王新宇,牛鵬帥,盧 偉,DENG Yiming
(1 南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 人工智能學(xué)院/江蘇省現(xiàn)代設(shè)施農(nóng)業(yè)技術(shù)與裝備工程實驗室,江蘇 南京 210031;2 密歇根州立大學(xué) 工學(xué)院,密歇根州 東蘭辛 48824)
美國農(nóng)業(yè)部2020年6月發(fā)布2020—2021年度全球玉米產(chǎn)量預(yù)估報告,我國以2.6億t的預(yù)估產(chǎn)量位居全球第2。玉米作為我國主要農(nóng)作物之一,是我國重要的經(jīng)濟產(chǎn)業(yè),其種子質(zhì)量直接影響玉米產(chǎn)量,其中種子發(fā)芽率是評價種子質(zhì)量的重要指標之一[1]。為避免因種子發(fā)芽率過低導(dǎo)致產(chǎn)量受損,需在播種前對隨機抽取的玉米種子進行發(fā)芽試驗以確定發(fā)芽率,但該方法耗時較長且受休眠期影響。為縮短檢測時間,染色法代替了發(fā)芽試驗法,有活力種子胚細胞中的脫氫酶被染色劑(TTC)還原,胚部位呈紅色,以此區(qū)分有無活力的種子。染色法簡單快速、準確可靠,同時適用于休眠期長和難以進行發(fā)芽試驗的種子,但仍為有損檢測且對操作者專業(yè)性要求較高[2]。因此,1995年國際種子檢驗協(xié)會的《種子生活力測定手冊》提出電導(dǎo)率檢測方法[3],在保證檢測速度的同時,降低了對操作人員的要求,但其主要基于種子吸脹初期細胞膜損傷重建過程中電解質(zhì)和可溶性物質(zhì)的外滲程度,對種子發(fā)芽率進行評價,耗時較長且損傷種子,同時準確性也易受室溫、水溫、水質(zhì)等因素影響。
為實現(xiàn)玉米種子發(fā)芽率的快速無損檢測,近年來,機器視覺、近紅外光譜、高光譜成像等多種無損檢測技術(shù)被應(yīng)用于種子質(zhì)量評價。為準確檢測玉米種子是否有機械損傷裂紋,閆彬等[4]基于機器視覺技術(shù)對自動提取的320幅玉米胚面和胚乳面圖像裂紋進行識別,準確率分別為94.4%和86.9%。Kusumaningrum等[5]采用近紅外光譜技術(shù)并結(jié)合偏最小二乘法判別區(qū)分有無活力的大豆種子,精確度接近100%。Kimuli等[6]采用可見/近紅外高光譜成像系統(tǒng)對不同地區(qū)的4個品種的玉米種子表面是否含黃曲霉毒素B1進行評估,結(jié)合主成分分析和因子判別分析建模,評估準確率達到96%。Feng等[7]利用高光譜成像技術(shù),通過圖譜融合鑒定不同加速老化時期的玉米種子活力,通過發(fā)芽試驗驗證分類模型,其結(jié)果表明,高光譜技術(shù)結(jié)合SVM模型可以進一步提高玉米種子活力的檢測精度。可見,檢測信息維度的增加有利于提高檢測精度。本文擬通過深度掃描光聲光譜技術(shù)將光譜技術(shù)拓展到光譜、聲音、深度維度,基于此,構(gòu)建玉米種子發(fā)芽率預(yù)測模型,實現(xiàn)對不同顏色玉米種子發(fā)芽率的快速、無損、高精度檢測,為種子質(zhì)量評估提供新的方法和技術(shù)。
選取3種顏色、6個品種的玉米種子為研究對象,其中每種顏色的玉米種子均有2個不同的品種,分別為白玉米(‘銀香’和‘京糯808’),黃玉米(‘京黏1號’和‘蘇玉’),黑玉米(‘黑糯4號’和‘黑糯6號’),于2019年收獲于山東濰坊,由壽光順昌種業(yè)提供,經(jīng)篩選剔除缺陷種子,每個品種挑選顆粒飽滿、外表無明顯差異的種子1 600粒,用于人工老化。
為得到不同發(fā)芽率的玉米種子,參照已有研究[8]采用人工老化法對玉米種子樣品進行高溫高濕人工老化處理。將挑選的種子均分為8份,按照0~7次序編號,將0~7號樣品置于托盤中放入培養(yǎng)箱(寧波江南儀器廠制造,型號:RXZ-128A)在溫度45 ℃和相對濕度95%環(huán)境下分別老化0、1、2、3、4、5、6和7 d。結(jié)束后從培養(yǎng)箱中取出,自然條件下風干1 d后裝入密封袋中,放入4 ℃冰箱冷藏保存。
