李少川,李菊香
(南昌大學(xué)第二附屬醫(yī)院 心血管內(nèi)科, 江西 南昌 330006)
CircRNA首次在RNA病毒中被發(fā)現(xiàn)[1],隨后在酵母菌和真核生物中也證實(shí)其存在,小鼠的性別決定區(qū)SRY中也發(fā)現(xiàn)了circRNA。隨著測序技術(shù)的發(fā)展,尤其是RNA-seq技術(shù)的開發(fā)[2],circRNA的研究在幾年得到快速發(fā)展。circRNA的主要特征是環(huán)狀結(jié)構(gòu),外顯子的3′端轉(zhuǎn)回并連接其上游外顯子的5′端以形成閉合分子。與經(jīng)典的線性RNA不同,circRNA不存在5′帽和3′多聚腺苷酸尾。由于不存在游離末端,所以這些分子不容易水解,特殊的環(huán)形結(jié)構(gòu)使circRNA具有一定的保守性和穩(wěn)定性[3]。對脫支酶和RNA外切核酸酶具有較高的抵抗,也因?yàn)橐恍┩怙@子環(huán)RNA的基因產(chǎn)物水平高于線性RNA, 所以circRNA可以作為生物標(biāo)志物來診斷疾病,也可以作為預(yù)后評估的一個指標(biāo),還可以在治療的關(guān)鍵靶點(diǎn)等方面具有明顯的優(yōu)勢。由于circRNA分子富含miRNA結(jié)合位點(diǎn),可以特異性地結(jié)合miRNA并抑制其功能,這一機(jī)制稱為競爭內(nèi)源RNA(ceRNA)機(jī)制,類似海綿吸收miRNA,稱之為miRNA海綿體作用(miRNA sponge)。許多疾病與circRNA相關(guān),如腫瘤、神經(jīng)系統(tǒng)、心血管和自身免疫性等疾病都被證明與circRNA密切相關(guān)。circRNA通過與疾病關(guān)聯(lián)的miRNA作用在分子水平對疾病進(jìn)行調(diào)節(jié),提示circRNA可以成為一種新的基因表達(dá)調(diào)節(jié)劑。
目前有多種機(jī)制解釋心肌肥大如何進(jìn)展成心力衰竭,如通過鈣調(diào)神經(jīng)磷酸/NFAT途徑和血管緊張素系統(tǒng)等發(fā)揮作用,但尚無一個公認(rèn)的機(jī)制詮釋心力衰竭的發(fā)生和發(fā)展。有報道指出從circRNA數(shù)據(jù)庫中隨機(jī)篩選了100個circRNA,其中 36個circRNA在心臟高度表達(dá),稱為心臟相關(guān)的circRNA(HRCR)。并發(fā)現(xiàn)HRCR可以通過與miRNA結(jié)合發(fā)揮其生物學(xué)功能[4]。miR- 223通過抑制其下游靶點(diǎn)ARC(具有CARD結(jié)構(gòu)域的凋亡阻抑物,ARC的3′UTR是miR- 223的結(jié)合位點(diǎn)),使其表達(dá)降低。miR- 223使ARC在心肌細(xì)胞中表達(dá)降低,可以增強(qiáng)異丙腎上腺素(ISO)誘導(dǎo)的心肌肥厚作用。HRCR可以作為miR- 223海綿狀物結(jié)合并抑制miR- 223的活性,因此認(rèn)為 HRCR是抗增殖因子,抑制心肌的肥大,初步的結(jié)果證明circRNA在心肌肥大誘發(fā)的心力衰竭中起關(guān)鍵作用。雖然證明miR223可以由 HRCR調(diào)節(jié),但是不排除其他circRNA或其他基因及表達(dá)產(chǎn)物可直接或間接地調(diào)節(jié)miR- 223。在ISO心力衰竭模型中的其他HRCR非依賴性途徑和它們在調(diào)節(jié)miR- 223中的作用尚需進(jìn)一步確定, miR- 223的下游靶點(diǎn)需更深入的研究。
心肌細(xì)胞衰老是身體功能的逐漸惡化和死亡的主要原因,可發(fā)生在細(xì)胞水平或生物水平。細(xì)胞衰老,也稱為復(fù)制衰老,其特征在于二倍體細(xì)胞的有絲分裂停止,而生物水平衰老的特征在于應(yīng)激反應(yīng)降低和穩(wěn)態(tài)平衡被打破,導(dǎo)致生物體的正常功能喪失。在生物應(yīng)激中,常用化學(xué)藥物多柔比星(Dox)來產(chǎn)生氧化應(yīng)激以誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡,制作心肌功能不全模型[5]。circRNA Foxo3的異位表達(dá)促進(jìn)Dox誘導(dǎo)心肌病形成,但沉默內(nèi)源性circRNA Foxo3可以減緩Dox的作用并阻止心肌病的形成。細(xì)胞質(zhì)中異位表達(dá)的circRNA Foxo3結(jié)合抗衰老相關(guān)蛋白ID1和E2F1、抗應(yīng)激相關(guān)蛋白HIF1α和FAK(HIF1α和FAK均可以抑制衰老)。細(xì)胞質(zhì)中Foxo3的增加導(dǎo)致細(xì)胞質(zhì)中ID1、E2F1、HIF1α和FAK的含量減少。這些蛋白質(zhì)的抗衰老功能被阻斷,其結(jié)果是,circRNA Foxo3的異位表達(dá)促進(jìn)細(xì)胞衰老,而沉默circRNA-Foxo3減少細(xì)胞衰老和凋亡。有報道靈芝可以抑制CIRC-Foxo3并且提高左室射血分?jǐn)?shù),改善心輸出量,改善心肌衰老[6]。
