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紫丁香查爾酮異構(gòu)酶基因SoCHI的克隆及表達(dá)分析

2018-08-30 06:55李彥慧
關(guān)鍵詞:紫丁香花期氨基酸

王 蕊, 李彥慧, 鄭 健

(1. 北京農(nóng)學(xué)院園林學(xué)院 北京林果業(yè)生態(tài)環(huán)境功能提升協(xié)同創(chuàng)新中心, 北京 102206; 2. 河北農(nóng)業(yè)大學(xué)園林與旅游學(xué)院, 河北 保定 071000)

黃酮類化合物是一類重要的植物次生代謝產(chǎn)物,在植物花色形成過(guò)程中具有重要作用。查爾酮異構(gòu)酶(chalcone isomerase,CHI)在黃酮類化合物的合成過(guò)程中起關(guān)鍵作用,能夠催化查爾酮異構(gòu)化為4,5,7-三羥基黃烷酮(naringenin),并在其他酶的催化作用下形成不同的黃酮類化合物[1]。1967年,Moustafa等[2]首先從大豆〔Glycinemax(Linn.) Merr.〕中純化獲得第1個(gè)CHI蛋白;20年后,Mehdy等[3]首次從菜豆(PhaseolusvulgarisLinn.)中克隆獲得CHI基因的cDNA序列;隨后,研究人員從玉米(ZeamaysLinn.)[4]、碧冬茄〔Petuniahybrida(J. D. Hook.) Vilm.〕[5]、銀杏(GinkgobilobaLinn.)[6]、番薯〔Ipomoeabatatas(Linn.) Lam.〕[7]和金魚(yú)草(AntirrhinummajusLinn.)[8]等植物中均克隆到CHI基因。近年來(lái),通過(guò)基因工程技術(shù)調(diào)控CHI基因表達(dá)、改變植物花色的研究屢見(jiàn)報(bào)道[9-11],對(duì)于觀花植物花色育種具有重要意義。

紫丁香(SyringaoblataLindl.)又名華北紫丁香,隸屬于木犀科(Oleaceae)丁香屬(SyringaLinn.),為落葉灌木。紫丁香適應(yīng)性強(qiáng),耐寒、耐旱、耐瘠薄,病蟲(chóng)害較少,并具有花序碩大、開(kāi)花繁茂及花色和花香獨(dú)特等特點(diǎn),是一種極具觀賞價(jià)值的園林植物;該種可孤植、對(duì)植或片植,常作為公園、庭園和街頭綠地的觀花灌木廣泛應(yīng)用于中國(guó)北方園林綠化。目前,關(guān)于紫丁香的研究主要集中在花期[12]、繁育技術(shù)[13]和抗逆生理[14]等方面,而關(guān)于其花色的研究尚處于起步階段,僅見(jiàn)關(guān)于紫丁香花色素生物合成相關(guān)基因[15]的研究報(bào)道以及肉桂酸4-羥化酶基因(SoC4H)時(shí)空表達(dá)模式[16]的研究報(bào)道。實(shí)際上,紫丁香花擁有從淺粉色到紫色再到深紫色等多種顏色,然而關(guān)于其花呈色的分子機(jī)制尚未清楚,阻礙了紫丁香花色育種研究進(jìn)展。

為了探明紫丁香花色形成的分子機(jī)制,作者采用RACE技術(shù)從紫丁香花中克隆獲得CHI基因的cDNA全長(zhǎng)序列,對(duì)該基因編碼蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)、氨基酸序列同源性以及結(jié)構(gòu)和功能進(jìn)行了分析,并采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)對(duì)該基因在紫丁香不同器官和花期的表達(dá)特性進(jìn)行了研究,以期明確紫丁香花色形成的分子機(jī)制,為利用基因工程技術(shù)培育紫丁香新品種提供理論基礎(chǔ)和備選基因。

