多細胞生物利用基因沉默(gene silencing)作為一種手段調(diào)控基因表達和基因組穩(wěn)定性。Small RNA與ARGONATUE(AGO)蛋白在基因沉默中發(fā)揮著重要作用。在植物中,small RNAs的兩大類主要是miRNAs和siRNAs。miRNA主要由21-22個nt核苷酸組成,通過mRNA的切割和翻譯抑制來調(diào)節(jié)靶基因的表達。
植物miRNA的生物合成被分為多步,MIR基因被Pol II轉(zhuǎn)錄成pri-miRNAs,被DCL1-HYL1-SE復(fù)合體加工為pre-miRNA,形成miRNA-miRNA*duplexes。經(jīng)HEN1在3端的甲基化,miRISCs復(fù)合體(AGO1相關(guān)復(fù)合體)加工完成后出核,進而被運輸?shù)郊毎|(zhì)。
與多細胞動物不同,植物中的microRNAs(miRNAs)是在細胞核內(nèi)逐步產(chǎn)生的。miRNAs的產(chǎn)生的主要步驟是如何協(xié)調(diào)的,很大程度上還未可知。2020年7月20日,美國加州大學陳雪梅團隊在Nature Plants雜志上發(fā)表了題為“Linking key steps of microRNA biogenesis by TREX-2 and the nuclear pore complex in Arabidopsis”的研究論文。研究發(fā)現(xiàn)植物TREX-2復(fù)合物能夠促進miRNA生物發(fā)生的多個過程,包括轉(zhuǎn)錄、加工和出核。
研究發(fā)現(xiàn)TREX-2復(fù)合體的核心亞基THP1和SAC3A與RNA聚合酶II相互作用并共定位,促進核質(zhì)MIR基因的轉(zhuǎn)錄。TREX-2與SERRATE(microprocessor component)相互作用,并促進核質(zhì)中剪切體的形成。此外,研究還發(fā)現(xiàn)THP1也與核孔蛋白中NUP1在核膜上相互作用并共定位。NUP1和THP1促進miRNAs和ARGONAUTE1的核輸出。這些結(jié)果表明,TREX-2協(xié)調(diào)miRNA生物合成中轉(zhuǎn)錄、加工過程以及核輸出的關(guān)鍵過程,以確保高效的產(chǎn)生miRNA。
綜上所述,研究表明擬南芥TREX-2協(xié)調(diào)miRNA生物合成的轉(zhuǎn)錄和加工以及核輸出相關(guān)。本研究更深一步地解析了植物miRNA生物合成的關(guān)鍵步驟是如何協(xié)調(diào)工作的。