心肌纖維化受多種因素調(diào)節(jié),其中基因水平的影響不容忽視。有報道在小鼠心肌纖維化模型中circRNA的表達(dá)譜和潛在機(jī)制[7]。使用circRNA微陣列檢查糖尿病小鼠心肌的circRNA發(fā)現(xiàn)43個circRNA異常表達(dá),包括24個上調(diào)和19個下調(diào)。在血管緊張素Ⅱ(Ang Ⅱ)處理的糖尿病小鼠心肌中的心臟成纖維細(xì)胞(CFs)中,circRNA_010567顯著上調(diào)。生物信息學(xué)分析預(yù)測circRNA_010567可以作為miR- 141的海綿體,而且miR- 141可以直接靶向TGF-β1并抑制其表達(dá)(雙熒光素酶測定驗(yàn)證)。隨后實(shí)驗(yàn)顯示circRNA_010567沉默可上調(diào)miR- 141并下調(diào)TGF-β1(纖維化的必需分子)表達(dá)。同時可以抑制Col Ⅰ、Col Ⅲ和α-SMA等成纖維細(xì)胞的表達(dá)。circRNA_010567 / miR- 141 / TGF-β1在糖尿病小鼠心肌纖維化模型中起著重要的調(diào)節(jié)作用。同時有類似研究發(fā)現(xiàn)circRNA_000203可以通過消除miR- 26b- 5p與Col1a2和CTGF的靶標(biāo)相互作用來抑制miR- 26b的抗纖維作用[8]。這個過程也是利用了circRNA的miRNA的海綿作用與miR- 26b- 5p緊密結(jié)合。circRNA_000203特異性增強(qiáng)Col1a2、Col3a1和α-SMA等成纖維細(xì)胞的表達(dá),miR- 26b就是通過抑制Col1a2、Col3a1、α-SMA和CTGF在內(nèi)的纖維化相關(guān)基因的表達(dá)而起到抗纖維化的作用。所以circRNA_000203的表達(dá)增多會引起心肌纖維化。circRNA_010567和circRNA_000203分別作為miR- 141和miR- 26b- 5p的海綿體起到抑制miRNA的作用。上述研究發(fā)現(xiàn)心肌纖維化的過程中兩類RNA相互作用至關(guān)重要。miRNA可以抑制纖維化,而circRNA可以抵消miRNA的抗纖維化作用,從基因水平闡述了心肌纖維化的調(diào)控作用。
動脈粥樣硬化(atherosclerosis,AS)是一種全身性疾病,是由于脂肪沉積物、炎性反應(yīng)、細(xì)胞和瘢痕組織在動脈壁內(nèi)積累而導(dǎo)致的疾病。 有報道circ ANRIL參與AS發(fā)生[9],circANRIL是在染色體9p21的AS基因座上轉(zhuǎn)錄的INK4基因座。circANRIL中的環(huán)狀反義非編碼RNA通過控制核糖體RNA(rRNA)成熟來調(diào)節(jié)動脈粥樣硬化形成。實(shí)驗(yàn)證實(shí)circANRIL結(jié)合到rRNA的C端賴氨酸豐富的區(qū)域PES1上,占據(jù)PES1與pre-rRNA結(jié)合位點(diǎn),阻止核酸外切酶介導(dǎo)的rRNA成熟。circANRIL抑制核糖體形成過程并導(dǎo)致pre-rRNA的積累,導(dǎo)致p53活化和隨后細(xì)胞凋亡增加,導(dǎo)致增殖率的降低,通過減少過度增殖的平滑肌細(xì)胞使動脈粥樣硬化發(fā)生減少。提示circANRIL可以作為治療AS的潛在治療靶標(biāo)。
