国产日韩欧美一区二区三区三州_亚洲少妇熟女av_久久久久亚洲av国产精品_波多野结衣网站一区二区_亚洲欧美色片在线91_国产亚洲精品精品国产优播av_日本一区二区三区波多野结衣 _久久国产av不卡

?

基于Comsol Multiphysics的微溝道式細(xì)胞分選儀研究

2018-03-10 00:49鄭陳張仁杰
軟件導(dǎo)刊 2018年2期
關(guān)鍵詞:主通道偏移量粒子

鄭陳+張仁杰

摘 要:細(xì)胞分選儀可以分析患者的病情,準(zhǔn)確而快速的分析能夠使患者得到及時(shí)治療。目前常用的細(xì)胞分選儀以流式細(xì)胞分選儀為主。隨著醫(yī)學(xué)界對(duì)細(xì)胞篩選、分離等能力要求的不斷提高,其對(duì)細(xì)胞分選儀的精確度和運(yùn)行速度提出了較高要求,并向小型化、集成化方向發(fā)展。因此,微溝道式細(xì)胞分選儀的理論研究備受矚目。微溝道式細(xì)胞分選儀在提取細(xì)胞的基礎(chǔ)上,把細(xì)胞按照需要篩選到不同試管內(nèi),以方便進(jìn)一步分析與鑒定;通過Comsol Multiphysics軟件的仿真環(huán)境,對(duì)微溝道式細(xì)胞分選儀的分選過程作必要的理論分析,并對(duì)細(xì)胞分選過程作模擬和定性分析。

關(guān)鍵詞:細(xì)胞分選;細(xì)胞篩選;小型化;微溝道;Comsol Multiphysics

DOIDOI:10.11907/rjdk.172236

中圖分類號(hào):TP319

文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A 文章編號(hào):1672-7800(2018)002-0128-03

0 引言

目前細(xì)胞分選儀主要向小型化、集成化、模塊化發(fā)展,具體來說就是性能變得更加可靠,機(jī)身小巧,方便運(yùn)輸。尤其在機(jī)器運(yùn)行操作方面有了很大改進(jìn),主要向簡(jiǎn)化操作、易于控制等方面發(fā)展。即使是初學(xué)者,也可以在很短時(shí)間內(nèi)掌握操作方法,從而大大提高可操作性,為醫(yī)院節(jié)約成本作出了巨大的貢獻(xiàn)。在系統(tǒng)信息采集方面,由于傳感器等電子行業(yè)的快速發(fā)展,系統(tǒng)采集信息的能力大幅提高,同時(shí)整體的靈敏度和分辨率提升[1]。機(jī)器從裝配、控制、信息采集、獲取到分析的過程都可以輕松掌控。

總的來說,細(xì)胞分選儀主要包含3個(gè)模塊:流體控制、光學(xué)檢測(cè)和分選模塊。作為用于臨床診斷和生物醫(yī)學(xué)研究的重要設(shè)備,流式細(xì)胞儀在醫(yī)學(xué)界不可或缺。在血液細(xì)胞計(jì)數(shù)、熒光蛋白的篩選等領(lǐng)域有著重要的應(yīng)用。從本質(zhì)上說,當(dāng)細(xì)胞流過毛細(xì)管時(shí),細(xì)胞被控制一個(gè)接一個(gè)通過導(dǎo)管,此時(shí)流式細(xì)胞儀通過對(duì)細(xì)胞散射和發(fā)出的熒光識(shí)別不同標(biāo)記的細(xì)胞,經(jīng)常選擇模塊進(jìn)入不同試管中(見圖1)。

