田大為,胡向軍,宋 蕾,彭瑞云,賈宏博 綜述 王麗峰 審校
?
NMDA受體基因單核苷酸多態(tài)性與神經(jīng)系統(tǒng)疾病的關(guān)聯(lián)研究
田大為1,2,胡向軍3,宋蕾4,彭瑞云3,賈宏博1綜述王麗峰3審校
1.100142北京,空軍航空醫(yī)學(xué)研究所;2.710032西安,第四軍醫(yī)大學(xué)航空航天醫(yī)學(xué)系航空航天生物動(dòng)力學(xué)教研室;3.100850北京,軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院放射與輻射醫(yī)學(xué)研究所;4.100720北京,空后衛(wèi)生部門(mén)診部
【關(guān)鍵詞】NMDA受體基因;SNP;神經(jīng)系統(tǒng)疾病
神經(jīng)系統(tǒng)由其結(jié)構(gòu)單位-神經(jīng)元組成,這使得神經(jīng)系統(tǒng)構(gòu)成了人類(lèi)組織器官中最為復(fù)雜的系統(tǒng),其作用機(jī)制是受多種因素調(diào)節(jié)的復(fù)雜生理過(guò)程。神經(jīng)系統(tǒng)疾病是神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)生的器質(zhì)性疾病,除受外界環(huán)境因素影響外,還受遺傳因素影響。已有大量的研究報(bào)道了神經(jīng)遞質(zhì)與神經(jīng)系統(tǒng)疾病之間的關(guān)系,其研究的深入可能為神經(jīng)系統(tǒng)疾病的防診治提供客觀的預(yù)測(cè)和監(jiān)測(cè)指標(biāo)。
谷氨酸( glutamate,Glu) 是中樞神經(jīng)系統(tǒng)重要的興奮性神經(jīng)遞質(zhì)之一,其中N-甲基-D-天門(mén)冬氨酸 (N-methyl-D-aspartate,NMDA)受體近年來(lái)逐漸受到重視,NMDA受體被普遍認(rèn)為是學(xué)習(xí)記憶中的關(guān)鍵物質(zhì)且參與長(zhǎng)時(shí)程增強(qiáng)(long-term potentiation,LTP)的形成和維持。
隨著人類(lèi)基因組序列的繪制完成,生命科學(xué)領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)正迅速轉(zhuǎn)向如何系統(tǒng)地研究和解讀基因結(jié)構(gòu)、功能與遺傳疾病之間的聯(lián)系。單核苷酸多態(tài)性( single nucleotidepolymorphism, SNP) ,作為基因組中最普遍的序列差異,在復(fù)雜性疾病與基因的關(guān)聯(lián)研究中發(fā)揮著重要作用,其意義的闡明有助于了解人類(lèi)基因的功能,并為復(fù)雜性疾病的評(píng)估、預(yù)測(cè)、預(yù)防、診斷和治療的突破提供重要的參考依據(jù)。筆者就NMDA受體基因SNP與神經(jīng)系統(tǒng)疾病關(guān)聯(lián)的相關(guān)研究作一綜述。
1NMDA受體結(jié)構(gòu)和功能
神經(jīng)科學(xué)的研究表明,谷氨酸是人類(lèi)中樞神經(jīng)系統(tǒng)內(nèi)最重要的興奮性神經(jīng)遞質(zhì),參與神經(jīng)系統(tǒng)多種重要功能的調(diào)節(jié)[1]。根據(jù)跨膜信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)機(jī)制的不同,Glu受體可分成兩大類(lèi):促離子型谷氨酸受體( ionotropic glutamater -eceptor,iGluR) 和促代謝型谷氨酸受體(metabotropicglutamate receptor,mGluR)。在iGluRs家族內(nèi),根據(jù)受體激動(dòng)劑的不同,又分為NMDA受體與非NMDA受體。NMDA受體有復(fù)雜的分子結(jié)構(gòu)和獨(dú)特的分子特性,涉及腦的很多重要功能如記憶和學(xué)習(xí)密切相關(guān)的LTP和長(zhǎng)時(shí)程抑制(long term depression,LTD)效應(yīng)與NMDA受體關(guān)系密切[2,3];大腦神經(jīng)元的數(shù)目及其連接的數(shù)目都受到NMDA受體活動(dòng)的影響,其活動(dòng)的異??赡苡绊懮窠?jīng)元的可塑性,從而導(dǎo)致中樞神經(jīng)系統(tǒng)的功能紊亂。因此, NMDA受體已成為治療某些神經(jīng)精神性疾病的靶點(diǎn)。
