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寧夏外引水稻種質(zhì)資源表型性狀遺傳多樣性分析

2017-02-15 19:32李振姣馬斯霜部麗群李耀棟唐輝
江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2016年8期
關(guān)鍵詞:遺傳多樣性種質(zhì)資源水稻

李振姣+馬斯霜+部麗群+李耀棟+唐輝+張銀霞+田蕾+李培富

摘要:為了解和拓寬寧夏水稻種質(zhì)資源的遺傳基礎(chǔ),利用18個(gè)表型性狀對(duì)從國(guó)外或外地引進(jìn)的269份水稻種質(zhì)資源進(jìn)行表型評(píng)價(jià)和遺傳多樣性分析,并進(jìn)行不同性狀間遺傳相關(guān)分析和聚類分析。表型評(píng)價(jià)結(jié)果表明,大多數(shù)種質(zhì)都表現(xiàn)為綠色葉片、葉枕、稈黃色穎尖、彎曲穗粒形狀和無芒特征;二次枝梗的變異系數(shù)最高,達(dá)35.82%,谷粒寬的變異系數(shù)最低,為7.66%,F(xiàn)測(cè)驗(yàn)結(jié)果表明各數(shù)量性狀差異都達(dá)到了極顯著水平。遺傳多樣性分析結(jié)果顯示,質(zhì)量性狀[JP3]的多樣性指數(shù)H′平均為0.34,數(shù)量性狀的多樣性指數(shù)平均為1.99。遺傳相關(guān)分析結(jié)果表明,各性狀間存在復(fù)雜的相互關(guān)系,其中二次枝梗與每穗總粒數(shù)的正相關(guān)系數(shù)最大,為0.946,谷粒寬與谷粒長(zhǎng)寬比的負(fù)相關(guān)系數(shù)最大,為 -0.771。根據(jù) UPGMA 聚類法,以歐式距離0.84為閾值,將參試材料分為四大類,第Ⅰ類為粒數(shù)型品種,第Ⅱ類早熟、結(jié)實(shí)率較高,第Ⅲ類是來自日本的矮稈品種,大部分聚在第Ⅳ類,為中間類型。對(duì)不同地理來源的種質(zhì)資源材料進(jìn)行聚類,結(jié)果顯示俄羅斯的水稻資源與其他地方的資源親緣關(guān)系相對(duì)較遠(yuǎn),韓國(guó)、日本、遼寧和江蘇的種質(zhì)資源親緣關(guān)系相對(duì)較近。說明外引水稻種質(zhì)資源表型遺傳多樣性較豐富,親緣關(guān)系較遠(yuǎn),可豐富和拓寬寧夏水稻種質(zhì)資源的遺傳多樣性。

關(guān)鍵詞:水稻;種質(zhì)資源;遺傳多樣性;表型性狀

中圖分類號(hào): S511.03文獻(xiàn)標(biāo)志碼:

文章編號(hào):1002-1302(2016)08-0117-05

種質(zhì)資源是作物優(yōu)良基因的載體,保護(hù)現(xiàn)有種質(zhì)資源的遺傳多樣性,改良與創(chuàng)新利用是當(dāng)前乃至長(zhǎng)遠(yuǎn)種質(zhì)資源研究的主要內(nèi)容,也是實(shí)施農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展戰(zhàn)略的重要舉措[1]。歷史經(jīng)驗(yàn)不斷證明,水稻育種上取得的突破性進(jìn)展無不與種質(zhì)資源的利用密切相關(guān)。寧夏大米素以品質(zhì)優(yōu)良而著稱,這與銀川平原優(yōu)越的氣候條件密不可分[2]。前人研究表明,不同地區(qū)間的種質(zhì)資源遺傳多樣性高于同一地區(qū)內(nèi)的不同品種間[3-4],因此,為了了解和拓寬寧夏水稻種質(zhì)資源的遺傳基礎(chǔ),對(duì)從國(guó)外或外地引進(jìn)的水稻種質(zhì)資源進(jìn)行遺傳多樣性研究顯得尤為必要[5-6]。近年來,有關(guān)水稻種質(zhì)資源遺傳多樣性的研究不勝枚舉,劉煒等利用SSR分子標(biāo)記對(duì)寧夏粳稻種質(zhì)資源進(jìn)行了初步研究,表明寧夏粳稻種質(zhì)資源之間的相似性較高,遺傳差異較小,遺傳背景比較單一[7-9]。賀治州等利用15個(gè)表型性狀比較分析了127份來源于9個(gè)熱帶國(guó)家和地區(qū)的熱帶水稻優(yōu)異種質(zhì)資源的遺傳多樣性,結(jié)果表明不同來源的熱帶水稻種質(zhì)各性狀變異范圍大,遺傳多樣性指數(shù)較高[10]。李自超等利用31個(gè)表型性狀研究了云南地方稻種資源的遺傳多樣性,發(fā)現(xiàn)其遺傳多樣性大,優(yōu)質(zhì)資源豐富,以滇西南和滇東南的遺傳多樣性最大,秈稻多樣性小于粳稻[11]。但是無論從表型性狀,還是從分子水平,有關(guān)寧夏外引水稻種質(zhì)資源的遺傳多樣性研究還未見報(bào)道。本研究利用18個(gè)表型性狀對(duì)在寧夏地區(qū)正常生長(zhǎng)的269份外引水稻種質(zhì)資源進(jìn)行表型遺傳多樣性分析,為今后本地區(qū)水稻育種提供理論依據(jù)。

