楊文煥,毋凡琛,申 涵,李衛(wèi)平,張 生
(1.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 水利與土木建筑工程學(xué)院,呼和浩特 010018; 2.內(nèi)蒙古科技大學(xué) 能源與環(huán)境學(xué)院,內(nèi)蒙古 包頭 014010)
細菌群落作為湖泊生態(tài)系統(tǒng)中重要組成部分,在推動湖區(qū)生物地球化學(xué)循環(huán)方面發(fā)揮著重要作用[1]。細菌不僅可通過自身新陳代謝與環(huán)境發(fā)生作用,進而改變水環(huán)境因子,亦可作為生物學(xué)指標,來指示湖泊生態(tài)系統(tǒng)的健康狀況[2]?!狙芯恳饬x】寒旱區(qū)湖泊由于其特殊的地理位置,和氣候特征,導(dǎo)致其有冰封期長、冰層厚、流量小、污染重等特有的水體特征以及其重要的生態(tài)系統(tǒng)功能,逐漸成為國內(nèi)外研究的焦點[3-4]。在冰封期間,由于湖泊水溫急劇下降,大量生物在極端環(huán)境下存活困難,但依然有些細菌還具有強大的生物活性,特殊的遺傳背景和代謝途徑使其能夠產(chǎn)生適合低溫極端環(huán)境的特殊酶類及活性物,從而使其能夠在寒冷條件下表現(xiàn)出較高的活性[5-6]?!狙芯窟M展】目前對于寒旱區(qū)湖泊的研究主要集中在其功能、水質(zhì)、魚類群落、鳥類、浮游生物和水生大型植物方面,而針對南海湖的研究多集中在營養(yǎng)鹽分布、生態(tài)風險評價和浮游植物分布等,而對微生物的研究還較少?!厩腥朦c】由于寒旱區(qū)湖泊具有較長的冰封期這一特點,而在冰封過程中,湖泊的生態(tài)系統(tǒng)特征受到物理和化學(xué)波動的影響,由此產(chǎn)生的一系列生態(tài)過程及表象將對生存在該生態(tài)系統(tǒng)中的細菌多樣性和代謝活動產(chǎn)生更大的影響,進而導(dǎo)致整個食物鏈的結(jié)構(gòu)發(fā)生變化[8]。因此,通過探究寒旱區(qū)湖泊冰封期細菌種群特征,了解細菌群落的組成和多樣性,對分析湖泊生態(tài)系統(tǒng)物質(zhì)循環(huán),以期能錨定該湖泊中主要優(yōu)勢菌屬,進而解決寒旱區(qū)水環(huán)境問題具有指導(dǎo)意義?!緮M解決的關(guān)鍵問題】本研究采用高通量測序技術(shù),通過對寒旱區(qū)湖泊在冰封期不同區(qū)域水體及沉積物細菌群落特征進行分析,與環(huán)境因子進行相關(guān)性分析,來探究寒旱區(qū)冰封期湖泊理化因子對細菌群落特征的影響,為進一步探究高原寒旱區(qū)湖泊細菌群落與環(huán)境的相應(yīng)關(guān)系和富營養(yǎng)化水體的生物修復(fù)提供參考。
南海湖受人為因素影響顯著,不同水域有不同特征。根據(jù)湖泊補水特征、水生植物生長特點及人為因素干擾等,將其劃分為4 個區(qū)域,分別為進水口區(qū)S1(NH1、NH2、NH3),旅游開發(fā)區(qū)S2(NH4、NH5、NH6),湖心區(qū)S3(NH7、NH8、NH9)及水草區(qū)S4(NH10、NH11、NH12),在每個區(qū)域均布設(shè)3 個采樣點。湖泊西南部定期接受黃河補水,水質(zhì)影響明顯;補水口東北部坐落一座小島,供游人觀光,污染較多;島嶼周圍及湖泊東北部水草密集生長,以蘆葦為主;湖中心污染較少,水力條件穩(wěn)定。采樣點具體分布如圖1 所示。
圖1 包頭南海湖冰封期采樣點布設(shè)圖 Fig.1 Distribution of sampling sites in the ice period of Nanhai Lake in Baotou
于2017 年12 月—2018 年2 月在研究區(qū)域各采樣點采集樣品。采集水樣時,使用不銹鋼柱狀采樣器,取冰體下表面之下0.5 m 與沉積物之上0.5 m 處水樣進行混合,水樣存放于經(jīng)滅菌消毒的聚乙烯取樣瓶中。于實驗室內(nèi)將樣品分為兩部分,一部分用于理化指標的測定,另一部分經(jīng)0.22 μm 無菌微濾孔濾膜過濾,將濾膜置于50 mL 無菌離心管中,放置于-80 ℃液氮中保存,用于微生物群落結(jié)構(gòu)和多樣性分析。
