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miR-155-5p靶向核因子κB抑制蛋白E在人單核巨噬細(xì)胞抗新生隱球菌免疫反應(yīng)中的機(jī)制研究

2019-09-24 09:19王一霖王中志林文婷陳江漢
中國感染與化療雜志 2019年5期
關(guān)鍵詞:腦膜炎球菌熒光素酶

王一霖, 滕 亮, 王中志, 王 妍, 林文婷, 陳江漢

新生隱球菌是一種環(huán)境致病菌,可以感染人類和許多哺乳動物的肺、皮膚、骨骼等全身各器官,但以侵犯中樞神經(jīng)系統(tǒng)最常見(即為隱球菌性腦膜炎)。據(jù)估計,僅2014年就新增223 100例隱球菌性腦膜炎病例,其中73%發(fā)生在非洲[1]。與歐美、非洲等地區(qū)隱球菌性腦膜炎主要發(fā)生在AIDS人群不同,我國主要發(fā)生在非AIDS的無免疫功能缺陷的人群,但在治療上卻比免疫功能受損的患者療程更長,治療更困難[2]。隱球菌性腦膜炎患者如不及時治療,86%在1年內(nèi)死亡,即使現(xiàn)代醫(yī)療的情況下,病死率仍有20%~30%[3]。因此,如何有效防治新生隱球菌中樞神經(jīng)系統(tǒng)感染,是目前亟需解決的問題。

微小RNA(miRNA)是一類長度約為20~24個核苷酸非編碼小RNA分子,主要在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)節(jié)靶基因表達(dá),參與細(xì)胞分化、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、免疫應(yīng)答、腫瘤發(fā)生等多種生命活動。miR-155-5p參與免疫細(xì)胞的發(fā)育分化,在活化的巨噬細(xì)胞、T淋巴細(xì)胞、B淋巴細(xì)胞和樹突狀細(xì)胞中表達(dá)明顯增加,并在免疫應(yīng)答中發(fā)揮重要作用[4-5]。核因子κB抑制蛋白E(IKBKE)是IκB激酶家族(IKKs)新近發(fā)現(xiàn)的成員,可通過調(diào)節(jié)核轉(zhuǎn)錄因子-κB(NF-κB)信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑,在固有免疫系統(tǒng)中發(fā)揮重要作用[6]。通過前期mirnada網(wǎng)站預(yù)測,發(fā)現(xiàn)miR-155-5p和IKBKE基因有結(jié)合位點(diǎn),而miR-155-5p和IKBKE基因均參與細(xì)胞炎性反應(yīng),因此猜測miR-155-5p通過靶向降解IKBKE信使RNA(mRNA)在人單核巨噬細(xì)胞(THP-1細(xì)胞)抗新生隱球菌免疫反應(yīng)中發(fā)揮著作 用。

1 材料與方法

1.1 材料

THP-1細(xì)胞購于中國科學(xué)院細(xì)胞庫;新生隱球菌標(biāo)準(zhǔn)株WM148來自上海長征醫(yī)院皮膚科真菌儲藏室;胎牛血清購自Gibco公司,細(xì)胞培養(yǎng)基RPMI-1640、Opti-MEM培養(yǎng)基及磷酸鹽緩沖液(PBS)購自美國Hyclone;腫瘤壞死因子(TNF)-α和白細(xì)胞介素(IL)-6 Elisa試劑盒來自中國欣博盛生物科技公司;異丙醇、三氯甲烷和無水乙醇來自鼎國生物技術(shù)有限公司;miR-155-5p mimics、IBKEK siRNA購自中國銳博生物公司;miR-155-5p、U6引物購自上海生工生物工程公司;反轉(zhuǎn)錄試劑盒和Trizol購自TaKaRa公司;實(shí)時熒光PCR試劑盒購自ABM公司;Dual-Luciferase?Reporter Assay System購自Promega公司;X-tremegene HP購自羅氏公司;佛波酯(PMA)購自SIGMA公司;脂質(zhì)體2000購自Invitrogen公司。

1.2 方法

1.2.1 細(xì)胞、菌株培養(yǎng) THP-1細(xì)胞培養(yǎng)于10%胎牛血清、100 U/mL青霉素和100 U/mL鏈霉素的RPMI-1640培養(yǎng)基中,置于37 ℃、5%CO2的培養(yǎng)箱中;2~3 d換液1次,細(xì)胞密度達(dá)80%時傳代培養(yǎng)。WM-148標(biāo)準(zhǔn)株培養(yǎng)于YEPD培養(yǎng)基(2%葡萄糖、2%蛋白胨和1%酵母提取物)中,30 ℃培養(yǎng),收集菌株予0.9% NaCl溶液沖洗2遍后65 ℃條件下滅活1 h,計數(shù)并調(diào)整菌液濃度。

