張卓鵬
摘要:試圖從不斷減少酶的種類,有利于反應(yīng)條件的控制角度來推測科學(xué)家們當(dāng)初的PCR設(shè)計思路。
關(guān)鍵詞:PCR技術(shù);DNA復(fù)制;酶
中圖分類號:Q-49 文獻標(biāo)志碼:E
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polvmerase chain reaction,PCR)是20世紀(jì)80年代發(fā)展起來的新技術(shù),它能以極少量的DNA為模板,在幾個小時內(nèi)復(fù)制出上百萬份的DNA拷貝。這項技術(shù)有效解決了因為樣品中DNA含量太低而難以對樣品進行分析研究的問題,現(xiàn)已廣泛應(yīng)用于分子生物學(xué)、基因工程及其他與DNA鑒定相關(guān)的領(lǐng)域。PCR雖然為一個簡單的實驗,但在實際過程中可能會出現(xiàn)各種問題。產(chǎn)生問題的原因可能來源于以下幾個方面:實驗操作、試劑質(zhì)量、PCR反應(yīng)過程中各種試劑的含量,以及反應(yīng)條件、溫度設(shè)置等。下面試圖從不斷減少酶的種類,有利于反應(yīng)條件的控制角度來推測科學(xué)家們當(dāng)初的PCR設(shè)計思路。
1PCR技術(shù)與細(xì)胞內(nèi)DNA復(fù)制的比較
PCR的循環(huán)過程分為三部分:模板變性、引物退火、熱穩(wěn)定DNA聚合酶在適當(dāng)溫度下催化DNA鏈延伸合成。PCR過程和細(xì)胞內(nèi)DNA復(fù)制的比較見表1。
2PCR技術(shù)從需要多種酶到一種酶的推測
PCR技術(shù)是由穆里斯等人于1988年發(fā)明的,穆里斯于1993年獲得諾貝爾化學(xué)獎。核酸體外擴增的最早設(shè)想是由美國的教授科蘭納(曾獲得1968年諾貝爾醫(yī)學(xué)獎)1971年提出:“經(jīng)過DNA變性,與合適引物雜交,用DNA聚合酶延伸引物,并不斷重復(fù)該過程便可克隆基因”。當(dāng)時,科蘭納實驗室己具備了進行PCR的條件,遺憾的是沒有付諸實踐,后來正是穆里斯等人把PCR技術(shù)引向了實際應(yīng)用。然而,1983年8月,穆里斯首次進行有關(guān)PCR原理的報告,其他人卻反應(yīng)冷淡甚至持懷疑態(tài)度,認(rèn)為這個原理太簡單了,如果可行,早就有人做了。
從表1胞內(nèi)DNA復(fù)制和PCR過程的異同比較可看出,細(xì)胞內(nèi)DNA復(fù)制是一個復(fù)雜的化學(xué)過程,需經(jīng)過多步連續(xù)反應(yīng),且需要一系列的酶參與反應(yīng)。理論上講,體外要模擬成功,就應(yīng)與體內(nèi)條件模擬的越接近、越相似,成功的可能性才會越大。實際上,要在體外條件下進行,應(yīng)使反應(yīng)過程簡單化,包括酶種類的減少,中間反應(yīng)步驟的減少,這樣所獲得產(chǎn)物的純度將會提高,便于鑒定;酶種類的減少,也使反應(yīng)的具體條件如溫度、pH等便于控制。那么,在PCR設(shè)計中,如何減少酶的種類呢?
(1)解旋酶、DNA連接酶、ATP的去除。
在高溫(90~95℃)下,DNA分子會自動解旋,且兩條單鏈將完全解開。因此,體外DNA復(fù)制時,不需要解旋酶,也不需要消耗ATP;體外又因DNA兩條單鏈完全解開,故將來合成子鏈時,兩條子鏈都是連續(xù)合成的,于是就不會出現(xiàn)岡崎片段。這樣就不再需要DNA連接酶來連接一個個岡崎片段。
(2)引物由RNA片段改換成DNA單鏈片段,RNA酶的去除。
利用PCR技術(shù)擴增目的基因的前提,是要有一段己知目的基因的核苷酸序列,以便根據(jù)這一序列合成引物。知道引物的核苷酸序列,通過DNA合成儀用化學(xué)方法便可直接人工合成。故PCR技術(shù)中引物由原先細(xì)胞內(nèi)的RNA片段改換成DNA單鏈片段。這樣就不再需要RNA酶水解RNA引物,PCR反應(yīng)體系中酶的種類再次減少。
(3)耐高溫DNA聚合酶的成功分離。
由于DNA子鏈合成延伸時,需DNA聚合酶將單個的核苷酸加到已存在的DNA單鏈片段上,形成磷酸二酯鍵,故PCR設(shè)計中DNA聚合酶不可或缺。然而,從體內(nèi)提取的DNA聚合酶一般在高溫條件下都會變性失活,尋找耐高溫的DNA聚合酶勢必成為PCR技術(shù)突破的瓶頸。我國臺灣科學(xué)家錢嘉韻第一個報道分離耐高溫DNA聚合酶的工作。她從美國黃石國家公園里熱泉中的嗜熱菌中成功分離出了耐高溫的DNA聚合酶,即Taq DNA聚合酶,從而使PCR變成真正的成熟技術(shù)。穆里斯等人正是按照錢嘉韻發(fā)明的操作步驟,成功分離出Taq/DNA聚合酶。
科學(xué)上許多偉大的發(fā)現(xiàn),往往離不開眾多科學(xué)家不懈的努力,尤其離不開科學(xué)家大膽的猜想和實踐創(chuàng)新,PCR技術(shù)從需要多種酶到一種酶的推測便是一個經(jīng)典范例,讓人深受啟發(fā)。