1 材料和方法

1.1 材料

在北京農(nóng)學(xué)院林木種質(zhì)資源圃內(nèi)選擇生長(zhǎng)健壯且無(wú)病蟲(chóng)害的紫丁香植株,采集葉片和花,置于-80℃冰箱中保存,分別用于總DNA和總RNA的提??;在該種質(zhì)資源圃中隨機(jī)選擇3株生長(zhǎng)健壯且無(wú)病蟲(chóng)害的紫丁香植株,在東、南、西、北4個(gè)方向分別采集嫩枝、嫩葉、成熟葉、花和根,并在花芽期、花蕾期、初花期、盛花期和末花期采集樣株的花,單株樣品混勻后置于-80℃冰箱中保存,分別用于不同器官和花期紫丁香CHI基因的表達(dá)特性分析。

實(shí)驗(yàn)使用的RNA提取試劑盒、RNA反轉(zhuǎn)錄試劑盒、2×EasyTaq? PCR SuperMix、質(zhì)粒提取試劑盒、pEASY-T載體和大腸桿菌菌株DH5α感受態(tài)細(xì)胞均購(gòu)自北京全式金生物技術(shù)有限公司,切膠回收試劑盒和SYBR?PremixExTaqTMⅡ(Tli RNaseH Plus)購(gòu)自寶生物工程(大連)有限公司,3′RACE和5′RACE試劑盒購(gòu)自北京百泰克生物技術(shù)有限公司;引物合成及測(cè)序工作均由北京三博遠(yuǎn)志生物技術(shù)有限責(zé)任公司完成。

1.2 方法

1.2.1 紫丁香CHI基因的克隆 參照李榮華等[17]的改良CTAB法提取紫丁香葉片的總DNA。

使用RNA提取試劑盒,按照說(shuō)明書(shū)操作流程提取紫丁香花的總RNA;按照RNA反轉(zhuǎn)錄試劑盒說(shuō)明書(shū)上的操作流程將提取的總RNA進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,獲得cDNA第1條鏈。使用BLASTn軟件(https:∥blast. ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi),將Zheng等[15]測(cè)序獲得的紫丁香CHI基因序列與NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中其他植物的CHI基因序列進(jìn)行比對(duì),確定CHI基因的保守區(qū);根據(jù)該基因的保守區(qū)序列設(shè)計(jì)引物SoCHI-1F和SoCHI-1R

(引物序列分別為 5′-T ̄T ̄G ̄G ̄A ̄A ̄C ̄C ̄T ̄A ̄C ̄A ̄C

C ̄G ̄A ̄T ̄G ̄C ̄T-3′和5′-A ̄A ̄C ̄A ̄C ̄C ̄G ̄T ̄G ̄C ̄T ̄T ̄G ̄C ̄C ̄A ̄A ̄T ̄T ̄A-3′),以cDNA第1條鏈為模板進(jìn)行擴(kuò)增反應(yīng),獲得紫丁香CHI基因cDNA序列的中間片段;設(shè)計(jì)3′RACE引物SoCHI-2F和SoCHI-3F(引物序列分別為5′-C ̄C ̄A ̄G ̄A ̄A ̄T ̄C ̄C ̄G ̄G ̄G ̄A ̄A ̄T ̄G ̄C ̄A ̄G ̄T ̄T ̄A ̄T ̄A ̄T ̄A ̄G-3′和5′-C ̄G ̄G ̄A ̄A ̄G ̄C ̄A ̄G ̄T ̄G ̄C ̄T ̄G ̄C ̄A ̄G ̄T ̄C ̄T ̄A ̄T ̄A ̄A ̄T ̄T ̄G ̄G ̄C-3′),以cDNA第1條鏈為模板,使用3′RACE試劑盒進(jìn)行擴(kuò)增反應(yīng),獲得紫丁香CHI基因cDNA序列的3′端片段;設(shè)計(jì)5′RACE引物SoCHI-2R和SoCHI-3R(引物序列分別為5′-G ̄G ̄A ̄A ̄A ̄G ̄T ̄T ̄T ̄C ̄G ̄T ̄T ̄C ̄T ̄T ̄G ̄A ̄A ̄G ̄A ̄C ̄C-3′和5′-C ̄T ̄C ̄C ̄A ̄A ̄G ̄A ̄A ̄C ̄T ̄T ̄T ̄T ̄C ̄A ̄A ̄T ̄T ̄G ̄C ̄T ̄T ̄T ̄A ̄G ̄A ̄C-3′),以cDNA第1條鏈為模板,使用5′RACE試劑盒進(jìn)行擴(kuò)增反應(yīng),獲得紫丁香CHI基因cDNA序列的5′端片段。擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)電泳檢測(cè)、膠回收、連接載體、轉(zhuǎn)化大腸桿菌、檢測(cè)陽(yáng)性克隆和測(cè)序后,使用DNAMAN 7.0軟件將擴(kuò)增獲得的紫丁香CHI基因cDNA序列的中間片段、3′端片段和5′端片段進(jìn)行拼接,獲得紫丁香CHI基因的cDNA全長(zhǎng)序列。

