高艷
在生命科學領(lǐng)域的標準中,符號的使用十分廣泛。除拉丁文符號在物種名稱中的應(yīng)用之外,符號的使用還可見于生命屬性、生命組成單元,以及生命活動過程和相關(guān)物質(zhì)的表示之中。
同樣的外文字母,組合不同、正斜體不同、大小寫不同,所含的信息也就不同。在標準編寫、編輯、排版、校對過程中,其使用往往存在一些問題。本文對國家標準中生命科學符號的使用原則和常用符號的表示規(guī)范做一簡單介紹。
一、生命科學符號使用的一般原則
生命科學領(lǐng)域科學概念繁多,為以最佳的表示方式,展現(xiàn)最清晰明確的含義,要求生命科學符號的使用需遵守一定的原則:
(1)名詞術(shù)語的縮寫、核苷酸或者氨基酸的單字母符號等一般用大寫,常用前綴一般用小寫,其余根據(jù)習慣選擇大小寫。
(2)有指代意義的核心字母(主符號)用平排;表示屬性、編號、類別的輔助性字母或數(shù)字標于主符號的上或下角,或與主符號平排,其間加連字符,但主符號和數(shù)字之間的對開連接線有時候可以省略。
(3)基因符號、拉丁學名(種、屬)、限制酶的學名部分等用斜體,其余一般用正體。
二、常用生命科學符號
1.雌雄性符號
性別是生命的基本屬性之一?!啊狻笔谴菩坌缘谋硎痉?。應(yīng)注意,雄性符號中的箭頭是指向右上方而不是正上方,♂或者排成斜體的都是不規(guī)范的。
2.氨基酸
蛋白質(zhì)的基本組成單位。自然界有20種常見的氨基酸,在表示單個氨基酸時,一般用英文三字母表示方法;在表示一段肽鏈時,可使用英文單字母表示方法,見表1。此外,還有一種漢字單(雙)字符表示方法,也可以使用于表示一段肽鏈,如甘氨酸表示為“甘”,甲硫氨酸表示為“甲硫”,此種表示法不提倡在非科普類科技圖書中使用。
3.堿基、核苷、核苷酸
堿基、核苷、核苷酸的命名規(guī)則和符號見表2。
部分稀有堿基及核苷的表示符號如下:
4.基因、蛋白質(zhì)、表型符號
基因與蛋白質(zhì)是兩個完全不同的概念?;颍╣ene)作為遺傳單位,是一段DNA序列(有一些RNA病毒中則是RNA序列);蛋白質(zhì)(protein)是基因的表達產(chǎn)物,是生物體的主要組成物質(zhì)之一。基因符號用斜體,表型產(chǎn)物符號用正體,是遺傳符號使用的一般原則。由于自然界物種繁多,基因類型復(fù)雜,逐漸形成了以大小寫字母的變換、前后綴、上下角標等標記來區(qū)別物種屬性、特定表型的突變等特征的約定。在具體標準中,應(yīng)對符號是代表基因還是其表型產(chǎn)物進行明確區(qū)分。
5.染色體
染色體核型表示常用符號見表3。
6.基因相關(guān)功能單元
常見基因相關(guān)功能單元的表示方式如下:
(1)起始因子和延伸因子。起始因子用IF通過連字符后跟編碼表示。細菌的起始因子沒有前綴,如IF-2;真核生物則要加前綴e,如eIF-2、eIF-β等。延伸因子則把IF換成EF,如EF-Ts、EF-1α等。
(2)轉(zhuǎn)座子。簡單轉(zhuǎn)座子一般用IS后跟一個數(shù)字編碼表示,用正體,如IS2、IS10R。復(fù)雜轉(zhuǎn)座子一般用Tn后跟一個數(shù)字編碼表示。對細菌,Tn用正體,編碼用斜體,如Tn5 lac,對真核生物,Tn和編碼均用正體,如Tn903。玉米的轉(zhuǎn)座子則全部斜體,如Ac等。
(3)限制性內(nèi)切核酸酶。前三字母為酶源物種學名部分的簡寫,用斜體;后面字母和編碼全部正體平排。如EcoRⅠ、TaqⅠ等。
(4)重組基因載體。病毒縮寫一般為正體,大多平排,如T7、M13。質(zhì)粒一律用正體,一般首字母為小寫p,后面字母和數(shù)字編碼平排,如pBR322,黏粒pJC720。
7.細胞
常見細胞相關(guān)符號表示方式如下:
(1) 細胞株縮寫。有一些已形成約定俗成的慣用寫法,如HeLa。
(2) 細胞周期。應(yīng)表示為G0、G1、GS等,其中下標S大寫。
(3) 細胞色素。細胞色素a、b、c、d以英文小寫表示。細胞色素P-450系列一般表示為P1-450、P-450c等。
三、其他相關(guān)符號
1.生命科學符號中為正體的符號
(1) 化學元素符號(包括單質(zhì)、化合物及元素的核素等)。如H(氫) 、O2(氧氣)、H2O(水)、235U(鈾的核素)等。
(2)? 毒理學符號。如CD50(半數(shù)驚厥量)、LD(藥物的致死劑量)、MLD(平均致命劑量)、TCID50(疫苗劑量)等。
(3) 表示氨基酸、肽類及糖類等的立體化學結(jié)構(gòu)的符號D和L。用大寫正體或大小寫正體表示,如L-Val-L-Ala-Gly-D-Phe-L-Trp-D-Pro。
2.生命科學符號中為斜體的符號
(1)? H表示額外氫時;N,O,S表示雜原子N,O,S時。
(2)? 表示取代位置的符號。如N-乙酰葡糖胺、N,N-二乙基乙酰胺、O-膽堿磷酸、 S-ethylcysteine。
(3)? 表示鏈異構(gòu)的形容詞——正、異、新、仲、叔。如n-,i-(iso-),neo-,sec-,tert-。
(4)表示多元取代苯中取代基的相對位置。o-,m-,p-,含義分別為鄰、間、對位。
(5)表示構(gòu)象的前綴。順式cis和反式trans,在句首出現(xiàn)時,仍舊用小寫。
(6)表示雙鍵順、反異構(gòu)、手性原子構(gòu)型的符號E、Z、R、S。應(yīng)為大寫,加圓括號,如(Z)-2-丁烯、(2S,5R)-2,5-dimethylheptan-1-ol。
(7) 表示旋光性的符號。如meso(內(nèi)消旋),dl-、r-(外消旋)。