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慢病毒介導(dǎo)CDCA5敲低的三陰乳腺癌細(xì)胞的構(gòu)建及鑒定

2018-06-13 03:34:26呂璐冶黃燕李萬(wàn)金韓秋影宋楠張學(xué)敏周濤
生物技術(shù)通訊 2018年3期
關(guān)鍵詞:核酸質(zhì)粒測(cè)序

呂璐冶,黃燕,李萬(wàn)金,韓秋影,宋楠,張學(xué)敏,周濤

國(guó)家生物醫(yī)學(xué)分析中心,北京 100850

乳腺癌是一類(lèi)發(fā)生在乳腺腺上皮組織的惡性腫瘤[1],其發(fā)病率位居女性腫瘤第一位,約占女性新發(fā)腫瘤的30%,致死人數(shù)占女性腫瘤死亡總?cè)藬?shù)的14%[2-4]。其中三陰乳腺癌(triple-negativebreast cancer)患者約占乳腺癌患者總體病例的20%,其特點(diǎn)是腫瘤細(xì)胞缺乏雌激素受體(estrogenreceptor,ER)、孕激素受體(progesteronereceptor,PR)和人表皮生長(zhǎng)因子受體2(humanepidermalgrowthfactor receptor2,HER2)的表達(dá)[5-7]。與非三陰乳腺癌相比,三陰乳腺癌往往具有較快的腫瘤進(jìn)程和較強(qiáng)的侵襲性,并且對(duì)化療響應(yīng)差?;颊甙l(fā)病5年內(nèi)具有較高的復(fù)發(fā)率及死亡率[8-10]。目前臨床使用的主要治療手段如手術(shù)、放化療、免疫治療、內(nèi)分泌治療等,對(duì)三陰乳腺癌治療效果有限,因而尋找新的三陰乳腺癌治療靶點(diǎn)具有重要意義[9,11]。

細(xì)胞分裂周期相關(guān)蛋白5(celldivisioncy?cleassociated5,CDCA5)是細(xì)胞周期有絲分裂檢查點(diǎn)重要復(fù)合物——Cdh1激活的后期促進(jìn)復(fù)合物(anaphase-promotingcomplex,APC)的底物,參與調(diào)節(jié)姐妹染色單體與黏連蛋白的結(jié)合[12-14]。CDCA5在脊椎動(dòng)物中廣泛表達(dá),保守性強(qiáng),且在其他種類(lèi)生物如酵母、爪蛙卵中存在同源基因,同樣參與調(diào)節(jié)黏連蛋白與染色體之間的相互作用[13]。有研究指出,敲除CDCA5顯著影響G2期細(xì)胞維持黏連蛋白與DNA穩(wěn)定結(jié)合[15]。近年研究發(fā)現(xiàn)CDCA5在多種亞型肺癌中高表達(dá),超過(guò)70%的非小細(xì)胞肺癌呈CDCA5陽(yáng)性,并且指示不良預(yù)后[16]。但是CDCA5作為癌基因,在乳腺癌及其他腫瘤中是否發(fā)揮作用有待研究。

RNA干擾(RNAinterference,RNAi)技術(shù)是一種能夠特異性敲低或沉默體內(nèi)目的基因表達(dá)的分子生物學(xué)技術(shù)[17-18],具有高效、穩(wěn)定、特異性強(qiáng)、可遺傳等優(yōu)點(diǎn),是生物學(xué)研究的重要工具[19-21]。慢病毒載體是一種基于逆轉(zhuǎn)錄病毒發(fā)展出的基因載體,能夠高效地將外源基因整合進(jìn)宿主細(xì)胞,并持續(xù)穩(wěn)定表達(dá)。慢病毒載體的應(yīng)用克服了瞬轉(zhuǎn)過(guò)程中轉(zhuǎn)染效率差、干擾RNA表達(dá)時(shí)間短等問(wèn)題,目前在生物學(xué)研究中已得到廣泛應(yīng)用。