具體來說,流體控制系統(tǒng)就是當(dāng)懸浮液細(xì)胞進(jìn)入導(dǎo)管單元時(shí),細(xì)胞以近似勻速的速度一個(gè)接著一個(gè)流過流動(dòng)室。流動(dòng)室是流體控制系統(tǒng)的核心部分,是由樣品管、鞘液管和噴孔等3個(gè)部分組成,流動(dòng)室通常是由光學(xué)玻璃或石英等透明且穩(wěn)定的材料精密制成[2]。而樣品管的主要作用是存儲(chǔ)細(xì)胞樣品,細(xì)胞懸液在流室內(nèi)的壓力作用下進(jìn)入樣品管,經(jīng)鞘液管向噴孔流去。因?yàn)橐刂屏黧w的流動(dòng)速度,以方便準(zhǔn)確測(cè)量,所以在通常情況下,懸浮液流速需要控制在適當(dāng)?shù)姆秶鷥?nèi)。經(jīng)過多年努力,人們已經(jīng)能夠快速、 準(zhǔn)確處理細(xì)胞樣本,而規(guī)模、復(fù)雜性和成本也在優(yōu)化與減少,使得流式細(xì)胞儀變得越來越成熟。

由于技術(shù)的不夠成熟,目前細(xì)胞分選儀設(shè)備比較大,因此,隨著科技的進(jìn)步,科學(xué)家們把目光投向了微電子行業(yè),進(jìn)一步實(shí)現(xiàn)元器件集成化、小型化。從而使流式細(xì)胞儀在分析速度上可以達(dá)到每秒檢測(cè)5 000~10 000個(gè)細(xì)胞,且能區(qū)分僅有5%差別的細(xì)胞。多參數(shù)的檢測(cè)與可調(diào),從而使得流式細(xì)胞分選技術(shù)能應(yīng)用到更多的臨床實(shí)踐中。而微溝道式細(xì)胞分選儀的另一個(gè)重要組成部分即為光學(xué)檢測(cè)系統(tǒng),光學(xué)檢測(cè)系統(tǒng)是由一個(gè)或多個(gè)激光器的不同波長(zhǎng)探測(cè)器、高靈敏度的光電倍增管(PMT)與非常復(fù)雜昂貴的光學(xué)器件等組成,這些光學(xué)器件精度非常高。大多數(shù)情況下,光學(xué)檢測(cè)系統(tǒng)通過對(duì)細(xì)胞的光散射和熒光檢測(cè)收集信號(hào),經(jīng)信號(hào)處理確定細(xì)胞的位置。光學(xué)檢測(cè)系統(tǒng)可以同時(shí)多渠道收集細(xì)胞,允許多種顏色測(cè)定,為用戶提供了更具選擇性的檢測(cè)能力[3]。

1 Comsol Multiphysics簡(jiǎn)介

Comsol Multiphyscis主要用于模擬多個(gè)物理場(chǎng)的疊加模擬效果。它提供了諸多完善的物理場(chǎng),是一款大型的高級(jí)數(shù)值仿真軟件,被應(yīng)用于各學(xué)科的研究及工程計(jì)算中,模擬科學(xué)、工程領(lǐng)域的各個(gè)物理過程。

Comsol Multiphysics最初起源于MATLAB的一個(gè)工具箱(Toolbox),后改名為Femlab1.0,這個(gè)名稱一直延續(xù)到Femlab3.1版。從3.2版本開始,正式更名為Comsol Multiphysics,一直更新到目前常用的4.4版本。本文所用的版本正是4.4版。Comsol Multiphysics軟件可以仿真零維,一維、一維軸對(duì)稱,二維、二維軸對(duì)稱,三維。Comsol Multiphysics軟件發(fā)展至今,已經(jīng)具備了許多常用的專業(yè)模塊:AC/DC模塊(AC/DC Module)、熱傳模塊(Heat Transfer Module)、化學(xué)反應(yīng)工程模塊(Chemical Reaction Engineering Module)、結(jié)構(gòu)力學(xué)模塊(Structural Mechanics Module)、微流模塊(Microfluidics Module)、多孔介質(zhì)流模塊(Subsurface Flow Module)、聲學(xué)模塊(Acoustics Module)、管道流模塊(Pipe Flow Module)、材料庫(kù)(Material Library)等。

