胡麗梅,張 瑞,鄒軍根(巴中市公安局物證鑒定所,四川 巴中 636099)
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·學(xué)術(shù)爭鳴·
接觸性生物檢材DNA提取方法的比較
胡麗梅,張瑞,鄒軍根
(巴中市公安局物證鑒定所,四川 巴中 636099)
關(guān)鍵詞:法醫(yī)遺傳學(xué);提取法;接觸性生物檢材;Chelex-100法;DNA IQTMSystem
在現(xiàn)代犯罪行為中,現(xiàn)場物證呈現(xiàn)多樣化、微量化的趨勢,接觸性生物檢材所占比例越來越大。接觸性生物檢材DNA模板量低,檢驗分型效果不穩(wěn)定,隨著法醫(yī)DNA檢驗技術(shù)的不斷提高、各種純化試劑盒和檢驗設(shè)備的研發(fā)和應(yīng)用,其檢出率逐漸提高[1-2]。本研究采用Chelex-100法與DNA IQTMSystem(DC6700,美國Promega公司)分別對本實驗室近年來實際檢案中的接觸性檢材進行DNA提取,分析比較兩種方法的提取效果,報道如下。
1.1材料
57份接觸性生物檢材中,瓶口、吸管類檢材29份,手柄類工具檢材17份,口罩、手套、衣物類檢材11份,均來自本實驗室日常檢案。
1.2方法
29份瓶口、吸管類檢材和17份手柄類工具檢材,采用普通醫(yī)用棉簽干濕兩步法進行擦拭提?。?1份口罩、手套、衣物類檢材,采用脫落細胞粘取器(公安部物證鑒定中心)粘取。以上檢材均取適量后分為兩份,分別采用Chelex-100法和DNA IQ純化法提取DNA。
Chelex-100法:檢材放入1.5mL的微量離心管,加入100 μL Chelex-100混懸液及3 μL蛋白酶K,56℃水浴30min,100℃煮沸8min,以離心半徑5cm,13000r/min,離心4min,取上清液適量擴增。
DNA IQ純化法:檢材置于1.5mL的微量離心管中,加入DNA IQTMSystem裂解液300 μL及1 mol/L DTT 3μL,95℃煮沸30min,套管離心,去載體后加入3μL磁珠,混勻后室溫放置10min,旋渦振蕩后將微量離心管放在磁架上,小心吸去液體,然后用100μL洗液洗滌3次,室溫下空氣干燥10min,加入30μL的純水,65℃ 5min進行洗脫,取洗脫液適量進行擴增。
使用Identifiler?Plus試劑盒(美國AB公司),10μL反應(yīng)體系,在9700型PCR擴增儀(美國AB公司)上進行28次循環(huán)擴增,擴增產(chǎn)物在3130xl型遺傳分析儀(美國AB公司)上進行電泳檢測,采用GeneMapper ID v3.2軟件進行數(shù)據(jù)分析。
通過對上述檢驗圖譜進行分析統(tǒng)計,DNA IQTMSystem檢出率明顯高于Chelex-100法,結(jié)果見表1。
表1 兩種DNA提取方法效果比較?。鄯荩?)]
瓶口、吸管類檢材兩種方法檢出率均較高,尤其采用DNA IQ純化法時更高,且峰型均衡、無雜峰,峰高基本在1 000 RFU以上,大多數(shù)為單一來源;采用DNA IQ純化法檢驗結(jié)果<9個基因座的案例中,有2例瓶口無瓶蓋,2例吸管包裝不當,可能致DNA降解嚴重。
手柄工具及口罩、手套、衣物類檢材,Chelex-100法的檢出率均不高;使用DNA IQ純化法提取,檢出率均有明顯提高,峰高基本在1000~2000RFU,但多
Chelex-100法提取DNA,因其操作簡便快捷、價格便宜、儀器設(shè)備要求低、在同一管中操作、檢材損失低、相對不易污染而廣泛用于常規(guī)檢材的DNA提?。?-3],但對微量、腐敗、降解檢材的DNA提取有一定的局限性,如本研究使用該方法處理手柄工具及口罩、手套、衣物類檢材檢出率較低,分別為35.29%、18.18%,明顯低于DNA IQ純化法的70.58%、72.72%。
DNA IQ純化法提取DNA,在高濃度硫氰酸胍和鹽酸胍等存在的條件下,核酸吸附到二氧化硅上,而在低鹽條件下核酸被洗脫下來,運用該系統(tǒng)提取DNA或?qū)helex-100法提取的DNA進行純化,成功率得到普遍提高。當然該方法操作較繁瑣,不適合大批量檢材的提取,如采用自動化工作站進行提?。?],更省時、簡便。
參考文獻:
[1]王彥濤,宋道江.M48磁珠法和Chelex-100法提取脫落細胞DNA的初步比較[J].刑事技術(shù),2013,(2):53-54.
[2]楊電,張麗萍,劉超,等.Chelex-100和兩種磁珠法提取接觸DNA效果的比較[J].刑事技術(shù),2012,(1):11-13.
[3]范生貴,王興俊,王得椿.不同方法提取生物檢材DNA的比較研究[J].生物技術(shù)世界,2014,(4):121.
[4]楊電,劉超,徐曲毅,等.DNA IQ磁珠法結(jié)合MaxwellTM16自動儀提取接觸DNA[J].刑事技術(shù),2011,(3):3-5.
(本文編輯:李成濤)
中圖分類號:DF795.2
文獻標志碼:B
doi:10.3969/j.issn.1004-5619.2016.03.013
文章編號:1004-5619(2016)03-0215-02
作者簡介:胡麗梅(1984—),女,主要從事法醫(yī)物證學(xué)研究;E-mail:261031103@qq.com數(shù)檢出混合圖譜。
收稿日期:(2015-08-24)