本實(shí)驗(yàn)室前期研究表明CDCA5蛋白在三陰乳腺癌患者癌組織中高表達(dá),且與患者不良預(yù)后存在正相關(guān),指示CDCA5在三陰乳腺癌中可能存在重要功能。為深入探討CDCA5在三陰乳腺癌增殖、轉(zhuǎn)移中的作用及相關(guān)分子機(jī)制,我們應(yīng)用慢病毒感染體系和RNAi技術(shù),構(gòu)建了穩(wěn)定干涉CDCA5表達(dá)的三陰乳腺癌細(xì)胞MDA-MB-231,為進(jìn)一步研究提供重要的實(shí)驗(yàn)材料。

1 材料與方法

1.1 材料

MDA-MB-231細(xì)胞、用于病毒包裝的HEK293細(xì)胞來(lái)源于本實(shí)驗(yàn)室細(xì)胞庫(kù);大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞購(gòu)自Genstar科技有限公司;pLKO.1空載體質(zhì)粒(嘌呤霉素抗性)、對(duì)照組質(zhì)粒來(lái)源于本實(shí)驗(yàn)室質(zhì)粒庫(kù)。

限制性核酸內(nèi)切酶、T4DNA連接酶購(gòu)自Ther?moFisherScientific有限公司;核酸膠回收試劑盒、小提質(zhì)粒提取試劑盒均購(gòu)自Promega公司;Opti-MEM、DMEM培養(yǎng)基、RPMI1640培養(yǎng)基、磷酸鈣轉(zhuǎn)染試劑、抗生素(青霉素、鏈霉素)、胰蛋白酶均購(gòu)自邁晨科技有限公司;胎牛血清購(gòu)自Hy?clone公司;2×上樣緩沖液購(gòu)自北京鼎國(guó)科技有限公司;蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)印PVDF膜購(gòu)自GEHealthcare公司;免疫印跡用兔抗人CDCA5抗體購(gòu)自SigmaAl?drich公司;鼠抗人Tubulin抗體購(gòu)自CellSignal?lingTechnology公司;辣根過(guò)氧化物酶標(biāo)記的兔抗人二抗購(gòu)自Jakson公司;ECL顯影試劑購(gòu)自威哥拉斯公司;CellTiter96AqueousOneSolution CellProliferationAssay購(gòu)自Promega公司。

細(xì)菌培養(yǎng)箱購(gòu)自上海一恒科技有限公司;PCR儀購(gòu)自Biometra公司;恒溫金屬浴購(gòu)自杭州恩盛公司;恒溫?fù)u床購(gòu)自上海恒智公司;細(xì)胞孵箱購(gòu)自SANYO公司;藍(lán)光切膠儀購(gòu)自無(wú)錫博弗瑞德公司;核酸電泳儀購(gòu)自Bio-Rad公司;熒光儀購(gòu)自TECAN公司;常溫高速離心機(jī)購(gòu)自Sigma公司;低溫高速離心機(jī)購(gòu)自Eppendorf公司;細(xì)胞操作臺(tái)購(gòu)自Airtech公司。

1.2CDCA5短發(fā)夾RNA(shRNA)引物設(shè)計(jì)

在 PublicTRCPortal(https://portals.broadinsti?tute.org/gpp/public/)和 Sigma網(wǎng)站(https://www.sig?maaldrich.com/)在線(xiàn)設(shè)計(jì)人源CDCA5特異shRNA干涉序列,選擇其中2條得分較高且適用于pLKO.1載體構(gòu)建的序列(表1、2)。

