王蓉 龔世飛 金濤 劉章勇
摘要:對稻蝦共作模式下水稻土壤反硝化細(xì)菌群落進(jìn)行研究,以期揭示稻蝦復(fù)合種養(yǎng)模式下土壤反硝化細(xì)菌豐度、群落多樣性及組成,為科學(xué)研究稻蝦共作模式的土壤微生物多樣性,維持土壤地力提供理論依據(jù)。依托長江大學(xué)農(nóng)學(xué)院基地設(shè)置常規(guī)中稻種植模式(MR)、稻蝦共作模式(CR)等2種模式,利用熒光定量PCR和高通量測序平臺比較2種模式下水稻土壤反硝化細(xì)菌nosZ基因的數(shù)量、群落多樣性及群落組成。結(jié)果表明,稻蝦共作顯著提高水稻土壤硝態(tài)氮、全碳、全氮含量,對堿解氮含量、pH值、碳氮比及銨態(tài)氮含量無顯著影響。nosZ基因在MR、CR處理中的基因豐度分別為1 g干土1.51×106、2.23×106拷貝數(shù),CR處理中nosZ基因豐度是MR的1.48倍。CR處理顯著提高了土壤nosZ基因的豐度。通過對α群落多樣性指數(shù)進(jìn)行方差分析可知,CR處理與MR處理間微生物群落多樣性差異不顯著。經(jīng)韋恩(Venn)分析,在目和科水平上,MR處理與CR處理的微生物群落組成顯示出較高的相似度,在屬與種水平上,2個處理下的土壤微生物群落結(jié)構(gòu)存在差異性,CR處理下的土壤缺失沼澤紅假單胞菌。經(jīng)冗余分析,土壤總碳(TC)含量對nosZ基因群落結(jié)構(gòu)的影響最為顯著,其次是pH值、堿解氮含量、硝態(tài)氮含量與銨態(tài)氮含量。綜合分析,稻蝦共作可顯著提高水稻土壤nosZ基因豐度,稻蝦輪作對群落多樣性的影響較小,其在種水平上缺失了沼澤紅假單胞菌。常規(guī)中稻種植模式與稻蝦共作模式下的土壤微生物群落結(jié)構(gòu)雖保有一定的相似度,但仍存在差異,土壤總碳含量是影響群落結(jié)構(gòu)差異的主要原因。
關(guān)鍵詞:稻蝦共作;反硝化作用;熒光定量;高通量測序技術(shù);α群落多樣性;nosZ基因
中圖分類號: S154.3? 文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A? 文章編號:1002-1302(2019)04-0246-06
反硝化作用作為土壤氮循環(huán)的組成部分,在土壤氮素轉(zhuǎn)化中占據(jù)重要地位[1-2]。反硝化過程在厭氧的條件下由微生物驅(qū)動,可產(chǎn)生氧化亞氮(N2O),被認(rèn)為是土壤釋放N2O的主要過程[3-7],主要指硝化作用產(chǎn)生的硝酸根(NO3-)最終被還原成氮?dú)猓∟2)的過程,中間過程會產(chǎn)生一氧化碳(NO)和N2O等氣體,造成氮素?fù)p失,并引起一系列環(huán)境問題[8-10]。反硝化過程分為4個部分[11]:第1步在由nar或narp基因編碼的硝酸鹽還原酶的催化作用下,將硝酸鹽(NO3-)還原成亞硝酸鹽(NO2-);第2步反應(yīng)是在由nirK基因或nirS基因編碼的亞硝酸鹽還原酶的催化作用下,將亞硝酸鹽還原成NO;第3步反應(yīng)在由norB基因編碼的一氧化氮還原酶的催化作用下,將NO還原為N2O,此步可將氮素以氣態(tài)的形式排放;第4步是在由nosZ基因編碼的氧化亞氮還原酶的催化作用下,將N2O還原為N2。由于氧化亞氮還原酶是控制N2O排放的主要調(diào)節(jié)因子,是完全脫氮途徑最后一步的重要催化劑,因此nosZ基因通常被用作研究反硝化群落的遺傳標(biāo)記。