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非小細(xì)胞肺癌中反義長(zhǎng)鏈非編碼RNA RAB11B-AS1的表達(dá)及臨床意義

2020-12-08 08:18:58汪柳黃培芝熊將軍
安徽醫(yī)藥 2020年12期
關(guān)鍵詞:長(zhǎng)鏈反義生存率

汪柳,黃培芝,熊將軍

作者單位:湖南中醫(yī)藥高等專(zhuān)科學(xué)校附屬第一醫(yī)院(湖南省直中醫(yī)醫(yī)院)檢驗(yàn)科,湖南 株洲412000

肺癌是最為常見(jiàn)的惡性腫瘤,其發(fā)病率和死亡率均居全球腫瘤首位,嚴(yán)重危害人類(lèi)的生命健康[1-2]。肺癌的發(fā)病機(jī)制尚未完全明確,可能與環(huán)境污染、吸煙、既往肺部慢性感染、電離輻射和遺傳等因素有關(guān)。非小細(xì)胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)約占肺癌的85%,進(jìn)展期病人5年生存率僅為15%[3]。尋找治療NSCLC的新途徑,探尋有效的基因治療靶點(diǎn)是目前亟須解決的問(wèn)題。全基因組分析顯示,人體內(nèi)超過(guò)90%的基因被轉(zhuǎn)錄為非編碼RNA(non-coding RNA,ncRNA)。大量研究表明,長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA)在細(xì)胞增殖、分化和凋亡等多種生物學(xué)行為中發(fā)揮作用,并在多種腫瘤中異常表達(dá),在腫瘤的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮抑癌或促癌作用[4-5]。lncRNA可通過(guò)表觀遺傳、轉(zhuǎn)錄及轉(zhuǎn)錄后多種途徑調(diào)控基因表達(dá)[6]。反義長(zhǎng)鏈非編碼RNA RAB11B-AS1(long non-coding RAB11B antisense RNA,lncRNA RAB11B-AS1)是一種反義lncRNA,能通過(guò)不同機(jī)制調(diào)控基因的表達(dá)。研究發(fā)現(xiàn),一些特定的lncRNA在NSCLC中表達(dá)異常,與NSCLC發(fā)生發(fā)展、轉(zhuǎn)移及預(yù)后有密切聯(lián)系[7]。然而lncRNA RAB11B-AS1在NSCLC中的作用鮮有報(bào)道,本研究將通過(guò)檢測(cè)NSCLC癌組織中l(wèi)ncRNA RAB11B-AS1的表達(dá)及與預(yù)后的關(guān)系,以期為NSCLC的治療和預(yù)后提供依據(jù)。

1 資料與方法

1.1一般資料選取2014年9月至2017年3月于湖南省直中醫(yī)醫(yī)院行手術(shù)治療的97例NSCLS病人,其中男/女:54例/43例,年齡(57.31±9.86)歲,范圍為34~79歲。Ⅰ~Ⅱ期/Ⅲ~Ⅳ期:47例/50例,淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移有/無(wú):60例/37例,遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移有/無(wú):28例/69例。試驗(yàn)組為病人的癌組織,對(duì)照組則選取同一病人的癌旁組織(距腫瘤邊緣>2 cm)。

納入標(biāo)準(zhǔn):①經(jīng)病理確認(rèn)為NSCLC;②入院前3個(gè)月未行放、化療;③臨床病理資料完整。排除標(biāo)準(zhǔn):①肝、腎、心臟等功能不良者;②同時(shí)患有其他惡性腫瘤者;③拒絕參與研究者。

對(duì)所有病人隨訪2年,從術(shù)后第1天起,隨訪日期截至2019年4月1日,無(wú)失訪病例,統(tǒng)計(jì)隨訪期間的生存人數(shù)。97例NSCLC病人中共存活41例,死亡56例。本研究符合《世界醫(yī)學(xué)協(xié)會(huì)赫爾辛基宣言》相關(guān)要求,病人及其近親屬均知情且同意。

1.2主要儀器與試劑實(shí)時(shí)熒光定量PCR(Quantitative Real-time PCR,qPCR)儀(型號(hào)T100),購(gòu)于伯樂(lè)生命醫(yī)學(xué)產(chǎn)品(上海)有限公司;Titan One Tube RT-PCR試劑盒(貨號(hào)11939823001),購(gòu)于Sigma-Aldrich中國(guó)上海總部;Prime Script?RT reagent Kit(Perfect Real Time)(貨號(hào) RR037A)及TRIzol試劑(貨號(hào)JMS12279),均購(gòu)于日本TaKaRa公司。