1.3CDCA5shRNA慢病毒質(zhì)粒的構(gòu)建與鑒定

①將合成的CDCA5shRNA單鏈引物稀釋至10μmol/L,取互補(bǔ)的單鏈引物(1#F和1#R,或2#F和2#R)對(duì)應(yīng)等量混勻;②取混合液5μL,加入5μL10×退火緩沖液、40μLddH2O配制成引物退火體系,置95℃水浴鍋中加熱15min,停止加熱4h后體系溫度達(dá)到室溫,完成退火;③取pLKO.1空載體質(zhì)粒5μg,加入10×緩沖液、限制性?xún)?nèi)切酶EcoRⅠ和AgeⅠ各5μL,用ddH2O補(bǔ)齊至50μL酶切體系,于37℃水浴鍋中酶切1h;④將酶切產(chǎn)物加入1.5%瓊脂糖核酸膠中,130V恒壓進(jìn)行凝膠電泳,根據(jù)酶切位點(diǎn)確定目的片段大小并切下目的條帶,用膠回收試劑盒回收載體酶切DNA片段;⑤各取回收的pLKO.1酶切片段和shRNA引物1μL退火,加入T4DNA連接酶和緩沖液各1μL,與6μLddH2O混合均勻,室溫連接2h;⑥將30μL大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞置于冰上,加入5μL連接產(chǎn)物混勻,配制成轉(zhuǎn)化體系,30min后在42℃水浴鍋熱激90s,迅速冰浴10min;⑦向轉(zhuǎn)化體系中加入無(wú)抗LB液體培養(yǎng)基500 μL,37℃搖床孵育1h,3000r/min常溫離心3min后棄300μL上清,重懸菌液,均勻涂布于LB固體培養(yǎng)基(含氨芐青霉素),37℃細(xì)菌孵箱中過(guò)夜;⑧用限制性?xún)?nèi)切酶EcoRⅠ和AgeⅠ對(duì)LB固體培養(yǎng)基中的單克隆進(jìn)行雙酶切,產(chǎn)物通過(guò)核酸膠電泳鑒定;⑨選取有明顯條帶的陽(yáng)性單克隆菌落分別加入5mLLB液體培養(yǎng)基(含氨芐青霉素)進(jìn)行培養(yǎng),用試劑盒提取質(zhì)粒并測(cè)序。

表1 CDCA5干涉靶序列

表2CDCA5shRNA引物序列

1.4 病毒包裝、感染

在10cm培養(yǎng)皿內(nèi)接種1×106HEK293細(xì)胞,待細(xì)胞貼壁,細(xì)胞密度達(dá)到50%左右時(shí)進(jìn)行病毒包裝:①將 VSVG(1.5 μg)、PAX2(4.5 μg)、對(duì)照組質(zhì)?;駽DCA5干涉質(zhì)粒(6μg)加入1mL HBS中,輕柔混勻,室溫靜置5min;②向該混合液中緩慢加入67μLCaCl2,混勻后室溫靜置15 min;③將混合液逐滴均勻加入HEK293細(xì)胞中,轉(zhuǎn)染10h后更換為10mLDMEM完全培養(yǎng)基;④分別于轉(zhuǎn)染后48和72h收集病毒,48h第一次收集培養(yǎng)上清并補(bǔ)加新鮮培養(yǎng)基,室溫1500r/min離心5min,取上清在50mL離心管中于4℃保存,72h第二次收集病毒;⑤將2次收集的上清液混勻,1500r/min離心5min;⑥取培養(yǎng)基上清加入病毒濃縮柱中,6000r/min低溫離心30 min,收集濾芯中含病毒培養(yǎng)基,-80℃儲(chǔ)存;⑦將2×106MDA-MB-231細(xì)胞接種于10cm培養(yǎng)皿,待完全貼壁后更換為10mL含8μL促感染劑聚凝胺(Polybrane)的RPMI1640完全培養(yǎng)基;⑧向MDA-MB-231細(xì)胞中均勻滴加濃縮后病毒,恒溫細(xì)胞孵箱培養(yǎng)24h;⑨撤去含病毒培養(yǎng)基,更換為含嘌呤霉素(2μg/mL)的RPMI1640完全培養(yǎng)基繼續(xù)培養(yǎng),直至細(xì)胞無(wú)大面積死亡,完成篩選。