設(shè)計(jì)能夠擴(kuò)增出紫丁香CHI基因的完整開(kāi)放閱讀框(ORF)的引物SoCHI-4F和SoCHI-4R(引物序列分別為5′-A ̄T ̄G ̄T ̄C ̄T ̄T ̄T ̄G ̄T ̄C ̄G ̄C ̄C ̄G ̄A ̄C ̄C ̄G ̄T-3′和5′-T ̄C ̄A ̄A ̄T ̄T ̄T ̄G ̄G ̄C ̄A ̄C ̄G ̄G ̄T ̄G ̄G ̄C ̄C ̄T-3′),分別以cDNA第1條鏈和總DNA為模板進(jìn)行擴(kuò)增反應(yīng),擴(kuò)增體系總體積20.0 μL,包括cDNA第1條鏈或總DNA 1.0 μL,上游引物和下游引物各0.4 μL,2×EasyTaq?PCR SuperMix 10.0 μL,ddH2O 8.2 μL。擴(kuò)增程序?yàn)椋?4 ℃預(yù)變性3 min;94 ℃變性30 s、55 ℃退火30 s、72 ℃延伸2 min,共30個(gè)循環(huán)反應(yīng);72 ℃延伸10 min。擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)電泳檢測(cè)、膠回收、連接載體、轉(zhuǎn)化大腸桿菌和檢測(cè)陽(yáng)性克隆后進(jìn)行測(cè)序。

1.2.2 紫丁香CHI基因序列分析及編碼蛋白質(zhì)特性分析 使用DNAMAN 7.0軟件尋找紫丁香CHI基因cDNA序列的開(kāi)放閱讀框,預(yù)測(cè)該基因編碼蛋白質(zhì)的氨基酸序列;使用NCBI(http:∥www.ncbi.nlm.nih.gov/)網(wǎng)站中的BLASTp軟件對(duì)該基因編碼蛋白質(zhì)的氨基酸序列進(jìn)行保守域預(yù)測(cè),并與NCBI網(wǎng)站UniProt數(shù)據(jù)庫(kù)中其他植物CHI蛋白的氨基酸序列進(jìn)行同源性比對(duì);使用ExPASy(http:∥www.expasy.org/)網(wǎng)站中的Compute PI/MW tool工具對(duì)該基因編碼蛋白質(zhì)的理論相對(duì)分子質(zhì)量和理論等電點(diǎn)進(jìn)行分析;同時(shí),使用GOR4和Swiss-Model軟件分別對(duì)該基因編碼蛋白質(zhì)的二級(jí)和三級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測(cè)分析。