使用不銹鋼采樣器取表層沉積物樣品,每個樣點均取3 個平行樣,充分混合后存放于經(jīng)滅菌消毒聚乙烯自封袋中(保證無菌)。將樣品分為2 部分,一部分待自然風干后研磨用于各理化指標測定,另一部分置于-80 ℃液氮冷凍保存,用于微生物群落結(jié)構(gòu)和多樣性分析。
本研究水質(zhì)檢測指標為水溫(T)、溶解氧(DO)、pH 值、總氮(TN)、總磷(TP)、氨態(tài)氮(NH4+-N)、硝態(tài)氮(NO3--N)、亞硝態(tài)氮(NO2--N)、葉綠素a(Chl.a)和化學(xué)需氧量(CODCr)。其中水溫,溶解氧和pH 值采用便攜式水質(zhì)檢測儀在采樣現(xiàn)場檢測,其他指標根據(jù)國家環(huán)境保護總局《水和廢水監(jiān)測分析方法》中所述方法檢測。沉積物理化指標包括pH 值、總有機碳(TOC)、總磷(TP)、總氮(TN)、氨態(tài)氮(NH4+-N)、硝態(tài)氮(NO3-N)和碳氮比(C/N)。具體測定方法如表1、表2 所示。
表1 水體理化指標測定方法 Table 1 Test method of physical and chemical indexes of water
表2 沉積物理化指標測定方法 Table 2 Test method of physical and chemical indexes of sediments
采用 OMEGA 的 Soil DNA Isolation Kit(BioTek,Inc.,GA,USA)提取沉積物及水體樣品總DNA,完成基因組DNA 抽取后,使用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測抽取基因組DNA。采用通用引物338F(5'-ACTCCTACGGGAGGCAGCA-3')和806R(5'-GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3')作為 16S rRNA 基因序列PCR 擴增的引物序列,進行V3~V4區(qū)目的基因PCR 擴增。將PCR 產(chǎn)物用2%瓊脂糖凝膠電泳檢測,使用 AxyPrepDNA 凝膠回收試劑盒(AXYGEN)公司切膠回收PCR 產(chǎn)物,Tris-HCl 洗脫,用25%瓊脂糖電泳檢測,參照電泳初步定量結(jié)果,將PCR 產(chǎn)物用QuantiFluorTM-ST 藍色熒光定量系統(tǒng)進行檢測定量,隨后按照每個樣本測序量要求,按照相應(yīng)比例混合,做Miseq 測序[10],高通量測試在上海美吉生物公司進行。
將相似性大于97%的優(yōu)化序列劃分為一個操作分類單元(Operational Taxonomic Units,OTU),對OTU 樣本進行聚類分析,計算Chao1 指數(shù)、香農(nóng)指數(shù)(Shannon)、文庫覆蓋率(Coverage),采用RDP-classifier 貝葉斯算法從各個分類水平對各個樣本的群落組成進行分析[11]。利用相關(guān)性Spearman圖分析理化因子與細菌群落結(jié)構(gòu)關(guān)系;Origin(8.5版本)繪制物種豐度柱狀圖。采用SPSS 進行方差分析。
南海湖水環(huán)境及沉積物理化因子分布情況見表3、表4。從表3 可以看出,不同湖區(qū)營養(yǎng)水平有一定差異,從水體看(表3),TN、NH4+-N、NO3--N、T 差異顯著(0.01
0.05)。除個別指標外,各湖區(qū)營養(yǎng)水平依次為S2>S4>S1>S3,其中旅游開發(fā)區(qū)相比于其他湖區(qū)各種污染物的量均較高,湖心區(qū)各種營養(yǎng)物質(zhì)的量較低。
島內(nèi)各種生活生產(chǎn)廢水排放入旅游開發(fā)區(qū),由于受人為污染較多,這一區(qū)域營養(yǎng)水平較其他區(qū)域偏高;由于水草區(qū)水生植物在冰封期的腐敗,殘體分解等過程,體內(nèi)營養(yǎng)元素釋放,各污染物的量處于較高的水平,且TP 和COD 較其他區(qū)域高;進水口受到黃河補水的影響,稀釋了水體中營養(yǎng)物質(zhì)造成,營養(yǎng)水平較低;湖心區(qū)受人為干擾因素較小,污染較少??傮w來看沉積物營養(yǎng)水平與冰封期冰下水體分布大致相同。