2 模型創(chuàng)建

在建立之前要在腦海中大致有個(gè)輪廓,由于微溝道式細(xì)胞分選儀在理論上應(yīng)該是2~3個(gè)分選通道、一個(gè)主通道,稱為inlet1,用來釋放需要篩選的細(xì)胞[4];在主通道的旁邊有一個(gè)與之垂直的分通道,此通道是可控的壓力通道,稱為inlet2。Inlet2通道的主要作用是用來改變下落細(xì)胞的軌跡,從而使得細(xì)胞按照預(yù)設(shè)想進(jìn)入需要收集的試管中,因此,在主通道的下方有3個(gè)分通道,從左往右分別為outlet1、outlet2、outlet3。具體操作:繪圖區(qū)域Graphics,所要繪制圖形是一個(gè)倒樹狀圖,要預(yù)設(shè)好各個(gè)通道的相關(guān)參數(shù),將主通道(inlet1)的高度設(shè)置為200um,寬度為100um;副通道(inlet2)寬度為80um,高度為40um;3個(gè)出口(outlet)的寬度都為30.216 95um,左右兩邊通道分別傾斜3/4π、π/3。經(jīng)繪制可以得到圖2。endprint

Practical Tracing是Comsol Multiphysics的粒子示蹤功能,它可以用來模擬細(xì)胞在主通道內(nèi)的運(yùn)動(dòng)情況,并可以根據(jù)制作者的要求顯示出不同效果。圖3是在主通道速度(inlet1)設(shè)為0.000 001m3/s、副通道(inlet2)速度為零時(shí)粒子的軌跡。

當(dāng)在副通道加上速度或者壓力時(shí)(inlet2),粒子的軌道將與所給速度或壓力的方向有關(guān),當(dāng)給inlet2一個(gè)很小的速度時(shí),可以觀察到粒子在軌道變化??梢愿鶕?jù)需要變化不同的物理量來研究粒子在軌道內(nèi)的下落軌跡[5-7],研究各物理量之間的關(guān)系。

3 模擬結(jié)果

在細(xì)胞分選時(shí),人為控制細(xì)胞從何時(shí)開始進(jìn)入哪個(gè)管中,需研究各個(gè)量對(duì)細(xì)胞運(yùn)行軌跡的影響。首先,當(dāng)主管道inlet1流速一定時(shí),隨著inlet2壓力的改變,用流速代替研究粒子在管道中運(yùn)動(dòng)的情況。先給粒子一個(gè)固定且適當(dāng)?shù)钠鹗嘉恢靡约俺跛俣?,得到粒子的運(yùn)動(dòng)軌跡如圖4。

以(0,0)點(diǎn)為起點(diǎn),縱坐標(biāo)設(shè)置為inlet2與inlet1的速度之比,橫坐標(biāo)設(shè)為粒子相對(duì)于中心位置(23.5,0)的偏移量,得到數(shù)據(jù)如圖5所示。

X=33.3和X=66.7分別是粒子左和右管道的分界線。粒子落在左通道,隨著通道inlet2的速度不斷減小,粒子相對(duì)于中心位置的偏移量也在不斷減小,且當(dāng)inlet2有一個(gè)很小的增量時(shí),粒子偏移量就會(huì)有一個(gè)顯著的變化。粒子落在中心通道,當(dāng)粒子位置在(33.3,50)之間時(shí),粒子的位置隨著inlet2速度的改變,位移量有較小的變化;在X=50時(shí),inlet2的速度向相反方向增大;當(dāng)粒子處在(50,66.7)時(shí),inlet2的速度有一個(gè)很小的變化,粒子位移量都會(huì)有顯著的變化。當(dāng)粒子落在右邊的通道時(shí),這種顯著變化依然存在。當(dāng)inlet1的速度大小是inlet2反向速度大小的2倍時(shí),粒子將打到inlet2管壁口。因此inlet2的反方向速度在選取時(shí)要精確控制,對(duì)于速度之比的分辨率要求非常高。

