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深圳地區(qū)柯薩奇病毒A16型分子特征分析

2020-06-24 00:08黃華鑫
健康必讀(上旬刊) 2020年4期

黃華鑫

【摘? 要】CVA16(柯薩奇病毒A16),為RNA病毒科腸道病毒屬,屬于沒有包膜單股正鏈的RNA病毒,是在EV71(腸道病毒71型)之外,導(dǎo)致HFMD(手足口?。┘膊〉囊环N主要病原體。鑒于此,本綜述為了將手足口病的發(fā)病率降低,以深圳地區(qū)為例,對CVA16型的分子特點(diǎn)展開綜述。

【關(guān)鍵詞】柯薩奇病毒;柯薩奇病毒A16;分子特征

CVA16型屬于導(dǎo)致皰疹性咽峽、HFMD等疾病的主要病原體,其也能夠像EV71導(dǎo)致心肌炎等疾病一樣,使HFMD加重,甚至?xí){到患兒的生命健康[1]。因?yàn)?,對于CVA16型分子來說,VP1蛋白為中和抗原、重要免疫原性蛋白質(zhì)的決定簇區(qū)域,所以,對VP1的區(qū)域深入研究,可用于此種病毒進(jìn)化分析與分子分型當(dāng)中[2]。本綜述,對深圳地區(qū)門診CVA16型展開研究,以掌握深圳地區(qū)CVA16型的病毒傳播動態(tài)、流行病學(xué)特點(diǎn),為深圳預(yù)防控手足口病,提供科學(xué)與理論依據(jù)。

1 CAl6病毒分子的流行病學(xué)特點(diǎn)

近些年來,由于腸道病毒,而導(dǎo)致的HFMD疾病發(fā)病率,呈逐年上升趨勢,在我國一些城市,已經(jīng)有局部流行情況出現(xiàn)。因?yàn)?,深圳市屬于高人口密度、沿海、流動頻繁地區(qū),并且兒童、嬰幼兒占比較高,所以,在深圳地區(qū)HFM的發(fā)病率較高。在對CAl6病毒分子的流行病學(xué)特點(diǎn)分析時,使用熒光RT-PCR方式,快速檢測,深圳地區(qū)全部HFM病例的CAl6病毒,之后選取深圳地區(qū)代表性陽性株,用于CAl6特異性的引物,以此RT-PC擴(kuò)增VPl基因,將陽性擴(kuò)增[3]。

2 深圳地區(qū)CVA16型分子特征

2.1 CVA16在HFMD病例中的分布

通過使用熒光RT-PGR對HFMD病例當(dāng)中CVA16檢測顯示,深圳市哨點(diǎn)醫(yī)院門診,在2016年到2017年的HFMD陽性樣本(1399份)中,CVA16的陽性樣本共有271份。在2016年的HFMD陽性樣本共有641份,其CVA16的陽性樣本有174份,2017年共有758份HFMD陽性樣本,其中有97份CVA16陽性樣本。

2.2 CVA16在病例中的分布信息

姚相杰等[4]通過對的VP1區(qū)氨基酸、核苷酸同源性進(jìn)行分析,經(jīng)過實(shí)踐總結(jié)得出,在51株CVA16的病毒株中,核苷酸同源性占到88.1%至100%,氨基酸同源性占比為98.6%到100%,和原型株相比,缺失與插入無堿基。在2016年的CVA16病毒株(28株)中,核苷酸同源性是92.8%到100%,氨基酸的同源性是99.3%至100%,在2017年中,CVA16病毒株核苷酸的同源性占比為88.4%到100%,氨基酸的同源性是98.6%~到100%。在2016年中病毒株JB1416300413、JB1416300399、JB1416300398和2017年的病毒株核苷酸的同源性是100%。

2.3 分析CVA16遺傳進(jìn)化情況

按照核苷酸的序列,使用軟件,使用模型、方式,創(chuàng)建51株病毒株,和各個基因型的代表株系統(tǒng)發(fā)生樹。實(shí)踐結(jié)果顯示,2016年深圳CVA16病毒株(28株)類型,都是B亞型B1b亞型,而JB1416300398株,和武漢B1b的代表化,有著十分密切的關(guān)系,JB141630375株、JB141630364株,和上海的株具有親緣的關(guān)系剩下的25株和溫州市的株、上海市的等為同一個進(jìn)化分支。

2.4 區(qū)的基因分型

周健明等[5]指出,當(dāng)前CVA16,VP1區(qū)的基因分型,還沒有統(tǒng)一的標(biāo)準(zhǔn),當(dāng)前,共有兩種常用方式進(jìn)行基因分型,(1)A基因型、B基因型、C基因型,其中,C基因型能夠分成C1亞型、C2亞型、C3亞型,這一種基因分型方式,會使B基因型與基因型間的核苷酸,有著較小的差異;(2)本次研究中,所參考的方法,該種方式的基本原則是按照苷酸差異最小是15%,將其分成A基因型、B基因型??蓪基因型分成B1亞型、B2亞型,在2000年之前流程B2亞型,B1亞型在2000年之后流行,B1基因亞型,能夠分成B1c、B1b、B1b。深圳龍崗區(qū)2017年的CVA16患者中,基因型都屬于B1,同時,有共同流行B1a基因亞型、B1b基因亞型,B1b是一種具備優(yōu)勢的基因亞型,同時,和深圳市,以及臨省以往流行株,存在著親緣的關(guān)系。在B1a亞型的分支序列當(dāng)中,一些和我國大陸地區(qū),以往的分離株具有同源性關(guān)系,一些和越南、泰國等臨近國家毒株存在進(jìn)化的關(guān)系,這一現(xiàn)象可以充分說明了,CVA16具有來源多樣性的特點(diǎn),這和深圳屬于重要對外窗口、移民較大城市有著一定的關(guān)系。

3 總結(jié)

在我國大多數(shù)地區(qū),在冬季和夏季是手足口病高發(fā)季節(jié)。嬰幼兒是手足口病的高發(fā)群體,而病毒為CVA16型患者的癥狀較輕。近些年來,CVA16、EV71依舊是導(dǎo)致手足口病出現(xiàn)的一個重要病原。以上對深圳地區(qū)CVA16在HFMD分布情況展開分析,從而為幫助深圳地區(qū),預(yù)防與治療手足口病提供科學(xué)依據(jù)。

參考文獻(xiàn)

[1] 王春榮,王春榮,楊國樑,等.2017年濟(jì)南市柯薩奇病毒A16型VP1基因特征分析[J].中華實(shí)驗(yàn)和臨床病毒學(xué)雜志,2019,33(1):44.

[2] 鄧紅,冀天嬌,黃永迪,等.2012~2016年新疆柯薩奇病毒A6的分子流行病學(xué)特征分析[J].病毒學(xué)報(bào),2018,34(06):839-843.

[3] 文婕,王鵬飛,李秀芳,等.2015年昆明市柯薩奇病毒A16型VP1區(qū)基因特征分析[J].中華疾病控制雜志,2018,22(06):607-612.

[4] 姚相杰,王偉琪,陳龍,等.2016-2017年深圳地區(qū)柯薩奇病毒A16型分子特征分析[J].中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志,2019,39(9):652-656.

[5] 周健明,鄧義州,洪澤濤,等.深圳市龍崗區(qū)2017年手足口病病原柯薩奇病毒A16型及腸道病毒71型VP1區(qū)基因特征分析[J].實(shí)用預(yù)防醫(yī)學(xué),2019,26(03):371-374.

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