史志坤 朝陽市疾病預(yù)防控制中心 微生物檢測所 (遼寧 朝陽 122000)
內(nèi)容提要: 目的:探討實(shí)時熒光定量PCR儀用于流感病毒檢測的效果。方法:選擇2016年11月~2017年12月本實(shí)驗(yàn)室收治210例流感病樣病例的患者作為本次實(shí)驗(yàn)的研究對象,運(yùn)用實(shí)時熒光PCR法測定患者的咽拭子標(biāo)本的流感病毒核酸,檢測呈陽性標(biāo)本執(zhí)行MDCK培養(yǎng)并給予分離,分析兩種方法的檢測結(jié)果,對比特異性、靈敏度。結(jié)果:實(shí)時熒光定量PCR儀檢測出陽性標(biāo)本72例,陽性率34.3%;細(xì)胞培養(yǎng)法從72例陽性標(biāo)本中分離40例流感病毒,陽性率為19.0%。對比兩種方法檢測結(jié)果,實(shí)時熒光定量PCR儀檢測陽性率明顯比細(xì)胞培養(yǎng)法要高(P<0.05)。結(jié)論:實(shí)時熒光定量PCR儀可以迅速且有效檢測出流感病毒核酸,成為高效診斷方式。
目前流感病毒呈現(xiàn)變異高度化,耐藥性日益增強(qiáng),新亞型流感病毒不斷涌出等特點(diǎn),防控流感病毒的形勢極為嚴(yán)峻[1]。本次實(shí)驗(yàn)選擇2016年11月~2017年12月本實(shí)驗(yàn)室收治的210例流感病樣病例的患者作為本次實(shí)驗(yàn)的研究對象,實(shí)驗(yàn)研究結(jié)果如下。
選擇2016年11月~2017年12月本實(shí)驗(yàn)室收治的210例流感病樣病例的患者作為本次實(shí)驗(yàn)的研究對象,提取所有患者的咽拭子標(biāo)本,患者體溫都在38?C以上,并有咳嗽、咽痛等癥狀,標(biāo)本采集存放在3mL標(biāo)本管中,24h內(nèi)送去檢測。
所有標(biāo)本接受病毒核酸檢測,遵循試劑盒說明執(zhí)行RNA提取與反應(yīng)體系,運(yùn)用SDS軟件操作實(shí)時熒光PCR系統(tǒng),設(shè)立陽性與陰性對照,反應(yīng)程序分為以下:①5個循環(huán):50?C定為30min、95?C定為3min、95?C定為15s、50?C定為30min、72?C定為1min;②40個循環(huán):95?C定為10s、55?C定為40s。設(shè)定熒光素為FAM,當(dāng)55?C時,收集熒光信號。
經(jīng)實(shí)時熒光定量PCR儀檢測呈陽性標(biāo)本,運(yùn)用細(xì)胞培養(yǎng)法對其加以分離、接種,再對其類型加以分類。以25mL/瓶的比例接種每份標(biāo)本,每份標(biāo)本2瓶,第2天觀察標(biāo)本有無細(xì)胞病變(CPE)。借助豚鼠血執(zhí)行血凝試驗(yàn),對血凝素(HA)及其滴度進(jìn)行嚴(yán)密觀察,若HA滴度<1:8或者陰性培養(yǎng)物盲傳第2代之后依舊呈陰性的,就拋棄這些標(biāo)本。根據(jù)國家流感中心提供的標(biāo)準(zhǔn)參照血清,對符合HA滴度試驗(yàn)標(biāo)準(zhǔn)者試驗(yàn)HAI,并對病毒類型進(jìn)行分類。
經(jīng)細(xì)胞培養(yǎng)法檢測呈陽性菌株提取細(xì)胞培養(yǎng)液,依據(jù)實(shí)時熒光定量PCR儀檢測程序,再次開展檢驗(yàn)與病毒類型的分類。
此次實(shí)驗(yàn)所有數(shù)據(jù)全部由SPSS21.0版統(tǒng)計軟件進(jìn)行處理,計量資料采用±s表示,采用t檢驗(yàn)進(jìn)行組間數(shù)據(jù)對比;以%表示計數(shù)資料,采用χ2檢驗(yàn)比較組間資料。以P<0.05代表差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
實(shí)時熒光PCR法檢測出72例陽性標(biāo)本,138例陰性,陽性率34.3%;病毒分離培養(yǎng)法檢測出40例陽性標(biāo)本,170例陰性,陽性率為19.0%。對比兩種方法檢測結(jié)果,實(shí)時熒光定量PCR儀檢測陽性率明顯比細(xì)胞培養(yǎng)法要高(P<0.05)。