當(dāng)粒子位置固定,inlet2與inlet1速度為定值時(shí),改變通道inlet2到分叉口的距離如圖6所示。

對(duì)圖6進(jìn)行數(shù)據(jù)采集,把采集到的數(shù)據(jù)用Excel繪制成橫坐標(biāo)為inlet2到分叉口處的距離,縱坐標(biāo)為粒子相對(duì)于橫坐標(biāo)(23.5,0)偏移量的散點(diǎn)圖(見圖7)。

從圖7可以看出,隨著inlet2位置的改變,粒子位移量幾乎不變??梢匀?個(gè)點(diǎn)來說明為什么粒子位移量變化很小,或者幾乎不變。首先,取inlet2管道位于最上側(cè),當(dāng)粒子從入口inlet1剛進(jìn)入時(shí),在現(xiàn)實(shí)應(yīng)用中,粒子做的是自由落體運(yùn)動(dòng),而inlet2所提供的速度數(shù)量級(jí)在1E-10,相對(duì)于自由落體獲得的速度要遠(yuǎn)遠(yuǎn)小得多,粒子會(huì)以極快速度通過inlet2的加速區(qū)域,因此粒子所獲得的橫向速度很小,可以說幾乎為零。因此粒子的偏移量很小。其次,當(dāng)inlet2位于中間或者下側(cè)時(shí),由于自由落體,使得粒子自身的速度成指數(shù)倍增長(zhǎng)。因此,改變inlet2的位置獲得粒子位置的改變并不是最理想的方法;移動(dòng)的inlet2不能保證與主通道之間的密閉性,對(duì)于像細(xì)胞分選儀這樣高精度的儀器來說是不允許的。而且在儀器制造時(shí),生產(chǎn)工藝復(fù)雜,成本高。因此,不提倡以這樣的方法獲得粒子的偏移量。

將inlet1與inlet2速度之比、inlet2的位置都設(shè)為定值。改變粒子在中心位置到交叉處的距離,統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù),以粒子到分叉口處的距離為橫坐標(biāo),以粒子相對(duì)于中心位置偏移量為縱坐標(biāo)。由Excel繪制散點(diǎn)圖如圖8所示。

從圖8可以看出,當(dāng)粒子遠(yuǎn)離分叉口時(shí),粒子的偏移量在不斷增加。當(dāng)粒子遠(yuǎn)離分叉口120um左右時(shí),粒子的偏移量趨向一個(gè)定值[8-9]。

假定細(xì)胞在管道中不是以自由落體的形式下落,忽略了細(xì)胞或者粒子自身的因素,如粘著度、大小、形狀等。在給定粒子一定下落速度的前提下,分別對(duì)粒子的位置、副通道口inlet2的位置以及inlet1與inlet2兩個(gè)通道的速度之比等條件進(jìn)行了考察。經(jīng)過試驗(yàn)分析可知,當(dāng)細(xì)胞或者粒子位置一定時(shí),側(cè)通道(inlet2)所給速度的大小將影響細(xì)胞或者粒子的分選方向。側(cè)通道(inlet2)所給速度越大,粒子或者細(xì)胞就會(huì)落入左下方通道,但與此同時(shí),速度不能超過一定的值,否則細(xì)胞或者粒子將打到主通道壁上,以至于影響細(xì)胞或粒子的收集速度與數(shù)量[10]。