1.1NMDA受體的功能區(qū)及分子構(gòu)型NMDA受體至少包含2種亞基,核心亞基(NR1)和強(qiáng)化亞基(NR2)。NR1和NR2中的任何一個(gè)亞單位都不能單獨(dú)構(gòu)成有功能的同寡聚體通道,NR2四個(gè)亞單位中的一個(gè)或幾個(gè)必須和NR1共同構(gòu)建成為異寡聚體,才可形成高活性的NMDA受體通道,提示NR1亞單位對(duì)NMDA受體通道功能是必須的[4]。
近年研究證明,人的NR1基因跨度約29.6 kb,含20個(gè)外顯子,與鼠腦NR1基因類(lèi)似,有8種序列不同的轉(zhuǎn)錄體,其5’側(cè)翼啟動(dòng)子區(qū)有兩個(gè)完整的果蠅even -skipping蛋白識(shí)別序列。大鼠的NR1基因總長(zhǎng)度為26.6 kb,含20個(gè)外顯子。小鼠基因的NR1總長(zhǎng)度為26.7 kb,含20個(gè)外顯子。
人類(lèi)NR2A基因定位于16p13.2,長(zhǎng)約429.35 kb,含14個(gè)外顯子;大鼠NR2A基因定位于10q11,長(zhǎng)約416.55 kb,含14個(gè)外顯子;小鼠NR2A基因定位于16A1; 16 3.4 cm,長(zhǎng)約414.82 kb,含12個(gè)外顯子。
人類(lèi)的NR2B總長(zhǎng)度為418.6 kb,含13個(gè)外顯子。大鼠的NR2B基因的總長(zhǎng)度為461.2 kb,含13個(gè)外顯子,是一種分子量約180 kda的跨膜糖蛋白,脫糖化后分子量為160 kDa左右,其基因有45個(gè)氨基酸序列,由1456個(gè)氨基酸組成,氨基酸殘基數(shù)為1482,特定氨基酸殘基1362-1406。小鼠的NR2B基因總長(zhǎng)度為443.7 kb,含15個(gè)外顯子。
1.2NMDA受體的調(diào)控
1.2.1基因轉(zhuǎn)錄對(duì)NMDA受體表達(dá)的影響NMDA受體亞基轉(zhuǎn)錄時(shí)可有多個(gè)起始位點(diǎn),各個(gè)位點(diǎn)周?chē)膲A基可以影響基因的表達(dá)。Bai[5]通過(guò)對(duì)大鼠NR1上游3 kb進(jìn)行測(cè)序和啟動(dòng)子功能試驗(yàn),發(fā)現(xiàn)從轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)到上游356 bp的區(qū)域?yàn)镹R1啟動(dòng)子的核心區(qū)域,并且有SP-1、AP-2、GSG等多個(gè)轉(zhuǎn)錄結(jié)合元件結(jié)合在核心啟動(dòng)子區(qū),在上游3 kb的范圍內(nèi)還有多個(gè)轉(zhuǎn)錄結(jié)合位點(diǎn)與AP-1、Repeats、CTF、CRE、MEF2-C等轉(zhuǎn)錄元件結(jié)合。NR2B主要起始位點(diǎn)周?chē)?50個(gè)堿基可影響NR2B的表達(dá),NR2B啟動(dòng)子缺乏TATA和CAAT盒,C/G含量>60%,因此,NR2B基因具有典型的管家基因特性。Klein等[6]對(duì)人NR2B基因啟動(dòng)區(qū)進(jìn)行測(cè)序并進(jìn)行功能實(shí)驗(yàn),發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)到上游541bp的區(qū)域?yàn)镹R2B啟動(dòng)子的重要調(diào)控區(qū)域,并且含有4個(gè)SP1和一個(gè)CREB轉(zhuǎn)錄結(jié)合元件。Sasner和Buonnano等[7,8]研究發(fā)現(xiàn)大鼠NR2B啟動(dòng)子上有一段長(zhǎng)約800個(gè)堿基對(duì)的序列決定了NR2B表達(dá)的神經(jīng)元依賴性,在NR2B基因上游356bp范圍為核心啟動(dòng)子區(qū),具有4個(gè)轉(zhuǎn)錄因子SP1和一個(gè)CREB的結(jié)合位點(diǎn),表明NR2B基因本身就是突觸后神經(jīng)元Ca2+通路上的靶基因之一。Miyatake等[9]對(duì)小鼠NR2B基因啟動(dòng)區(qū)進(jìn)行測(cè)序并結(jié)合軟件分析,發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)到上游420 bp的區(qū)域?yàn)镹R2B啟動(dòng)子區(qū)的重要調(diào)控區(qū)域,該區(qū)域包括SP1、GATA-2、CREB等轉(zhuǎn)錄結(jié)合位點(diǎn)。