1材料與方法

1.1供試材料

以269份寧夏外引水稻種質(zhì)資源為試驗(yàn)材料,其中來自澳大利亞5份,意大利10份,法國(guó)3份,俄羅斯1份,葡萄牙2份,日本43份,韓國(guó)4份,朝鮮1份,中國(guó)臺(tái)灣2份,中國(guó)云南6份,中國(guó)北京20份,中國(guó)黑龍江44份,中國(guó)吉林89份,中國(guó)遼寧27份,中國(guó)江蘇12份,參試材料名稱、編號(hào)及來源略。

1.2試驗(yàn)方法

參試材料于2014年4月16日在寧夏大學(xué)水稻育種基地[LM]

育秧,5月17號(hào)插秧。每個(gè)材料栽3行,每行10株,行長(zhǎng) 1.0 m,行距0.3 m,株距0.1 m,單株插秧,田間管理與大田相同。

按照《稻種資源形態(tài)農(nóng)藝性狀鑒定方法》的鑒定標(biāo)準(zhǔn),主要考察水稻葉色、葉枕色、穎尖色、穗粒形狀、芒色等5個(gè)質(zhì)量性狀以及株高、穗長(zhǎng)、每穗總粒數(shù)、每穗實(shí)粒數(shù)、結(jié)實(shí)率、著粒密度、一次枝梗數(shù)、二次枝梗數(shù)、谷粒長(zhǎng)、谷粒寬、谷粒長(zhǎng)寬比、單株穗數(shù)、千粒質(zhì)量等13個(gè)數(shù)量性狀。

1.3數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析

將所調(diào)查的表型質(zhì)量性狀進(jìn)行頻次分布統(tǒng)計(jì),數(shù)量性狀的基本數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)在Excel中進(jìn)行,包括均值、標(biāo)準(zhǔn)差、變異系數(shù)等,各性狀的方差分析在SAS 8.2軟件中進(jìn)行。對(duì)數(shù)量性狀進(jìn)行質(zhì)量化處理,參照王述民的方法,進(jìn)行10個(gè)等級(jí)的劃分,每0.5σ為1級(jí),σ為標(biāo)準(zhǔn)差,計(jì)算Shannon-Wiener多樣性指數(shù)(H′),其計(jì)算公式為:H′=-∑PilnPi(i=1,2,3,…),其中Pi是某性狀第i個(gè)級(jí)別的材料數(shù)占總材料數(shù)的比例。通過SPSS Statistics 17.0對(duì)13個(gè)數(shù)量性狀進(jìn)行相關(guān)性分析。利用SAS 91軟件采用UPGMA法進(jìn)行聚類分析,繪制樹狀聚類圖。

2結(jié)果與分析

2.1不同質(zhì)量性狀的表型頻次分布

通過對(duì)269份外引水稻種質(zhì)資源5個(gè)質(zhì)量性狀的調(diào)查分析,各性狀的頻次分布見圖1。不同水稻種質(zhì)資源的葉枕色以綠色為主,占96.66%,其次為紫色,占12.6%,而紅色的極少,只占0.74%;穎尖色以稈黃為主,占86.25%,其次是紅色,占7.43%,紫色占6.32%;葉片以綠色為主,占97.8%,個(gè)別品種為紫色,占0.34%,而葉緣色為紫色的占1.86%;穗粒形狀以彎曲為主,占81.04%,直立或半直立穗分別占 10.04% 和8.92%;無芒水稻品種占94.4%,有芒品種只占5.6%,且芒色以白色為主,占3.46%,而紅芒或紫芒品種分別占1.73%和0.35%(圖1)。從不同性狀的頻次分布可以看出,大部分水稻品種呈現(xiàn)綠色的葉片,綠色葉枕,稈黃色的穎尖,無芒和彎曲的穗粒形狀。