此外,要注意左右通道與中間通道的臨界點(diǎn),對(duì)于左通道,因?yàn)榱W与S著側(cè)通道(inlet2)所給速度的增加,粒子的偏移量適中,即分辨率可調(diào)性更強(qiáng),因此,操作時(shí)盡量讓粒子或細(xì)胞落在左通道的中間位置。對(duì)于中間通道門,可以讓粒子或細(xì)胞自由落下,不予以人工干預(yù)就可以達(dá)到收集目的。對(duì)于右邊的通道,靈敏度比較小,可調(diào)性比較低,很小的速度變化就會(huì)使得細(xì)胞或粒子有極大的偏移量。通過此次試驗(yàn),可以看到,在微溝道式細(xì)胞分選儀還不是很普及的今天,要想獲得精度較高的細(xì)胞分選儀,一方面要從細(xì)胞的預(yù)處理方面下工夫,另一方面要加強(qiáng)對(duì)儀器的小型化、集成化研究[11]。一門學(xué)科的發(fā)展離不開其它學(xué)科的支持,尤其是電子、材料、光學(xué)等方面的突破,都會(huì)為微溝道式細(xì)胞分選的進(jìn)步與發(fā)展提供強(qiáng)有力的支持,因此,只有與其它學(xué)科相互推進(jìn),才能更好地發(fā)展。

參考文獻(xiàn):

[1] TUNG, Y C. PDMS-based opto-fluidic micro flow cytometer with two-color, multi-angle fluorescence detection capability using PIN photodiodes[J]. Sensors and Actuators B-Chemical,2004,98(2-3):356-367.

[2] MAO, X L. Single-layer planar on-chip flow cytometer using microfluidic drifting based three-dimensional (3D) hydrodynamic focusing[J]. Lab on a Chip,2009,9(11):1583-1589.

[3] SHAPIRO, H M. Practical flow cytometry 4th ed[M]. New York:Wiley-Liss Inc.,2002.

[4] 馬學(xué)恩.用微溝道式細(xì)胞計(jì)數(shù)儀檢測(cè)雞淋巴細(xì)胞亞群[J].內(nèi)蒙古古畜科學(xué),1994,78:38-42.

[5] 姚波,馮雪,羅國(guó)安,等.微流控芯片系統(tǒng)流式細(xì)胞術(shù)及單細(xì)胞熒光檢測(cè)[J].高等學(xué)?;瘜W(xué)學(xué)報(bào),2005,26:40-43.

[6] JACOBSON, S C, RAMSEY J M. Electrokinetic focusing in microfabricated channel structures[J]. Analytical Chemistry,1997,69(16):3212-3217.

[7] Lee, G B. The hydrodynamic focusing effect inside rectangular microchannels[J].Journal of Micromechanics and Microengineering,2006,16(5):1024-1032.

[8] 岳保紅,孫曉莉.正確認(rèn)識(shí)流式細(xì)胞術(shù)在血液腫瘤診斷中的價(jià)值與作用[J].中華臨床醫(yī)師雜志(電子版),2013(12):5201-5205.

[9] 陳實(shí).用于微流體芯片的PDMS被動(dòng)式微混合器研究[D].上海:上海交通大學(xué),2007.

[10] 林秉承,秦建華.微流控芯片實(shí)驗(yàn)室[M].北京:科學(xué)出版社,2006.

[11] 林秉承,秦建華.圖解微流控芯片實(shí)驗(yàn)室[M].北京:科學(xué)出版社,2008.endprint

猜你喜歡
主通道偏移量粒子
基于格網(wǎng)坐標(biāo)轉(zhuǎn)換法的矢量數(shù)據(jù)脫密方法研究
寧波舟山港主通道項(xiàng)目全線建成通車
品質(zhì)工程的浙江范本
——浙江舟山港主通道百年品質(zhì)工程建設(shè)的理念與措施
基于粒子群優(yōu)化的橋式起重機(jī)模糊PID控制
試論快修式倒虹吸系統(tǒng)
基于粒子群優(yōu)化極點(diǎn)配置的空燃比輸出反饋控制
攪拌針不同偏移量對(duì)6082-T6鋁合金接頭勞性能的影響
基于最小二乘平差的全極化SAR配準(zhǔn)偏移量估計(jì)方法
淺談第六代超深水鉆井船逃生路線的設(shè)計(jì)
基于Matlab的α粒子的散射實(shí)驗(yàn)?zāi)M