1.2.2翻譯對(duì)NMDA受體表達(dá)的影響NR2A的5′非翻譯區(qū)含有282個(gè)堿基。Wood等[10]在離體研究時(shí)發(fā)現(xiàn),NR2A的mRNA擁有不同的5′非翻譯區(qū),如果移去大多數(shù)的282bp的mRNA的5′非翻譯區(qū)可使NR1、NR2A介導(dǎo)的電生理反應(yīng)放大100倍,如僅移去其上游的AUG則只增加其對(duì)受體的翻譯。
NR2B含有一個(gè)超過(guò)其他NMDA亞單位的長(zhǎng)5′-UTR,含有1199個(gè)堿基對(duì)[6]。在含ATG起始編碼的4號(hào)外顯子上有3個(gè)分散的未翻譯的外顯子分布在20 kb的區(qū)域內(nèi)。在剪接過(guò)程中可形成兩個(gè)不同的剪接變體,分別含有或缺失2號(hào)外顯子,其中以不含2號(hào)外顯子的形式居多。在5′-UTR中還有多個(gè)ATG編碼,形成9個(gè)短的UOFs,主要分布于3號(hào)外顯子上,與轉(zhuǎn)錄后調(diào)控有關(guān)。
2NMDA受體基因SNP與神經(jīng)系統(tǒng)疾病的關(guān)聯(lián)
SNP是DNA多態(tài)性的一種,為DNA序列中單堿基的差異。絕大多數(shù)復(fù)雜性狀疾病都是由遺傳因素與環(huán)境因素相互作用的多基因病,就是這些SNP造成人群和個(gè)體在各種表現(xiàn)型上的差異,表現(xiàn)在體質(zhì)特征、運(yùn)動(dòng)能力、疾病易感性,以及心智等各個(gè)方面。根據(jù)SNP在NMDA受體基因中的位置,SNP可分為受體基因編碼區(qū)SNP(coding SNP,cSNP)、受體基因內(nèi)含子區(qū)SNP和受體基因調(diào)控區(qū)SNP(regulatory SNP,rSNP)。其中cSNP根據(jù)是否改變編碼的氨基酸又可分為同義cSNP(synonymouscSNP)和非同義cSNP(non—synonymous cSNP)。
非同義cSNP,由于其改變編碼的氨基酸,對(duì)NMDA受體基因功能的影響較直觀,近來(lái)有研究表明,非同義cSNP可通過(guò)影響NMDA受體基因產(chǎn)物,引起細(xì)胞信號(hào)通路方面的改變[11]。同義cSNP由于其不改變編碼的氨基酸,過(guò)去一直認(rèn)為它不會(huì)改變NMDA受體基因的功能。近來(lái),隨著這方面研究的日益深入,人們發(fā)現(xiàn)同義cSNP也可影響NMDA受體基因的功能,同義cSNP通過(guò)引起核糖體通過(guò)mRNA特定區(qū)域時(shí)速度的加快或變慢,影響翻譯動(dòng)力學(xué),最終使蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能發(fā)生改變[12]。內(nèi)含子區(qū)SNP與基因功能的關(guān)系方面,通過(guò)關(guān)聯(lián)分析和生化、細(xì)胞水平分析,近來(lái)研究表明:NR2B基因rs1806201基因型頻率和單倍體與酒精中毒的關(guān)系密切[13]。在調(diào)控區(qū)rSNP影響NMDA受體基因功能的研究方面,通過(guò)關(guān)聯(lián)分析表明,基因調(diào)控區(qū)的rSNP可通過(guò)影響啟動(dòng)子元件來(lái)調(diào)節(jié)NMDA受體基因的功能[14]。
目前,已有研究就不同人群NMDAR不同亞型受體基因多態(tài)性與精神分裂癥、阿爾茨海默病、酒精中毒癥、雙相性精神障礙等神經(jīng)系統(tǒng)疾病的關(guān)聯(lián)進(jìn)行了探討,部分研究發(fā)現(xiàn)了NMDA受體基因與上述疾病存在關(guān)聯(lián)性[15]。
