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四元數(shù)改進區(qū)域生長的腦腫瘤圖像分割

2018-12-26 07:42:48蔣秋霖
關(guān)鍵詞:鄰域灰度像素

蔣秋霖, 王 昕

(長春工業(yè)大學(xué) 計算機科學(xué)與工程學(xué)院, 吉林 長春 130012)

0 引 言

通過核磁共振成像(MRI)掃描可以很容易分析大腦的結(jié)構(gòu)[1]。大腦組織的每個片段通過核磁共振掃描,將各個組織對應(yīng)地呈現(xiàn)在每個像素中。腦腫瘤分割是外科治療方案中的一項重要且具有挑戰(zhàn)性的任務(wù)。在實踐中,人工分割被廣泛應(yīng)用于臨床診斷中,但它仍然會出錯并且耗時長。除此之外,放射科醫(yī)生還需要一些額外的知識,如病理學(xué)和解剖學(xué)[2]。目前,眾多的自動分割和半自動分割技術(shù)被提出來處理各種變異的腫瘤[3-4]。然而,對模糊與不規(guī)則邊緣的分割效果一般[5]。此外,某些算法的實時性差導(dǎo)致其無法應(yīng)用于實際的臨床診斷中。但是這些技術(shù)仍然給以后學(xué)者的研究提供了幫助。

區(qū)域生長最早由 Zucker 在 1976 年提出,該算法最先應(yīng)用于圖像處理,其分割步驟為手動設(shè)置種子節(jié)點,將周圍的像素點依照判定準則與種子點進行比較,判斷其是否滿足判定條件,滿足則將該點與種子點劃分為同一區(qū)域,重復(fù)上述過程,直到所有的點被檢測完畢,形成一個生長區(qū)域[6]。傳統(tǒng)區(qū)域生長算法需要手動選擇閾值,閾值不準確會造成圖像的過分割或者欠分割,并且對最優(yōu)閾值的調(diào)試會消耗許多時間。近年來,國內(nèi)外學(xué)者對區(qū)域生長算法進行了改進。Weglinski等[7]提出了利用區(qū)域生長法來進行腦腫瘤圖像的分割,并通過中值濾波減少噪聲對區(qū)域生長法的影響。Deng等[8]提出了在區(qū)域生長法的基礎(chǔ)上,利用邊界的平均梯度和類內(nèi)方差的特征信息,在生長過程中不斷調(diào)整生長閾值以達到更好的分離精度。然而,上述兩種方法均存在對圖像陰影區(qū)域分割不理想的問題。 Angelina等[9]結(jié)合區(qū)域合并和遺傳算法改進了區(qū)域生長法,分割精度高,但邊界保持并不理想。

文中在區(qū)域生長中引入四元數(shù),根據(jù)四元數(shù)的表示形式取種子點前后左右四點像素值表示種子點像素值,同時利用四元數(shù)矢量積結(jié)合粒子群算法確定生長規(guī)則,實現(xiàn)了腦腫瘤圖像的精確分割。

1 算法描述

1.1 四元數(shù)

四元數(shù)(Quaternions)又稱超復(fù)數(shù),是由愛爾蘭數(shù)學(xué)家哈密頓(William Rowan Hamilton)在1843年發(fā)明的數(shù)學(xué)概念[10]。四元數(shù)可表示為:

q=a+ib+jc+kd(1)

式中:a、b、c、d----實數(shù);

i、j、k----虛部。

四元數(shù)有以下性質(zhì):

(2)

四元數(shù)的模:

當且僅當|q|=1時,q為單位四元數(shù)。

1.2 區(qū)域生長算法描述

區(qū)域生長是從“種子點”開始,依據(jù)特定的生長準則對其鄰域進行搜索,將與種子點相似的像素合并添加到種子點集合中,直至達到終止條件。區(qū)域生長的研究重點主要是初始種子點的選取和生長準則的制定。在MR腦腫瘤圖像的分割中,區(qū)域生長常根據(jù)種子點灰度值確定生長準則,通過上下閾值確定范圍,判斷其鄰域像素值是否在設(shè)定的范圍內(nèi)。如果是,則合并到種子集合中;否則不合并。