1.2.3 紫丁香CHI基因的表達(dá)特性分析 參照苑笑陽(yáng)等[18]的方法,以SoActin7為內(nèi)參基因,采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)對(duì)紫丁香嫩枝、嫩葉、成熟葉、花和根以及花芽期、花蕾期、初花期、盛花期和末花期花中CHI基因的相對(duì)表達(dá)量進(jìn)行檢測(cè),每個(gè)單株視為1個(gè)重復(fù),共3個(gè)重復(fù)。使用的熒光定量PCR擴(kuò)增引物為SoCHI-5F 和 SoCHI-5R (引物序列分別為5′-C ̄A ̄C ̄C ̄G ̄T ̄G ̄C ̄T ̄T ̄G ̄C ̄C ̄A ̄A ̄T ̄T ̄A ̄T ̄A ̄G ̄A-3′ 和5′-G ̄A ̄A ̄T ̄C ̄C ̄G ̄G基因的相對(duì)表達(dá)量進(jìn)行檢測(cè)G ̄A ̄A ̄T ̄G ̄C ̄A ̄G ̄T ̄T ̄A ̄T ̄A ̄G ̄A-3′),內(nèi)參基因擴(kuò)增引物為SoActin-7F 和 SoActin-7R(引物序列分別為 5′-T ̄G基因的相對(duì)表達(dá)量進(jìn)行檢測(cè)G ̄A ̄A ̄T ̄G ̄T ̄G ̄C ̄T ̄G ̄A ̄G ̄A ̄G ̄A ̄T ̄G ̄C-3′ 和5′-T ̄G ̄C ̄T ̄G ̄A ̄C ̄C ̄G ̄T基因的相對(duì)表達(dá)量進(jìn)行檢測(cè)A ̄T ̄G ̄A ̄G ̄C ̄A ̄A ̄A ̄G-3′)。使用Bio-Rad iQTM5熒光定量PCR儀(美國(guó)Bio-Rad公司)進(jìn)行擴(kuò)增反應(yīng),擴(kuò)增體系總體積25.0L,包括cDNA模板1.0L,上游引物和下游引物各1.0L,SYBR?PremixExTaqTMⅡ(Tli RNaseH Plus)12.5L,ddH2O 9.5L。根據(jù)2計(jì)算紫丁香CHI基因在不同器官和花期的相對(duì)表達(dá)量。

2 結(jié)果和分析

2.1 紫丁香CHI基因cDNA和gDNA的全長(zhǎng)序列分析

擴(kuò)增結(jié)果表明:以紫丁香花中cDNA第1條鏈為模板擴(kuò)增獲得的紫丁香CHI基因cDNA序列的中間片段長(zhǎng)度為247 bp(圖1-A),通過(guò)與NCBI數(shù)據(jù)中的數(shù)據(jù)進(jìn)行比對(duì),該片段編碼的蛋白質(zhì)與多種植物CHI基因編碼的蛋白質(zhì)的同源性達(dá)90%以上;根據(jù)同源特異片段序列分別設(shè)計(jì)3′RACE和5′RACE特異引物進(jìn)行擴(kuò)增,分別獲得紫丁香CHI基因cDNA序列的3′端片段(圖1-B)和5′端片段(圖1-C),序列長(zhǎng)度分別約為270和460 bp;將上述3個(gè)片段測(cè)序后進(jìn)行拼接,獲得紫丁香CHI基因的cDNA全長(zhǎng)序列,命名為SoCHI。根據(jù)SoCHI基因3′端片段和5′端片段的序列設(shè)計(jì)引物,分別以紫丁香cDNA第1條鏈和總DNA為模板,擴(kuò)增獲得該基因cDNA(圖1-D)和gDNA(圖1-E)的全長(zhǎng)序列,經(jīng)比對(duì),SoCHI基因的cDNA序列與拼接后得到的cDNA序列一致,并且,該基因無(wú)內(nèi)含子,全部由外顯子構(gòu)成。

分析結(jié)果(圖2)表明:SoCHI基因的開(kāi)放閱讀框(ORF)長(zhǎng)度為684 bp,編碼227個(gè)氨基酸殘基,編碼的蛋白質(zhì)為SoCHI蛋白。

M: DNA marker; A: 中間片段 Intermediate fragment; B: 3′端片段 3′ terminal fragment; C: 5′端片段 5′ terminal fragment; D: cDNA全長(zhǎng)序列 Full-length sequence of cDNA; E: gDNA全長(zhǎng)序列 Full-length sequence of gDNA.圖1 紫丁香SoCHI基因的擴(kuò)增結(jié)果Fig. 1 Amplification result of SoCHI gene in Syringa oblata Lindl.