1.2.2 細(xì)胞分組、干預(yù)及收集樣品 將濃度為1×106/mL的THP-1細(xì)胞液2 mL接種于6孔板,每孔加入200 ng PMA,48 h誘導(dǎo)THP-1細(xì)胞分化為巨噬細(xì)胞,按照菌與細(xì)胞5∶1數(shù)量比加入已滅活的新生隱球菌進(jìn)行干預(yù),在0 h、3 h、6 h、9 h和12 h時間點(diǎn)離心收集細(xì)胞及上清液,保存于-80 ℃冰 箱。

1.2.3 反轉(zhuǎn)錄合成cDNA及qPCR檢測 Trizol法提取總RNA后,利用紫外分光光度計將RNA濃度調(diào)整至500 ng/μL左右,miR-155-5p反轉(zhuǎn)錄10 μL體系(mRQ緩沖液5 μL、mRQ酶混合物1.25 μL及RNA樣品3.75 μL),反應(yīng)條件為37 ℃ 1 h、85 ℃5 min;IKBKE反轉(zhuǎn)錄10 μL體系(5×PrimeScript RT預(yù)混合溶液2 μL、RNA樣品500 ng、無酶水加至10 μL),反應(yīng)條件為37 ℃ 15 min、85 ℃ 5 s;miR-155-5p及U6實(shí)時熒光PCR 25 μL體系[無酶水9.5 μL、SYBR 12.5 μL、MRQ 3'引物0.5 μL(U6上游引物)、miRNA引物0.5 μL(U6下游引物)、cDNA 2 μL],反應(yīng)步驟為:①95 ℃ 5 min,②95 ℃ 10 s,③63 ℃ 15 s,④72 ℃ 5 s(步驟②~④重復(fù)40個循環(huán)),進(jìn)行溶解曲線分析,采用2-ΔΔCt計算miRNA的相對表達(dá)量。引物見表1。

1.2.4 檢測上清液TNF-α和IL-6含量 利用酶聯(lián)免疫吸附法(ELISA)檢測,按照試劑盒操作步驟進(jìn)行操作,于分光光度計450 nm處檢測各組吸光值。根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)品線性回歸方程計算各組細(xì)胞因子的濃度。

表1 qRT-PCR引物信息表Table 1 Primers used for real-time quantitative PCR in this study

1.2.5 驗證miR-155-5p與IKBKE基因的靶向關(guān)系 將實(shí)驗分為6組,分別是海腎熒光素酶(pRL)質(zhì)粒+模擬物(mimics)陰性對照(NC)、pRL質(zhì)粒+miR-155-5p、pRL質(zhì)粒+IKBKE 3'UTR+mimicsNC、pRL質(zhì)粒+IKBKE 3'UTR+ miR-155-5p、pRL質(zhì)粒+IKBKE 3'UTR-突變型(mut)+mimicsNC、pRL質(zhì)粒+IKBKE 3'UTR-mut+miR-155-5p。將生長良好的細(xì)胞分入24孔培養(yǎng)板培養(yǎng),按實(shí)驗設(shè)計的組別進(jìn)行質(zhì)粒轉(zhuǎn)染實(shí)驗。轉(zhuǎn)染24 h后熒光顯微鏡下觀察細(xì)胞內(nèi)熒光標(biāo)記基因的表達(dá)情況,然后使用“Dual-Luciferase?Reporter Assay System(E1910,promega)”試劑盒處理細(xì)胞、進(jìn)行熒光素酶表達(dá)檢測。

1.2.6 IKBKE siRNA的轉(zhuǎn)染 將實(shí)驗分為空白對照組和轉(zhuǎn)染IKBKE siRNA組,用不含抗生素和血清的培養(yǎng)基稀釋IKBKE siRNA后,將其加入生長良好的細(xì)胞中,轉(zhuǎn)染6 h后測定IKBKE、TNF-α和IL-6的表達(dá)變化。

