劉曉伶,郝建平,付琳
(山西大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,山西太原030006)
山西野生黃芩種質(zhì)資源的RAPD分析
劉曉伶,郝建平,付琳
(山西大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,山西太原030006)
應(yīng)用RAPD分子標(biāo)記技術(shù)對7個山西不同產(chǎn)地的野生黃芩試管植株進行了分析,應(yīng)用SPSS 19.0軟件對結(jié)果進行了聚類分析。結(jié)果表明,5條引物擴增出20條片段,其中,多態(tài)性條帶17條,多態(tài)率為85%;7個野生種質(zhì)的遺傳距離在0~1,可聚為兩類,說明7個不同產(chǎn)地的山西野生黃芩之間存在明顯差異,具有豐富的遺傳多樣性。研究結(jié)果為山西野生黃芩種質(zhì)資源的保護和開發(fā)、利用以及黃芩優(yōu)良種質(zhì)的選育提供了試驗依據(jù)。
黃芩;試管植株;RAPD;遺傳多樣性
黃芩(Scutellaria baicalensis Georgi)為唇形科黃芩屬多年生草本植物,是我國的傳統(tǒng)中藥材,也是最常用和用量最大的中藥材之一,具有清熱燥濕、涼血安胎、解毒等功效[1],其所含的黃芩苷、黃芩素、漢黃芩苷、漢黃芩素等黃酮類衍生物具有抗病原體、抗炎、抗自由基損傷、抗腫瘤、抗過敏、抗氧化、鎮(zhèn)痛、保肝、增強免疫功能以及調(diào)節(jié)中樞神經(jīng)系統(tǒng)等作用[2-4]。黃芩是山西省的道地藥材,全省共有野生黃芩13.52萬hm2,家種黃芩2.91萬hm2,野生資源分布區(qū)域和人工種植面積均位于全國前列[5]。RAPD是常用的遺傳標(biāo)記方法[6-7],通過PCR來反映特異性擴增的DNA片段的多態(tài)性,可以快速有效地進行遺傳多樣性評價[8-12]。馮學(xué)鋒等[13]和邵愛娟等[14]利用RAPD方法分別對黃芩和并頭黃芩樣本以及34個不同種源的黃芩進行了種源間親緣關(guān)系的分析。RAPD分子標(biāo)記技術(shù)在北柴胡[15]、擬南芥[16]、太行菊[17]、蓖麻[18-19]、珍珠黃楊[20]、紫花苜蓿[21]等許多植物中也得到了普遍的應(yīng)用[12-13]。
本研究以山西7個產(chǎn)地的野生黃芩試管植株為材料,應(yīng)用RAPD技術(shù)分析不同種源試管植株的遺傳多樣性。黃芩種質(zhì)間的遺傳背景及親緣關(guān)系的確定,可為不同種質(zhì)的鑒定提供了新的試驗技術(shù)平臺,為山西黃芩種質(zhì)資源的保護和開發(fā)、利用以及優(yōu)良種質(zhì)資源的選育提供科學(xué)依據(jù)。而以試管植株為試驗材料,可以彌補由于個別野生種質(zhì)資源分布稀少所引起的數(shù)量限制,克服由于野生植株生長年限難以確定所帶來的原始誤差,以保證試驗數(shù)據(jù)的可比性和可信度。
1.1 材料
分別在山西省7個不同產(chǎn)地采集野生黃芩植株(種質(zhì)來源如表1所示),并應(yīng)用快速繁殖技術(shù)獲得試管植株。選取生長30 d長勢良好的試管植株的幼嫩葉片作為試驗材料。
表1 山西野生黃芩試管植株種質(zhì)來源
1.2 試驗儀器
Blue pard人工氣候箱(上海一恒科學(xué)儀器有限公司),YXQ-LS立式壓力蒸汽滅菌鍋(上海博迅實業(yè)有限公司醫(yī)療設(shè)備廠),HH-2數(shù)顯恒溫水浴鍋(國華電器有限公司),TGL-16G臺式離心機(上海安亭科學(xué)儀器廠),Eppendorf移液槍,BIOER LifeECO基因擴增儀(杭州博日科技有限公司),DYY-8C型電泳儀(北京市六一儀器廠),ZF-2紫外分析儀(上海嘉鵬科技有限公司)。
1.3 試驗試劑
CTAB,β-巰基乙醇,Tris,EDTA,無水乙醇,異戊醇,氯仿和異丙醇等,均為分析純試劑。
1.4 試驗方法
