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PLAC4基因用于21三體綜合征無創(chuàng)性產(chǎn)前診斷的可行性分析

2018-11-28 02:31胡春風(fēng)王翠艷劉紅英通訊作者
醫(yī)藥前沿 2018年34期
關(guān)鍵詞:創(chuàng)性雜合三體

胡春風(fēng) 王翠艷 劉紅英(通訊作者)

(濰坊醫(yī)學(xué)院遺傳學(xué)教研室 山東 濰坊 261053)

21-三體綜合征(Trisomy 21syndrome),又稱唐氏綜合征(Down's syndrome),是新生兒最常見的非整倍體染色體疾病[1-3]。主要臨床特征是智力低下,特殊面容和多器官發(fā)育遲緩,對(duì)人類傷害極大且無有效的治療方法。因此產(chǎn)前篩查和產(chǎn)期診斷是預(yù)防該疾病的重要手段[4]。目前臨床常用的染色體核型分析需要依賴有創(chuàng)性手段獲取胎兒細(xì)胞,對(duì)母胎均有一定的風(fēng)險(xiǎn)[5],因此無創(chuàng)性產(chǎn)前診斷為近年來的研究熱點(diǎn)。

2007年,Lo等[6]發(fā)現(xiàn)21號(hào)染色體上的胎盤特異性表達(dá)(Placental Specific Expression Gene,PLAC4)基因僅在胎盤表達(dá),具有胎兒特異性。這個(gè)發(fā)現(xiàn)為應(yīng)用胎兒游離核酸進(jìn)行21三體綜合征無創(chuàng)性產(chǎn)前診斷提供了科學(xué)依據(jù)。隨著基因組技術(shù)在產(chǎn)前診斷臨床應(yīng)用方面取得的最新進(jìn)展[9,10],有研究者提出母體血漿中PLAC4基因mRNA的定量分析將會(huì)有助于胎兒21三體綜合征的診斷[7,8]。

本研究通過檢測(cè)妊娠婦女和非妊娠婦女外周血中PLAC4基因mRNA表達(dá)水平差異以及計(jì)算分析健康人群PLAC4基因多態(tài)性位點(diǎn)雜合度,來探討PLAC4基因在21三體綜合征無創(chuàng)性產(chǎn)前診斷中應(yīng)用的可行性,為其臨床應(yīng)用奠定理論基礎(chǔ)。

1.材料與方法

1.1 研究對(duì)象

選擇2016年10月—2017年11月在濰坊市人民醫(yī)院進(jìn)行產(chǎn)前檢查的7~16周正常單胎妊娠婦女30例為孕婦組,同期進(jìn)行健康查體非妊娠婦女30例為對(duì)照組,均無內(nèi)外科疾病和吸煙史。簽署知情同意書后。抽取外周靜脈血5ml,置于乙二胺四乙酸二鈉(EDTA-Na2)抗凝管中,并于低溫冰箱保存。

1.2 方法

1.2.1 外周血PLAC4基因mRNA的表達(dá)水平檢測(cè)

1.2.1.1 全血RNA的提取 常規(guī)提取兩組婦女樣本的總RNA,終產(chǎn)物溶于20μl DEPC-ddH2O中,紫外分光光度計(jì)測(cè)定RNA的濃度和純度,將提取的總RNA進(jìn)行標(biāo)記并保存于-80℃冰箱。

1.2.1.2 PLAC4基因mRNA表達(dá)水平的檢測(cè) 抽取總RNA 10μl,熒光定量PCR技術(shù)檢測(cè)兩組PLAC4基因mRNA的表達(dá)水平,PLAC4基因PCR引物和探針序列如下:

PLAC4引物上游為5’-AAATGCAGATTCTCAGGTCCTAGTG-3’,下游為5’-TGCCGATGGTTCCTGGAA-3’;

PLAC4 Taqman探針為5’-CTGCAAGGTATTCCTG-3’。反應(yīng)總體系為25μl,其中cDNA 5μl,2×Premix緩沖液12.5μl,上下游引物各0.2μl,Taqman探針0.2μl。為確保實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的有效性,每次實(shí)驗(yàn)都設(shè)陰性對(duì)照組和4個(gè)標(biāo)準(zhǔn)品,每個(gè)樣本都平行做3個(gè)復(fù)孔。

PLAC4基因的PCR反應(yīng)條件:94℃預(yù)變性2min,93℃變性45s,60℃退火15s。循環(huán)10次,最后93℃變性30s,59℃退火45s,30個(gè)循環(huán)。

1.2.2 PLAC4基因SNP位點(diǎn)雜合度檢測(cè)

1.2.2.1 外周血基因組DNA的提取 使用DNA抽提試劑盒(中量血液基因組DNA提取試劑盒-離心柱型,北京天根公司)提取基因組DNA。操作步驟嚴(yán)格按照說明書進(jìn)行。紫外分光光度計(jì)測(cè)定DNA的濃度和純度,OD值介于1.8和2.0之間的留用。將提取的基因組DNA進(jìn)行標(biāo)記并冷凍于-80℃冰箱。