稻田是重要的農(nóng)業(yè)用地,其中約70%位于亞熱帶和熱帶地區(qū),同時也是N2O的主要來源[12]。與旱地土壤不同,常年淹水的稻田土壤提供的厭氧條件有利于反硝化作用的發(fā)生[13]。稻蝦種養(yǎng)是將水稻種植與克氏螯蝦養(yǎng)殖相結(jié)合組成的互利共生復(fù)合生態(tài)農(nóng)業(yè)系統(tǒng),是稻田綜合種養(yǎng)模式之一。該模式實現(xiàn)了一水兩用、一田雙收,在節(jié)約稻田水土資源的同時帶來可觀的經(jīng)濟(jì)效益[14]。當(dāng)前,我國農(nóng)業(yè)正面臨著資源與環(huán)境約束加劇和農(nóng)民增收難度加大的難題,稻蝦生態(tài)種養(yǎng)高效模式的興起,被農(nóng)業(yè)部譽(yù)為“現(xiàn)代農(nóng)業(yè)的一次革命”,很快在長江中下游地區(qū)獲得大面積的推廣種植。截至2016年,稻蝦種養(yǎng)模式在江漢平原推廣面積已經(jīng)達(dá)到20萬hm2以上[15]。統(tǒng)計顯示,全國適合稻蝦種養(yǎng)模式的稻田面積高達(dá)450萬hm2[16]。稻蝦種養(yǎng)模式面積逐年擴(kuò)大,但國內(nèi)外關(guān)于稻蝦種養(yǎng)模式下參與稻田土壤反硝化反應(yīng)微生物的研究較少。通過研究微生物種群數(shù)量和群落結(jié)構(gòu),可以明確稻蝦土壤反硝化過程的作用機(jī)制及影響因素。本試驗以江漢平原典型稻蝦種養(yǎng)區(qū)湖北省荊州市為研究對象,研究該模式下土壤反硝化微生物的變化特征,以期揭示稻蝦種養(yǎng)模式土壤微生物群落結(jié)構(gòu)和多樣性的變化規(guī)律,豐富稻蝦種養(yǎng)模式反硝化微生物理論,同時為該地區(qū)土地利用改良、農(nóng)業(yè)結(jié)構(gòu)戰(zhàn)略性調(diào)整以及發(fā)展稻蝦種養(yǎng)高產(chǎn)高效生態(tài)友好型農(nóng)業(yè)提供理論依據(jù)。
1 材料與方法
1.1 試驗設(shè)計
試驗地位于湖北省荊州市長江大學(xué)農(nóng)學(xué)院基地(地理位置30°6′ N,111°54′ E)。該地區(qū)處于江漢平原地帶,具有四季分明、雨熱同季、年降水量充沛等特點(diǎn),冬季受極地大陸氣團(tuán)影響,氣溫偏低,降水量少;夏季受熱帶海洋氣團(tuán)影響,高溫多雨,水分季節(jié)分配不均,屬于亞熱帶季風(fēng)氣候區(qū),年均降水量在1 100 mm左右,無霜期200 d。土壤類型為潮土,土壤母質(zhì)為河流沖積物。供試土壤全氮、全磷、速效鉀含量分別為0.75 g/kg、0.54 g/kg、17.09 mg/kg,有機(jī)質(zhì)含量為38.8 g/kg,pH值為7.5。
試驗設(shè)置常規(guī)中稻種植模式(MR)與稻蝦共作模式(CR),本研究自2015年開始,連續(xù)開展2年,于中稻抽穗期采集土壤樣品作為研究對象。試驗小區(qū)由長12 m、寬5 m的田埂圍成,每個處理3次重復(fù),為防止小龍蝦逃出,田埂加高加固并在田埂周圍鋪設(shè)塑料膜。水稻品種為隆兩優(yōu)華占,小龍蝦品種為克氏原鰲蝦,施肥量采用當(dāng)?shù)亓?xí)慣用量,年均施肥量為氮肥180 kg/hm2、磷肥75 kg/hm2、鉀肥105 kg/hm2,以尿素(含N 46%)、過磷酸鈣(含P2O5 12%)、氯化鉀(含K2O 60%)的形式施用。氮肥按基肥:蘗肥:穗肥=5 ∶ 2 ∶ 3施用,磷肥用作底肥1次基施,鉀肥按照50%基肥、50%追肥的方式施肥。2種模式水稻期間田間水分管理為前期灌水、中期曬田、后期干濕交替的模式。蝦田于每年水稻收獲后覆水泡田,隨即投放蝦苗,投放密度約為20萬只/hm2,來年4月至6月上旬捕撈成蝦,捕撈完成后開始整體準(zhǔn)備中稻的移栽,等待水稻收獲后進(jìn)行下一輪的小龍蝦養(yǎng)殖。