: 底物結(jié)合位點(diǎn) Substrate binding site; □: 氫鍵結(jié)合位點(diǎn) Hydrogen bond binding site; ▲: 活性催化位點(diǎn) Active catalytic site; *: 終止密碼子 Stop condon.圖2 紫丁香SoCHI基因的cDNA序列及其編碼的氨基酸序列Fig. 2 cDNA sequence of SoCHI gene in Syringa oblata Lindl. and its amino acid sequence encoded

2.2 SoCHI蛋白特性分析

2.2.1 理化性質(zhì)分析 分析結(jié)果表明:SoCHI蛋白的理論相對(duì)分子質(zhì)量24 988,理論等電點(diǎn)pI 5.53;其氨基酸序列包含21個(gè)帶正電荷的氨基酸殘基〔精氨酸(Arg)和賴氨酸(Lys)〕和24個(gè)帶負(fù)電荷的氨基酸殘基〔天冬氨酸(Asp)和谷氨酸(Glu)〕,并且,絲氨酸(Ser)、Lys、甘氨酸(Gly)、丙氨酸(Ala)和亮氨酸(Leu)含量較高;SoCHI蛋白的不穩(wěn)定系數(shù)為47.58,說(shuō)明該蛋白質(zhì)屬于不穩(wěn)定蛋白;其平均親水指數(shù)為-0.096,說(shuō)明該蛋白質(zhì)為親水性蛋白。

2.2.2 氨基酸序列同源性分析 將SoCHI蛋白的氨基酸序列與NCBI網(wǎng)站UniProt數(shù)據(jù)庫(kù)中其他植物CHI蛋白的氨基酸序列進(jìn)行比對(duì),桂花(OsmanthusfragransLour.)、油橄欖(OleaeuropaeaLinn.)、黑果枸杞(LyciumruthenicumMurr.)、金花茶(CamellianitidissimaChi)、忍冬(LonicerajaponicaThunb.)、金魚(yú)草、黃芩(ScutellariabaicalensisGeorgi)、芍藥(PaeonialactifloraPall.)和石榴(PunicagranatumLinn.)9種植物與紫丁香CHI蛋白的氨基酸序列相似性較高,同源性比對(duì)結(jié)果(圖3)表明:紫丁香與同科植物桂花(登錄號(hào)為ALL27265.1)和油橄欖(登錄號(hào)為AHI86005.1)CHI蛋白的同源性最高,為88%;其與黑果枸杞(登錄號(hào)為AHH86092.1)、金花茶(登錄號(hào)為ADZ28513.1)、忍冬(登錄號(hào)為AGE10599.1)、金魚(yú)草(登錄號(hào)為BAO32070.1)、黃芩(登錄號(hào)為AMW91737.1)、芍藥(登錄號(hào)為AEK32592.1)和石榴(登錄號(hào)為AHZ97871.1)CHI蛋白的同源性也較高,均在76%以上。

So: 紫丁香 Syringa oblata Lindl.; Of: 桂花 Osmanthus fragrans Lour.; Oe: 油橄欖Olea europaea Linn.; Lr: 黑果枸杞 Lycium ruthenicum Murr.; Cn: 金花茶 Camellia nitidissima Chi; Pl: 芍藥 Paeonia lactiflora Pall.; Pg: 石榴 Punica granatum Linn.; Am: 金魚(yú)草 Antirrhinum majus Linn.; Sb: 黃芩 Scutellaria baicalensis Georgi; Lj: 忍冬 Lonicera japonica Thunb.圖3 紫丁香及其他9種植物CHI蛋白氨基酸序列的同源性比對(duì)Fig. 3 Homology comparison on amino acid sequences of CHI protein in Syringa oblata Lindl. and other nine species