1.2.7 miR-155-5p mimics的轉(zhuǎn)染 更換細(xì)胞液,調(diào)整好細(xì)胞生長的狀態(tài);將實(shí)驗分為4組,分別是0 h對照組、6 h對照組、0 h mimics組、6 h mimics組,用脂質(zhì)體2000試劑盒,按照試劑盒操作步驟進(jìn)行操作,實(shí)驗組轉(zhuǎn)染miR-155- 5p mimics,對照組轉(zhuǎn)染miR-155-5p mimics對照物,檢測轉(zhuǎn)染效率,提取RNA和上清液進(jìn)行下一步實(shí) 驗。

1.2.8 統(tǒng)計學(xué)方法 根據(jù)SPSS 19.0統(tǒng)計軟件進(jìn)行分析,實(shí)驗數(shù)據(jù)以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差表示,兩組樣本均數(shù)的比較采用t檢驗,各組間的兩兩差異比較采用LSD-t檢驗,P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 miR-155-5p、IKBKE、TNF-α和IL-6在新生隱球菌誘導(dǎo)THP-1細(xì)胞后的表達(dá)變化

新生隱球菌誘導(dǎo)THP-1細(xì)胞后,以0 h為對照,miR-155-5p在3 h、6 h、9 h、12 h表達(dá)量均升高,其中在6 h升高最為顯著(P<0.01),隨后逐漸下降;IKBKE在3 h、6 h、9 h下降量與0 h比較差異有統(tǒng)計學(xué)意義,其中在6 h下降最顯著(P<0.01),TNF-α和IL-6表達(dá)逐漸增加,其中TNF-α在9 h達(dá)到峰值。見圖1。

2.2 雙熒光素酶報告系統(tǒng)驗證miR-155--55pp和IKBKE 3'非翻譯區(qū)(3' UTR)區(qū)域的相互作用

根據(jù)mirnada網(wǎng)站預(yù)測結(jié)果,miR-155-5p和IKBKE基因有結(jié)合位點(diǎn)(圖2A)。雙熒光素酶報告系統(tǒng)進(jìn)一步驗證了這一點(diǎn):miR-155-5p作用后IKBKE 3'UTR活性下降了30%,說明miR-155-5p能夠作用IKBKE 3'UTR區(qū)域,引起IKBKE 3'UTR活性下降;將IKBKE 3'UTR進(jìn)行突變后,IKBKE 3'UTR-mut活性較野生型增加15%,而與對照組相比差異無統(tǒng)計學(xué)意義(圖2B),說明突變位點(diǎn)對miR-155-5p的結(jié)合很重要,可能是其相互結(jié)合的位點(diǎn)。見圖2。

2.3 miR-155-5p通過調(diào)控IKBKE進(jìn)一步調(diào)節(jié)THP-1細(xì)胞的功能

經(jīng)轉(zhuǎn)染miR-155-5p mimics,miR-155-5p實(shí)驗組較對照組在6 h表達(dá)明顯增加,證明轉(zhuǎn)染效率較高,相對應(yīng)IKBKE基因6 h實(shí)驗組較6 h對照組表達(dá)下降,進(jìn)一步驗證了miR-155-5p與IKBKE的靶向關(guān)系;檢測上清液因子發(fā)現(xiàn)實(shí)驗組 TNF-α和IL-6在6 h表達(dá)均較對照組增加,表明miR-155-5p表達(dá)增加促進(jìn)了THP-1細(xì)胞中TNF-α和IL-6的表達(dá)。見圖 3。

圖1 新生隱球菌誘導(dǎo)后miR-155-5p和IKBKE的表達(dá)倍數(shù)變化以及TNF-α和IL-6的表達(dá)量變化Figure 1 Fold change of miR-155-5p expression and IKBK expression,TNF-α expression and IL-6 expression at different time points after induction by C. neoformans

圖2 miR-155-5p和IKBKE基因的結(jié)合位點(diǎn)(A)及雙熒光素酶報告系統(tǒng)中IKBKE 3'UTR和IKBKE 3'UTR-mut的活性變化(B)Figure 2 Binding site of miR-155-5p and IKBKE(Panel A), activity change of IKBKE 3'UTR and IKBKE 3'UTR-mut in the dual luciferase reporter system(Panel B)

2.4 IKBKE siRNA轉(zhuǎn)染THP-1細(xì)胞后TNF-α和ILL--66的表達(dá)變化

經(jīng)轉(zhuǎn)染IKBKE siRNA,IKBKE含量在6 h下降,表明轉(zhuǎn)染效率較高,而TNF-α和IL-6在6 h表達(dá)增加,表明經(jīng)抑制IKBKE能夠促進(jìn)TNF-α和IL-6的表達(dá)。見圖4。