1.2 土壤樣品采集
土壤樣品在水稻抽穗期采集,用于基本理化性質(zhì)分析與土壤微生物測定。采用不銹鋼土鉆按照5點(diǎn)采樣法采集用于測定土壤基本理化性質(zhì)的土樣,重復(fù)3次,將土樣帶回實驗室剔除石子、根系等雜物,存放在陰涼處混勻風(fēng)干,待土樣風(fēng)干磨碎后分別過20目與100目篩用于室內(nèi)分析。用谷物采樣器采集用于測定水稻土壤微生物的樣品,每個處理重復(fù)3次,樣品采集后剔除石子與根系,然后立即放入錫箔紙中包裹,存放在液氮罐中,并帶回實驗室存放于-80 ℃冰箱備用。
1.3 土壤基本理化性質(zhì)測定
土壤基本理化性質(zhì)分析參考鮑士旦的方法[17]。土壤全氮、全碳含量采用ECS4024元素分析儀(意大利Costech公司)測定;土壤堿解氮含量測定采用堿解擴(kuò)散法;土壤硝態(tài)氮含量采用 2 mol/L KCl溶液浸提并在203、270 nm下測定;銨態(tài)氮含量測定采用靛酚藍(lán)比色法;pH值測定采用電位法(水與土質(zhì)量比為2.5 ∶ 1)。
1.4 土壤總DNA提取
取0.25 g低溫保存的土壤樣品,用PowerSoil DNA Isolation Kit(美國Mobio公司) DNA試劑盒提取土壤總DNA。采用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測總DNA,并用NanoDrop ND-1000UVevis分光光度計(美國賽默飛世爾科技公司)檢測提取的DNA濃度與純度。
1.5 反硝化微生物nosZ基因擴(kuò)增與熒光定量PCR分析
用引物對[18]nosZF(CGYTGTTCMTCGACAGCCAG)和nosZ-1622R(CGSACCTTSTTGCCSTYGCG)擴(kuò)增nosZ基因。PCR反應(yīng)體系總體積為20 μL,包括:10 μL 2×syberMIX,0.2 μL 的2種上、下游引物(10 μmol/L),1 μL稀釋8倍后的樣品,最后用無RNA酶的ddH2O補(bǔ)足至20 μL。PCR擴(kuò)增程序為:94 ℃ 預(yù)變性5 min;94 ℃變性30 s,57 ℃退火45 s,72 ℃ 延伸55 s,32個循環(huán);72 ℃終延伸10 min,通過1%瓊脂糖凝膠電泳檢測PCR產(chǎn)物。
標(biāo)準(zhǔn)曲線的制備:將PCR產(chǎn)物純化回收后,選取熒光假單胞菌的nosZ基因陽性克隆轉(zhuǎn)接過夜培養(yǎng),質(zhì)粒濃度經(jīng)分光光度計測定后,按照10倍梯度逐漸將質(zhì)粒稀釋至103~108拷貝數(shù),-80 ℃低溫保存。
熒光定量PCR反應(yīng)在ABI7500熒光定量PCR儀(美國應(yīng)用生物系統(tǒng)公司)上進(jìn)行,引物序列前文已標(biāo)出,反應(yīng)體系總體積為25 μL,包括2×SYBER Green 12.5 μL,上下游引物各 0.8 μL,ROX 0.4 μL,DNA模板2.0 μL,用ddH2O補(bǔ)至 25 μL,試驗試劑購寶生物工程(大連)有限公司。