實(shí)時熒光PCR法檢測出72例陽性標(biāo)本,全部由病毒分離培養(yǎng)法檢測,其中45例呈陽性反應(yīng),運(yùn)用MDCK細(xì)胞分離培養(yǎng)法測定的138例標(biāo)本呈陰性,而此138例標(biāo)本是經(jīng)實(shí)時熒光PCR法檢測呈陰性的標(biāo)本。MDCK細(xì)胞分離培養(yǎng)法與實(shí)時熒光PCR法檢測的一致率為87.1%,細(xì)胞分離培養(yǎng)法靈敏度是實(shí)時熒光PCR法的62.5%,特異性則為100%,兩者差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),見表1。
表1.對比兩種方法檢測靈敏度、特異性(n)
流感病毒的實(shí)驗(yàn)室診斷流感病毒最常用的方法就是分離病毒、鑒定病毒,經(jīng)細(xì)胞培養(yǎng)法進(jìn)行分離的流感病毒可以確保流感病毒的抗原性與原始標(biāo)本保持一致性,以利長時間儲存,可以較好分析病毒抗原性和基因[2]。但是MDCK細(xì)胞所分離的病毒不可以用來生產(chǎn)疫苗,根據(jù)現(xiàn)行實(shí)踐研究結(jié)果判斷,細(xì)胞培養(yǎng)法的檢出率會受到病毒載量、被檢樣品質(zhì)量的一定影響,如果被檢樣品質(zhì)量較低或病毒載量不夠時,就易產(chǎn)生假陰性[3]。此外,細(xì)胞培養(yǎng)法僅適用于活體病毒,因此收集標(biāo)本、保存標(biāo)本時,需要保證病毒活性。
聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)可以擴(kuò)增特定核苷酸片的指數(shù)級,結(jié)束擴(kuò)增反應(yīng)后,運(yùn)用凝膠電泳方式定性分析擴(kuò)增物,借助放射核素進(jìn)行標(biāo)記后的光密度掃描方式,開展定量分析[4]。實(shí)時定量PCR指實(shí)時檢測PCR擴(kuò)增反應(yīng)中每一個循環(huán)產(chǎn)物熒光信號,從而定量與定性分析起始模板,隨著實(shí)時熒光定量PCR反應(yīng)產(chǎn)物的增多,熒光信號強(qiáng)度也隨之增強(qiáng),當(dāng)歷經(jīng)一個循環(huán),就有一個熒光強(qiáng)度信號被收集到,如此以來,就可憑借熒光強(qiáng)度的變化,觀測產(chǎn)物量變化情況,最終構(gòu)成熒光擴(kuò)增曲線圖[5]。
實(shí)時定量PCR檢測法提取病毒RNA時間在2.5~4h左右,針對甲型流感病毒此法有較高特異性,可以識別多株多亞型甲型流感病毒,對比血清學(xué)診斷法、特異性抗體檢測法,此法有較高靈敏性,但是實(shí)時定量PCR檢測法需要在條件較高的實(shí)驗(yàn)室中實(shí)施,實(shí)驗(yàn)室要求配備特殊儀器,需要專業(yè)操作人員操作,難以全面普及。
實(shí)時熒光PCR檢測法可以準(zhǔn)確、迅速、靈敏檢測流感病毒,被國內(nèi)廣泛應(yīng)用于臨床診斷。
本次試驗(yàn)研究結(jié)果表明,實(shí)時熒光PCR法檢測出72例陽性標(biāo)本,138例陰性,陽性率34.3%;病毒分離培養(yǎng)法檢測出40例陽性標(biāo)本,170例陰性,陽性率為19.0%;對比兩種方法檢測結(jié)果,實(shí)時熒光定量PCR儀檢測陽性率明顯比細(xì)胞培養(yǎng)法要高。實(shí)時熒光PCR法檢測出72例陽性標(biāo)本,全部由病毒分離培養(yǎng)法檢測,其中45例呈陽性反應(yīng),運(yùn)用MDCK細(xì)胞分離培養(yǎng)法測定的138例標(biāo)本呈陰性,而此138例標(biāo)本是經(jīng)實(shí)時熒光PCR法檢測呈陰性的標(biāo)本。MDCK細(xì)胞分離培養(yǎng)法與實(shí)時熒光PCR法檢測的一致率為87.1%,細(xì)胞分離培養(yǎng)法靈敏度是實(shí)時熒光PCR法的62.5%,特異性則為100%。
綜上所述,實(shí)時熒光PCR法可以準(zhǔn)確、迅速檢測流感病毒核酸,有著高特異性、高靈敏性、便捷的優(yōu)勢,可以成為實(shí)驗(yàn)室快速診斷流感病毒的高效方式。