1.2.1 生長準則

傳統(tǒng)的區(qū)域生長算法是將種子點周邊的像素依據(jù)生長準則進行相似性判斷,如果相似就加入分割區(qū)域中,最終形成一個有相似像素組成的連通區(qū)域。但是,對于腦腫瘤圖像來說,因為其存在水腫、浸潤等問題,水腫區(qū)域和腦腫瘤區(qū)域的灰度值差別大;同時正常腦溝回的MR影像的灰度值又與腫瘤灰度值接近,病變區(qū)域邊界不明顯,會導(dǎo)致欠分割或誤分割。為了解決上述問題,文中在傳統(tǒng)區(qū)域生長算法上進行改進,利用種子點鄰域灰度信息描述種子點灰度值,再利用四元數(shù)單位向量的不等式性質(zhì)和粒子群算法制定生長規(guī)則,判斷該點是否屬于目標區(qū)域。

1.2.2 基于四元數(shù)矢量積的區(qū)域生長算法

選取種子點前后左右4個鄰域的像素值構(gòu)造一個四元數(shù),設(shè)種子點坐標為(x,y),則種子點前后左右的像素值分別為f(x,y+1)、f(x,y-1)、f(x-1,y)、f(x+1,y)。種子點四元數(shù)可表示為:

qseed=f(x,y+1)+if(x,y-1)+jf(x-1,y)+kf(x+1,y)(3)

構(gòu)造種子點的單位向量:

令式(4)簡化為:

q=a1+ia2+ja3+ka4(5)

再尋找種子點鄰域一點構(gòu)造其單位向量:

q1=b1+ib2+jb3+kb4(6)

利用不等式的性質(zhì)將單位化的四元數(shù)式(5)、式(6)相乘得:

0<|qq1|≤|q||q1|=1(7)

由于q和q1均為單位向量,所以q、q1越相近,|qq1|的值越接近1。文中據(jù)此初步制定生長規(guī)則0<|qq1|<1,判斷兩個像素是否相似。

1.2.3 粒子群算法確定閾值下限

由于q、q1在接近1時像素相似,所以1可作為上限,而0作為下限并不精確,因此文中利用粒子群算法計算出最優(yōu)下限e,使e<|qq1|<1范圍內(nèi)的像素均是相似像素。

假設(shè)在D維的空間中,粒子群規(guī)模是N,第i(i=1,2,…,N)個粒子位置是ei=[ei1,ei2,…,eiN],飛行速度vi=[vi1,vi2,…,viD],第t次迭代時粒子的自身最優(yōu)位置為pbest,全局粒子最優(yōu)位置為gbest,粒子通過這兩個不斷更新的極值來更新自己的速度和位置[11]。迭代公式如下:

v(t+1)=v(t)+c1r1(pbest-e(t))+

c2r2(gbest-e(t))(8)

e(t+1)=e(t)+v(t+1)(9)

式中:t----當前進化次數(shù);

c1、c2----學(xué)習(xí)因子,非負常數(shù),一般取c1=c2=2;

3.概述開花和結(jié)果的過程(理解)。這個內(nèi)容每年都有考查,除2017年出現(xiàn)了兩個選擇題,分值為3分外,其他年份每年只有一題選擇題,分值1.5分??键c主要在花、種子、果實的結(jié)構(gòu),以及花、種子的各個結(jié)構(gòu)將來發(fā)育成的結(jié)果是什么。

r1、r2----隨機數(shù),在[0,1]內(nèi)。

為使粒子一直保持在解空間的搜索范圍中, 令v∈[-vmax,vmax],其中,vmax表示粒子最大速度。 文獻[12]將粒子群算法簡化為:

e(t+1)=ωe(t)+c1r1(pbest-e(t))+

c2r2(gbest-e(t))(10)