1.3研究方法

1.3.1 樣品采集 于術(shù)中收集新鮮的NSCLC癌組織及癌旁組織(距腫瘤邊緣大于2 cm),液氮中冷凍后,移至-80℃超低溫冰箱保存。

1.3.2 實(shí)時(shí)熒光定量逆轉(zhuǎn)錄PCR(RT-qPCR)測(cè)定lncRNA RAB11B-AS1的表達(dá) ①提取總RNA:組織破碎后勻漿,按照Trizol RNA提取說(shuō)明書(shū)操作,所得RNA溶于RNase Free水,保證RNA完整,并檢測(cè)RNA純度及濃度。②逆轉(zhuǎn)錄:將RNA逆轉(zhuǎn)錄為互補(bǔ)DNA(cDNA),按照Prime Script? RT reagent Kit試劑盒說(shuō)明書(shū)操作,-20℃保存所得cDNA。③qPCR反應(yīng)(20μL體系):2×SYBR Green PCR Master Mix(10μL),上下游引物(各1μL),cDNA模板(2μL),水(6μL),各樣本均設(shè)置3個(gè)重復(fù)。以GAPDH為內(nèi)參,其正向引物序列為5’-GGAGCGAGATCCCTCCAAAAT-3’,反向引物序列為5’-GGCTGTTGTCTTACTTCTCATGG-3’;lncRNA RAB11B-AS1正向引物序列為5’-CCATGGACCCTTGCGAGAT-3’,反向引物序列為 5’-CAAAGTCCATGTAAACATGTTCCC-3’。④反應(yīng)條件:于T100 qPCR儀上進(jìn)行,95℃30 s、95 ℃ 10 s、60 ℃ 30 s,40個(gè)循環(huán)。采用2-ΔΔCt法計(jì)算lncRNA RAB11B-AS1相對(duì)表達(dá)量。

1.4統(tǒng)計(jì)學(xué)方法采用SPSS 24.0分析,計(jì)量資料以xˉ±s表示,采用配對(duì)樣本t檢驗(yàn);計(jì)數(shù)資料用例數(shù)表示,采用χ2檢驗(yàn);Kaplan-Meier曲線繪制NSCLC病人術(shù)后24個(gè)月的生存曲線;影響NSCLC預(yù)后的危險(xiǎn)因素采用Cox多因素回歸分析,檢驗(yàn)水準(zhǔn)α=0.05。

2 結(jié)果

2.1 RT-qPCR法測(cè)定組織中l(wèi)ncRNA RAB11BAS1表達(dá)量試驗(yàn)組lncRNA RAB11B-AS1的表達(dá)量為(2.61±0.74),對(duì)照組lncRNA RAB11B-AS1的表達(dá)量為(1.35±0.41),試驗(yàn)組明顯高于對(duì)照組,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t=14.669,P<0.001)。

2.2癌組織中l(wèi)ncRNA RAB11B-AS1表達(dá)與NSCLC病人臨床病理特征的關(guān)系以lncRNA RAB11B-AS1表達(dá)的平均數(shù)值(2.61)將試驗(yàn)組分為高、低表達(dá)組。lncRNA RAB11B-AS1表達(dá)與病人年齡、性別、吸煙史及腫瘤直徑無(wú)關(guān)(P>0.05),與病理類(lèi)型、分化程度、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移和疾病分期有關(guān)(P<0.05)。見(jiàn)表1。

2.3癌組織中l(wèi)ncRNA RAB11B-AS1表達(dá)與NSCLC病人預(yù)后的關(guān)系繪制97例NSCLC病人術(shù)后1~24個(gè)月的生存曲線,其中生存41例,總生存率為42.27%(41/97)。lncRNA RAB11B-AS1高表達(dá)組術(shù)后 2年總生存率為 28.30%(15/53),95%CI:13.401~17.542;低表達(dá)組術(shù)后2年總生存率為59.09%(26/44),95%CI:17.595~21.451,兩組比較log-rank值為9.272,P=0.002。見(jiàn)圖1。

圖1 非小細(xì)胞肺癌97例癌組織反義長(zhǎng)鏈非編碼RNA RAB11B-AS1表達(dá)24個(gè)月生存曲線

2.4影響NSCLC病人預(yù)后的危險(xiǎn)因素分析單因素分析顯示,病理類(lèi)型、分化程度、疾病分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、lncRNA RAB11B-AS1表達(dá)及遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移是影響NSCLC病人預(yù)后的危險(xiǎn)因素。多因素分析顯示,lncRNA RAB11B-AS1表達(dá)、遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移和疾病分期(HR=2.69、2.70、2.93,95%CI:1.83~3.96、1.58~4.62、1.67~5.13,均P<0.05)均是影響NSCLC病人預(yù)后的獨(dú)立危險(xiǎn)因素。見(jiàn)表2。