2.2不同數(shù)量性狀的表型變異分析

根據(jù)形態(tài)和農(nóng)藝性狀考察結(jié)果,計(jì)算每個(gè)表型性狀的均值、標(biāo)準(zhǔn)差、變異范圍、變異系數(shù)和F值(表1)。由表1可知,不同水稻種質(zhì)資源材料間每穗總粒數(shù)、每穗實(shí)粒數(shù)、結(jié)實(shí)率、著粒密度、二次枝梗的變異范圍大,變異系數(shù)高,均達(dá)到23%以上,其中二次枝梗的變異系數(shù)最大,為35.82%,說明二次枝梗的變異程度較高。谷粒長(zhǎng)與谷粒寬的變異系數(shù)較小,分別為8.08%和7.66%,說明這2個(gè)性狀的變異程度較小。13個(gè)表型性狀的F值都達(dá)到了極顯著的水平,說明寧夏外引的種質(zhì)資源材料各表型性狀間都存在著非常大的遺傳差異。

2.3水稻種質(zhì)資源的遺傳多樣性分析

根據(jù)形態(tài)和農(nóng)藝性狀考察結(jié)果,計(jì)算每個(gè)表型性狀的Shannon-Weiner多樣性指數(shù)(Hs=-∑pi·lnpi),結(jié)果如表2所示。從表3可知,5個(gè)質(zhì)量性狀中,穗粒形狀的遺傳多樣性指數(shù)最高,H′為0.62,穎尖色為0.50,葉片色最低,H′為012,平均為0.34,總體上質(zhì)量性狀的遺傳多樣性指數(shù)H′較低。13個(gè)數(shù)量性狀中,各個(gè)性狀的多樣性指數(shù)基本都在2.0左右,谷粒長(zhǎng)寬比的最小,H′為1.77,最大的是一次枝梗數(shù),H′為2.09,平均值為1.99。所以,數(shù)量性狀的遺傳多樣性指數(shù)H′明顯高于質(zhì)量性狀的多樣性指數(shù)H′,表明數(shù)量性狀的遺傳多樣性較大。

2.4不同數(shù)量性狀表型性狀間的相關(guān)性分析

對(duì)寧夏外引269份種質(zhì)資源的13個(gè)數(shù)量性狀進(jìn)行遺傳相關(guān)分析,相關(guān)系數(shù)見表3。由表3可見,不同表型性狀間存在顯著、極顯著相關(guān)關(guān)系,有些性狀間為正相關(guān)關(guān)系,而有些性狀間則為負(fù)相關(guān)關(guān)系,表明性狀間復(fù)雜的相互關(guān)系。在極顯著正相關(guān)中,每穗總粒數(shù)與二次枝梗數(shù)相關(guān)系數(shù)最大,為0.946,表明每穗總粒數(shù)與二次枝梗的遺傳相關(guān)性較大,每穗實(shí)粒數(shù)與谷粒長(zhǎng)寬比的相關(guān)系數(shù)最小,為0.167;在極顯著負(fù)相關(guān)中,谷粒寬與谷粒長(zhǎng)寬比的相關(guān)系數(shù)最大,為-0.771,每穗總粒數(shù)與結(jié)實(shí)率的遺傳相關(guān)性最小,相關(guān)系數(shù)為 -0.159。

2.5寧夏外引水稻種質(zhì)資源表型性狀的聚類分析

以收集到的269份寧夏外引水稻種質(zhì)資源13個(gè)數(shù)量性狀的均值為基礎(chǔ)數(shù)據(jù),以類平均法進(jìn)行聚類分析,結(jié)果如圖2所示,根據(jù)聚類分析結(jié)果,以歐式距離0.84為閾值,可將269份水稻種質(zhì)資源材料劃分為四大類,第Ⅰ類包含8份材料,包括牡12-1822、牡12-815、超級(jí)稻-2、超級(jí)稻-3、E1、S2-4、K60、馬引3號(hào),此類種質(zhì)資源的特點(diǎn)是每穗總粒數(shù)較多,平均200粒左右;第Ⅱ類共66份材料, 包括羅薩馬啟蒂、羅瑪、羅卡等5份意大利材料和龍粳43、豐優(yōu)5110等61份東北材料,這類材料平均每穗實(shí)粒數(shù)多,結(jié)實(shí)率較高;第Ⅲ類包含3份材料,分別為Hitomehore、京引114、Kirara397,主要是日本引進(jìn)材料,此類種質(zhì)資源材料的株高相對(duì)較矮,平均 60 cm 以下,每穗總粒數(shù)較少,平均60粒左右,為矮稈小穗類型;第Ⅳ類包含192份材料,占到總數(shù)的71.38%,包括中國(guó)東北、日本、韓國(guó)、澳大利亞和歐洲等地區(qū),為中間類型。這些表型遺傳差異大的水稻資源是豐富寧夏水稻種質(zhì)資源的良好材料,可拓寬寧夏種質(zhì)資源的遺傳基礎(chǔ)。