3 討論

發(fā)生在我國免疫正常人群的隱球菌性腦膜炎病原菌多為新生隱球菌,該病病情兇險,病死率高,療程長,治療費(fèi)用高,對患者和社會都是沉重的負(fù)擔(dān),迫切需要對其發(fā)病機(jī)制及治療手段進(jìn)行研究[2]。

THP-1細(xì)胞是人體固有免疫系統(tǒng)的重要組成部分,在外界因素刺激下可被激活為經(jīng)典激活巨噬細(xì)胞(M1型)和替代激活巨噬細(xì)胞(M2型):M1型細(xì)胞分泌TNF-α、IL-1β、IL-6等炎性因子,具有很強(qiáng)的殺菌作用;M2型巨噬細(xì)胞分泌轉(zhuǎn)化生長因(TGF)-β、精氨酸酶1(Arg1)、IL-10等炎性因子,可抑制炎性反應(yīng)[7]。在新生隱球菌性腦膜炎患者中,M1型細(xì)胞有助于清除病原體,而M2型細(xì)胞介導(dǎo)免疫逃逸[8],因此促進(jìn)THP-1細(xì)胞向M1型極化有助于治療隱球菌性腦膜 炎。

圖3 轉(zhuǎn)染miR-155-5p mimics及其對照物后,miR-155-5p和IKBKE的表達(dá)倍數(shù)變化及TNF-α和IL-6的表達(dá)量變化Figure 3 After transfection of miR-155-5p mimics and its controls, the fold change of expression of miR-155-5p and IKBKE and the changes of expression levels of TNF-α and IL-6

圖4 轉(zhuǎn)染IKBKE siRNA及其對照物后IKBKE的表達(dá)倍數(shù)變化及TNF-α和IL-6的表達(dá)量變化Figure 4 After transfection of IKBKE siRNA and its controls, the fold change of expression of IKBKE and the changes of expression levels of TNF-α and IL-6

通過研究新生隱球菌干預(yù)THP-1細(xì)胞發(fā)現(xiàn),miR-155-5p在6 h時間點(diǎn)表達(dá)增加,同時炎性因子TNF-α、IL-6表達(dá)明顯增加,而IKBKE基因在6 h表達(dá)減少,因此推測miR-155-5p通過靶向降解IKBKE mRNA促進(jìn)TNF-α和IL-6的表達(dá)。之后通過雙熒光素酶報告系統(tǒng)發(fā)現(xiàn)在miR- 155- 5p mimics作用下,IKBKE 3'UTR活性下降,將3'UTR突變其活性再次增加,證實(shí)miR-155-5p可與IKBKE 3'UTR結(jié)合。隨后我們對miR-155-5p功能進(jìn)行了研究,在miR-155-5p mimics作用下,與對照組比較,實(shí)驗組在6 h時IKBKE表達(dá)降低,TNF-α和IL-6表達(dá)明顯增加,表明miR-155-5p促進(jìn)TNF-α、IL-6的表達(dá)。為了驗證miR-155-5p通過靶向調(diào)控IKBKE發(fā)揮了此作用,我們將IKBKE siRNA轉(zhuǎn)染至THP-1細(xì)胞中,發(fā)現(xiàn)在6 h時IKBKE表達(dá)減少,同時TNF-α和IL-6表達(dá)增加。

綜上所述,本研究顯示并驗證了miR-155-5p通過靶向降解IKBKE mRNA促進(jìn)TNF-α和IL-6的表達(dá)這一調(diào)控機(jī)制。根據(jù)已知研究結(jié)果可知TNF-α和IL-6是M1型巨噬細(xì)胞分泌的炎性因子,該細(xì)胞為促炎類型的巨噬細(xì)胞,具有強(qiáng)效殺菌特點(diǎn)并促進(jìn)輔助性T細(xì)胞1型參與的免疫反應(yīng)(Th1型免疫反應(yīng)),其在隱球菌性腦膜炎病程中發(fā)揮抗感染殺菌作用[5]。因此miR-155-5p可作為隱球菌性腦膜炎潛在的治療靶點(diǎn),在臨床實(shí)踐中發(fā)揮重要作用。盡管發(fā)現(xiàn)IKBKE在隱球菌干預(yù)THP-1細(xì)胞反應(yīng)中發(fā)揮重要作用,但其作用的炎癥通路和具體分子機(jī)制仍然不清楚,需要進(jìn)一步探索和研究。

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