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優(yōu)質(zhì)型黃羽肉雞腹脂的遺傳選擇

2019-02-28 07:15:36徐振強(qiáng)彭志軍季從亮張德祥
中國(guó)畜牧雜志 2019年2期
關(guān)鍵詞:遺傳力協(xié)方差公雞

徐振強(qiáng),彭志軍,季從亮,張 燕,張德祥*

(1.華南農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院,廣東廣州 510642;2.廣東溫氏南方家禽育種有限公司,廣東云浮 527439)

脂類為生物體供應(yīng)能量,但脂肪沉積過(guò)多會(huì)對(duì)優(yōu)質(zhì)黃羽肉雞的生產(chǎn)性能產(chǎn)生負(fù)面影響,如誘發(fā)健康問(wèn)題、降低飼料轉(zhuǎn)化效率、降低胴體中瘦肉比例、增加肉類加工者負(fù)擔(dān)、廢棄物處理困難并加重環(huán)境污染等。據(jù)消費(fèi)市場(chǎng)反映,優(yōu)質(zhì)型和中速型黃羽肉雞母雞過(guò)肥的問(wèn)題較為突出,特別是在上市和開(kāi)產(chǎn)日齡前后。在生產(chǎn)中,有經(jīng)驗(yàn)的飼養(yǎng)員依靠手摸或者觀察體型進(jìn)行疑似高腹脂個(gè)體的判斷和淘汰,這種評(píng)定方法依賴于人的主觀判斷,另外腹脂重、腹脂率為中等遺傳力性狀,個(gè)體選擇的效果有限[1]。近年,學(xué)者們主要集中研究與腹脂性狀呈中、高等遺傳相關(guān)的血液生理生化指標(biāo),如超低密度脂蛋白(VLDL)、甘油三酯、高密度脂蛋白-膽固醇(HDL-C)等,并對(duì)其進(jìn)行選擇來(lái)實(shí)現(xiàn)對(duì)腹脂的間接改良[2-3]。另一方面,隨著分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展,可以挖掘和利用一些顯著影響腹脂的基因或QTL(如RB1、PCSK1、ApoB、IGFBP-2等基因[4-6])進(jìn)行標(biāo)記輔助選擇。但主效基因的數(shù)量和效能不確定,突變位點(diǎn)之間又存在互作效應(yīng),因此難以應(yīng)用于育種實(shí)踐。本研究以溫氏集團(tuán)的天露黃雞父系作為研究對(duì)象,采用屠宰法測(cè)定腹脂含量,結(jié)合系譜信息,通過(guò)最佳線性無(wú)偏預(yù)測(cè)(BLUP)估計(jì)同胞育種值并對(duì)其進(jìn)行選擇,通過(guò)縱向?qū)Ρ仁来鷶?shù)據(jù)評(píng)估選擇效果,為黃羽肉雞腹脂的遺傳改良提供基礎(chǔ)參數(shù)。

1 材料與方法

1.1 材料 天露黃雞父系2個(gè)世代共3個(gè)批次的群體由廣東溫氏南方家禽育種有限公司提供。其中,第8世代第1批次為參考群體,第2批次為候選群體,第9世代第1批次為驗(yàn)證群體。

1.2 飼養(yǎng)管理 參考群體約5 000個(gè)體在育成期采用籠養(yǎng)方式飼養(yǎng),公、母各半。實(shí)驗(yàn)期間自由飲水、自由采食,淘汰發(fā)育不良和殘次個(gè)體。育雛期(1~5周齡)日糧代謝能水平為11.86 MJ/kg,粗蛋白質(zhì)為200 g/kg;育成期(6~15周齡)日糧代謝能水平為12.12 MJ/kg,粗蛋白質(zhì)為190 g/kg。15周齡末(105日齡)全群屠宰。候選群體4 650個(gè)體在育成期采用籠養(yǎng)方式飼養(yǎng),公、母各半。試驗(yàn)期間淘汰發(fā)育不良、殘次和外貌體型不符合育種目標(biāo)的個(gè)體。公雞和母雞在測(cè)定體重后,以腹脂率育種值和體重離均差作為選種指標(biāo),選留數(shù)量分別為350只和1 500只,選留后限飼。32周按1:15的公母配比組建50個(gè)全同胞家系繁殖下一世代,在此前進(jìn)行疾病凈化和公雞精液檢測(cè),淘汰部分不符合標(biāo)準(zhǔn)的個(gè)體。驗(yàn)證群體約1 000個(gè)體,公、母各半,飼喂程序與8世代參考群體相同,飼養(yǎng)至105日齡全群屠宰。