表3 南海湖水環(huán)境因子分布特征 Table 3 Distribution characteristics of water environmental factors in Nanhai Lake
表4 南海湖沉積物理化因子分布特征 Table 4 Distribution characteristics of sediments factors in Nanhai Lake
不同湖區(qū)沉積物中污染物質(zhì)的量有一定差異,污染嚴重程度由高到低依次為S2>S4> S1> S3。沉積物整體呈弱堿性,TN、NH4+-N差異極顯著(p<0.01),NO3--N 在S1、S3 湖區(qū)差異極顯著(p<0.01),在S2、S4 湖區(qū)(0.01
0.05)。從表3、表4 可以看出,旅游開發(fā)區(qū)由于受人為影響較大,所以這一區(qū)域污染物較其他區(qū)域偏高;水草區(qū)由于水生植物腐敗,殘體厭氧分解,體內(nèi)營養(yǎng)元素釋放,總氮、氨氮等的量較平時也有所上升;進水口區(qū)受黃河補水影響,營養(yǎng)鹽的量較低;湖心區(qū)水深較大,受人為干擾因素較小,因此沉積物營養(yǎng)鹽的量最低。
各采樣點α多樣性指數(shù)及OTU聚類結(jié)果見表5。測序結(jié)果顯示覆蓋率均在99%以上,表明測序結(jié)果基本代表了樣本中微生物的真實情況[12]。
表5 各區(qū)域水體及沉積物OTU 聚類與多樣性分析 Table 5 OTU clustering and diversity analysis of water and sediment in different regions
以多樣性指數(shù)Sobs 做稀釋曲線(圖2),各樣點的稀釋曲線逐漸趨緩。通過Chao1、Shannon 等多樣性指數(shù)綜合來看,在本次試驗中不同湖區(qū)樣品物種豐度和均勻度大小依次為S3>S1>S4>S2。在冬季冰封期由于冰蓋的影響導(dǎo)致水體內(nèi)溶解氧較低,因此溶解氧成為制約微生物量的關(guān)鍵因素。
圖2 稀釋曲線 Fig.2 Rarefaction curve
為了探究不同區(qū)域水體、沉積物細菌的群落組成差異,對各個區(qū)域樣品進行β 多樣性分析(圖3),在沉積物中湖心區(qū)與水草區(qū)沉積物細菌組成最為接近,進水口區(qū)次之;進水口區(qū)與旅游開發(fā)區(qū)細菌組成差異最大。在水體中,進水口區(qū)與湖心區(qū)細菌群落最為相似,水草區(qū)次之,類似的營養(yǎng)條件使得細菌群落結(jié)構(gòu)最為接近。旅游開發(fā)區(qū)在其他季節(jié)受人為影響較大,故在經(jīng)歷冰封期的沉降作用后與其他區(qū)域細菌群落組成差異較大;雖然在冰封期進水口區(qū)接受黃河補水有限,但也對沉積物細菌組成造成了一定影響;湖心區(qū)與水草區(qū)均位于內(nèi)湖,受外界干擾較小,細菌組成也最為接近。
圖3 樣本層級聚類樹 Fig.3 Hierarchical clustering tree
對測序結(jié)果進行分析得出,南海湖在冰封期水體及沉積物中具有較豐富的微生物群落結(jié)構(gòu)。共計46 個門,1 073 個屬。按門水平分類,水體及沉積物中優(yōu)勢種均集中在變形菌門(Proteobacteria)、綠彎菌門(Chloroflexi)、藍藻門(Cyanobacteria)、擬桿菌門(Bacteroidetes)和放線菌門(Actinobacteria)等(圖4),其中變形菌門和綠彎菌門是沉積物中的優(yōu)勢菌屬,綠彎菌門和擬桿菌門是水體中的優(yōu)勢菌。進水口區(qū)沉積物中變形菌門和綠彎菌門為優(yōu)勢菌種,此外,藍藻細菌也較為豐富,水體中放線菌門、藍藻門為優(yōu)勢菌種。旅游開發(fā)區(qū)沉積物中主要菌種為變形菌門、綠彎菌門和擬桿菌門,水體中主要菌種為藍藻門、變形菌門和放線菌門。湖心區(qū)與水草區(qū)沉積物細菌組成較為相似,主要菌種為變形菌門、綠彎菌門,但二者的水體細菌差異較大,湖心區(qū)的優(yōu)勢菌種為放線菌門,水草區(qū)的優(yōu)勢菌種為藍藻門。