1.6 高通量測序
擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)切膠純化后連接至pUC-T載體上,轉(zhuǎn)至大腸桿菌DH5α中進(jìn)行培養(yǎng),選用陽性克隆進(jìn)行測序,序列提交至NCBI數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對,并將同源性大于等于97%的序列進(jìn)行可操作分類單元(operational taxonomic units,簡稱OTU)聚類。
1.7 數(shù)據(jù)處理與作圖
利用SPSS 22.0對土壤基本理化性質(zhì)數(shù)據(jù)進(jìn)行方差分析;采用CANOCO 5.0軟件對土壤基本理化性質(zhì)與反硝化微生物nosZ基因群落結(jié)構(gòu)進(jìn)行冗余分析(redundancy analysis,簡稱RDA),使用Mothur1.30.1在同源性達(dá)97%上進(jìn)行群落多樣性指數(shù)分析,nosZ基因數(shù)量采用Excel軟件作圖,R語言繪制曲線與相關(guān)熱圖。
2 結(jié)果與分析
2.1 不同處理下土壤基本理化性質(zhì)
稻蝦共作處理顯著影響了部分土壤基本理化性質(zhì)(表1)。方差分析結(jié)果表明,除土壤堿解氮含量、pH值、銨態(tài)氮含量及碳氮比(C/N)無顯著變化外,稻蝦共作顯著增加了土壤硝態(tài)氮、全碳、全氮的含量。相比常規(guī)中稻種植模式,硝態(tài)氮含量提升了29.03%,全碳含量增加了2.37%,全氮含量提升了4.30%,對土壤pH值、堿解氮含量、銨態(tài)氮含量及C/N無顯著影響。
2.2 測序結(jié)果及多樣性指數(shù)
采用Miseq技術(shù)對微生物nosZ基因進(jìn)行測序分析,數(shù)據(jù)經(jīng)過優(yōu)化篩選后,6個樣品共測得原始序列218 108條,序列平均長度為407.74 bp,共測得堿基88 937 543個, 所有樣品的序列長度在218~552 bp之間(表2)。按97%的相似度對非重復(fù)序列進(jìn)行OTU分析,共得到344個OTUs。對各樣本序列采用隨機(jī)抽樣方法進(jìn)行抽樣,以抽到的序列數(shù)與它們對應(yīng)的物種多樣性指數(shù),構(gòu)建稀釋曲線。由圖1可知,樣本覆蓋度(coverage)指數(shù)為0.998 2~0.999 2,稀釋性曲線均趨于平坦飽和,表明此測序深度獲得的序列數(shù)據(jù)量可以反映土壤樣品nosZ基因微生物信息。
對α多樣性指數(shù)進(jìn)行單因素方差分析,結(jié)果(表3)顯示,2個處理間多樣性指數(shù)差異不顯著(P<0.05)。MR處理的Ace指數(shù)、Chao指數(shù)、香濃(Shannon)指數(shù)、Sobs指數(shù)均高于CR處理,差異不顯著;MR處理的辛普森(Simpson)指數(shù)低于CR處理,差異不顯著。多樣性分析結(jié)果表明,稻蝦種養(yǎng)模式(CR)沒有顯著改變nosZ基因微生物群落豐富度及群落多樣性。
2.3 稻蝦種養(yǎng)對土壤nosZ基因豐度的影響