1.4.1 總DNA的提取采用CTAB法提取DNA。取150mg黃芩試管植株葉片置于研缽中,加入1 mL CTAB提取液置冰上研磨,研磨均勻后倒入2 mL EP管中,65℃水浴2 h,10 000 r/min離心10 min,取上清液加氯仿-異戊醇(24∶1)抽提3次,取上清液加入1/10體積NaAc冰浴10 min后再加入等體積異丙醇,置于4℃過夜沉淀DNA,次日取出后12 000 r/min離心10 min,棄上清液,用70%乙醇洗滌DNA沉淀3次,留沉淀自然風(fēng)干,加20 μL滅菌ddH2O溶解,并根據(jù)OD260值將各基因組DNA稀釋為40 ng/μL濃度,置于-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.4.2 RCR反應(yīng)體系及擴增程序PCR擴增反應(yīng)在20 μL體系中進行,其中含有10×Buffer(含Mg2+)緩沖液2 μL,dNTP 0.63 μL(其中含dATP,dGTP,dTTP,dCTP各10 mmol/L),擴增引物(濃度為10 μmol/L)1 μL,模板DNA稀釋液2.5 μL,Taq聚合酶0.3 μL,ddH2O13.57 μL。
PCR反應(yīng)程序:94℃預(yù)變性5 min;94℃變性1 min,34℃復(fù)性50 s,72℃延伸2 min,37個循環(huán);72℃8 min補齊。4℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.4.3 RAPD擴增產(chǎn)物檢測取5 μLLoadingBuffer與PCR擴增產(chǎn)物混勻,于含4%的GoldenView的質(zhì)量分?jǐn)?shù)為1%的瓊脂糖凝膠上電泳檢測,DNA Marker DL5000作為參照。
1.5 數(shù)據(jù)統(tǒng)計與分析
將PCR產(chǎn)物在瓊脂糖凝膠上同一位置的條帶按有帶(包括顯帶和弱帶)、無帶分別記為“1”和“0”,將試驗結(jié)果轉(zhuǎn)化為數(shù)字形式,用SPSS 19.0軟件分析計算7個處理種之間的遺傳相似系數(shù)及遺傳距離,并繪制聚類圖。
2.1 7種晉產(chǎn)野生黃芩試管植株P(guān)CR擴增結(jié)果
在查詢相關(guān)文獻的基礎(chǔ)上,設(shè)計20條引物,經(jīng)反復(fù)篩選,其中,5條引物擴增的條帶清晰、多態(tài)性良好,可用于RAPD檢測。圖1、圖2為部分引物的擴增結(jié)果。
RAPD統(tǒng)計結(jié)果表明,5條引物共擴增出20條片段,其中,平行性條帶3條,多態(tài)性條帶17條,多態(tài)率為85%(表2)。
表2 山西野生黃芩試管植株的PCR擴增結(jié)果
2.2 7種山西野生黃芩種質(zhì)聚類分析
由表3,4可知,7個不同產(chǎn)地的山西野生黃芩間的遺傳距離在0~1。其中,產(chǎn)自汾陽市后溝村的種質(zhì)與產(chǎn)自朔城區(qū)大蓮花村、右玉縣溝北村、平魯區(qū)烏龍洞的種質(zhì)之間遺傳距離最小,為0;產(chǎn)自沁源縣上灣村的種質(zhì)與產(chǎn)自朔城區(qū)大蓮花村、右玉縣溝北村、平魯區(qū)烏龍洞及汾陽市后溝村的種質(zhì)之間的遺傳距離最大,為1。
表3 7種山西野生黃芩試管苗植株的遺傳距離
表4 7種山西野生黃芩試管植株的遺傳相似系數(shù)
由圖3可知,7個產(chǎn)地的山西野生黃芩種質(zhì)可劃分為2個類群:產(chǎn)自朔城區(qū)大蓮花村、右玉縣溝北村、平魯區(qū)烏龍洞及汾陽市后溝村的種質(zhì)首先聚在一起,然后與沁源縣西王勇村的種質(zhì)聚在一起形成類群Ⅰ;產(chǎn)自交城縣雙家寨村的種質(zhì)與沁源縣上灣村的種質(zhì)遺傳距離較近,首先聚到一起,然后與類群Ⅰ聚到一起形成類群Ⅱ。
7個不同產(chǎn)地的山西野生黃芩試管植株的PCR擴增多態(tài)率達到了85%,說明山西野生黃芩具有豐富的遺傳多樣性,也有著一定程度的相似性。本研究以不同產(chǎn)地的野生黃芩試管植株為試驗材料,不受生長季節(jié)、生長年限以及氣候條件的限制;試管植株生長環(huán)境一致,遺傳穩(wěn)定性相對更高,使試驗結(jié)果更加可靠。
從生長地理位置及環(huán)境來看,產(chǎn)自山西省朔州市大蓮花村、溝北村、烏龍洞以及產(chǎn)自山西省汾陽市后溝村的4種黃芩種質(zhì)的遺傳距離為0;產(chǎn)自山西省長治市沁源縣上灣村和西王勇村的2種黃芩種質(zhì)的遺傳距離為0.750,差異較大;產(chǎn)自山西省呂梁市交城縣雙家寨村的黃芩種質(zhì)與產(chǎn)自山西省呂梁市汾陽市后溝村的黃芩種質(zhì)產(chǎn)地相距較近,但遺傳距離為0.750,差異較大。本研究結(jié)果表明,山西野生黃芩分布的地理位置與其遺傳多樣性沒有直接的相關(guān)性。
[1]國家藥典委員會.中華人民共和國藥典(一部)[M].北京:中國醫(yī)藥科技出版社,2015:301.