2.1SNP與阿爾茨海默病(Alzheimer disease,AD)的關(guān)聯(lián)性Jiang和Jia[14]在中國(guó)北方漢族群體中檢測(cè)了362名AD患者NR2B基因位于啟動(dòng)子區(qū)4個(gè)SNP,分別為-200T/G(rs1019385),-421C/A(rs3764028),-1447T/C(ENS105578和-1497G/A(rs12368476),發(fā)現(xiàn)-421CC基因型比CA和AA基因型患AD的概率高,對(duì)比-421A、NR2B啟動(dòng)子區(qū)-421C等位基因轉(zhuǎn)錄活性降低34.69~39.79%。研究顯示-421C等位基因型能夠引起NR2B轉(zhuǎn)錄活性降低、NR2B蛋白表達(dá)下降,提示-421(rs3764028)與AD相關(guān)聯(lián)。
Zhao等[16]研究了2455名AD患者NR1和NR2A受體中的5個(gè)SNP,通過(guò)分析單個(gè)變異體和多重基因座單倍型發(fā)現(xiàn)位于5′非翻譯區(qū)rs11146020與AD相關(guān)聯(lián),未發(fā)現(xiàn)NR2A SNP與AD 相關(guān)聯(lián)。
Seripa等[17]研究了222例高加索AD患者NR2B 3個(gè)SNP:rs1019385(200T/G,在5′末端G置換T), rs1806201(2664 G / A,在外顯子13 A轉(zhuǎn)換G), rs890(5072 T/G,在3′末端G置換T),未發(fā)現(xiàn)與AD相關(guān)聯(lián)。
Liou等[18]研究了275例長(zhǎng)期接受抗精神病藥物治療的AD患者(其中患遲發(fā)性運(yùn)動(dòng)障礙TD患者142例,未患遲發(fā)性運(yùn)動(dòng)障礙TD患者133例)NR2B 3個(gè)SNP-200G/T, 366G /C和2664T/C,并未發(fā)現(xiàn)患者的基因型和等位基因頻率和TD密切相關(guān)。
2.2SNP與精神分裂癥(schizophrenia,SP)的關(guān)聯(lián)Ohtsuki等[19]在日本人群中研究發(fā)現(xiàn)NR2B 的最后一個(gè)外顯子3′端和366C/G位點(diǎn)存在多態(tài)性并與SP存在關(guān)聯(lián),推測(cè)NR2B 或其連鎖不平衡位點(diǎn)可能成為致病基因。
Qin 等[20]在中國(guó)人群的研究中檢測(cè)了NR1和NR2B基因中5個(gè)SNP,發(fā)現(xiàn)G1001C與T4197C、T5988C在多態(tài)性方面重要的遺傳學(xué)相互作用,并且發(fā)現(xiàn)了上述位點(diǎn)單倍型與SP存在陽(yáng)性關(guān)聯(lián)。
Begni等[11]在意大利人群中研究證實(shí),NR1基因位點(diǎn)上1001G/C 多態(tài)性與SP關(guān)聯(lián),C等位基因可能改變轉(zhuǎn)錄因子NF-кB的共同序列。病例組C等位基因及其純合子與雜合子基因型頻率明顯高于對(duì)照組,因此NR1可能是SP敏感的候選基因之一。
Zhao 等[16]在中國(guó)漢族群體中檢測(cè)了5個(gè)橫跨NR1的SNP,發(fā)現(xiàn)位于5′端非翻譯區(qū)rs11146020 (1001G/C) 的C等位基因在患者組中高頻表達(dá),提示rs11146020是SP候選SNP位點(diǎn)。
2.3SNP與其他神經(jīng)系統(tǒng)疾病的關(guān)聯(lián)Kim等[13]檢測(cè)了206名酒精中毒的韓國(guó)患者NR2B3個(gè)SNP:(rs1806201, rs1805247, and rs1805502),其中rs1806201基因型頻率和單倍體分析顯示患病組和對(duì)照組差異明顯,為酒精中毒癥的候選SNP位點(diǎn)。
Szczepankiewicz 等[21]研究了419例雙相性精神障礙(BDNF)患者NR2B3個(gè)SNP:-200G/T, 366C/G and rs890G/T,未發(fā)現(xiàn)與BDNF相關(guān)聯(lián)。