1.5 細(xì)胞感染后的干涉效果和增殖能力檢測(cè)

將用嘌呤毒素篩選過(guò)的表達(dá)穩(wěn)定干涉質(zhì)粒的MDA-MB-231細(xì)胞培養(yǎng)皿置于冰上,棄掉培養(yǎng)基,用PBS清洗2次,用細(xì)胞裂解液(20mmol/L pH7.4Tris-HCl,3mmol/LEDTA,3mmol/LEG?TA,0.5%NP40,250mmol/LNaCl,50×Cocktail)裂解10min,收集裂解產(chǎn)物,12000r/min低溫離心3min,收集上清加入等量2×上樣緩沖液混勻,105℃金屬浴加熱30min,使樣品蛋白質(zhì)充分變性,用Western印跡檢測(cè)CDCA5蛋白的表達(dá)水平。

將篩選后的MDA-MB-231細(xì)胞進(jìn)行消化處理,將對(duì)照組和干涉組細(xì)胞用臺(tái)盼藍(lán)進(jìn)行活細(xì)胞計(jì)數(shù),種入7個(gè)96孔板中,每孔接種2×103細(xì)胞,每種細(xì)胞種3個(gè)復(fù)孔,分別于接種培養(yǎng)的第0、24、48、72、96、120、144h檢測(cè)每孔細(xì)胞活力。

2 結(jié)果

2.1 pLKO.1-CDCA5-shRNA質(zhì)粒構(gòu)建

利用數(shù)據(jù)庫(kù)信息設(shè)計(jì)了特異針對(duì)人源CDCA5進(jìn)行干涉的引物序列。將退火引物加入DNA核酸膠中進(jìn)行電泳,發(fā)現(xiàn)核酸凝膠最前端出現(xiàn)明顯條帶(圖1),表明引物退火成功。根據(jù)需求選取EcoRⅠ和AgeⅠ酶切位點(diǎn)對(duì)pLKO.1空載體進(jìn)行雙酶切。將載體片段與退火產(chǎn)物進(jìn)行連接,構(gòu)建pLKO.1-CDCA5-shRNA質(zhì)粒。

2.2 菌液鑒定與質(zhì)粒測(cè)序

將2種CDCA5干涉質(zhì)粒進(jìn)行轉(zhuǎn)化后,分別挑選2株單克隆進(jìn)行菌落酶切鑒定。PCR產(chǎn)物DNA凝膠電泳結(jié)果如圖2,核酸膠中1#、2#干涉質(zhì)粒菌落均有明顯條帶,表明pLKO.1-CDCA5-shRNA質(zhì)粒構(gòu)建成功。培養(yǎng)陽(yáng)性菌落,提取質(zhì)粒并測(cè)序,將測(cè)序結(jié)果與shCDCA5-mRNA進(jìn)行堿基序列比對(duì),發(fā)現(xiàn)特異性干涉CDCA5基因的DNA片段成功插入pLKO.1空載體(圖3),表明pLKO.1-CDCA5-shRNA質(zhì)粒構(gòu)建成功。

2.3 MDA-MB-231中敲低CDCA5的干涉效果檢測(cè)

將對(duì)照組質(zhì)粒與干涉組質(zhì)粒用磷酸鈣轉(zhuǎn)染法進(jìn)行病毒包裝,收集48與72h含病毒培養(yǎng)基,用100k病毒濃縮柱濃縮病毒,感染人乳腺癌細(xì)胞系MDA-MB-231,24h后進(jìn)行抗性篩選。收集篩選得到的穩(wěn)定表達(dá)干涉質(zhì)粒的細(xì)胞樣品,通過(guò)Western印跡檢測(cè)CDCA5蛋白質(zhì)表達(dá)水平,結(jié)果見(jiàn)圖4,與對(duì)照組相比,表達(dá)1#、2#干涉質(zhì)粒的細(xì)胞CDCA5蛋白表達(dá)水平顯著降低,2條干涉序列對(duì)CDCA5敲低效果明顯。