1.3 指標(biāo)測(cè)定 參考群體在屠宰測(cè)定前記錄籠組位置,分別測(cè)定參考群體和驗(yàn)證群體的宰前空腹體重、腹脂重和肌胃脂肪重。腹脂重為包含肌胃脂肪重的重量。

1.4 統(tǒng)計(jì)分析 利用Minitab 17的個(gè)體分布標(biāo)識(shí)工具,對(duì)參考群體表型數(shù)據(jù)進(jìn)行正態(tài)分布檢驗(yàn),如不服從正態(tài)分布,使用Box-Cox變換。

利用SAS 9.0軟件的GLM程序進(jìn)行方差-協(xié)方差分析。在分析參考群體腹脂率時(shí)采用兩因素方差分析模型:

其中,y為腹脂率觀察值,觀察值個(gè)數(shù)為4 335,μ為群體均數(shù),ai為性別效應(yīng)(i=1,2,分別代表公雞和母雞),bj為籠組效應(yīng)(i=1,2,3,……16),e為隨機(jī)殘差。

方差分析時(shí)計(jì)算固定效應(yīng)的最小二乘均值,并進(jìn)行多重比較??紤]到宰前空腹體重和腹脂重存在線性關(guān)系,故在分析參考群體的腹脂重時(shí)在模型中加入宰前空腹體重作為協(xié)方差,消除宰前空腹體重對(duì)腹脂重的影響。方差與協(xié)方差組分估計(jì)采用DMU軟件包的AI-REML算法。第8世代表型數(shù)據(jù)遺傳參數(shù)估計(jì)采用單性狀動(dòng)物模型:

其中,y為表型測(cè)定值構(gòu)成的向量,X為固定效應(yīng)關(guān)聯(lián)矩陣,b為固定效應(yīng)向量,Z為個(gè)體加性遺傳效應(yīng)的關(guān)聯(lián)矩陣,a為個(gè)體育種值向量,e為隨機(jī)殘差。

用SAS 9.0軟件的CORR程序?qū)Σ煌N值向量進(jìn)行Spearman等級(jí)相關(guān)分析。等級(jí)相關(guān)程度用系數(shù)rs表示,分析中未用校正公式對(duì)相同秩次的元素進(jìn)行校正。

2 結(jié) 果

2.1 腹脂率選擇效果分析 參考群體分析性狀的統(tǒng)計(jì)樣本量均超過(guò)2 000,統(tǒng)計(jì)說(shuō)服力強(qiáng)。公、母雞體重已經(jīng)過(guò)多個(gè)世代的選擇和控制,變異系數(shù)維持在10%左右(表1)。母雞腹脂重和腹脂率均高于公雞。腹脂重和腹脂率的變異系數(shù)均較大,在20%以上,理論上通過(guò)傳統(tǒng)選擇對(duì)其進(jìn)行改良是可行的。與腹脂率相比,腹脂重的變異程度更大。

本研究利用參考群體的公、母雞合并腹脂率(以下簡(jiǎn)稱為合并腹脂率)來(lái)估計(jì)第2批次候選群體的育種值,從中選留低脂個(gè)體組建全同胞家系并繁殖第9世代。第9世代第1批次驗(yàn)證群體分析性狀的統(tǒng)計(jì)樣本量在500左右。對(duì)腹脂率進(jìn)行低向選擇,分子和分母選擇壓分配不均勻會(huì)導(dǎo)致腹脂重和宰前空腹體重的降幅不同。如果分子降幅更大,腹脂率下降,反之腹脂率提高。與參考群體相比,驗(yàn)證群體公雞腹脂重的降幅大,宰前空腹體重的降幅小,腹脂率下降了45.6%,選擇效果理想;而母雞腹脂重的降幅偏低,造成腹脂率的降幅也較低,只有14.1%(表1)。