表1 NMDA受體基因部分SNP位點(diǎn)遺傳多態(tài)性數(shù)據(jù)
Dorval等[22]通過(guò)對(duì)NR2B 205個(gè)核心家族中9個(gè)SNP進(jìn)行檢測(cè),發(fā)現(xiàn)rs2284411和ADHD密切相關(guān)。
以上文獻(xiàn)提示,NMDA受體基因多態(tài)性與神經(jīng)系統(tǒng)疾病密切相關(guān),以下SNP位點(diǎn)可以考慮作為候選位點(diǎn)(表1)。
綜上所述,SNP做為DNA序列變異的主要形式,是決定人類(lèi)復(fù)雜疾病易感性和藥物反應(yīng)性個(gè)體差異的核心信息。目前,復(fù)雜性多基因疾病,是由遺傳和環(huán)境等眾多因素共同作用所致,其中多因素共同作用影響了疾病的表現(xiàn)型,從而隱藏了多態(tài)性的作用。另外,同一基因多態(tài)性在不同種族或不同數(shù)量人群中,得出的結(jié)論可能不同甚至完全相反,遺傳異質(zhì)性的問(wèn)題值得我們關(guān)注。
隨著基因組流行病學(xué)的發(fā)展,NMDA受體基因在中樞神經(jīng)系統(tǒng)疾病發(fā)生發(fā)展中的作用日益受到人們的重視。NMDA受體基因多態(tài)性除與上述疾病有關(guān)外,還可能與其他環(huán)境刺激因素引起的復(fù)雜疾病有關(guān)。因此,研究NMDA受體基因多態(tài)性與復(fù)雜疾病的關(guān)系可從基因水平的角度來(lái)闡述疾病的發(fā)病機(jī)制,為疾病的預(yù)防和治療提供新的途徑。
【參考文獻(xiàn)】
[1]Konradi C, Heckers S. Molecular aspects of glutamate dysregulation: implications for schizophrenia and its treatment[J]. Pharmacol Ther, 2003, 97(2): 153-179.
[2]Shimizu E, Tang Y P, Rampon C,etal. NMDA receptor-dependent synaptic reinforcement as a crucial process for memory consolidation[J]. Science, 2000, 290(5494): 1170-1174.
[3]Wilson M A, Tonegawa S. Synaptic plasticity, place cells and spatial memory: study with second generation knockouts[J]. Trends Neurosci, 1997, 20(3): 102-106.
[4]Luo J, Bosy T Z, Wang Y,etal. Ontogeny of NMDA R1 subunit protein expression in five regions of rat brain[J]. Brain Res Dev Brain Res, 1996, 92(1): 10-17.
[5]Bai G K J. Functional analysis of the proximal 5’-flanking region of the N-methyl-D-aspartate receptor subunit gene, NMDAR1[J]. J Biol Chem,1995,270:7737-7744.
[6]Klein M, Pieri I, Uhlmann F,etal. Cloning and characterization of promoter and 5’-UTR of the NMDA receptor subunit epsilon 2: evidence for alternative splicing of 5’-non-coding exon[J]. Gene, 1998, 208(2):259-269.
[7]Sasner M, Buonanno A. Distinct N-methyl-D-aspartate receptor 2B subunit gene sequences confer neural and developmental specific expression[J]. J Biol Chem, 1996, 271(35): 21316-21322.