利用熒光定量技術(shù)對氧化亞氮還原酶nosZ基因進(jìn)行定量分析,結(jié)果(圖2)表明,CR處理nosZ基因豐度顯著高于MR處理。其中CR處理中nosZ基因豐度為1 g干土2.23×106拷貝數(shù),MR處理中nosZ基因豐度為1 g干土1.51×106拷貝數(shù),CR處理nosZ基因豐度是MR處理基因豐度的1.48倍。與常規(guī)中稻種植模式相比,稻蝦種養(yǎng)模式可以顯著提升稻田土壤nosZ基因豐度。
2.4 稻蝦種養(yǎng)對土壤中nosZ基因物種組成的影響
在水稻抽穗期,對CR處理和MR處理nosZ基因微生物進(jìn)行目、科、屬、種的物種分類學(xué)水平韋恩(Vern)分析,結(jié)果見圖3。在目和科水平上,CR處理和MR處理具有相同的10個目(圖3-a)和12個科(圖3-b),在目和科水平的群落組成上表現(xiàn)出極大的相似性;在屬水平上,CR處理和MR處理有17個相同的屬,MR處理獨(dú)有紅假單胞菌屬(圖3-c);在種水平上,CR處理和MR處理有19個相同的種,MR處理獨(dú)有沼澤紅假單胞菌(圖3-d)。分析表明,在科水平以上,稻蝦種養(yǎng)模式(CR)nosZ基因微生物群落組成與常規(guī)稻田表現(xiàn)出極大的相似性,在屬和種水平上,2個處理之間的微生物群落組成存在差異,稻蝦種養(yǎng)模式(CR)缺失紅假單胞菌屬下的沼澤紅假單胞菌。
2.5 稻蝦種養(yǎng)模式對nosZ基因物種目水平相對豐度的影響
樣品獲得的nosZ基因微生物物種分類在2個域、2個界、4個門、6個綱、10個目、12個科、18個屬和20個種。將無法分類的序列定義為無法歸類,樣品獲得的nosZ基因OTUs在分類學(xué)界、門、綱、目、科、屬、種水平上可歸類比例為 95.0%、95.0%、90.0%、85.0%、75.0%、50.0%、35.0%。
在目水平上,未分類c_β-變形菌目、未分類_p_變形菌目、嗜氫菌目、紅環(huán)菌目、未分類_k_norank d_細(xì)菌目、根瘤菌目是2個處理平均相對豐度同時大于1%的6個優(yōu)勢菌目(圖4),CR處理3次重復(fù)平均相對豐度分別為52.45%、29.49%、6.72%、5.57%、2.91%、1.82%;MR處理3次重復(fù)平均相對豐度分別為58.43%、15.57%、8.85%、9.77%、2.98%、2.40%。對nosZ目水平上相對豐度大于>0.1%的群落物種進(jìn)行顯著性分析,結(jié)果(表4)顯示,紅環(huán)菌目在CR處理中的相對豐度顯著低于MR處理(P<0.05),norank_p_environmental_samples在CR處理中的相對豐度顯著高于MR處理(P<0.05)。稻蝦種養(yǎng)模式顯著降低了紅環(huán)菌目的相對豐度,增加了norank_p_environmental_samples的相對豐度,改變了nosZ基因微生物目水平相對豐度的組成。
2.6 nosZ型反硝化細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)與土壤理化性質(zhì)的相關(guān)性
對97%相似水平上的OTU代表序列進(jìn)行決策曲線分析法(decision curve analysis,簡稱DCA)進(jìn)行分析,看分析結(jié)果中l(wèi)engths of gradient 的第一軸的大小,如果大于4.0,就應(yīng)該選典型關(guān)聯(lián)分析(canonical correlation analysis,簡稱CCA),如果介于3.0~4.0之間,選RDA和CCA分析均可,如果小于3.0,RDA分析優(yōu)于CCA分析。分析結(jié)果中l(wèi)engths of gradient第一軸的大小為0.553,因此選用RDA分析環(huán)境因子、樣本、菌群三者間的關(guān)系。