2.2 正態(tài)分布與正態(tài)轉(zhuǎn)換 參考群體合并腹脂率的分布曲線類似于二元正態(tài)分布(圖1),其中一個(gè)以平均值3.3%為中心展開(kāi),另外一個(gè)以平均值6.3%為中心展開(kāi)。由正態(tài)分布概率圖可知(圖2-A),腹脂率在2%以下的數(shù)據(jù)點(diǎn)偏離直線,且落在95%置信區(qū)間外,合并腹脂率的正態(tài)分布擬合較差。結(jié)合AD檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)量進(jìn)行分析,AD=8.446,P<0.01,合并腹脂率不服從正態(tài)分布。對(duì)非正態(tài)表型做Box-Cox變換,變換后AD值變化不明顯,且P<0.01,說(shuō)明變換無(wú)效(圖2-B)。因此在育種值估計(jì)時(shí),只考慮未經(jīng)轉(zhuǎn)換且不服從正態(tài)分布的合并腹脂率表型。

表1 腹脂率選擇效果

圖2 合并腹脂率正態(tài)分布概率圖

2.3 方差-協(xié)方差分析 兩因素協(xié)方差分析模型的F檢驗(yàn)P<0.01,擬合度R2=0.56。固定效應(yīng)顯著性檢驗(yàn)見(jiàn)表2。公、母雞腹脂重的最小二乘均值分別為63.3、122.8 g(P<0.01)。腹脂重與宰前空腹體重間呈極顯著直線關(guān)系(表2),因此對(duì)校正后的腹脂重進(jìn)行方差分析。在育種值估計(jì)時(shí),以性別作為固定效應(yīng),同時(shí)也可以納入宰前空腹體重作為協(xié)方差,消除宰前空腹體重對(duì)腹脂重的影響。

表2 腹脂重的固定效應(yīng)檢驗(yàn)

兩因素方差分析模型的F檢驗(yàn)P<0.01,擬合度R2=0.55。固定效應(yīng)顯著性檢驗(yàn)見(jiàn)表3。公、母雞腹脂率的最小二乘均值分別為3.60%、6.46%(P<0.01)。在育種值估計(jì)時(shí),以性別作為固定效應(yīng)。

2.4 腹脂性狀遺傳參數(shù)估計(jì) 由于籠組效應(yīng)對(duì)腹脂率的影響不顯著,故遺傳參數(shù)估計(jì)模型中的固定效應(yīng)確定為2個(gè):性別(2個(gè)水平)和批次(2個(gè)水平)。利用動(dòng)物模型BLUP分別進(jìn)行分析:①利用參考群體合并腹脂重估計(jì)候選群體育種值;②利用參考群體合并腹脂率估計(jì)候選群體育種值;③只利用參考群體母雞腹脂重估計(jì)候選群體育種值;④只利用參考群體公雞腹脂重估計(jì)候選群體育種值;⑤只利用參考群體母雞腹脂率估計(jì)候選群體育種值;⑥只利用參考群體公雞腹脂率估計(jì)候選群體育種值;⑦利用參考群體合并腹脂重估計(jì)候選群體育種值,以宰前空腹體重作為協(xié)方差;⑧只利用參考群體母雞腹脂重估計(jì)候選群體育種值,以宰前空腹體重作為協(xié)方差;⑨只利用參考群體公雞腹脂重估計(jì)候選群體育種值,宰前空腹體重作為協(xié)方差。利用上述不同類型數(shù)據(jù)估計(jì)的腹脂性狀遺傳力見(jiàn)表4,系譜個(gè)數(shù)均為8 923。合并腹脂率和腹脂重的遺傳力均為0.36,屬于中等遺傳力性狀。公雞的腹脂率、腹脂重遺傳力高于母雞。不同類型數(shù)據(jù)估計(jì)的候選群體育種值向量之間的等級(jí)相關(guān)系數(shù)(rs)在 0.388~0.983(表 5)。

表3 腹脂率的固定效應(yīng)檢驗(yàn)

表4 天露黃雞腹脂性狀遺傳力

表5 不同數(shù)據(jù)類型估計(jì)的候選個(gè)體育種值之間的等級(jí)相關(guān)系數(shù)