2.6不同地理來源水稻種質(zhì)資源表型性狀的聚類分析

通過對(duì)不同來源的水稻資源進(jìn)行歸類后,以13個(gè)數(shù)量性狀的均值為基礎(chǔ)數(shù)據(jù),利用SAS 9.1軟件類平均法進(jìn)行聚類分析,結(jié)果如圖3,發(fā)現(xiàn)在歐式距離0.88為閾值,可將不同地理來源的水稻分為五大類,其中第Ⅰ類只有1個(gè)品種,為俄羅斯水稻品種,表明俄羅斯水稻資源與其他各個(gè)地方的水稻資源親緣關(guān)系相對(duì)較遠(yuǎn);第Ⅱ類包括中國(guó)(云南、臺(tái)灣)、意大利和葡萄牙的水稻資源;第Ⅲ類有中國(guó)(遼寧、江蘇)、日本、韓國(guó)、朝鮮和法國(guó)的水稻資源;第Ⅳ類僅包括中國(guó)黑龍江的水稻種質(zhì)資源;第Ⅴ類有澳大利亞、中國(guó)(北京、吉林)的水稻資源,聚在同一類的材料表明其親緣關(guān)系較近,有可能來自同一個(gè)祖先,不同類別間種質(zhì)資源的親緣關(guān)系較遠(yuǎn),遺傳差異較大,多樣性豐富,可豐富和拓寬寧夏水稻種質(zhì)資源的遺傳多樣性,為水稻育種提供良好的資源材料。

3結(jié)論與討論

本研究通過對(duì)269份寧夏外引水稻種質(zhì)資源的表型性狀進(jìn)行遺傳多樣性分析,在質(zhì)量性狀上,大部分水稻資源表現(xiàn)為綠色的葉枕,桿黃色的穎尖,彎曲的穗立形狀,無芒的水稻類型,且有芒品種大多數(shù)以白色為主。在數(shù)量性狀上,每穗總粒數(shù)、每穗實(shí)粒數(shù)、結(jié)實(shí)率、著粒密度、二次枝梗,結(jié)實(shí)率的變異系數(shù)較大,都達(dá)到了23%以上,其中二次枝梗的相對(duì)最高,為35.82%,說明此性狀的變異程度相對(duì)較大,而谷粒長(zhǎng)與谷粒寬則相對(duì)較小,分別為8.08%和7.06%,變異程度較小。通過方差分析表明,各性狀間均達(dá)到了極顯著的水平,說明269份材料各性狀間都有很大的遺傳差異。遺傳相關(guān)性分析結(jié)果

顯示,各數(shù)量性狀間大部分存在極顯著或顯著的關(guān)系,其中每穗總粒數(shù)與二次枝梗的正相關(guān)系數(shù)最大,谷粒寬與谷粒長(zhǎng)寬比負(fù)相關(guān)系數(shù)最大。陳小龍等對(duì)寧夏的60份種質(zhì)資源的16個(gè)表型性狀進(jìn)行遺傳相關(guān)分析,結(jié)果表明各性狀間也呈現(xiàn)出復(fù)雜的相互關(guān)系[12]。遺傳多樣性指數(shù)表明,質(zhì)量性狀的遺傳多樣性指數(shù)(H′)平均在0.5以下,數(shù)量性狀的遺傳多樣性指數(shù)(H′)平均在2.0左右,明顯高于質(zhì)量性狀的多樣性指數(shù)(H′),這與賀治州等研究的熱帶水稻優(yōu)異種質(zhì)資源表型遺傳多樣性的結(jié)果[10]一致,說明數(shù)量性狀的遺傳多樣性大,而數(shù)量性狀中以一次枝梗(2.09)的最高,質(zhì)量性狀中以穗立性狀(0.62)最高。聚類結(jié)果顯示,以歐式距離0.84為閾值,可將269份水稻分成四大類,每一類在一些性狀上較為獨(dú)特,大部分聚在了第Ⅳ類,占到了總數(shù)的71.38%,不同地理來源水稻的聚類結(jié)果表明,俄羅斯與其他不同地方種質(zhì)資源的親緣關(guān)系較遠(yuǎn),日本、韓國(guó)、中國(guó)(遼寧和江蘇)的水稻種質(zhì)資源親緣關(guān)系較近,寧夏外引水稻的表型遺傳差異較大,親緣關(guān)系較遠(yuǎn),為育種家在選擇親本上提供理論依據(jù),可作為拓寬寧夏水稻遺傳基礎(chǔ)的良好資源。利用表型性狀來檢測(cè)遺傳變異是最比較簡(jiǎn)便易行的方法[13-15],能夠在短期內(nèi)對(duì)所研究材料的遺傳變異水平有個(gè)基本的認(rèn)識(shí),但是表型性狀易受環(huán)境和基因顯隱性的影響,若要更準(zhǔn)確,深入地了解,今后還得結(jié)合SSR分子標(biāo)記[16-25]進(jìn)行進(jìn)一步地檢測(cè)。

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