對nosZ群落結(jié)構(gòu)與土壤理化性質(zhì)進(jìn)行冗余分析,結(jié)果(圖5)表明,2個排序軸共解釋了98.35%的變化,第一排序軸(RDA1)解釋了95.56%的群落變化,第二排序軸(RDA2)解釋了2.79%的變化。第一排序軸與土壤全碳(TC)含量、pH值、硝態(tài)氮(NO3--N)含量的關(guān)系最為密切,第二排序軸與土壤堿解氮(AN)含量的關(guān)系最為密切??傮w而言,土壤全碳(TC)含量對群落結(jié)構(gòu)的影響最為顯著(R2=0.482 8),影響順序依次是土壤總碳含量>pH值>堿解氮含量>硝態(tài)氮含量>銨態(tài)氮含量。沿第一排序軸看,稻蝦種養(yǎng)的3個樣本全部分布在常規(guī)中稻處理左側(cè),其中CR2、CR3分別與常規(guī)中稻的MR1、MR2、MR3樣本距離較近,而CR1處理與其他樣本距離較遠(yuǎn)。表明2個處理群落結(jié)構(gòu)存在差異,但稻蝦種養(yǎng)模式與常規(guī)稻田模式在群落結(jié)構(gòu)上仍保留著一定的相似性,土壤總碳含量是影響2種模式群落結(jié)構(gòu)的主效因子。
3 討論與結(jié)論
佀國涵等研究表明,長期稻蝦輪作顯著提高水稻土0~40 cm 耕層有機(jī)碳、全鉀、堿解氮含量,0~30 cm耕層的土壤全氮含量及0~10 cm土壤速效鉀、全磷含量在稻蝦輪作下也顯著提高,該模式可改善土壤結(jié)構(gòu)增加土壤養(yǎng)分[19]。金乃康研究結(jié)果顯示,稻蝦種養(yǎng)模式下蝦子的糞便可增強(qiáng)土壤肥力,減少化肥使用量,在降低生產(chǎn)投入的情況下又可提高農(nóng)田利用效率與經(jīng)濟(jì)效益[20]。本研究的結(jié)果與前人研究基本一致,與常規(guī)中稻種植模式相比,稻蝦輪作模式顯著提高了土壤全氮、全碳、硝態(tài)氮含量。目前,稻蝦稻田種養(yǎng)復(fù)合模式的研究多數(shù)集中在土壤物理化學(xué)性質(zhì)、稻蝦田溫室氣體以及稻蝦種養(yǎng)技術(shù)等方面,對于稻蝦土壤反硝化微生物方面的研究較少。研究結(jié)果表明,稻田養(yǎng)蝦對nosZ基因微生物群落豐富度及群落多樣性的影響均不顯著。稻蝦種養(yǎng)模式與常規(guī)中稻種植模式nosZ基因微生物群落結(jié)構(gòu)存在差異,但二者在群落結(jié)構(gòu)上仍保留著一定的相似性。該結(jié)果與之前的研究發(fā)現(xiàn)一致,在不同的土地利用方式、不同環(huán)境條件下,nosZ基因的微生物群落組成變化不大,nosZ基因微生物群落在土壤中相對比較穩(wěn)定,受到環(huán)境條件影響的變化不大[21-22]。在中稻抽穗期,稻蝦種養(yǎng)模式nosZ基因豐度是常規(guī)中稻種植模式的1.48倍,顯著提升了稻田土壤中nosZ基因的豐度。稻蝦種養(yǎng)模式顯著提升了土壤中硝態(tài)氮含量,而NO3--N是反硝化反應(yīng)第1步硝酸還原反應(yīng)的底物,反應(yīng)生成的N2O是nosZ基因編碼的N2O還原酶的原料,能夠促進(jìn)nosZ的增長。