光聲光譜技術(shù)(Photoacoustic spectrometry technology, PAS)是一種基于光熱測量原理的新型技術(shù),與傳統(tǒng)吸收光譜的測量原理差異在于,PAS并非基于光子特性直接進行光譜檢測,而是在樣品受光照之后,對其在無輻射激發(fā)現(xiàn)象中的周期性熱流進行檢測。在不同光譜波長和調(diào)制頻率下,不同材料中的熱擴散長度具有差異,因此,可通過物質(zhì)表面附近熱擴散層內(nèi)的光吸收進行物質(zhì)成分分析。隨著調(diào)制頻率的降低,熱擴散距離增加,檢測深度更深,基于此原理可以檢測樣品不同深度的物質(zhì)成分[9]。由于玉米種子的種皮具有良好的透光性,而胚乳、子葉、胚芽、胚軸和胚根的老化程度和種子生命活力具有密切的聯(lián)系,因此通過深度掃描光聲光譜可挖掘出玉米種子的生命信息[10],原理如圖1所示。
圖1 玉米種子光聲光譜深度掃描原理Fig. 1 Photoacoustic spectroscopy deep scan schematic diagram of maize seed
試驗使用美國Thermal Fish公司生產(chǎn)的Nicolet Is50R 紅外光譜儀和美國MTEC Photoacoustics公司生產(chǎn)的PA300光聲檢測器搭建玉米種子光聲光譜檢測系統(tǒng)。在試驗數(shù)據(jù)采集之前,將光譜儀開機預(yù)熱0.5 h,并用氮氣對整個紅外光譜儀倉體內(nèi)部進行吹掃,以減小水分對光譜測定的干擾,然后對光譜儀進行設(shè)定。試驗過程中掃描的光聲光譜波數(shù)范圍為中紅外400~4 000 cm-1,光譜掃描的分辨率為8 cm-1,動鏡速率為0.32 cm/s,光譜的連續(xù)掃描次數(shù)為32次。把不同老化程度的玉米樣品以單顆形式均勻放置在銅質(zhì)圓柱形樣品池(直徑10 mm,高5 mm)中,調(diào)整樣品的高度,使其低于樣品倉邊緣 1~2 mm,用氦氣 (5 mL·min-1)連續(xù)吹掃10 s后采集樣品的光聲光譜,每改變一次采集深度前需重新用玻璃碳進行一次相位校準,以碳黑背景光譜作為對照,用于光譜信號的標準化處理。檢測裝置如圖2所示。
圖2 光聲光譜采集試驗裝置示意圖Fig. 2 Schematic diagram of photoacoustic spectrum acquisition experimental device
經(jīng)過人工加速老化處理和光譜采集后,取不同老化處理時間的玉米種子各200粒,均分為4組,進行發(fā)芽試驗。試驗過程中首先將不同老化時間的玉米種子按編號放入裝有清水的500 mL燒杯中,在20 ℃恒溫條件下浸種48 h。然后,將不同老化時間的玉米種子按編號順序依次放置在內(nèi)鋪2層濾紙的玻璃培養(yǎng)皿的相應(yīng)位置,加水濕潤,每粒玉米種子之間留有種子直徑5倍以上的間距,蓋好蓋子后放入20 ℃的智能人工氣候箱(型號:RXZ型-多段編程,寧波江南儀器廠)中,按照GB/T 3543.4—1995農(nóng)作物種子檢驗規(guī)程 發(fā)芽試驗[11]要求培養(yǎng)玉米種子7 d。每天記錄玉米種子的發(fā)芽情況,第7天計算發(fā)芽率,結(jié)果取4組試驗的平均值。發(fā)芽率試驗結(jié)果見表1。
表1 不同老化時間玉米種子的發(fā)芽率Table 1 Germination rates of maize seeds with different aging times %
通過集合經(jīng)驗?zāi)B(tài)分解(Ensemble empirical mode decomposition, EEMD)對采集到的原始光譜信息進行去噪,得到平滑的原始光譜曲線[12]。步驟如下:
1)在原始光譜曲線x(t)中引入正態(tài)分布的白噪聲w(t);
2)加入白噪聲的光譜作為一個新的光譜曲線X(t)=x(t)+w(t),對構(gòu)造的新光譜曲線X(t)進行經(jīng)驗?zāi)B(tài)分解,得到各個本征模函數(shù)(Intrinsic mode function, IMF)分量:
式中,cj是經(jīng)驗?zāi)B(tài)分解得到的第j個IMF,rn是分解刪除n個IMF后的殘余分量,常表示信號趨勢;
3)給原始光譜曲線x(t)加入不同的白噪聲wi(t),重復(fù)以上步驟得到各自分解后的IMF分量組:
式中,X(i)是加入白噪聲wi(t)后的光譜,cij是經(jīng)驗?zāi)B(tài)分解得到的第j個IMF,rin是分解刪除n個IMF后的殘余分量;
4)每次獲得的IMF集合平均后作為最終的IMF:
式中,N為添加噪聲的次數(shù)。