圖4 樣品門水平優(yōu)勢細菌分布 Fig.4 Distribution of dominant bacteria at the phylum level
圖5 樣品屬水平優(yōu)勢細菌分布 Fig.5 Distribution of dominant bacteria at the genus level
對樣品在屬水平上進行相對豐度計算(圖5), 在沉積物中硫桿菌屬(Thiobacillus)、未命名厭氧繩菌科(norank-f-Anaerolineaceae)、未分類綠彎菌科(unclassified-p-Chloroflexi)是優(yōu)勢菌屬,在水體中,未分類藍藻細菌(unclassified-Cyanobacteria)、分支桿菌屬(Mycobacterium)和hgcl-clade 是優(yōu)勢菌屬。硫桿菌屬和norank-f-Anaerolineaceae 在進水口區(qū)豐度接近;硫桿菌屬在旅游開發(fā)區(qū)內(nèi)豐度較其他區(qū)域更高,此外unclassified-p-Chloroflexi 豐度也處于4 個采樣點的最高水平;在湖心區(qū)與水草區(qū),豐度最高的為norank-f-Anaerolineaceae,硫桿菌屬的稍低,除此之外螺旋體屬(Spirochaeta-2)、暖發(fā)菌屬(Caldithrix)、硝化螺菌屬(Nitrospira)等也均有檢出。
環(huán)境因子對細菌群落結(jié)構(gòu)有著顯著影響,通過對環(huán)境因子與主要屬水平細菌的相關(guān)性熱圖得出(圖6):unclassified-c-Cyanobacteria 與pH 值、COD、DO、T 正相關(guān),與TP、TN 負相關(guān);Mycobacterium與TP、COD 正相關(guān),與NH4+-N、NO3--N、NO2--N呈負相關(guān);norank-o-PeM15 則與NH4+-N、NO3--N、NO2--N、Chaol 呈極顯著負相關(guān)(p<0.001)。對hgcl-clade 影響較大的環(huán)境因子是TN。總體來看,TN、DO、T 對水體細菌群落結(jié)構(gòu)影響較大。
圖6 Spearman 相關(guān)性熱圖 Fig.6 Spearman correlation heat map
沉積物中硫桿菌屬、unclassified-p-Chloroflexi 與TN、NH4+-N 正相關(guān),與C/N 負相關(guān),與TP 相關(guān)性不大;norank-f-Anaerolineaceae、norank-c-KD4-96與 TOC 負 相 關(guān), 與 pH 值 正 相 關(guān); 對norank-c-Cyanobacteria 影響較大的環(huán)境因子是TOC。總體來看,TN、NH4+-N、C/N 對沉積物細菌群落結(jié)構(gòu)影響較大。沉積物理化因子的量受湖泊水體質(zhì)量長期影響,短期內(nèi)不會產(chǎn)生劇烈變化。由于南海湖氮污染及有機物污染嚴重,因而沉積物中氮元素的量及總有機碳對細菌群落結(jié)構(gòu)影響顯著。
變形菌門能夠適應(yīng)復(fù)雜的生存環(huán)境,另外在變形菌門中已發(fā)現(xiàn)多種可參與氮循環(huán)的細菌,因此,其在南海湖中占據(jù)優(yōu)勢地位,綠彎菌門為兼性厭氧微生物,在冰封期水低體溶解氧的條件下依然可以保持較好的活性[14]。藍藻門并不是沉積物中的優(yōu)勢菌種,但在水體中的量較高。各采樣點間營養(yǎng)水平的差異,使微生物擁有不同的生存環(huán)境,進而影響細菌群落結(jié)構(gòu),變形菌門、綠彎菌門、放線菌門、擬桿菌門和藍藻門在4 個采樣點之間具有顯著差異,Thiobacillus、unclassified-p-Chloroflexi、unrank-c-Bacteroidetes-vadinHA17 等在營養(yǎng)化水平較高區(qū)域豐度更高,放線菌門在營養(yǎng)化水平較低區(qū)域的量較高,Liu 等[15]在對太湖進行相關(guān)研究時也得出了類似結(jié)論。