[2]楊全,白音,陳千良.黃芩資源現(xiàn)狀及可持續(xù)利用的研究[J].時珍國醫(yī)國藥,2006,17(7):1159-1160.
[3]劉金花,張永清,王修奇.不同方法繁殖黃芩藥材的產(chǎn)量與質(zhì)量比較[J].中國中醫(yī)藥科技,2009,16(5):394-395.
[4]李化.黃芩采收規(guī)律及其數(shù)學(xué)模型的研究[D].北京:中國中醫(yī)科學(xué)院,2008.
[5]李樹軍,陳廷珠,徐國平,等.山西省黃芩蜜源植物分布特點及開花流蜜規(guī)律[J].中國蜂業(yè),2014,65(10):30-32.
[6]Williams J G K,Kubelik A R,Livak K L,et al.DNA polymorphisms amplified byarbitraryprimers are useful as genetic markers[J].Nucleic Acids Research,1990(18):6531-6535.
[7]Welsh J,Mclelland M.Finger printing genomes using PCR with arbitraryprimers[J].Nucleic Acids Research,1990(18):7213-7218.
[8]荊玉祥.植物分子生物學(xué):成就與前景[M].北京:科學(xué)出版社,1995:95-302.
[9]王華,李淵,郭尚,等.5種食用菌遺傳多樣性的RAPD分析[J].山西農(nóng)業(yè)科學(xué),2015,43(5):516-517,547.
[10]武青山,馬建華,武峻新,等.芹菜種質(zhì)資源遺傳多樣性RAPD分析[J].山西農(nóng)業(yè)科學(xué),2013,41(8):774-777.
[11]楊慧珍,牛西午,任志強,等.RAPD標(biāo)記在林木育種中的應(yīng)用[J].山西農(nóng)業(yè)科學(xué),2007,35(1):73-76.
[12]車代弟,秦智偉,王金剛.仙客來的種質(zhì)資源RAPD分析[J].植物研究,2002,22(3):314-317.
[13]馮學(xué)鋒,胡世林,郭寶林,等.黃芩種群遺傳多樣性初步研究[J].世界科學(xué)技術(shù):中藥現(xiàn)代化,2002,4(4):38-43.
[14]邵愛娟,李欣,黃璐琦,等.不同種源黃芩的RAPD分析[J].中國中藥雜志,2006,31(6):452-455.
[15]趙瑒,高可青,郝建平,等.晉產(chǎn)北柴胡試管植株的RAPD分析[J].山西大學(xué)學(xué)報:自然科學(xué)版,2013,36(2):267-270.
[16]郭美麗,郝建平,裴雁曦.擬南芥抗鹽突變體的RAPD分析[J].西北植物學(xué)報,2004,24(8):1514-1516.
[17]趙利新,張安世,劉瑩.珍稀瀕危植物太行菊遺傳多樣性的RAPD分析[J].河南農(nóng)業(yè)科學(xué),2014,43(4):106-109.
[18]黃鳳蘭,趙永,彭木,等.與蓖麻果刺性狀連鎖的RAPD標(biāo)記[J].華北農(nóng)學(xué)報,2014,29(1):83-88.
[19]包春光,黃鳳蘭,朱國立,等.與蓖麻種子大小性狀連鎖的RAPD分析[J].華北農(nóng)學(xué)報,2015,30(5):108-114.
[20]姜自紅.珍珠黃楊RAPD最佳反應(yīng)體系研究[J].天津農(nóng)業(yè)科學(xué),2015,21(4):15-18.
[21]劉青松,陳立波,李志勇.基因組DNA分子標(biāo)記在紫花苜蓿遺傳多樣性研究中的應(yīng)用[J].華北農(nóng)學(xué)報,2013,28(增刊):36-40.
RAPD Analysis of Germplasm Resources of WildScutellaria baicalensisfrom Shanxi
LIUXiao-ling,HAOJian-ping,F(xiàn)ULin
(College ofLife Sciences,Shanxi University,Taiyuan 030006,China)
Toknowthe genetic distance and phylogenetic relationsships amongthe 7 varies oftest-tube plantlets ofwild Scutellaria baicalensis from Shanxi,the paper used the RAPD technique to analyze and make a cluster analysis to the result with the software SPSS 19.0.The results showed that 5 primers amplificated 20 pieces,including17 polymorphic bands,and the polymorphic rate was 85%.The genetic distance among 7 varies of test-tube plantlets of wild Scitellarie baicalensis was from 0 to 1,and it could be divided into two classes.This revealed that there was a obvious difference and the abundant genetic diversity among the test-tube plantlets of wild Scitellarie baicalensis in 7 different regions of Shanxi,which provided experimental basis for genetic resources breeding,artificial cultivation and resources protection.
Scutellaria baicalensis;test-tube plantlet;RAPD;genetic diversity
R282.71
A
1002-2481(2016)03-0288-04
10.3969/j.issn.1002-2481.2016.03.03
2015-08-14
山西省科技攻關(guān)計劃項目(振東專項)(2014ZD0503)
劉曉伶(1991-),女,山西朔州人,在讀碩士,研究方向:藥用植物細胞工程。郝建平為通信作者。