱癌進(jìn)展的具體機(jī)制。
膀胱癌臨床病理分期分級(jí)對(duì)膀胱癌的治療選擇及預(yù)后判斷具有重要的提示作用,然而它們對(duì)于膀胱癌患者預(yù)后的提示、治療方式的選擇同時(shí)存在一定的局限性,尤其是對(duì)于行膀胱癌電切的患者,存在病理分期分級(jí)偏低的可能,而且具有同樣病理分期分級(jí)的患者,預(yù)后也大不相同[17]。筆者將進(jìn)一步擴(kuò)大研究的樣本量,在更多的樣本中去驗(yàn)證HOTAIR表達(dá)量對(duì)膀胱癌患者預(yù)后的提示作用,為膀胱癌的個(gè)體化治療提供參考。
綜上所述,我們的研究證實(shí)HOTAIR在膀胱癌組織中高表達(dá),高表達(dá)的HOTAIR與膀胱癌病理分期、分級(jí)密切相關(guān),可以作為膀胱癌惡性程度判斷的輔助指標(biāo),高表達(dá)的HOTAIR可以作為膀胱癌預(yù)后監(jiān)測(cè)重要分子標(biāo)志物。
[1]Siegel R,Ma J,Zou Z,et al.Cancer statistics[J].CA Cancer J Clin, 2013,310(9):982
[2]韓蘇軍,張思維,陳萬(wàn)青,等.中國(guó)膀胱癌發(fā)病現(xiàn)狀及流行趨勢(shì)分析[J].癌癥進(jìn)展,2013,11(1):89
[3] van Rhijn B W,Burger M,Lotan Y,et al.Recurrence and progression of disease in non-muscle-invasive bladder cancer:from epidemiology to treatment strategy[J].Eur Urol,2009,56(3):430
[4] Babjuk M,Burger M,Zigeuner R,et al.EAU guidelines on nonmuscle-invasive urothelial carcinoma of the bladder:update 2013 [J].Eur Urol,2013,64(4):639
[5]Yeung C,Dinh T,Lee J.The health economics of bladder Cancer:an updatedreviewofthepublishedliterature[J].Pharmacoeconomics,2014, 32(11):1093
[6]KaufmanDS,ShipleyW,FeldmanAS.Bladdercancer[J].Lancet,2009, 374(9685):239
[7] Jacobs B L,Lee C T,Montie J E.Bladder cancer in 2010 how far have we come[J].CA Cancer J Clin,2010,60(4):244
[8] Cheetham S W,Gruhl F,Mattick J S,et al.Long noncoding RNAs and the genetics of cancer[J].Br J cancer,2013,108(12):2419
[9]Gupta R A,Shah N,Wang K C,et al.Long non-coding RNA HOTAIR reprograms chromatin state to promote cancer metastasis [J].Nature,2010,464(7291):1071
[10]ENCODE Project Consortium,Birney E,Stamatoyannopoulos J A,et al.Identification and analysis of functional elements in 1%of the human genome by the ENCODE pilot project[J].Nature,2007,447(7146):799
[11]Pennisi E.Shining a light on the genome’s’dark matter’[J].Science, 2010,330(6011):1614
[12]Rinn J L,Kertesz M,Wang J K,et al.Functional demarcation of active and silent chromatin domains in human HOX loci by noncoding RNAs[J].Cell,2007,129(7):1311
[13]Ishibashi M,Kogo R,Shibata K,et al.Clinical significance of the expression oflongnon-codingRNA HOTAIR in primary hepatocellular carcinoma[J].Oncol Rep,2013,29(3):946
[14]Niinuma T,Suzuki H,Nojima M,et al.Upregulation of miR-196a and HOTAIR drive malignant character in gastrointestinal stromal tumors[J].Cancer Res,2012,72(5):1126
[15]Kim K,Jutooru I,Chadalapaka G,et al.HOTAIR is a negative prognostic factor and exhibits pro-oncogenic activity in pancreatic Cancer[J].Oncogene,2013,32(13):1616
[16]Yan T H,Lu S W,Huang Y Q,et al.Upregulation of the long noncoding RNA HOTAIR predicts recurrence in stage Ta/T1 bladder cancer[J].Tumour Biol,2014,35(10):10249
[17]Hussain S A,James N D.Molecular markers in bladder cancer[J]. Semin Radiat Oncol,2005,15(1):3
(2015-09-16修稿)
Clinical significance of HOTAIR expression in patients with bladder cancer
LI Ning,MA Jun
(Department of Epidemiology and Health Statistics,School of Public Health,Tianjin Medical University,Tianjin 300070,China)
Objective:To investigate the HOTAIR expression in bladder cancer tissues and adjacent non-cancerous tissues and its potential relevance to clinicopathological variables and prognosis.Methods:HOTAIR RNA expression was determined by real-time quantitative polymerase chain reaction in 88 pairs of bladder cancer tissues and adjacent non-cancerous tissues.Kapaln-Meier analysis and COX proportional hazards regression models were used to investigate the correlation between HOTAIR expression and prognosis of bladder cancer patients.Results:This study showed that the expression level of HOTAIR in bladder cancer tissues was significantly higher than those in non-cancerous tissues.The results indicated that high expression of HOTAIR in bladder cancer was associated with advanced stage and high grade(P<0.05).Kapaln-Meier survival analysis suggested that patients with high HOTAIR expression was associated with poor overall survival(P<0.05).Multivariate analysis revealed that HOTAIR expression was an independent predictor of overall survival. Conclusions:HOTAIR might play a positive role in bladder cancer development and could serve as an biomarker for overall survival of bladder cancer.
long non-coding RNA;HOTAIR;bladder cancer
R737.14
A
1006-8147(2016)02-0126-03
李寧(1984-),女,碩士在讀,研究方向:流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)學(xué);通信作者:馬駿,E-mail:majun@tmu.edu.cn。
天津醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào)2016年2期