在冰封期間,雖然低溫在一定程度上限制了細菌的活性,但其仍然在湖泊物質(zhì)循環(huán)中發(fā)揮著重要作用,且在本研究中細菌種類繁多。本次研究中,變形菌門、綠彎菌門在沉積物中有較高的量,這與薛銀剛等[16]在對太湖進行的相關(guān)研究相似,但是與太湖相比,南海湖在冰封期獨有的冰蓋導(dǎo)致溶解氧量較低,檢測到了種類繁多的厭氧菌,如硝化螺菌屬、螺旋體屬等。硫桿菌屬是沉積物中的優(yōu)勢菌種,屬于硫氧化細菌,可將還原態(tài)硫化物和元素硫氧化為硫酸。由于冰蓋的存在使湖中污染物發(fā)生濃縮效應(yīng),污染狀況較其他時間更為嚴重,占據(jù)優(yōu)勢菌種的硫桿菌屬可以極大程度地減少水體中還原態(tài)硫化物的量,降低了水體中的污染,對減輕湖泊富營養(yǎng)化現(xiàn)象具有積極作用[17]。
unclassified-c-Cyanobacteria 是水體中占比最高的屬。unclassified-c-Cyanobacteria 分布極廣,普遍生長在淡水、海水和土壤中,并且在極端環(huán)境中也能生長,故有“先鋒生物”的美稱[18],因此在冰封期水體中雖然外界條件惡劣,但也能發(fā)現(xiàn)較多unclassified-c-Cyanobacteria 存在。在相關(guān)研究中unclassified-c-Cyanobacteria 類群具有固氮能力,通過氮氣的固定提高稻田與其他土壤的肥力[19],但其在富營養(yǎng)化嚴重的水體中具有較高的量,是水體富營養(yǎng)化的指示生物,其中的一些屬種普遍存在于發(fā)生赤潮與水華的水體中,導(dǎo)致水體環(huán)境的惡化及水生動物的死亡,由此可見南海湖中氮磷污染較為嚴重,若產(chǎn)生合適的條件極易爆發(fā)水華[20]。
造成湖泊富營養(yǎng)化的因素有很多,情況復(fù)雜,特別是在北方冰封期,由于冰蓋的影響造成水體中溶解氧較低,并且營養(yǎng)物質(zhì)發(fā)生沉降作用,使水體污染狀況加劇。以往研究表明,南海湖在冰封期水體已呈現(xiàn)出富營養(yǎng)狀態(tài),沉積物中相關(guān)污染物也隨之加劇,從而對沉積物細菌群落造成影響[9]。Winter等[21]對勞倫森大湖研究后發(fā)現(xiàn)硝態(tài)氮、氨氮以及有機物量是影響其中細菌群落結(jié)構(gòu)的主要影響因子,而同樣地處我國北方寒旱區(qū)的烏梁素海中,總磷、水溶鹽總量和氨氮對其中細菌群落結(jié)構(gòu)的影響最為明顯。
unclassified-c-Cyanobacteria 為水體中各區(qū)域豐度較高的菌屬,較多unclassified-c-Cyanobacteria 的存在,說明南海湖冰封期水體已呈現(xiàn)富營養(yǎng)化狀態(tài),污染已十分嚴重。pH 值、COD 是冰封期unclassified-c-Cyanobacteria 的主要影響因子,控制pH 值、COD 量是避免南海湖水華爆發(fā)的重要舉措。
硫桿菌屬為沉積物中各個區(qū)域豐度較高的菌屬,其在南海湖冰封期生物物質(zhì)循環(huán)中扮演著重要的角色[22]。從相關(guān)性熱圖可以看出,TN、NH4+-N以及COD 與硫桿菌屬有較強的正相關(guān)。冰封期沉積物為硫桿菌屬提供了良好的生存環(huán)境,鑒于其在預(yù)防水體惡化中的重要作用,應(yīng)給予足夠重視,通過研究分析出與硫桿菌屬呈負相關(guān)的理化因子,從而控制其在水體及沉積物中的量,有效預(yù)防南海湖在冰封期水質(zhì)發(fā)生惡化。
1)在冰封期,溶解氧成為影響細菌物種豐富度的關(guān)鍵因素,物種豐富度依次為旅游開發(fā)區(qū)>水草區(qū)>進水口區(qū)>湖心區(qū)。
2)冰封期南海湖細菌主要類群分別為Proteobacteria 、 Chloroflexi 、 Cyanobacteria 、Bacteroidetes 和Acidobacteria;從屬水平分析,優(yōu)勢類群集中在Thiobacillus、unclassified-c-Cyanobacteria、unclassified-p-Chloroflexi。
3)南海湖在冰封期已經(jīng)呈富營養(yǎng)化狀態(tài),控制TN、NH4+-N 以及COD 量是避免南海湖水華爆發(fā)的重要舉措。