水稻不僅是全球一半人口的主食,也為研究能源作物提供了模型。為優(yōu)化生物燃料作物,科學(xué)家正尋找決定水稻產(chǎn)量、抗病性和灌溉效率等性狀的基因。
最近在《植物細(xì)胞》雜志刊登的一篇論文中,美國(guó)加州大學(xué)戴維斯分校的研究團(tuán)隊(duì)與來(lái)自能源部聯(lián)合基因組研究所的合作者,宣布開(kāi)發(fā)出粳稻Kitaake的第一個(gè)全基因組測(cè)序快中子誘導(dǎo)突變體種群,一種新型的短生命周期水稻品種模型。
相對(duì)于其它水稻品種,Kitaake的新品種生命周期只有九周,一年四熟,且對(duì)光周期的變化不敏感,能夠加速水稻及其它單子葉植物的功能遺傳研究。快中子輻射能使Kitaake形成多種多樣的突變,包括單堿基取代、插入、倒置和異位等,而包括基因和染色體片段插入及CRISPER-Cas9在內(nèi)的其它技術(shù)則往往只能形成單一類型的突變。因此,全基因測(cè)序允許研究人員僅用常規(guī)方法三百分之一的植株樣本就能確定影響單個(gè)基因的突變,大大提高了快速基因分析能力。
為方便科學(xué)家獲取資源,該研究團(tuán)隊(duì)還建立了名為KitBase的門戶網(wǎng)站,允許用戶查找與突變相關(guān)的信息,包括每個(gè)水稻品系的序列、突變和表型數(shù)據(jù)。該項(xiàng)研究由美國(guó)能源部、國(guó)立衛(wèi)生研究院和國(guó)家科學(xué)基金會(huì)共同資助。