以‘京黏1號’玉米為例,由于Nicolet Is50R紅外光譜儀的測量波數(shù)范圍(4 000~3 700 cm-1和940~400 cm-1)內(nèi)的信噪比過低,因此去除該段波數(shù)。圖3為該玉米種子在調(diào)制頻率為500 Hz下的光聲光譜原始圖像和EEMD去噪圖像。
圖3 ‘京黏1號’玉米的500 Hz (8 μm)原始圖像和去噪圖像Fig. 3 ‘Jingnian No.1’ maize original image and denoised image at 500 Hz (8 μm)
由圖4可見,不同老化程度的玉米種子在波數(shù)3 700~940 cm-1之間具有相似的吸收特性,出現(xiàn)相似度較強的吸收峰。在波數(shù)3 500~3 100 cm-1處有較寬吸收峰;在波數(shù)3 000~2 850 cm-1處均出現(xiàn)一尖峰;在2 700~1 850 cm-1范圍內(nèi),光聲光譜信號較平緩,僅在2 320 cm-1處出現(xiàn)一小峰;在波數(shù)1 630 cm-1處有較明顯尖峰;在波數(shù)1 500~1 200 cm-1處有一段平緩且不明顯小峰;在波數(shù)1 440~1 317 cm-1處亦然,在1 412 cm-1附近有一吸收峰;指紋區(qū)1 060 cm-1附近有一強而寬的吸收峰;以上吸收峰均反映了玉米種子內(nèi)部成分的光聲光譜特性。
圖4 不同老化時間玉米種子的光聲光譜Fig. 4 Photoacoustic spectroscopy of maize seeds with different aging time
主成分分析(Principal component analysis,PCA)旨在實現(xiàn)數(shù)據(jù)降維,消除眾多信息相互重疊的部分[13]。本文對已經(jīng)預(yù)處理過的每個深度的樣本進行主成分分析,經(jīng)過預(yù)處理之后,每條玉米種子光聲光譜有727個數(shù)據(jù)點,各檢測深度的玉米種子光譜信息組成數(shù)據(jù)矩陣。雖均可作為模型的輸入,但大量的數(shù)據(jù)會顯著增加計算量,同時信息冗余也會導(dǎo)致過擬合而降低模型的預(yù)測精度,因此利用主成分分析分別獲取各檢測深度數(shù)據(jù)矩陣的主成分及相應(yīng)貢獻率,以95%為目標累積貢獻率選取主成分,完成光聲光譜的特征提取,特征光譜如圖5。
圖5 ‘京黏1號’500 Hz (8 μm)特征光譜Fig. 5 Characteristic spectrum of ‘Jingnian No.1’ at 500 Hz (8 μm)
為優(yōu)化玉米光聲光譜發(fā)芽率預(yù)測模型,分別采用偏最小二乘法回歸(Partial least squares regression, PLSR)、BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(Back propagation neural network, BPNN)、支持向量回歸(Support vector regression, SVR)和廣義回歸神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(Generalized regression neural network, GRNN) 4種建模方法,在7個檢測斬波頻率下建立28種玉米種子發(fā)芽率預(yù)測模型。各檢測斬波頻率以3∶1為比例隨機選出訓(xùn)練集和預(yù)測集,將特征光譜作為模型輸入,玉米種子發(fā)芽率作為模型輸出,建模結(jié)果對比見表2和表3。
由表2可見,‘京黏1號’玉米在不同深度下的SVR建模結(jié)果均較優(yōu),BP、PLSR和GRNN模型在不同深度下的結(jié)果優(yōu)劣各異,且穩(wěn)定性較差。綜合建模精度和采樣時間兩方面因素,選定500 Hz為最優(yōu)檢測頻率,該頻率下訓(xùn)練集和預(yù)測集的相關(guān)系數(shù)較高,且相對偏差較小。其余5個品種玉米的發(fā)芽率預(yù)測模型建立結(jié)果與‘京黏1號’趨勢相同,均在500 Hz調(diào)制頻率下SVR預(yù)測結(jié)果最優(yōu)。
表2 不同深度‘京黏1號’光聲光譜建模結(jié)果Table 2 Photoacoustic spectroscopy modeling results of ‘Jingnian No.1’ with different depths