2.2.3 結(jié)構(gòu)及功能位點(diǎn)分析 對(duì)SoCHI蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)分析結(jié)果表明:在SoCHI蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)中,α-螺旋、延伸鏈和無(wú)規(guī)則卷曲分別包含72、46和109個(gè)氨基酸殘基,各占氨基酸殘基總數(shù)的31.7%、20.3%和48.0%。對(duì)SoCHI蛋白的三級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行建模(圖4),該蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)模型的QMEAN得分為0.78,且該蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)與擬南芥〔Arabidopsisthaliana(Linn.) Heynh.〕AtCHI蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu)的相似性為67.3%。

圖4 紫丁香SoCHI蛋白的三級(jí)結(jié)構(gòu)Fig. 4 Tertiary structure of SoCHI protein in Syringa oblata Lindl.

對(duì)SoCHI蛋白功能位點(diǎn)的分析結(jié)果(圖2)表明:該蛋白質(zhì)含有2個(gè)保守的氫鍵結(jié)合位點(diǎn)、2個(gè)活性催化位點(diǎn)和7個(gè)底物結(jié)合位點(diǎn),氫鍵結(jié)合位點(diǎn)分別位于第50位的蘇氨酸(Thr)和第108位的酪氨酸(Tyr)處;活性催化位點(diǎn)分別位于第115位的天冬酰胺(Asn)和第208位的Ser處,底物結(jié)合位點(diǎn)分別位于第38位的Arg處、第39位的Gly處、第40位的Leu處、第49位的苯丙氨酸(Phe)處、第52位的異亮氨酸(Ile)處、第111位的Lys處和第112位的纈氨酸(Val)處。這些位點(diǎn)均高度保守且相對(duì)位置保持不變。

2.3 SoCHI基因在紫丁香不同器官和花期的表達(dá)特性分析

2.3.1 在不同器官的表達(dá)特性分析 研究結(jié)果(圖5)表明:SoCHI基因在紫丁香的花、嫩葉、成熟葉、嫩枝和根中均有表達(dá),但其相對(duì)表達(dá)量存在明顯差異,表現(xiàn)為在嫩葉中最高,在成熟葉中次之,在花中也較高,在嫩莖中較少,在根中極低。

F: 花 Flower; TL: 嫩葉 Tender leaf; ML: 成熟葉 Mature leaf; TS: 嫩莖 Tender stem; R: 根 Root.圖5 紫丁香不同器官中SoCHI基因的相對(duì)表達(dá)量Fig. 5 Relative expression level of SoCHI gene in differennt organs of Syringa oblata Lindl.

2.3.2 在不同花期的表達(dá)特性分析 研究結(jié)果(圖6)表明:SoCHI基因在紫丁香花芽期、花蕾期、初花期、盛花期和末花期均有表達(dá),但其相對(duì)表達(dá)量存在明顯差異,表現(xiàn)為在花蕾期最高,在花芽期次之,在初花期和盛花期較低,在末花期最低。

FB: 花芽期 Flower bud stage; B: 花蕾期 Budding stage; EF: 初花期 Early flowering stage; FF: 盛花期 Full flowering stage; LF: 末花期 Late flowering stage.圖6 不同花期紫丁香花中SoCHI基因的相對(duì)表達(dá)量Fig. 6 Relative expression level of SoCHI gene in flower of Syringa oblata Lindl. at different flowering stages