[8]Durand G M, Bennett M V, Zukin R S. Splice variants of the N-methyl-D-aspartate receptor NR1 identify domains involved in regulation by polyamines and protein kinase C[J]. Proc Natl Acad Sci USA, 1993, 90(14): 6731-6735.
[9]Miyatake R, Furukawa A, Suwaki H. Identification of a novel variant of the human NR2B gene promoter region and its possible association with schizophrenia[J]. Mol Psychiatry, 2002, 7(10): 1101-1106.
[10]Wood M W, VanDongen H M, VanDongen A M. The 5’-untranslated region of the N-methyl-D-aspartate receptor NR2A subunit controls efficiency of translation[J]. J Biol Chem, 1996, 271(14): 8115-8120.
[11]Begni S, Moraschi S, Bignotti S,etal. Association between the G1001C polymorphism in the GRIN1 gene promoter region and schizophrenia[J]. Biol Psychiatry, 2003, 53(7): 617-619.
[12]Alonso P, Gratacos M, Segalas C,etal. Association between the NMDA glutamate receptor GRIN2B gene and obsessive-compulsive disorder[J]. J Psychiatry Neurosci, 2012, 37(4): 273-281.
[13]Kim J H. Association study of polymorphisms in N-methyl-D-aspartate receptor 2B subunits (GRIN2B) gene with Korean alcoholism[J].Neurosci Res,2006,56:220-223.
[14]Jiang H, Jia J. Association between NR2B subunit gene (GRIN2B) promoter polymorphisms and sporadic Alzheimer's disease in the North Chinese population[J]. Neurosci Lett, 2009, 450(3): 356-360.
[15]Shastry B S. SNP alleles in human disease and evolution[J]. J Hum Genet, 2002, 47(11): 561-566.
[16]Zhao X, Li H, Shi Y,etal. Significant association between the genetic variations in the 5' end of the N-methyl-D-aspartate receptor subunit gene GRIN1 and schizophrenia[J]. Biol Psychiatry, 2006, 59(8): 747-753.
[17]Seripa D, Matera M G, Franceschi M,etal. Association analysis of GRIN2B, encoding N-methyl-D-aspartate receptor 2B subunit, and Alzheimer's disease[J]. Dement Geriatr Cogn Disord, 2008, 25(3): 287-292.
[18]Liou Y J, Wang Y C, Chen J Y,etal. Association analysis of polymorphisms in the N-methyl-D-aspartate (NMDA) receptor subunit 2B (GRIN2B) gene and tardive dyskinesia in schizophrenia[J]. Psychiatry Res, 2007, 153(3): 271-275.
[19]Ohtsuki T, Sakurai K, Dou H,etal. Mutation analysis of the NMDAR2B (GRIN2B) gene in schizophrenia[J]. Mol Psychiatry, 2001,6(2):211-216.
[20]Qin S, Zhao X, Pan Y,etal. An association study of the N-methyl-D-aspartate receptor NR1 subunit gene (GRIN1) and NR2B subunit gene (GRIN2B) in schizophrenia with universal DNA microarray[J]. Eur J Hum Genet, 2005, 13(7): 807-814.
[21]Szczepankiewicz A, Skibinska M, Suwalska A,etal. No association of three GRIN2B polymorphisms with lithium response in bipolar patients[J]. Pharmacol Rep, 2009, 61(3): 448-452.
[22]Dorval K M, Wigg K G, Crosbie J,etal. Association of the glutamate receptor subunit gene GRIN2B with attention-deficit/hyperactivity disorder[J]. Genes Brain Behav, 2007,6(5):444-452.
(2015-12-08收稿2016-03-15修回)
(責(zé)任編輯梁秋野)
基金項(xiàng)目:全軍后勤科研“十二五”重大資助項(xiàng)目(AKJ11J003);全軍后勤科研“十二五”重大資助項(xiàng)目(AKJ11J002)
作者簡(jiǎn)介:田大為,博士研究生,助理研究員。 通訊作者:賈宏博, E-mail:jiahongbo@163.com
【中國(guó)圖書(shū)分類(lèi)號(hào)】R34