表3 單一品種玉米和混合玉米最優(yōu)建模(SVR模型)結(jié)果Table 3 Optimal modeling (SVR modle) results of single cultivar mazie and mixed-cultivar maize
表3為6個品種玉米種子以最優(yōu)模型(SVR模型)獨立、混合建模的結(jié)果。由表3可見,訓(xùn)練集和預(yù)測集的相關(guān)系數(shù)較高,且相對偏差較小,表明SVR建模方法對單一品種玉米種子和多品種混合玉米種子的發(fā)芽率預(yù)測均適用,且不受玉米表面顏色影響。同時,混合建模時,訓(xùn)練集相關(guān)系數(shù)為0.994 5,均方根誤差為0.974 8,預(yù)測集相關(guān)系數(shù)為0.942 1,均方根誤差為1.387 8,雖然建模效果評定為優(yōu)良,但精度較單一品種玉米種子建模精度相比略低。單一品種玉米和混合玉米發(fā)芽率的SVR預(yù)測模型見圖6。
圖6 單一品種玉米和多種混合玉米的SVR建模結(jié)果Fig. 6 SVR modeling results of single cultivar mazie and mixed-cultivar maize
基于不同老化時間玉米膜結(jié)構(gòu)完整性差異、玉米種子內(nèi)部物質(zhì)發(fā)生變化的生物學(xué)原理及光聲光譜檢測的物理學(xué)原理對玉米發(fā)芽率進行預(yù)測。已有生物學(xué)分析[14-15]表明:隨著玉米種子老化劣變,玉米種子發(fā)芽率降低,其內(nèi)部酶基團(主要元素:C、H、O、N)的活性也逐漸降低,如玉米內(nèi)部的過氧化物酶、脫氫酶、過氧化氫酶等;同時,可溶性糖(主要元素:C、H、O)和丙二醛 (主要元素:C、H、O)含量逐漸增加,可溶性蛋白 (主要元素:C、H、O、N、S等)含量不斷減少。光聲光譜檢測技術(shù)能夠通過對光轉(zhuǎn)換成聲的能力大小的探測來確定物質(zhì)的熱學(xué)性質(zhì)和光譜學(xué)性質(zhì),改變調(diào)制頻率便可獲取玉米種子不同深度下物質(zhì)變化的信息。
在500 Hz時,玉米種子的生物學(xué)變化最為敏感,其中:可溶性糖和蛋白質(zhì)等C—O鍵、C—N鍵的伸縮振動導(dǎo)致波數(shù)1 160~1 000 cm-1的波段內(nèi)出現(xiàn)吸收峰;油脂和纖維素等C—O鍵和C—C鍵的伸縮振動導(dǎo)致波數(shù)1 060 cm-1附近強而寬的吸收峰;波數(shù)1 412 cm-1附近的吸收峰為淀粉中C—O—O、CH2伸縮振動吸收區(qū);波數(shù) 1 440~1 317 cm-1附近的吸收峰為亞甲基和甲基對稱彎曲振動及CH3剪式振動吸收;波數(shù)1 500~1 200 cm-1范圍內(nèi)的吸收峰是多糖和蛋白質(zhì)混合振動的吸收區(qū);波數(shù)1 630 cm-1處小的吸收峰主要由蛋白質(zhì)C—O鍵的伸縮振動(酰胺I)和水的O—H鍵的彎曲振動以及不飽和油脂中C—C鍵的伸縮振動疊加而導(dǎo)致;波數(shù)2 320 cm-1處的小吸收峰由光聲池中殘余CO2氣體導(dǎo)致;波數(shù)3 000~2 850 cm-1處的尖狀吸收峰主要為丙二醛和纖維素等物質(zhì)的C—H鍵伸縮振動所導(dǎo)致;波數(shù)3 500~3 100 cm-1處寬的吸收峰主要由水中O—H鍵和蛋白質(zhì)中N—H鍵振動伸縮的疊加作用導(dǎo)致[16-18]。
本文采用基于深度掃描的單粒玉米發(fā)芽率光聲光譜檢測方法,采集3種顏色、6個品種的不同老化程度的玉米種子在不同調(diào)制頻率下的光聲光譜信息,通過EEMD和PCA對原始光聲光譜進行去噪和降維處理,分別結(jié)合PLSR、BPNN、GRNN和SVR進行建模。結(jié)果表明,500 Hz為最佳掃描頻率,SVR建模為最優(yōu)發(fā)芽率預(yù)測模型;單一品種玉米種子發(fā)芽率預(yù)測相關(guān)系數(shù)均超過0.980 0,混合品種玉米種子發(fā)芽率預(yù)測相關(guān)系數(shù)達0.942 1。結(jié)果表明,光聲光譜深度掃描技術(shù)通過拓展光譜、聲音和深度信息預(yù)測玉米種子發(fā)芽率是可行的,可為多維、高精度檢測種子發(fā)芽率提供新方法。