3 討論和結(jié)論

紫丁香是中國(guó)北方地區(qū)常見(jiàn)的鄉(xiāng)土樹(shù)種之一,亦是國(guó)內(nèi)重要的木本花卉種類,花色和花香獨(dú)特,被廣泛用于園林綠化。本研究成功獲得紫丁香查爾酮異構(gòu)酶(CHI)完整的同源基因,命名為SoCHI,該基因的開(kāi)放閱讀框(ORF)長(zhǎng)度為684 bp,編碼227個(gè)氨基酸殘基,編碼的蛋白質(zhì)為SoCHI蛋白。相關(guān)研究結(jié)果表明:CHI基因?yàn)槎嗷蚣易?,且基因的結(jié)構(gòu)變異較大,如油橄欖的OeCHI基因及Lotusjaponicus(Regel) K. Larsen的LjCHI1和LjCHI3基因均包含4個(gè)外顯子和3個(gè)內(nèi)含子[19-20],大麥(HordeumvulgareLinn.)的HvCHI基因包含3個(gè)外顯子和2個(gè)內(nèi)含子[21],蕓薹屬(BrassicaLinn.)植物的BrCHI-2、BoCHI-2和BnCHI-2基因均包含6個(gè)外顯子和5個(gè)內(nèi)含子[22]。與上述植物CHI基因不同的是,紫丁香SoCHI基因無(wú)內(nèi)含子。

蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果表明:無(wú)規(guī)則卷曲在SoCHI蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)中所占比例最大(48.0%),α-螺旋次之(31.7%),延伸鏈最小(20.3%)。另外,SoCHI蛋白的氨基酸序列具有保守的氫鍵結(jié)合位點(diǎn)、活性催化位點(diǎn)和底物結(jié)合位點(diǎn),與油橄欖和金花茶等植物CHI蛋白的結(jié)構(gòu)相似[19,23],屬于查爾酮合酶超家族。同源性比對(duì)結(jié)果表明:紫丁香SoCHI蛋白與薔薇科(Rosaceae)、山茶科(Theaceae)、忍冬科(Caprifoliaceae)、茄科(Solanaceae)、唇形科(Lamiaceae)及芍藥科(Paeoniaceae)植物CHI蛋白的氨基酸序列同源性略低于同科植物油橄欖和桂花的CHI蛋白,表明CHI蛋白的氨基酸序列在不同植物中相對(duì)保守。

本研究中,SoCHI基因在紫丁香嫩葉中的相對(duì)表達(dá)量最高,其次為成熟葉,這可能是紫丁香嫩葉色素積累并呈現(xiàn)紫紅色的重要原因。相關(guān)研究結(jié)果[24-26]表明:查爾酮異構(gòu)酶處于植物體內(nèi)黃酮類化合物合成途徑的上游,對(duì)黃酮類化合物等次生代謝產(chǎn)物的合成具有重要作用,并且,CHI基因主要在生命活動(dòng)較旺盛的器官中表達(dá)。

周興文等[23]的研究結(jié)果表明:CHI基因在植物花呈色過(guò)程中起重要作用,且植物的花色素苷含量隨該基因表達(dá)量升高而升高。在紫丁香花發(fā)育過(guò)程中,SoCHI基因的相對(duì)表達(dá)量呈先升高后降低的變化趨勢(shì),在花發(fā)育早期特別是花蕾期最高,這一研究結(jié)果與紫丁香花蕾期花蕾顏色濃于盛花期和末花期花冠裂片顏色的現(xiàn)象相吻合。另外,CHI基因在金花茶[23]和紅掌(AthuriumandraeanumLind.)[27]等植物花發(fā)育過(guò)程中也存在類似的表達(dá)模式。根據(jù)上述研究結(jié)果推測(cè)CHI基因的表達(dá)量在不同植物花發(fā)育前期明顯升高有助于植物體內(nèi)花色素的積累。

綜上所述,SoCHI基因無(wú)內(nèi)含子,全部由外顯子構(gòu)成;SoCHI蛋白屬于不穩(wěn)定蛋白和親水性蛋白,其氨基酸序列相對(duì)保守;并且,SoCHI基因的表達(dá)與紫丁香花呈色關(guān)系密切。

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