圖1CDCA5干涉序列引物退火結(jié)果

圖2 菌落酶切鑒定結(jié)果

圖3 pLKO.1-CDCA5-shRNA質(zhì)粒測(cè)序

2.4 MDA-MB-231中敲低CDCA5后顯著抑制細(xì)胞增殖能力

細(xì)胞完成病毒感染、抗性篩選后,計(jì)數(shù)種入96孔板,用 CellTiter96AqueousOneSolution CellProliferationAssay分別檢測(cè)接種后第0、24、48、72、96、120、144h的細(xì)胞活力。結(jié)果顯示,敲低CDCA5能顯著抑制MDA-MB-231的細(xì)胞增殖能力(圖5)。

3 討論

乳腺癌是女性常見(jiàn)的癌癥和主要的癌癥致死原因[1-4]。隨著社會(huì)發(fā)展、人口老齡化、生化壓力增大及生態(tài)環(huán)境的惡化,乳腺癌發(fā)病率和復(fù)發(fā)率逐漸升高,并已成為威脅人類(lèi)生存與社會(huì)發(fā)展的嚴(yán)重疾病和重大公共衛(wèi)生問(wèn)題[3]。而三陰乳腺癌因其惡性程度高、對(duì)化療的不敏感及缺乏ER、PR、HER2等常規(guī)靶點(diǎn)的表達(dá),從發(fā)現(xiàn)以來(lái)便成為人們想要解決的重點(diǎn)問(wèn)題[5-7,11]。因此,探索和發(fā)現(xiàn)三陰乳腺癌中新的基因靶點(diǎn)具有重大意義。

圖4CDCA5shRNA敲低CDCA5基因的效果檢測(cè)

CDCA5在人體多個(gè)組織器官中高表達(dá),如骨髓、睪丸、胃、淋巴結(jié)、脾臟等,并且在一些癌細(xì)胞中也明顯高表達(dá),如非小細(xì)胞肺癌、口腔鱗狀細(xì)胞癌、前列腺癌、胃癌等[16,22-24]。且文獻(xiàn)報(bào)道其與ERK通路、周期蛋白E1等具有相互作用,指示其在癌細(xì)胞增殖中發(fā)揮重要作用,但是CDCA5在三陰乳腺癌中的生理學(xué)功能還有待探索[16,23-24]。

前期,我們通過(guò)大數(shù)據(jù)分析發(fā)現(xiàn)CDCA5在三陰乳腺癌細(xì)胞中高表達(dá)。為了研究CDCA5在三陰乳腺癌中的調(diào)控功能,本實(shí)驗(yàn)室利用RNAi技術(shù)和慢病毒感染體系,構(gòu)建了穩(wěn)定干涉CDCA5的MDA-MB-231細(xì)胞系。在隨后的細(xì)胞活力檢測(cè)實(shí)驗(yàn)中,我們發(fā)現(xiàn)在干涉CDCA5后能夠顯著抑制三陰乳腺癌細(xì)胞的增殖能力,表明CDCA5在人三陰乳腺癌細(xì)胞MDA-MB-231增殖過(guò)程中發(fā)揮重要作用。那么CDCA5在三陰乳腺癌的發(fā)生、發(fā)展、轉(zhuǎn)移過(guò)程中是否具有調(diào)控作用,以及CDCA5對(duì)三陰乳腺癌患者抵抗放化療及復(fù)發(fā)具有怎樣的影響?本研究將為我們進(jìn)一步探索CDCA5在三陰乳腺癌中的功能及相應(yīng)機(jī)制提供實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)。

圖5 敲低CDCA5抑制MDA-MB-231細(xì)胞增殖能力

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