所以,硝態(tài)氮間接地為nosZ基因微生物提供了原料,促進(jìn)了nosZ基因豐度的增加[9]。沼澤紅假單胞菌是一種菌體富含蛋白質(zhì)、維生素、類胡蘿卜素等營養(yǎng)物質(zhì),被廣泛應(yīng)用于漁業(yè)的光合細(xì)菌,作為飼料添加劑可以有效地提高飼料效率,促進(jìn)魚蝦生長[23]。沼澤紅假單胞菌和紅螺菌同屬紅螺菌科,二者生存條件相似,均是在光照和厭氧條件下適宜生長[24]。稻蝦種養(yǎng)模式缺失沼澤紅假單胞菌可能與缺失紅螺菌的原因相似,一方面是抽穗期株高較高,遮光效應(yīng)不利于沼澤紅假單胞菌的生長;另一方面可能在淺水狀態(tài)下,克氏螯蝦的擾動帶入了水體氧氣,打破了厭氧環(huán)境,不利于沼澤紅假單胞菌的生長[25]。Miller等在研究短期內(nèi)(72 h)碳源對小麥反硝化基因豐度的影響發(fā)現(xiàn),碳含量較高是氮施入可以提高反硝化微生物豐度的前提[26]。自然界中多種環(huán)境因素,如土壤pH值[27]、土壤含氧量[28-29]、土壤溫度[30]、土壤含水量[31]、土壤中的養(yǎng)分供應(yīng)狀況[32]以及植物種類[33-34]等均能夠影響反硝化細(xì)菌群落的結(jié)構(gòu)。續(xù)勇波等認(rèn)為,凡是能促進(jìn)土壤碳、氮積累和厭氧微生物活性的土地利用方式和耕作管理措施均會促進(jìn)反硝化作用進(jìn)行,可見碳、氮是影響反硝化活性的主要因子[35]。本研究結(jié)果顯示,土壤總碳是影響2種模式nosZ基因微生物群落結(jié)構(gòu)的主效因子,與前人的研究結(jié)果基本一致。此外,由于稻蝦田土壤的環(huán)境較為復(fù)雜,須經(jīng)歷干濕交替階段,且受水稻植株根系分泌物的影響,因此對于稻蝦土壤反硝化細(xì)菌群落的研究也就更為復(fù)雜,須要更加深入系統(tǒng)的研究。
本研究結(jié)論如下:(1)相比常規(guī)中稻種植模式,稻蝦共作顯著增加了水稻土壤硝態(tài)氮、全碳、全氮含量,對土壤pH值、堿解氮含量及土壤碳氮比無顯著影響。(2)本研究借助熒光定量PCR對常規(guī)中稻種植模式與稻蝦共作模式下的土壤反硝化細(xì)菌nosZ基因數(shù)量進(jìn)行研究,結(jié)果表明,稻蝦共作模式中nosZ基因豐度顯著高于常規(guī)中稻種植模式。(3)與常規(guī)中稻種植模式相比,稻蝦種養(yǎng)模式?jīng)]有顯著改變nosZ基因微生物群落豐富度及群落多樣性。在目和科水平以上,稻蝦種養(yǎng)模式nosZ基因微生物群落組成與常規(guī)稻田表現(xiàn)出極大的相似性;在屬和種水平,2個處理微生物群落組成存在差異,稻蝦種養(yǎng)模式缺失紅假單胞菌屬下的沼澤紅假單胞菌。2種種植模式群落結(jié)構(gòu)存在差異,但稻蝦種養(yǎng)模式與常規(guī)稻田種植模式在群落結(jié)構(gòu)上仍保留著一定的相似性。與常規(guī)中稻種植模式相比,稻蝦種養(yǎng)模式顯著降低了紅環(huán)菌目的相對豐度,改變了nosZ基因微生物目水平相對豐度的組成。此外,土壤pH值、堿解氮含量、硝態(tài)氮含量、銨態(tài)氮含量與群落結(jié)構(gòu)存在顯著相關(guān)關(guān)系,而土壤總碳含量是影響2種模式nosZ基因微生物群落結(jié)構(gòu)的主效因子。
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