冠心病(coronary atherosclerotic heart disease, CAD)是心血管疾病中致死率最高的疾病[10],一直被臨床工作者重視,但早期診斷存在一定的困難。目前診斷的方式有很多種,無創(chuàng)檢查有心電圖(ECG)、心電圖平板運(yùn)動實(shí)驗(yàn)(TET)、動態(tài)心電圖(Holter)監(jiān)測和冠狀動脈計(jì)算機(jī)斷層攝影(CTA),有創(chuàng)冠狀動脈造影(CAG)檢查。但是各自存在弊端,ECG靈敏度以及特異性低,CTA價格昂貴,患者一般難以接受CAG檢查。hsa_circ_0124644在冠狀動脈疾病的患者中明顯上調(diào),靈敏度和特異性分別為0.861和0.626,hsa_circ_0098964敏感性和特異性分別為0.825和0.730[11]。常規(guī)ECG的靈敏度和特異性已顯示為0.290和0.670[12]。Holter及TET監(jiān)測的靈敏度和特異性分別為0.649、0.894[13]和0.731、0.693[14],CTA的靈敏度和特異性分別為0.920和0.750[15],CAG一直作為CAD的診斷金標(biāo)準(zhǔn)。綜合價格和患者的依從性等因素,hsa_circ_0124644和hsa_circ_0098964可以作為診斷CAD的一種手段。而且circ RNA的特殊環(huán)狀結(jié)構(gòu)不易被酶分解,更加證明了其可以作為診斷CAD的一種方法。
心肌梗死(myocardial infarction,MI)一般發(fā)生于冠心病的基礎(chǔ)上,心肌梗死多伴有心肌細(xì)胞的凋亡。有報道用左前動脈永久結(jié)扎制造大鼠心力衰竭模型發(fā)現(xiàn)circRNA Cdr1as和miR- 7a的共表達(dá),且Cdr1as是miR- 7a的海綿體,可以抑制miR- 7a的生物學(xué)功能[16]。miR- 7a通過靶向抑制PARP和SP1的表達(dá)(PARP和SP1均是可以促進(jìn)心肌凋亡的蛋白),從而抑制MI的心肌凋亡。circRNA Cdr1as可以引發(fā)MI,其中一條途徑就是通過抑制miR- 7a對PARP和SP1的抑制作用。還發(fā)現(xiàn)miR- 7a并不受過表達(dá)的Cdr1as所誘導(dǎo), miR- 7a對正常的心肌細(xì)胞凋亡無影響,僅僅對應(yīng)激誘導(dǎo)的心肌凋亡有影響,并且在應(yīng)激狀態(tài)下才會被Cdr1as所抑制。有報道在冠脈結(jié)扎誘導(dǎo)的心肌細(xì)胞凋亡大鼠模型中發(fā)現(xiàn)mm9-circ 01659 明顯上調(diào),稱之為MFACR(線粒體裂變和凋亡相關(guān)的circRNA),通過海綿體作用下調(diào)miR- 652- 3p控制心臟線粒體分裂和細(xì)胞凋亡[17]。miR- 652- 3p可以通過抑制MTP18(線粒體蛋白18)的表達(dá)來阻斷線粒體裂隙和心肌細(xì)胞死亡。MFACR在細(xì)胞質(zhì)中直接螯合miR- 652- 3p并抑制其活性。 實(shí)驗(yàn)證明敲低MFACR的小鼠心肌細(xì)胞線粒體裂解的現(xiàn)象減弱,表明circRNA在調(diào)節(jié)心臟線粒體動力學(xué)和凋亡中的關(guān)鍵作用。MFACR和circRNA Cdr1as的發(fā)現(xiàn)為進(jìn)一步研究MI的發(fā)生以及后續(xù)的診斷和治療提供了新的依據(jù)。
主動脈瘤是指主動脈病理性的擴(kuò)張,超過正常血管直徑的50%,具有很高的死亡風(fēng)險,發(fā)生機(jī)制復(fù)雜。有報道發(fā)現(xiàn)hsa-circ- 000595與主動脈平滑肌凋亡有關(guān),進(jìn)而影響主動脈瘤的發(fā)生。在低氧條件下主動脈平滑肌細(xì)胞中hsa-circ- 000595的表達(dá)上調(diào),通過敲低hsa-circ- 000595發(fā)現(xiàn)低氧條件下主動脈平滑肌細(xì)胞凋亡減弱。實(shí)驗(yàn)還發(fā)現(xiàn)hsa-circ- 000595是作為miR- 19a海綿體來起作用的,hsa-circ- 000595減低可以使miR- 19a表達(dá)增加,從而減少平滑肌細(xì)胞凋亡[18]。miR- 19a影響平滑肌細(xì)胞的機(jī)制還需要進(jìn)一步探討,但是hsa-circ- 000595的發(fā)現(xiàn)可以為診治主動脈瘤提供一個新的基因?qū)W上的依據(jù)。
隨著基因測序技術(shù)的升級,越來越多的基因組數(shù)據(jù)庫被建立,有許多在線數(shù)據(jù)庫可以用于circRNA的研究,目前僅有少數(shù)circRNA被證明與心血管疾病有關(guān),如HRCR、hsa_circ_0124644和circRNA Cdr1as等,其中大部分circRNA都是作為miRNA的海綿體而發(fā)揮作用,提示兩者之間可能存在著某種聯(lián)系,但作為與遺傳高度相關(guān)的高血壓和心律失常等疾病卻無circRNA的身影,現(xiàn)已發(fā)現(xiàn)人類體內(nèi)含有上萬個circRNA,其中是否有大量和心臟疾病相關(guān)的circRNA值得研究。