3 討 論

天露黃雞父系腹脂率和腹脂重的遺傳力均為0.36,屬于中等遺傳力性狀,腹脂率的遺傳力與文獻(xiàn)報(bào)道一致[1,7],但本研究腹脂重遺傳力偏低。在各種遺傳力估計(jì)方法中,均假定雜交親本間不存在親緣關(guān)系。本文以參考群體作為基礎(chǔ)群也基于這一假設(shè),遺傳力可能會(huì)被高估。家系繼代選育的結(jié)果表明,通過(guò)屠宰測(cè)定、腹脂率育種值估計(jì)和選擇來(lái)降低腹脂的方法是有效的,但選擇效果存在性別差異。公雞的選擇壓高于母雞,這是公雞選擇效果優(yōu)于母雞的重要原因,而公雞腹脂率的表型變異和遺傳力均大于母雞,也可能導(dǎo)致該結(jié)果產(chǎn)生。

在進(jìn)行遺傳參數(shù)估計(jì)、性狀—基因關(guān)聯(lián)分析或全基因組選擇時(shí),對(duì)于表型的分布類型,并沒(méi)有嚴(yán)格規(guī)定,在分析中可以選取近似分布類型進(jìn)行定義[8-9]。一些遺傳力中等偏低的數(shù)量性狀(如腹脂率、產(chǎn)蛋數(shù)、剩余飼料消耗等)的表型大多不服從正態(tài)分布。本研究計(jì)算的合并腹脂率不服從正態(tài)分布,且用Box-Cox轉(zhuǎn)換無(wú)效,因此在育種值估計(jì)時(shí),只考慮未經(jīng)轉(zhuǎn)換的合并腹脂率表型。對(duì)另外一個(gè)性狀睪丸重進(jìn)行分析,表型數(shù)據(jù)正態(tài)與否并不影響育種值的排序(數(shù)據(jù)待發(fā)表)。

在實(shí)踐中,BLUP法利用估計(jì)育種值進(jìn)行排序后選種,但不同表型數(shù)據(jù)類型、模型計(jì)算得出的育種值大小和排序不同。為比較這種差異,可以通過(guò)Spearman等級(jí)相關(guān)分析比較得出不同組別候選群體育種值向量的差異。其中,①和②的rs為0.944,兩者的排序比較一致,由此可知,如果分別以合并腹脂重和合并腹脂率作為選種指標(biāo),留選個(gè)體有94.4%相同。②和⑤的rs為0.877,②和⑥的rs為0.864,表明只用母雞腹脂率估計(jì)育種值進(jìn)行選種,有87.7%的個(gè)體和合并腹脂率估計(jì)育種值進(jìn)行選種時(shí)的選留個(gè)體相同;只用公雞腹脂率估計(jì)育種值進(jìn)行選種,兩者的吻合度為86.4%。另外,②和⑦、⑤和⑧、⑥和⑨的rs分別為0.966、0.983和0.948,表明以腹脂重(宰前空腹體重作為協(xié)方差)作為選種指標(biāo),和直接以腹脂率作為選種指標(biāo),兩者效果相當(dāng)。在現(xiàn)場(chǎng)選育中,關(guān)鍵在于確定選種指標(biāo)是腹脂重還是腹脂率。本研究只以腹脂率作為選種指標(biāo),因此難以比較兩者的選擇效果。后續(xù)研究中,可以嘗試?yán)酶怪兀ㄔ浊翱崭贵w重不作為協(xié)方差)作為選種指標(biāo),一方面是由于腹脂重的變異程度大于腹脂率,另一方面可以避免比值中選擇壓的不均勻分配。

4 結(jié) 論

綜上所述,運(yùn)用傳統(tǒng)遺傳選擇方法對(duì)腹部脂肪含量進(jìn)行屠宰測(cè)定,結(jié)合BLUP法進(jìn)行同胞腹脂率育種值估計(jì)和選擇,可有效降低黃羽肉雞的腹脂含量,但選擇效果存在性別差異。如果從節(jié)約勞動(dòng)成本的角度考慮,只屠宰單性別是可行的,與屠宰公母全群相比較,只有14%左右的選留個(gè)體不同。母雞的采食量更低、體型較小、脂肪沉積較多,在屠宰時(shí)脂肪較容易分離、屠體更適銷,這些都是決定屠宰性別的因素。

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