式(3)去除了速度項,粒子的進化過程變得更為簡單,生成的最優(yōu)值在(0,1)之間保存。文獻[12]通過證明ω=0.8時簡化的粒子群算法最高效。因此得出e(t+1)為最佳下限值,記為e。

綜上所述,由式(7)和式(10)確定生長準則:

e<|qq1|<1(11)

當滿足式(11)時,認為目標像素點與種子點相似,進而將目標像素點歸入種子點集合。

1.3 算法步驟

1)采用交互式方式選取種子點;

2)標記種子點,將種子點的前后左右鄰域的像素取出,利用式(4)構(gòu)造種子點單位向量;

3)搜索種子點鄰域的像素點,利用四元數(shù)和粒子群優(yōu)化算法分別確定閾值的上下限;

4)判斷是否滿足生長規(guī)則,若滿足則繼續(xù)下一步,若不滿足則返回2);

5)將滿足生長規(guī)則的像素點歸并到種子點集合,得到區(qū)域生長的區(qū)域。

分割過程如圖1所示。

圖1 分割過程

2 實驗結(jié)果與分析

分割實驗在多例腦腫瘤患者的MR圖像上進行,采用 PC 機、英特爾R酷睿i5處理器,內(nèi)存為4 GB,操作系統(tǒng)為Window7,實驗平臺為 MATLAB R2015b。GVF Snake模型[13]與水平集模型是MR腦腫瘤圖像分割的常用模型,因此為了驗證文中所提模型的優(yōu)越性,考慮將文中模型與傳統(tǒng)區(qū)域生長算法、水平集模型、GVF Snake模型做對比。文中列舉了其中三個病例的三張MR腫瘤圖像的分割結(jié)果,分別如圖2~圖4所示。

與文中算法對比的區(qū)域生長算法(見圖2(c)、圖3(c)、圖4(c))并未將MR圖像灰度不均勻、邊界不明顯等因素考慮進去,因此該算法在分割MR腦腫瘤圖像時,出現(xiàn)了對弱邊界不敏感、出現(xiàn)誤分割等問題。圖2(d)、圖3(d)、圖4(d)是水平集模型分割結(jié)果,水平集對初始輪廓比較敏感,而腦腫瘤圖像的初始輪廓并不明顯,因此無法準確分割MR腦腫瘤圖像。圖2(e)、圖3(e)、圖4(e)為GVFSnake模型的分割結(jié)果,從圖中可以看出,GVFSnake模型無法精確地收斂到弱邊界,在三幅圖中均出現(xiàn)了在邊界處分割不精確的問題。

文中算法很好地避免了上述對于邊界分割出現(xiàn)的過分割和欠分割問題,準確地分割了腦腫瘤區(qū)域。為了更客觀評價分割結(jié)果,引入精度(True Positive, TP,正確分割的腫瘤部分)、誤檢率(False Positive, FP,正常組織誤分割為腫瘤部分)和漏檢率(False Negative, FN,未被分割的腫瘤部分)對分割結(jié)果進行定量評估,不同算法的分割結(jié)果見表1。

表1 不同算法的分割結(jié)果 %

由表1可以看出,文中算法比其他兩種算法精度更高,誤檢率和漏檢率更低。

3 結(jié) 語

利用四元數(shù)單位向量不等式性質(zhì)和粒子群優(yōu)化算法改進傳統(tǒng)區(qū)域生長算法分割MR腦腫瘤。首先用交互式選取種子點,再利用種子點前后左右像素灰度值構(gòu)造種子點四元數(shù),然后結(jié)合單位四元數(shù)的不等式性質(zhì)和粒子群算法確定生長規(guī)則,最后實現(xiàn)腦腫瘤準確分割。文中所提算法充分利用種子點周圍的像素值,克服了水腫區(qū)域和腦腫瘤區(qū)域灰度值差別大,以及MR腦腫瘤邊界不明顯而造成的過分割和欠分割的問題。

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