在《自然·遺傳學(xué)》發(fā)表的一項新研究中,來自美國農(nóng)業(yè)部農(nóng)業(yè)研究局和博伊斯·湯普森研究所等機構(gòu)的研究人員繪制了人工栽培和野生西紅柿的基因組圖譜。該團隊標(biāo)記了近5000個以前未知的基因,將人工栽培西紅柿的基因組與野生西紅柿的基因組進行比較,并獲得不少有趣的發(fā)現(xiàn)。
2012年科學(xué)家首次對普通栽培西紅柿進行基因組測序,測序的西紅柿品種為Heinz 1706。這項新工作將這種觀點擴展到所有定期種植的番茄品種及其“近親”的完整基因組。這包括來自725個品種的西紅柿的所有基因,在此過程中,該團隊發(fā)現(xiàn)了額外的4873個基因,這些基因未包括在Heinz 1706基因組中。
將人工栽培的西紅柿與其野生對應(yīng)物進行比較,研究人員注意到通常在超市中購買的西紅柿丟失了數(shù)千種基因。在追求能夠以更快的速度獲得更大、更多西紅柿的過程中,種植者似乎放棄了味道等特性。
“構(gòu)建這種泛基因組最重要的發(fā)現(xiàn)之一是標(biāo)記為TomLoxC的罕見基因形式,其DNA基因啟動子的版本大多不同,”該論文的共同作者James Giovannoni在一份聲明中說?!霸摶蛲ㄟ^催化許多脂質(zhì)-揮發(fā)物的生物合成來影響水果的味道,而這些化合物容易消失。”根據(jù)測試,研究人員認(rèn)為,這種與味道有關(guān)的基因僅存在于2%的人工栽培西紅柿中,而在超過90%的野生西紅柿中發(fā)現(xiàn)。
研究人員表示,獲取如此多西紅柿品種基因組的詳細數(shù)據(jù),將有助于育種者栽培更美味的作物并保留基因。