3 討論

NSCLC多數(shù)病人確診時(shí)處于NSCLC晚期[8]。晚期NSCLC病人常伴隨淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移,療效不佳[9]。隨著科技的進(jìn)步和分子生物技術(shù)的發(fā)展,NSCLC分子靶向治療取得一定進(jìn)展,但發(fā)病機(jī)制尚未明確,目前仍缺乏有效的診斷及預(yù)后判斷指標(biāo)[10]。

lncRNA不具有編碼蛋白功能,但可以參與細(xì)胞的多種生物學(xué)行為,在人體內(nèi)發(fā)揮重要作用。lncRNA主要通過(guò)以下途徑參與細(xì)胞調(diào)控:①影響目的基因啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄;②影響RNA聚合酶Ⅱ活性;③與目的基因轉(zhuǎn)錄本形成互補(bǔ)雙鏈;④與目的蛋白結(jié)合影響其活性;⑤改變目的蛋白在細(xì)胞中的定位[11]。越來(lái)越多研究表明,lncRNA在肺癌的發(fā)生發(fā)展中起重要作用[12-13]。Meng等[14]發(fā)現(xiàn),lncRNA RMRP在肺腺癌細(xì)胞系A(chǔ)546、SPC-A1、H1299和H23中均呈高表達(dá),且其異常表達(dá)可促進(jìn)肺腺癌癌細(xì)胞增殖和侵襲。She等[15]研究表明,長(zhǎng)鏈非編碼RNA SNHG7可增強(qiáng)Fas凋亡抑制分子2(FAIM2)蛋白的表達(dá),從而促進(jìn)肺癌細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲,并抑制細(xì)胞凋亡。

表2 非小細(xì)胞肺癌病人97例的預(yù)后影響因素分析

根據(jù)位置及轉(zhuǎn)錄方向,可將lncRNA分為5類(lèi):雙向、正義、反義、基因間和內(nèi)含子lncRNA[16]。反義lncRNA含有m7GPPPN結(jié)構(gòu),可躲避5’-3’核酸外切酶,比其他lncRNA更穩(wěn)定,并且反義lncRNA亞細(xì)胞定位相對(duì)自由,其發(fā)揮作用的機(jī)制更加廣泛[17]。反義lncRNA正在受到人們的廣泛關(guān)注。Wu等[18]研究發(fā)現(xiàn),長(zhǎng)鏈非編碼RNA GAS5-AS1在NSCLC癌組織中表達(dá)下調(diào),且與疾病分期和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移有關(guān),lncRNA GAS5-AS1過(guò)表達(dá)能夠抑制NSCLC細(xì)胞的上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化,發(fā)揮抑癌作用。lncRNA RAB11BAS1是RAS癌基因家族成員,定位于19q13.2處,長(zhǎng)1 022 bp,有3個(gè)外顯子。馮麗萍等[19]研究表明,胃癌組織中l(wèi)ncRNA RAB11B-AS1表達(dá)上調(diào),且與病人預(yù)后密切相關(guān)。Chen等[20]發(fā)現(xiàn),lncRNA RAB11BAS1在骨肉瘤中組織中表達(dá)下調(diào),能夠抑制骨肉瘤細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲。目前,對(duì)于lncRNA RAB11B-AS1在腫瘤疾病中的作用研究較少,在NSCLC中的表達(dá)情況及作用未見(jiàn)報(bào)道。

本研究檢查NSCLC病人癌組織中l(wèi)ncRNA RAB11B-AS1的表達(dá)水平,結(jié)果顯示lncRNA RAB11B-AS1表達(dá)在癌組織中明顯高于癌旁組織,NSCLC病人癌組織中腺癌、低分化、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移、Ⅲ~Ⅳ期病人lncRNA RAB11B-AS1表達(dá)水平明顯高于鱗癌及其他、中高分化、無(wú)淋巴轉(zhuǎn)移、無(wú)遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移、Ⅰ~Ⅱ期病人,提示lncRNA RAB11B-AS1表達(dá)可能影響NSCLC的發(fā)生及病程進(jìn)展;Kaplan-Meier曲線顯示,lncRNA RAB11B-AS1高表達(dá)組的生存率(28.30%)低于低表達(dá)組(59.09%),提示lncRNA RAB11B-AS1高表達(dá)影響NSCLC病人術(shù)后生存率;Cox回歸分析顯示,lncRNA RAB11B-AS1表達(dá)、處轉(zhuǎn)移和疾病分期均是影響NSCLC預(yù)后的獨(dú)立危險(xiǎn)因素,提示下調(diào)lncRNA RAB11B-AS1可能對(duì)提高NSCLC病人的術(shù)后生存率有一定幫助。

綜上所述,lncRNA RAB11B-AS1在NSCLC病人癌組織中上調(diào),其表達(dá)與病人臨床病例特征有關(guān),且與NSCLC病人的預(yù)后密切相關(guān),可為NSCLC的治療提供參考。

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