1.2.2.2 引物設(shè)計(jì) 查找NCBI數(shù)據(jù)庫,篩選PLAC4基因上雜合度較高的4個(gè)SNP位點(diǎn),候選位點(diǎn)為rs8130833,rs9977003,rs4818219和rs59066201。依據(jù)NCBI數(shù)據(jù)庫上PLAC4基因序列信息,合成引物序列。

1.2.2.3 檢測(cè)SNP位點(diǎn)雜合度 PCR成份組成:10XBuffer 2μl,Template 1μl,Primer F 0.5μl,Primer R 0.5μl,dNTP 0.5μl,TransStart Taq Polymerase 0.2μl,加 ddH2O補(bǔ)至 20μl。

PCR反應(yīng)條件:95℃預(yù)變性5min,95℃變性30s,58℃退火30sec,72℃延伸30sec,72℃ 終延伸5min,變性、退火和延伸進(jìn)行35個(gè)循環(huán)。

4個(gè)位點(diǎn)(rs8130833,rs9977003,rs4818219和rs59066201)的擴(kuò)增片段長度分別為492bp,487bp,576bp和474bp。

PCR產(chǎn)物經(jīng)蝦酶消化后,去除部分殘留二聚體和雜質(zhì)對(duì)測(cè)序的影響,將樣本送去金唯智公司測(cè)序。

2.結(jié)果

2.1 外周血中PLAC4基因mRNA的表達(dá)水平

兩組婦女外周血PLAC4 mRNA水平比較見表1。孕婦組PLAC4 mRNA表達(dá)水平的最小值為3.221×103copy/ml,最大值為13.657×103copy/ml,中位數(shù)為7.862×103copy/ml,對(duì)照組中均未檢測(cè)到PLAC4 mRNA的存在。兩組比較,差異有明顯統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.01)。因此,PLAC4mRNA可作為21三體綜合征的無創(chuàng)性產(chǎn)前診斷的生物學(xué)標(biāo)志物。

表1 兩組標(biāo)本PLAC4 mRNA 水平比較

2.2 PLAC4基因SNP位點(diǎn)雜合度分析

PLAC4基因4個(gè)SNP位點(diǎn)PCR產(chǎn)物擴(kuò)增結(jié)果見圖1,4個(gè)位點(diǎn)的原始?jí)A基均為A,rs4818219,rs8130833,rs59066201和rs9977003 原始位點(diǎn)A的基因頻率分別為0.7833,0.850,0.700和0.0167,可以計(jì)算得出PLAC4基因上3個(gè)位點(diǎn)(rs4818219,rs8130833和rs59066201)的雜合度較高,分別為0.339,0.255和0.420(表2),可作為本地人群21三體綜合征無創(chuàng)性產(chǎn)前診斷的候選位點(diǎn)。

圖1 PCR產(chǎn)物電泳結(jié)果

表2 SNP位點(diǎn)雜合度分析

3.討論

21三體綜合征是最常見的染色體病之一。近年來,染色體核型分析一直是臨床上21三體綜合征產(chǎn)前診斷的金標(biāo)準(zhǔn)[11,12]。由于該方法是使用有創(chuàng)性手段獲取胎兒細(xì)胞,有一定的風(fēng)險(xiǎn),故不能在孕婦中廣泛開展。因此無創(chuàng)性產(chǎn)前診斷已被大量倡導(dǎo)。近年來學(xué)者們致力于探討應(yīng)用母血中胎兒游離核酸無創(chuàng)性產(chǎn)前診斷21三體綜合征的可行性。

本研究中,我們分別檢測(cè)了孕婦組和非孕婦對(duì)照組外周血中PLAC4基因mRNA的表達(dá)水平,結(jié)果顯示,孕婦組PLAC4基因mRNA濃度中位數(shù)為7.862×103copy/ml,而非孕婦組中均未檢測(cè)到PLAC4基因mRNA的存在,因此PLAC4基因mRNA在兩組婦女外周血中的表達(dá)水平存在明顯差異,具有妊娠特異性,可視為21三體綜合征產(chǎn)前診斷的生物學(xué)標(biāo)志物。而且我們利用PCR和DNA測(cè)序技術(shù)對(duì)PLAC4基因上4個(gè)SNP位點(diǎn)的雜合度進(jìn)行了分析。結(jié)果顯示其中3個(gè)位點(diǎn),即rs4818219,rs8130833和rs59066201的雜合度高于20%,可作為PLAC4基因21三體綜合征無創(chuàng)性產(chǎn)前診斷的候選位點(diǎn)。

孕婦外周血中胎兒特異性mRNA的發(fā)現(xiàn)為無創(chuàng)性產(chǎn)前診斷的研究開辟了新的篇章,從母血中尋找母體不表達(dá)的胎兒特異性mRNA,即不存在胎兒有核紅細(xì)胞微量的缺點(diǎn),又成功避開了龐大的母體背景,實(shí)為從母血中無創(chuàng)性獲取胎兒遺傳物質(zhì)的最佳途徑。

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